MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1d

Total Repeats: 11103

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_021908	ATC	2	6	507409	507414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832956
11002	NC_021908	CGCCT	2	10	507421	507430	0 %	20 %	20 %	60 %	528832956
11003	NC_021908	GGC	2	6	507448	507453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832956
11004	NC_021908	CTC	2	6	507532	507537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528832957
11005	NC_021908	GCA	2	6	507555	507560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832957
11006	NC_021908	AT	3	6	507562	507567	50 %	50 %	0 %	0 %	528832957
11007	NC_021908	GCCTC	2	10	507591	507600	0 %	20 %	20 %	60 %	528832957
11008	NC_021908	GCC	2	6	507639	507644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832957
11009	NC_021908	GAT	2	6	507652	507657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832957
11010	NC_021908	AGA	2	6	507687	507692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528832957
11011	NC_021908	TCG	2	6	507707	507712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832957
11012	NC_021908	GAC	2	6	507745	507750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832957
11013	NC_021908	TGC	2	6	507753	507758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832957
11014	NC_021908	GCC	3	9	507783	507791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832957
11015	NC_021908	GTG	2	6	507794	507799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528832957
11016	NC_021908	CGA	2	6	507816	507821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832957
11017	NC_021908	TGGC	2	8	507839	507846	0 %	25 %	50 %	25 %	528832957
11018	NC_021908	GAT	2	6	507925	507930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832957
11019	NC_021908	GCC	2	6	507985	507990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832957
11020	NC_021908	TG	3	6	508058	508063	0 %	50 %	50 %	0 %	528832957
11021	NC_021908	TCTG	2	8	508069	508076	0 %	50 %	25 %	25 %	528832957
11022	NC_021908	CGG	2	6	508209	508214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832957
11023	NC_021908	GAT	2	6	508273	508278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832957
11024	NC_021908	CCG	2	6	508593	508598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832958
11025	NC_021908	AGA	2	6	508606	508611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528832958
11026	NC_021908	GCC	2	6	508638	508643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832958
11027	NC_021908	GAT	2	6	508646	508651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832958
11028	NC_021908	GAC	4	12	508880	508891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832958
11029	NC_021908	TCC	2	6	508968	508973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528832958
11030	NC_021908	CGC	2	6	509143	509148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832958
11031	NC_021908	CGTCG	2	10	509190	509199	0 %	20 %	40 %	40 %	528832958
11032	NC_021908	TGG	2	6	509236	509241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528832958
11033	NC_021908	CCG	2	6	509253	509258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832958
11034	NC_021908	GCC	2	6	509292	509297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832958
11035	NC_021908	GCT	2	6	509303	509308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832958
11036	NC_021908	CTG	2	6	509358	509363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832958
11037	NC_021908	TCT	2	6	509375	509380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528832958
11038	NC_021908	CT	3	6	509379	509384	0 %	50 %	0 %	50 %	528832958
11039	NC_021908	CGG	2	6	509399	509404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832958
11040	NC_021908	GCA	2	6	509411	509416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832958
11041	NC_021908	TCA	2	6	509422	509427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832958
11042	NC_021908	GTC	2	6	509433	509438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832958
11043	NC_021908	GCT	2	6	509483	509488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832958
11044	NC_021908	CGA	2	6	509722	509727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832959
11045	NC_021908	CTT	2	6	509766	509771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528832959
11046	NC_021908	CG	3	6	509772	509777	0 %	0 %	50 %	50 %	528832959
11047	NC_021908	CCGGT	2	10	509784	509793	0 %	20 %	40 %	40 %	528832959
11048	NC_021908	GGA	2	6	509824	509829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528832959
11049	NC_021908	AG	3	6	509830	509835	50 %	0 %	50 %	0 %	528832959
11050	NC_021908	AGG	2	6	509847	509852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528832959
11051	NC_021908	TCG	2	6	509874	509879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832959
11052	NC_021908	TTC	2	6	509902	509907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528832959
11053	NC_021908	GCAG	2	8	510061	510068	25 %	0 %	50 %	25 %	528832959
11054	NC_021908	GCT	2	6	510073	510078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832959
11055	NC_021908	CGA	2	6	510112	510117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832959
11056	NC_021908	GTC	2	6	510125	510130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832959
11057	NC_021908	GC	3	6	510155	510160	0 %	0 %	50 %	50 %	528832959
11058	NC_021908	TGT	2	6	510276	510281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528832959
11059	NC_021908	GAC	2	6	510342	510347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832959
11060	NC_021908	GAC	2	6	510382	510387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832959
11061	NC_021908	GGC	2	6	510388	510393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832959
11062	NC_021908	GGA	2	6	510433	510438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528832959
11063	NC_021908	CCG	2	6	510445	510450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832959
11064	NC_021908	GCG	2	6	510528	510533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832959
11065	NC_021908	GCCG	2	8	510542	510549	0 %	0 %	50 %	50 %	528832959
11066	NC_021908	GCG	2	6	510872	510877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832960
11067	NC_021908	CAG	2	6	510917	510922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832960
11068	NC_021908	GATC	2	8	510923	510930	25 %	25 %	25 %	25 %	528832960
11069	NC_021908	GTCG	2	8	510938	510945	0 %	25 %	50 %	25 %	528832960
11070	NC_021908	CG	3	6	510963	510968	0 %	0 %	50 %	50 %	528832960
11071	NC_021908	CG	3	6	511005	511010	0 %	0 %	50 %	50 %	528832960
11072	NC_021908	GAA	2	6	511046	511051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528832960
11073	NC_021908	TCG	2	6	511075	511080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832960
11074	NC_021908	AGC	2	6	511096	511101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832960
11075	NC_021908	GC	3	6	511109	511114	0 %	0 %	50 %	50 %	528832960
11076	NC_021908	CATGG	2	10	511116	511125	20 %	20 %	40 %	20 %	528832960
11077	NC_021908	CAC	2	6	511130	511135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528832960
11078	NC_021908	GCG	2	6	511139	511144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832960
11079	NC_021908	TGG	2	6	511159	511164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528832960
11080	NC_021908	ATC	2	6	511176	511181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832960
11081	NC_021908	CGG	2	6	511182	511187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832960
11082	NC_021908	CGC	2	6	511215	511220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832960
11083	NC_021908	CTC	2	6	511269	511274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528832960
11084	NC_021908	GTGC	2	8	511275	511282	0 %	25 %	50 %	25 %	528832960
11085	NC_021908	GGC	2	6	511301	511306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832960
11086	NC_021908	GCA	3	9	511433	511441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832960
11087	NC_021908	CGG	2	6	511483	511488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832960
11088	NC_021908	CTG	2	6	511500	511505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832960
11089	NC_021908	A	6	6	511567	511572	100 %	0 %	0 %	0 %	528832960
11090	NC_021908	CATA	2	8	511604	511611	50 %	25 %	0 %	25 %	528832960
11091	NC_021908	CACAC	2	10	511621	511630	40 %	0 %	0 %	60 %	528832960
11092	NC_021908	GGA	2	6	511676	511681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528832960
11093	NC_021908	GCC	2	6	511703	511708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832960
11094	NC_021908	TGC	2	6	511732	511737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832960
11095	NC_021908	TTG	2	6	511753	511758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528832960
11096	NC_021908	GCG	2	6	511771	511776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832960
11097	NC_021908	GCC	3	9	511803	511811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832960
11098	NC_021908	GTC	3	9	511812	511820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832960
11099	NC_021908	CAG	2	6	511854	511859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832960
11100	NC_021908	TGC	2	6	511886	511891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832960
11101	NC_021908	CGG	2	6	511919	511924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832960
11102	NC_021908	CGG	2	6	511936	511941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832960
11103	NC_021908	CGG	2	6	511965	511970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832960

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.