MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1d

Total Repeats: 11103

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_021908	GCCA	2	8	350047	350054	25 %	0 %	25 %	50 %	528832803
7502	NC_021908	GAC	2	6	350068	350073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832803
7503	NC_021908	GGC	2	6	350170	350175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832803
7504	NC_021908	TCA	2	6	350189	350194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832803
7505	NC_021908	GGC	2	6	350281	350286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832803
7506	NC_021908	GAC	2	6	350304	350309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832803
7507	NC_021908	AAC	2	6	350311	350316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528832803
7508	NC_021908	GGT	2	6	350379	350384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528832803
7509	NC_021908	TGA	2	6	350388	350393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832803
7510	NC_021908	TCA	2	6	350399	350404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832803
7511	NC_021908	CG	3	6	350477	350482	0 %	0 %	50 %	50 %	528832803
7512	NC_021908	CAC	2	6	350490	350495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528832803
7513	NC_021908	GCTTT	2	10	350519	350528	0 %	60 %	20 %	20 %	528832803
7514	NC_021908	CTG	2	6	350536	350541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832803
7515	NC_021908	CGA	2	6	350618	350623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832803
7516	NC_021908	AGA	2	6	350630	350635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528832803
7517	NC_021908	CA	3	6	350666	350671	50 %	0 %	0 %	50 %	528832803
7518	NC_021908	GCCCG	2	10	350678	350687	0 %	0 %	40 %	60 %	528832803
7519	NC_021908	ACG	2	6	350735	350740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832803
7520	NC_021908	GCC	2	6	350903	350908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832804
7521	NC_021908	ACT	2	6	350931	350936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832804
7522	NC_021908	CCAT	2	8	350994	351001	25 %	25 %	0 %	50 %	528832804
7523	NC_021908	CCG	2	6	351017	351022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832804
7524	NC_021908	GGT	2	6	351070	351075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528832804
7525	NC_021908	CGG	2	6	351091	351096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832804
7526	NC_021908	GTT	2	6	351104	351109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528832804
7527	NC_021908	GCCA	2	8	351158	351165	25 %	0 %	25 %	50 %	528832804
7528	NC_021908	CAG	2	6	351266	351271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832805
7529	NC_021908	ATC	2	6	351295	351300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832805
7530	NC_021908	GCT	2	6	351356	351361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832805
7531	NC_021908	GCA	3	9	351379	351387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832805
7532	NC_021908	CGATG	2	10	351416	351425	20 %	20 %	40 %	20 %	528832805
7533	NC_021908	CGG	2	6	351521	351526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832805
7534	NC_021908	CGA	3	9	351629	351637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832805
7535	NC_021908	GCC	2	6	351771	351776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832805
7536	NC_021908	CTG	2	6	351847	351852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832805
7537	NC_021908	TGCCGC	2	12	351881	351892	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	528832805
7538	NC_021908	CGGC	2	8	351910	351917	0 %	0 %	50 %	50 %	528832805
7539	NC_021908	CACAG	2	10	351945	351954	40 %	0 %	20 %	40 %	528832805
7540	NC_021908	CGT	2	6	351955	351960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832805
7541	NC_021908	CCCGGC	2	12	351966	351977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832805
7542	NC_021908	AC	3	6	352063	352068	50 %	0 %	0 %	50 %	528832805
7543	NC_021908	CTC	3	9	352145	352153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528832805
7544	NC_021908	CAA	2	6	352157	352162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528832805
7545	NC_021908	GAC	2	6	352214	352219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832805
7546	NC_021908	TGT	2	6	352271	352276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528832805
7547	NC_021908	CGG	2	6	352334	352339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832805
7548	NC_021908	CAG	2	6	352346	352351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832805
7549	NC_021908	CAA	2	6	352355	352360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528832805
7550	NC_021908	ACT	2	6	352432	352437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832805
7551	NC_021908	ACG	2	6	352486	352491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832805
7552	NC_021908	CGG	2	6	352568	352573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832805
7553	NC_021908	CGC	2	6	352629	352634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832805
7554	NC_021908	CGTC	2	8	352672	352679	0 %	25 %	25 %	50 %	528832805
7555	NC_021908	CG	3	6	352705	352710	0 %	0 %	50 %	50 %	528832805
7556	NC_021908	CG	3	6	352721	352726	0 %	0 %	50 %	50 %	528832805
7557	NC_021908	GAT	2	6	352784	352789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832805
7558	NC_021908	GGT	2	6	352806	352811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528832805
7559	NC_021908	GAA	2	6	352839	352844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528832805
7560	NC_021908	GAT	3	9	352858	352866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832805
7561	NC_021908	GCT	2	6	352945	352950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832806
7562	NC_021908	CCATCA	2	12	353295	353306	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	528832806
7563	NC_021908	TTCC	2	8	353308	353315	0 %	50 %	0 %	50 %	528832806
7564	NC_021908	AG	3	6	353320	353325	50 %	0 %	50 %	0 %	528832806
7565	NC_021908	CGC	2	6	353433	353438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832807
7566	NC_021908	TGC	2	6	353565	353570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832807
7567	NC_021908	CAA	2	6	353580	353585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528832807
7568	NC_021908	GCA	2	6	353648	353653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832807
7569	NC_021908	GGC	2	6	353655	353660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832807
7570	NC_021908	GCC	2	6	353801	353806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832807
7571	NC_021908	ACG	2	6	353926	353931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832807
7572	NC_021908	CTG	2	6	353955	353960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832807
7573	NC_021908	CCA	2	6	354017	354022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528832808
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7575	NC_021908	CGA	2	6	354039	354044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832808
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7578	NC_021908	TGC	2	6	354194	354199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832808
7579	NC_021908	TCG	3	9	354248	354256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832808
7580	NC_021908	GAC	2	6	354274	354279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832808
7581	NC_021908	GCT	2	6	354288	354293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832808
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7584	NC_021908	TCG	2	6	354451	354456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832808
7585	NC_021908	TAT	2	6	354544	354549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528832808
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7587	NC_021908	TGC	2	6	354713	354718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832808
7588	NC_021908	GGC	2	6	354732	354737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832808
7589	NC_021908	TCG	2	6	354758	354763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832808
7590	NC_021908	TAT	2	6	354772	354777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528832808
7591	NC_021908	TTTG	2	8	354870	354877	0 %	75 %	25 %	0 %	528832808
7592	NC_021908	TCA	2	6	354923	354928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832808
7593	NC_021908	TCGGCC	2	12	354950	354961	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	528832808
7594	NC_021908	CGA	2	6	354967	354972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832808
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7599	NC_021908	ATCGTC	2	12	355293	355304	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	528832809
7600	NC_021908	CG	3	6	355344	355349	0 %	0 %	50 %	50 %	528832809
7601	NC_021908	GC	4	8	355458	355465	0 %	0 %	50 %	50 %	528832809
7602	NC_021908	ATCT	2	8	355524	355531	25 %	50 %	0 %	25 %	528832809
7603	NC_021908	GAACG	2	10	355538	355547	40 %	0 %	40 %	20 %	528832809
7604	NC_021908	CAT	2	6	355719	355724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832810
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7606	NC_021908	TGCC	2	8	355793	355800	0 %	25 %	25 %	50 %	528832810
7607	NC_021908	GAG	2	6	355936	355941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528832810
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7609	NC_021908	TGATC	2	10	356019	356028	20 %	40 %	20 %	20 %	528832810
7610	NC_021908	CGA	2	6	356040	356045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832810
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7612	NC_021908	CGA	2	6	356082	356087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832810
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7614	NC_021908	ACA	2	6	356117	356122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528832810
7615	NC_021908	GAGCG	2	10	356134	356143	20 %	0 %	60 %	20 %	528832810
7616	NC_021908	CCG	2	6	356159	356164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832810
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7618	NC_021908	GCC	2	6	356225	356230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832810
7619	NC_021908	CGA	2	6	356235	356240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832810
7620	NC_021908	CGCC	2	8	356259	356266	0 %	0 %	25 %	75 %	528832810
7621	NC_021908	CGATG	2	10	356394	356403	20 %	20 %	40 %	20 %	528832810
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7737	NC_021908	GTC	2	6	363058	363063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832818
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7853	NC_021908	CG	3	6	367934	367939	0 %	0 %	50 %	50 %	528832822
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7982	NC_021908	CGATGG	2	12	373010	373021	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	528832829
7983	NC_021908	GC	3	6	373053	373058	0 %	0 %	50 %	50 %	528832829
7984	NC_021908	TGT	2	6	373142	373147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528832829
7985	NC_021908	GCC	2	6	373167	373172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832829
7986	NC_021908	CGAG	2	8	373256	373263	25 %	0 %	50 %	25 %	528832829
7987	NC_021908	CGG	2	6	373268	373273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832829
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7990	NC_021908	CTG	2	6	373393	373398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832829
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7992	NC_021908	GGC	2	6	373410	373415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832829
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7994	NC_021908	TGC	2	6	373562	373567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832829
7995	NC_021908	TGC	2	6	373585	373590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832829
7996	NC_021908	CGA	2	6	373604	373609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832829
7997	NC_021908	CGG	2	6	373644	373649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832829
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