MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1d

Total Repeats: 11103

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_021908	TGC	2	6	283910	283915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832739
6002	NC_021908	TGG	2	6	283943	283948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528832739
6003	NC_021908	CTT	2	6	284058	284063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528832739
6004	NC_021908	GGC	2	6	284091	284096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832739
6005	NC_021908	GAT	2	6	284097	284102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832739
6006	NC_021908	ATC	2	6	284137	284142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832739
6007	NC_021908	CGC	2	6	284244	284249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832739
6008	NC_021908	GAT	2	6	284307	284312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832739
6009	NC_021908	GGC	2	6	284313	284318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832739
6010	NC_021908	CCGG	2	8	284338	284345	0 %	0 %	50 %	50 %	528832739
6011	NC_021908	CTT	2	6	284349	284354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528832739
6012	NC_021908	CGGC	2	8	284390	284397	0 %	0 %	50 %	50 %	528832739
6013	NC_021908	ATCG	2	8	284423	284430	25 %	25 %	25 %	25 %	528832740
6014	NC_021908	TGC	2	6	284470	284475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832740
6015	NC_021908	TCG	2	6	284509	284514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832740
6016	NC_021908	TCG	2	6	284518	284523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832740
6017	NC_021908	GAT	2	6	284558	284563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832740
6018	NC_021908	GGA	2	6	284573	284578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528832740
6019	NC_021908	GAAC	2	8	284618	284625	50 %	0 %	25 %	25 %	528832740
6020	NC_021908	GGC	3	9	284759	284767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832740
6021	NC_021908	CGC	2	6	284768	284773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832740
6022	NC_021908	GCT	2	6	284792	284797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832740
6023	NC_021908	CGG	2	6	284802	284807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832740
6024	NC_021908	CGG	2	6	284822	284827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832740
6025	NC_021908	CGA	2	6	284888	284893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832740
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6027	NC_021908	GC	3	6	284933	284938	0 %	0 %	50 %	50 %	528832740
6028	NC_021908	AAG	2	6	284946	284951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528832740
6029	NC_021908	GATCG	2	10	285021	285030	20 %	20 %	40 %	20 %	528832740
6030	NC_021908	CATG	2	8	285035	285042	25 %	25 %	25 %	25 %	528832740
6031	NC_021908	GCG	2	6	285043	285048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832740
6032	NC_021908	CAG	2	6	285054	285059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832740
6033	NC_021908	GCCA	2	8	285089	285096	25 %	0 %	25 %	50 %	528832740
6034	NC_021908	GGCG	2	8	285158	285165	0 %	0 %	75 %	25 %	528832740
6035	NC_021908	GCCGCT	2	12	285206	285217	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	528832740
6036	NC_021908	TGA	2	6	285265	285270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832740
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6041	NC_021908	GAG	2	6	286011	286016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528832741
6042	NC_021908	GAC	2	6	286020	286025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832741
6043	NC_021908	TTA	2	6	286043	286048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528832741
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6045	NC_021908	GAG	2	6	286245	286250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528832741
6046	NC_021908	CAT	2	6	286298	286303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832741
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6048	NC_021908	CGA	2	6	286340	286345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832741
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6050	NC_021908	GAA	2	6	286406	286411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528832741
6051	NC_021908	GCC	3	9	286418	286426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832741
6052	NC_021908	GGC	2	6	286475	286480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832741
6053	NC_021908	GAA	2	6	286523	286528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528832741
6054	NC_021908	CG	5	10	286541	286550	0 %	0 %	50 %	50 %	528832741
6055	NC_021908	GCG	2	6	286576	286581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832741
6056	NC_021908	CGC	2	6	286590	286595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832741
6057	NC_021908	GAT	2	6	286679	286684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832742
6058	NC_021908	CA	3	6	286719	286724	50 %	0 %	0 %	50 %	528832742
6059	NC_021908	CGT	2	6	286748	286753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832742
6060	NC_021908	AGACGA	2	12	286793	286804	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	528832742
6061	NC_021908	GCG	2	6	286822	286827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832742
6062	NC_021908	CGAT	2	8	286891	286898	25 %	25 %	25 %	25 %	528832742
6063	NC_021908	CGC	2	6	286912	286917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832742
6064	NC_021908	CTA	2	6	286952	286957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832742
6065	NC_021908	TC	3	6	286958	286963	0 %	50 %	0 %	50 %	528832742
6066	NC_021908	CGA	2	6	286967	286972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832742
6067	NC_021908	CGCGA	2	10	287004	287013	20 %	0 %	40 %	40 %	528832742
6068	NC_021908	GGC	2	6	287015	287020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832742
6069	NC_021908	CG	3	6	287054	287059	0 %	0 %	50 %	50 %	528832742
6070	NC_021908	GC	3	6	287066	287071	0 %	0 %	50 %	50 %	528832742
6071	NC_021908	CGA	2	6	287126	287131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832742
6072	NC_021908	CGG	2	6	287176	287181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832742
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6080	NC_021908	TGA	2	6	287437	287442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832743
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6090	NC_021908	GCTC	2	8	287830	287837	0 %	25 %	25 %	50 %	528832743
6091	NC_021908	GGC	2	6	287838	287843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832743
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6099	NC_021908	CGG	2	6	288185	288190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832743
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6101	NC_021908	A	6	6	288315	288320	100 %	0 %	0 %	0 %	528832743
6102	NC_021908	TGA	2	6	288479	288484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832743
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6110	NC_021908	GCC	2	6	288959	288964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832744
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6120	NC_021908	TGG	2	6	289532	289537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528832744
6121	NC_021908	GCT	2	6	289587	289592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832744
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6153	NC_021908	ACGC	2	8	291452	291459	25 %	0 %	25 %	50 %	528832745
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6156	NC_021908	CG	3	6	291529	291534	0 %	0 %	50 %	50 %	528832745
6157	NC_021908	TGG	2	6	291536	291541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528832745
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6222	NC_021908	GCA	2	6	295214	295219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832748
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6225	NC_021908	TTCCA	2	10	295344	295353	20 %	40 %	0 %	40 %	528832748
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6228	NC_021908	GAC	2	6	295549	295554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832749
6229	NC_021908	AGC	2	6	295595	295600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832749
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6237	NC_021908	GAG	2	6	296030	296035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528832749
6238	NC_021908	CGA	2	6	296091	296096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832749
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6480	NC_021908	GCCG	2	8	305726	305733	0 %	0 %	50 %	50 %	528832757
6481	NC_021908	CCG	3	9	305731	305739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832757
6482	NC_021908	GCC	2	6	305777	305782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832757
6483	NC_021908	CGC	2	6	305800	305805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832757
6484	NC_021908	CGC	2	6	305843	305848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832757
6485	NC_021908	GAT	2	6	305894	305899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832757
6486	NC_021908	ATT	2	6	305972	305977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528832757
6487	NC_021908	CAG	2	6	305984	305989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832757
6488	NC_021908	GC	3	6	306008	306013	0 %	0 %	50 %	50 %	528832757
6489	NC_021908	CCAGAG	2	12	306092	306103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832757
6490	NC_021908	TTGCCG	2	12	306129	306140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832757
6491	NC_021908	GGT	2	6	306167	306172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528832757
6492	NC_021908	GC	4	8	306220	306227	0 %	0 %	50 %	50 %	528832757
6493	NC_021908	GGC	2	6	306245	306250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832757
6494	NC_021908	GAT	2	6	306281	306286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832757
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6496	NC_021908	CGA	2	6	306411	306416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832758
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6499	NC_021908	GCC	2	6	306451	306456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832758
6500	NC_021908	CGA	2	6	306474	306479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832758

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