MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1d

Total Repeats: 11103

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_021908	GCGCAG	2	12	260140	260151	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	528832712
5502	NC_021908	TGG	2	6	260206	260211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528832712
5503	NC_021908	CGAAA	2	10	260239	260248	60 %	0 %	20 %	20 %	528832712
5504	NC_021908	CCT	2	6	260300	260305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528832712
5505	NC_021908	GC	3	6	260320	260325	0 %	0 %	50 %	50 %	528832712
5506	NC_021908	TCC	2	6	260434	260439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528832712
5507	NC_021908	GCC	2	6	260496	260501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832712
5508	NC_021908	GCC	2	6	260571	260576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832712
5509	NC_021908	GAG	2	6	260588	260593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528832712
5510	NC_021908	ACG	2	6	260596	260601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832712
5511	NC_021908	GAC	2	6	260676	260681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832712
5512	NC_021908	CGG	2	6	260690	260695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832712
5513	NC_021908	GC	3	6	260786	260791	0 %	0 %	50 %	50 %	528832712
5514	NC_021908	ACC	2	6	260826	260831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528832712
5515	NC_021908	CTCCG	2	10	260859	260868	0 %	20 %	20 %	60 %	528832712
5516	NC_021908	GTG	2	6	260895	260900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528832712
5517	NC_021908	GAC	2	6	260916	260921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832712
5518	NC_021908	GCCG	2	8	260934	260941	0 %	0 %	50 %	50 %	528832712
5519	NC_021908	CAG	2	6	260961	260966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832712
5520	NC_021908	CCG	2	6	260987	260992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832712
5521	NC_021908	AAT	2	6	261051	261056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528832712
5522	NC_021908	TCA	2	6	261083	261088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832712
5523	NC_021908	GTA	2	6	261126	261131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832712
5524	NC_021908	GGA	2	6	261134	261139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528832712
5525	NC_021908	TTC	2	6	261156	261161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528832712
5526	NC_021908	TCTG	2	8	261164	261171	0 %	50 %	25 %	25 %	528832712
5527	NC_021908	GC	3	6	261345	261350	0 %	0 %	50 %	50 %	528832712
5528	NC_021908	CGA	2	6	261485	261490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832713
5529	NC_021908	TGCA	2	8	261513	261520	25 %	25 %	25 %	25 %	528832713
5530	NC_021908	TTC	2	6	261527	261532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528832713
5531	NC_021908	TGCT	2	8	261578	261585	0 %	50 %	25 %	25 %	528832713
5532	NC_021908	TCA	2	6	261619	261624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832713
5533	NC_021908	CG	3	6	261631	261636	0 %	0 %	50 %	50 %	528832713
5534	NC_021908	CAT	2	6	261699	261704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832713
5535	NC_021908	GTC	2	6	261756	261761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832713
5536	NC_021908	GGC	2	6	261777	261782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832713
5537	NC_021908	TCA	2	6	261805	261810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832713
5538	NC_021908	GAC	2	6	262209	262214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832714
5539	NC_021908	CGTC	2	8	262252	262259	0 %	25 %	25 %	50 %	528832714
5540	NC_021908	CGG	2	6	262289	262294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832714
5541	NC_021908	CGT	2	6	262295	262300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832714
5542	NC_021908	TGA	2	6	262408	262413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832714
5543	NC_021908	CGG	2	6	262429	262434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832714
5544	NC_021908	ACG	2	6	262455	262460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832714
5545	NC_021908	AGC	2	6	262463	262468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832714
5546	NC_021908	TTG	2	6	262599	262604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528832714
5547	NC_021908	GCT	2	6	262630	262635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832714
5548	NC_021908	CGG	2	6	262636	262641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832714
5549	NC_021908	GTG	2	6	262695	262700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528832714
5550	NC_021908	GAC	2	6	262709	262714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832714
5551	NC_021908	GTC	2	6	262725	262730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832715
5552	NC_021908	AGCC	2	8	262741	262748	25 %	0 %	25 %	50 %	528832715
5553	NC_021908	TGGCG	2	10	262936	262945	0 %	20 %	60 %	20 %	528832715
5554	NC_021908	GCG	2	6	262947	262952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832715
5555	NC_021908	CGG	2	6	262965	262970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832715
5556	NC_021908	CCA	2	6	262977	262982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528832715
5557	NC_021908	TCG	2	6	262985	262990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832715
5558	NC_021908	GGC	2	6	263035	263040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832715
5559	NC_021908	GCC	2	6	263045	263050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832715
5560	NC_021908	AGG	2	6	263087	263092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528832715
5561	NC_021908	CGT	2	6	263097	263102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832715
5562	NC_021908	GGC	2	6	263104	263109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832715
5563	NC_021908	CGG	2	6	263175	263180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832715
5564	NC_021908	AGGC	2	8	263202	263209	25 %	0 %	50 %	25 %	528832715
5565	NC_021908	GCT	2	6	263452	263457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832716
5566	NC_021908	CGG	2	6	263472	263477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832716
5567	NC_021908	CTC	2	6	263522	263527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528832716
5568	NC_021908	CG	3	6	263559	263564	0 %	0 %	50 %	50 %	528832716
5569	NC_021908	CGA	2	6	263644	263649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832716
5570	NC_021908	TGC	2	6	263686	263691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832716
5571	NC_021908	GGC	2	6	263713	263718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832716
5572	NC_021908	CGC	2	6	263764	263769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832716
5573	NC_021908	CGA	2	6	263896	263901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832716
5574	NC_021908	CAT	2	6	263953	263958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832716
5575	NC_021908	CGA	2	6	263995	264000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832716
5576	NC_021908	CAT	2	6	264034	264039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832716
5577	NC_021908	GC	3	6	264076	264081	0 %	0 %	50 %	50 %	528832716
5578	NC_021908	TCG	2	6	264099	264104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832716
5579	NC_021908	GCG	2	6	264120	264125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832716
5580	NC_021908	GC	4	8	264148	264155	0 %	0 %	50 %	50 %	528832716
5581	NC_021908	CGG	2	6	264195	264200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832716
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5583	NC_021908	CG	3	6	264241	264246	0 %	0 %	50 %	50 %	528832716
5584	NC_021908	GCC	2	6	264273	264278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832716
5585	NC_021908	GGC	2	6	264328	264333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832716
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5587	NC_021908	CTGG	2	8	264423	264430	0 %	25 %	50 %	25 %	528832717
5588	NC_021908	CTGC	2	8	264433	264440	0 %	25 %	25 %	50 %	528832717
5589	NC_021908	CCCG	2	8	264454	264461	0 %	0 %	25 %	75 %	528832717
5590	NC_021908	CGT	2	6	264489	264494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832717
5591	NC_021908	CAT	2	6	264495	264500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832717
5592	NC_021908	CGG	3	9	264501	264509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832717
5593	NC_021908	TCG	2	6	264521	264526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832717
5594	NC_021908	CCG	2	6	264584	264589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832717
5595	NC_021908	TAT	2	6	264694	264699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528832717
5596	NC_021908	GC	3	6	264703	264708	0 %	0 %	50 %	50 %	528832717
5597	NC_021908	GCAGC	2	10	264713	264722	20 %	0 %	40 %	40 %	528832717
5598	NC_021908	TGGA	2	8	264757	264764	25 %	25 %	50 %	0 %	528832717
5599	NC_021908	CG	3	6	264836	264841	0 %	0 %	50 %	50 %	528832717
5600	NC_021908	CCT	2	6	264858	264863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528832717
5601	NC_021908	GCC	2	6	264899	264904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832717
5602	NC_021908	CGT	2	6	264906	264911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832717
5603	NC_021908	CCG	2	6	264995	265000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832717
5604	NC_021908	GGTGCG	2	12	265048	265059	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	528832717
5605	NC_021908	CGCC	2	8	265101	265108	0 %	0 %	25 %	75 %	528832717
5606	NC_021908	CCG	2	6	265122	265127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832717
5607	NC_021908	CAA	2	6	265146	265151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528832717
5608	NC_021908	CGA	2	6	265203	265208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832717
5609	NC_021908	CAG	2	6	265243	265248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832717
5610	NC_021908	CGC	3	9	265250	265258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832717
5611	NC_021908	TGC	2	6	265271	265276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832717
5612	NC_021908	CGG	2	6	265323	265328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832717
5613	NC_021908	GAC	2	6	265342	265347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832717
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5615	NC_021908	GCCG	2	8	265491	265498	0 %	0 %	50 %	50 %	528832717
5616	NC_021908	GC	3	6	265681	265686	0 %	0 %	50 %	50 %	528832717
5617	NC_021908	CGT	2	6	265689	265694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832717
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5619	NC_021908	TC	3	6	265901	265906	0 %	50 %	0 %	50 %	528832718
5620	NC_021908	ATC	2	6	265932	265937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832718
5621	NC_021908	GAC	2	6	265958	265963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832718
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5623	NC_021908	CGA	2	6	266018	266023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832718
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5625	NC_021908	CAG	2	6	266097	266102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832718
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5636	NC_021908	GGTCTC	2	12	266625	266636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832719
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5862	NC_021908	TCG	2	6	277253	277258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832733
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5978	NC_021908	CCGATC	2	12	283147	283158	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	528832738
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5980	NC_021908	TGG	2	6	283191	283196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528832738
5981	NC_021908	T	6	6	283206	283211	0 %	100 %	0 %	0 %	528832738
5982	NC_021908	GCG	2	6	283227	283232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832738
5983	NC_021908	CG	3	6	283246	283251	0 %	0 %	50 %	50 %	528832738
5984	NC_021908	GGC	2	6	283262	283267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832738
5985	NC_021908	TCGA	2	8	283269	283276	25 %	25 %	25 %	25 %	528832738
5986	NC_021908	CGA	2	6	283330	283335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832738
5987	NC_021908	TCG	2	6	283390	283395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832738
5988	NC_021908	CCG	2	6	283414	283419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832738
5989	NC_021908	TCG	2	6	283432	283437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832738
5990	NC_021908	CAC	2	6	283451	283456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528832738
5991	NC_021908	TGC	2	6	283504	283509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832738
5992	NC_021908	GCT	3	9	283514	283522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832738
5993	NC_021908	ATC	2	6	283539	283544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832738
5994	NC_021908	CTG	2	6	283545	283550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832738
5995	NC_021908	GCT	2	6	283559	283564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832738
5996	NC_021908	CCA	2	6	283601	283606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528832739
5997	NC_021908	GCT	2	6	283665	283670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832739
5998	NC_021908	TGC	2	6	283760	283765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832739
5999	NC_021908	CTT	2	6	283785	283790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528832739
6000	NC_021908	CGG	2	6	283820	283825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832739

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