MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1d

Total Repeats: 11103

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_021908	GCG	2	6	207444	207449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832664
4502	NC_021908	GCC	3	9	207509	207517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832664
4503	NC_021908	CG	3	6	207537	207542	0 %	0 %	50 %	50 %	528832664
4504	NC_021908	CTC	2	6	207602	207607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528832664
4505	NC_021908	GGC	2	6	207686	207691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832664
4506	NC_021908	TGC	3	9	207695	207703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832664
4507	NC_021908	ATC	2	6	207755	207760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832664
4508	NC_021908	CTA	2	6	207787	207792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832664
4509	NC_021908	GGTG	2	8	207805	207812	0 %	25 %	75 %	0 %	528832664
4510	NC_021908	TGA	2	6	207856	207861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832664
4511	NC_021908	TGCC	2	8	208040	208047	0 %	25 %	25 %	50 %	528832665
4512	NC_021908	CAG	2	6	208059	208064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832665
4513	NC_021908	GGAC	2	8	208144	208151	25 %	0 %	50 %	25 %	528832665
4514	NC_021908	CCT	2	6	208163	208168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528832665
4515	NC_021908	TTGC	2	8	208174	208181	0 %	50 %	25 %	25 %	528832665
4516	NC_021908	GGAAGG	2	12	208195	208206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528832665
4517	NC_021908	GA	3	6	208240	208245	50 %	0 %	50 %	0 %	528832665
4518	NC_021908	TGG	2	6	208250	208255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528832665
4519	NC_021908	GCA	2	6	208259	208264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832665
4520	NC_021908	CGA	2	6	208295	208300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832665
4521	NC_021908	GCG	2	6	208486	208491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832665
4522	NC_021908	TCG	2	6	208510	208515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832665
4523	NC_021908	GCG	2	6	208533	208538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832665
4524	NC_021908	CG	3	6	208545	208550	0 %	0 %	50 %	50 %	528832665
4525	NC_021908	GCA	2	6	208622	208627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832665
4526	NC_021908	CGC	2	6	208673	208678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832665
4527	NC_021908	GGC	2	6	208770	208775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832665
4528	NC_021908	TGT	2	6	208778	208783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528832665
4529	NC_021908	GCC	2	6	208812	208817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832665
4530	NC_021908	GCA	2	6	208847	208852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832665
4531	NC_021908	CGGA	2	8	208871	208878	25 %	0 %	50 %	25 %	528832665
4532	NC_021908	ACG	2	6	208888	208893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832665
4533	NC_021908	TCG	2	6	208976	208981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832665
4534	NC_021908	CAC	2	6	209035	209040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528832666
4535	NC_021908	CGA	3	9	209058	209066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832666
4536	NC_021908	TGC	2	6	209067	209072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832666
4537	NC_021908	TCA	2	6	209076	209081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832666
4538	NC_021908	GCA	2	6	209087	209092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832666
4539	NC_021908	CGAC	2	8	209112	209119	25 %	0 %	25 %	50 %	528832666
4540	NC_021908	GGA	2	6	209290	209295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528832667
4541	NC_021908	CGA	2	6	209400	209405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832667
4542	NC_021908	GAC	2	6	209470	209475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832667
4543	NC_021908	GCC	2	6	209521	209526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832667
4544	NC_021908	TGC	2	6	209537	209542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832667
4545	NC_021908	GAC	2	6	209584	209589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832667
4546	NC_021908	GC	3	6	209680	209685	0 %	0 %	50 %	50 %	528832667
4547	NC_021908	TCG	2	6	209699	209704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832667
4548	NC_021908	CAGC	2	8	209732	209739	25 %	0 %	25 %	50 %	528832667
4549	NC_021908	TAAAGG	2	12	209898	209909	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	528832667
4550	NC_021908	CCG	2	6	209910	209915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832667
4551	NC_021908	CGG	2	6	209950	209955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832667
4552	NC_021908	CG	3	6	210007	210012	0 %	0 %	50 %	50 %	528832667
4553	NC_021908	GAT	2	6	210094	210099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832667
4554	NC_021908	CGG	2	6	210102	210107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832667
4555	NC_021908	ATC	2	6	210122	210127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832667
4556	NC_021908	CGTG	2	8	210159	210166	0 %	25 %	50 %	25 %	528832667
4557	NC_021908	CCT	2	6	210237	210242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528832667
4558	NC_021908	AGA	2	6	210396	210401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528832668
4559	NC_021908	CAGGAT	2	12	210407	210418	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	528832668
4560	NC_021908	GCCA	2	8	210500	210507	25 %	0 %	25 %	50 %	528832668
4561	NC_021908	CGC	2	6	210609	210614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832669
4562	NC_021908	GTTC	2	8	210627	210634	0 %	50 %	25 %	25 %	528832669
4563	NC_021908	AGCG	2	8	210654	210661	25 %	0 %	50 %	25 %	528832669
4564	NC_021908	GTC	2	6	210664	210669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832669
4565	NC_021908	CGA	2	6	210687	210692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832669
4566	NC_021908	CGC	2	6	210828	210833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832669
4567	NC_021908	TCCAGC	2	12	210838	210849	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	528832669
4568	NC_021908	CAG	2	6	210978	210983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832669
4569	NC_021908	GCA	2	6	210992	210997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832669
4570	NC_021908	GGC	2	6	211009	211014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832669
4571	NC_021908	CGC	3	9	211052	211060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832669
4572	NC_021908	CGC	2	6	211086	211091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832669
4573	NC_021908	GC	3	6	211103	211108	0 %	0 %	50 %	50 %	528832669
4574	NC_021908	TCG	2	6	211210	211215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832669
4575	NC_021908	CCA	2	6	211272	211277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528832669
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4577	NC_021908	AGG	2	6	211322	211327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528832669
4578	NC_021908	CAG	2	6	211382	211387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832670
4579	NC_021908	CAG	2	6	211418	211423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832670
4580	NC_021908	ACC	2	6	211511	211516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528832670
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4582	NC_021908	CATC	2	8	211555	211562	25 %	25 %	0 %	50 %	528832670
4583	NC_021908	CAG	2	6	211583	211588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832670
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4586	NC_021908	ATG	2	6	211740	211745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832670
4587	NC_021908	TGT	2	6	211783	211788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528832670
4588	NC_021908	AGC	2	6	211848	211853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832670
4589	NC_021908	CAA	2	6	211970	211975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528832670
4590	NC_021908	ACG	3	9	211986	211994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832670
4591	NC_021908	GC	3	6	212015	212020	0 %	0 %	50 %	50 %	528832670
4592	NC_021908	GAA	2	6	212117	212122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528832670
4593	NC_021908	GAAC	2	8	212149	212156	50 %	0 %	25 %	25 %	528832670
4594	NC_021908	CGA	3	9	212158	212166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832670
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4599	NC_021908	TCT	2	6	212554	212559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528832671
4600	NC_021908	CGA	2	6	212569	212574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832671
4601	NC_021908	TCG	2	6	212583	212588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832671
4602	NC_021908	CAG	2	6	212669	212674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832671
4603	NC_021908	CCA	2	6	212718	212723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528832671
4604	NC_021908	AT	3	6	212736	212741	50 %	50 %	0 %	0 %	528832671
4605	NC_021908	GCT	2	6	212757	212762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832671
4606	NC_021908	CGA	2	6	212809	212814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832671
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4608	NC_021908	CGGC	2	8	212883	212890	0 %	0 %	50 %	50 %	528832671
4609	NC_021908	CGG	2	6	212936	212941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832671
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4614	NC_021908	GCC	2	6	213005	213010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832671
4615	NC_021908	CGAC	2	8	213076	213083	25 %	0 %	25 %	50 %	528832671
4616	NC_021908	GAA	2	6	213086	213091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528832671
4617	NC_021908	GGC	2	6	213101	213106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832671
4618	NC_021908	CGA	2	6	213116	213121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832671
4619	NC_021908	GAA	2	6	213170	213175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528832671
4620	NC_021908	CGT	2	6	213203	213208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832671
4621	NC_021908	ATC	2	6	213263	213268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832671
4622	NC_021908	TGA	2	6	213298	213303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832671
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4624	NC_021908	AGCG	2	8	213416	213423	25 %	0 %	50 %	25 %	528832671
4625	NC_021908	GCG	2	6	213684	213689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832671
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4628	NC_021908	GCG	2	6	214177	214182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832672
4629	NC_021908	GCA	2	6	214240	214245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832672
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4631	NC_021908	GCT	2	6	214508	214513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832672
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4634	NC_021908	TTC	2	6	214692	214697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528832672
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4639	NC_021908	AGTG	2	8	214948	214955	25 %	25 %	50 %	0 %	528832672
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4642	NC_021908	CAC	2	6	215076	215081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528832673
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4649	NC_021908	TCA	2	6	215765	215770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832674
4650	NC_021908	AAATG	2	10	215778	215787	60 %	20 %	20 %	0 %	528832674
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4652	NC_021908	TCG	2	6	216007	216012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832675
4653	NC_021908	CCA	2	6	216014	216019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528832675
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4699	NC_021908	GCT	2	6	220436	220441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832677
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4702	NC_021908	TTCGA	2	10	220486	220495	20 %	40 %	20 %	20 %	528832677
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4704	NC_021908	ATC	2	6	220651	220656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832677
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4708	NC_021908	ATTGCC	2	12	221984	221995	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	528832678
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4712	NC_021908	CAT	2	6	222184	222189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832678
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4721	NC_021908	CAT	2	6	222610	222615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832678
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4724	NC_021908	TCC	2	6	222840	222845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528832678
4725	NC_021908	TCA	2	6	222900	222905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832678
4726	NC_021908	CGA	2	6	222915	222920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832678
4727	NC_021908	CATAAG	2	12	222964	222975	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	528832678
4728	NC_021908	CGC	2	6	222976	222981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832678
4729	NC_021908	ATC	2	6	222999	223004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832678
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4731	NC_021908	TTG	2	6	223131	223136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528832678
4732	NC_021908	GCCG	2	8	223208	223215	0 %	0 %	50 %	50 %	528832678
4733	NC_021908	GAC	2	6	223223	223228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832678
4734	NC_021908	GCGG	2	8	223256	223263	0 %	0 %	75 %	25 %	528832678
4735	NC_021908	TGC	2	6	223413	223418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832678
4736	NC_021908	CG	3	6	223455	223460	0 %	0 %	50 %	50 %	528832678
4737	NC_021908	AGAC	2	8	223482	223489	50 %	0 %	25 %	25 %	528832678
4738	NC_021908	CCA	2	6	223495	223500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528832678
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4740	NC_021908	CGG	3	9	223531	223539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832678
4741	NC_021908	GTC	2	6	223550	223555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832678
4742	NC_021908	GCT	2	6	223622	223627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832678
4743	NC_021908	CT	3	6	223626	223631	0 %	50 %	0 %	50 %	528832678
4744	NC_021908	GAT	2	6	223693	223698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832678
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4746	NC_021908	CAT	2	6	223718	223723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832678
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4748	NC_021908	GCT	2	6	225266	225271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832679
4749	NC_021908	TCG	2	6	225331	225336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832679
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4760	NC_021908	GA	3	6	226008	226013	50 %	0 %	50 %	0 %	528832680
4761	NC_021908	GAT	2	6	226064	226069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832680
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4777	NC_021908	A	7	7	226875	226881	100 %	0 %	0 %	0 %	528832680
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4981	NC_021908	GGA	2	6	236233	236238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528832688
4982	NC_021908	CGC	2	6	236278	236283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832688
4983	NC_021908	CG	3	6	236304	236309	0 %	0 %	50 %	50 %	528832688
4984	NC_021908	TCA	2	6	236328	236333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832688
4985	NC_021908	CCA	2	6	236359	236364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528832688
4986	NC_021908	CGA	2	6	236488	236493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832688
4987	NC_021908	AAT	2	6	236622	236627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528832688
4988	NC_021908	ATT	2	6	236734	236739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528832688
4989	NC_021908	GC	3	6	236741	236746	0 %	0 %	50 %	50 %	528832688
4990	NC_021908	GGC	2	6	236749	236754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832688
4991	NC_021908	CCG	2	6	236790	236795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832688
4992	NC_021908	TCT	2	6	236802	236807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528832688
4993	NC_021908	GGGA	2	8	236894	236901	25 %	0 %	75 %	0 %	528832688
4994	NC_021908	AGC	2	6	236948	236953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832688
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4997	NC_021908	AT	3	6	237353	237358	50 %	50 %	0 %	0 %	528832689
4998	NC_021908	ATC	2	6	237361	237366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832689
4999	NC_021908	CAAAGA	2	12	237384	237395	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	528832689
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