MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1b

Total Repeats: 396

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021907	GC	3	6	440	445	0 %	0 %	50 %	50 %	528831100
2	NC_021907	CG	3	6	1257	1262	0 %	0 %	50 %	50 %	528831101
3	NC_021907	GC	3	6	2045	2050	0 %	0 %	50 %	50 %	528831102
4	NC_021907	TC	3	6	2155	2160	0 %	50 %	0 %	50 %	528831102
5	NC_021907	GC	3	6	2939	2944	0 %	0 %	50 %	50 %	528831102
6	NC_021907	GC	3	6	4380	4385	0 %	0 %	50 %	50 %	528831103
7	NC_021907	CT	3	6	4913	4918	0 %	50 %	0 %	50 %	528831104
8	NC_021907	GC	3	6	5170	5175	0 %	0 %	50 %	50 %	528831105
9	NC_021907	GC	3	6	8670	8675	0 %	0 %	50 %	50 %	528831107
10	NC_021907	AT	3	6	8931	8936	50 %	50 %	0 %	0 %	528831108
11	NC_021907	TC	3	6	9217	9222	0 %	50 %	0 %	50 %	528831108
12	NC_021907	GC	3	6	10224	10229	0 %	0 %	50 %	50 %	528831109
13	NC_021907	GC	3	6	10503	10508	0 %	0 %	50 %	50 %	528831109
14	NC_021907	CG	3	6	11034	11039	0 %	0 %	50 %	50 %	528831110
15	NC_021907	GC	3	6	11632	11637	0 %	0 %	50 %	50 %	528831112
16	NC_021907	GC	3	6	12957	12962	0 %	0 %	50 %	50 %	528831116
17	NC_021907	GC	4	8	13273	13280	0 %	0 %	50 %	50 %	528831116
18	NC_021907	GC	3	6	13343	13348	0 %	0 %	50 %	50 %	528831116
19	NC_021907	CG	3	6	13733	13738	0 %	0 %	50 %	50 %	528831117
20	NC_021907	TC	3	6	14340	14345	0 %	50 %	0 %	50 %	528831117
21	NC_021907	TG	3	6	14613	14618	0 %	50 %	50 %	0 %	528831118
22	NC_021907	GC	3	6	14731	14736	0 %	0 %	50 %	50 %	528831118
23	NC_021907	GC	4	8	14878	14885	0 %	0 %	50 %	50 %	528831118
24	NC_021907	GC	3	6	15668	15673	0 %	0 %	50 %	50 %	528831119
25	NC_021907	CG	3	6	16010	16015	0 %	0 %	50 %	50 %	528831119
26	NC_021907	GT	3	6	17070	17075	0 %	50 %	50 %	0 %	528831120
27	NC_021907	CT	3	6	17332	17337	0 %	50 %	0 %	50 %	528831120
28	NC_021907	GC	3	6	17600	17605	0 %	0 %	50 %	50 %	528831120
29	NC_021907	CG	3	6	17732	17737	0 %	0 %	50 %	50 %	528831120
30	NC_021907	CG	3	6	20032	20037	0 %	0 %	50 %	50 %	528831123
31	NC_021907	GC	3	6	20084	20089	0 %	0 %	50 %	50 %	528831123
32	NC_021907	CG	3	6	21548	21553	0 %	0 %	50 %	50 %	528831125
33	NC_021907	CG	4	8	21884	21891	0 %	0 %	50 %	50 %	528831125
34	NC_021907	GC	3	6	22510	22515	0 %	0 %	50 %	50 %	528831126
35	NC_021907	GC	3	6	23339	23344	0 %	0 %	50 %	50 %	528831126
36	NC_021907	GA	3	6	23416	23421	50 %	0 %	50 %	0 %	528831126
37	NC_021907	TC	3	6	24171	24176	0 %	50 %	0 %	50 %	528831127
38	NC_021907	GC	3	6	24188	24193	0 %	0 %	50 %	50 %	528831127
39	NC_021907	GC	3	6	25009	25014	0 %	0 %	50 %	50 %	528831128
40	NC_021907	CG	4	8	27912	27919	0 %	0 %	50 %	50 %	528831131
41	NC_021907	CG	3	6	28203	28208	0 %	0 %	50 %	50 %	528831132
42	NC_021907	GC	3	6	28343	28348	0 %	0 %	50 %	50 %	528831132
43	NC_021907	GC	3	6	28721	28726	0 %	0 %	50 %	50 %	528831132
44	NC_021907	CG	4	8	29387	29394	0 %	0 %	50 %	50 %	528831132
45	NC_021907	GC	3	6	30078	30083	0 %	0 %	50 %	50 %	528831133
46	NC_021907	AG	3	6	30347	30352	50 %	0 %	50 %	0 %	528831133
47	NC_021907	CG	3	6	30369	30374	0 %	0 %	50 %	50 %	528831133
48	NC_021907	CG	3	6	30930	30935	0 %	0 %	50 %	50 %	528831134
49	NC_021907	AG	3	6	30987	30992	50 %	0 %	50 %	0 %	528831134
50	NC_021907	CG	3	6	31104	31109	0 %	0 %	50 %	50 %	528831135
51	NC_021907	TC	3	6	31411	31416	0 %	50 %	0 %	50 %	528831135
52	NC_021907	GC	3	6	31565	31570	0 %	0 %	50 %	50 %	528831136
53	NC_021907	GC	3	6	32027	32032	0 %	0 %	50 %	50 %	528831136
54	NC_021907	CG	3	6	32803	32808	0 %	0 %	50 %	50 %	528831137
55	NC_021907	GA	3	6	32850	32855	50 %	0 %	50 %	0 %	528831137
56	NC_021907	CG	3	6	33109	33114	0 %	0 %	50 %	50 %	528831137
57	NC_021907	GA	3	6	34034	34039	50 %	0 %	50 %	0 %	528831138
58	NC_021907	AG	3	6	34062	34067	50 %	0 %	50 %	0 %	528831138
59	NC_021907	AG	4	8	35234	35241	50 %	0 %	50 %	0 %	528831139
60	NC_021907	GC	3	6	36854	36859	0 %	0 %	50 %	50 %	528831140
61	NC_021907	CG	3	6	37084	37089	0 %	0 %	50 %	50 %	528831140
62	NC_021907	TC	3	6	37815	37820	0 %	50 %	0 %	50 %	528831140
63	NC_021907	GC	3	6	37829	37834	0 %	0 %	50 %	50 %	528831140
64	NC_021907	CG	3	6	38201	38206	0 %	0 %	50 %	50 %	528831141
65	NC_021907	GC	3	6	38207	38212	0 %	0 %	50 %	50 %	528831141
66	NC_021907	GC	3	6	38348	38353	0 %	0 %	50 %	50 %	528831141
67	NC_021907	CG	3	6	38775	38780	0 %	0 %	50 %	50 %	528831141
68	NC_021907	CG	3	6	42012	42017	0 %	0 %	50 %	50 %	528831144
69	NC_021907	GC	3	6	42063	42068	0 %	0 %	50 %	50 %	528831144
70	NC_021907	GC	3	6	42342	42347	0 %	0 %	50 %	50 %	528831144
71	NC_021907	CG	3	6	42908	42913	0 %	0 %	50 %	50 %	528831144
72	NC_021907	AT	3	6	43230	43235	50 %	50 %	0 %	0 %	528831145
73	NC_021907	CG	3	6	43256	43261	0 %	0 %	50 %	50 %	528831145
74	NC_021907	GC	3	6	43408	43413	0 %	0 %	50 %	50 %	528831145
75	NC_021907	GC	3	6	43461	43466	0 %	0 %	50 %	50 %	528831145
76	NC_021907	CG	3	6	43523	43528	0 %	0 %	50 %	50 %	528831145
77	NC_021907	GC	3	6	43932	43937	0 %	0 %	50 %	50 %	528831145
78	NC_021907	CG	3	6	44566	44571	0 %	0 %	50 %	50 %	528831146
79	NC_021907	CG	3	6	45502	45507	0 %	0 %	50 %	50 %	528831147
80	NC_021907	GC	3	6	46428	46433	0 %	0 %	50 %	50 %	528831148
81	NC_021907	GC	3	6	48601	48606	0 %	0 %	50 %	50 %	528831149
82	NC_021907	GC	3	6	49243	49248	0 %	0 %	50 %	50 %	528831150
83	NC_021907	GC	3	6	49611	49616	0 %	0 %	50 %	50 %	528831150
84	NC_021907	GC	3	6	49646	49651	0 %	0 %	50 %	50 %	528831150
85	NC_021907	GC	5	10	50049	50058	0 %	0 %	50 %	50 %	528831151
86	NC_021907	GC	3	6	50370	50375	0 %	0 %	50 %	50 %	528831151
87	NC_021907	CG	4	8	50509	50516	0 %	0 %	50 %	50 %	528831151
88	NC_021907	GC	3	6	50634	50639	0 %	0 %	50 %	50 %	528831151
89	NC_021907	GC	3	6	52172	52177	0 %	0 %	50 %	50 %	528831152
90	NC_021907	AT	3	6	52771	52776	50 %	50 %	0 %	0 %	528831152
91	NC_021907	GC	3	6	52856	52861	0 %	0 %	50 %	50 %	528831152
92	NC_021907	AG	3	6	54322	54327	50 %	0 %	50 %	0 %	528831153
93	NC_021907	GC	3	6	54957	54962	0 %	0 %	50 %	50 %	528831153
94	NC_021907	AG	3	6	55247	55252	50 %	0 %	50 %	0 %	528831153
95	NC_021907	GC	3	6	56753	56758	0 %	0 %	50 %	50 %	528831155
96	NC_021907	GC	3	6	57154	57159	0 %	0 %	50 %	50 %	528831155
97	NC_021907	CG	3	6	57278	57283	0 %	0 %	50 %	50 %	528831155
98	NC_021907	CA	3	6	58023	58028	50 %	0 %	0 %	50 %	528831156
99	NC_021907	GC	3	6	58760	58765	0 %	0 %	50 %	50 %	528831156
100	NC_021907	GC	3	6	59516	59521	0 %	0 %	50 %	50 %	528831157
101	NC_021907	GC	4	8	60527	60534	0 %	0 %	50 %	50 %	528831159
102	NC_021907	GC	5	10	60775	60784	0 %	0 %	50 %	50 %	528831159
103	NC_021907	AT	3	6	61690	61695	50 %	50 %	0 %	0 %	528831159
104	NC_021907	TC	3	6	62513	62518	0 %	50 %	0 %	50 %	528831160
105	NC_021907	CG	3	6	62519	62524	0 %	0 %	50 %	50 %	528831160
106	NC_021907	GC	3	6	62855	62860	0 %	0 %	50 %	50 %	528831160
107	NC_021907	CG	3	6	63743	63748	0 %	0 %	50 %	50 %	528831160
108	NC_021907	CG	3	6	63779	63784	0 %	0 %	50 %	50 %	528831160
109	NC_021907	GC	4	8	64164	64171	0 %	0 %	50 %	50 %	528831161
110	NC_021907	GC	3	6	64323	64328	0 %	0 %	50 %	50 %	528831161
111	NC_021907	CT	3	6	64621	64626	0 %	50 %	0 %	50 %	528831161
112	NC_021907	GC	3	6	64818	64823	0 %	0 %	50 %	50 %	528831161
113	NC_021907	CG	3	6	66312	66317	0 %	0 %	50 %	50 %	528831164
114	NC_021907	GC	3	6	66359	66364	0 %	0 %	50 %	50 %	528831164
115	NC_021907	GC	4	8	66684	66691	0 %	0 %	50 %	50 %	528831164
116	NC_021907	GC	3	6	67095	67100	0 %	0 %	50 %	50 %	528831165
117	NC_021907	GC	4	8	67789	67796	0 %	0 %	50 %	50 %	528831165
118	NC_021907	CG	3	6	68345	68350	0 %	0 %	50 %	50 %	528831166
119	NC_021907	GC	3	6	68711	68716	0 %	0 %	50 %	50 %	528831166
120	NC_021907	TG	3	6	69303	69308	0 %	50 %	50 %	0 %	528831167
121	NC_021907	AC	3	6	69586	69591	50 %	0 %	0 %	50 %	528831167
122	NC_021907	GC	3	6	71747	71752	0 %	0 %	50 %	50 %	528831169
123	NC_021907	GC	3	6	73141	73146	0 %	0 %	50 %	50 %	528831170
124	NC_021907	GC	3	6	73361	73366	0 %	0 %	50 %	50 %	528831170
125	NC_021907	GC	5	10	74812	74821	0 %	0 %	50 %	50 %	528831171
126	NC_021907	GC	3	6	75010	75015	0 %	0 %	50 %	50 %	528831171
127	NC_021907	GC	3	6	76661	76666	0 %	0 %	50 %	50 %	528831173
128	NC_021907	GC	3	6	77948	77953	0 %	0 %	50 %	50 %	528831174
129	NC_021907	GC	3	6	77971	77976	0 %	0 %	50 %	50 %	528831174
130	NC_021907	GC	3	6	78074	78079	0 %	0 %	50 %	50 %	528831174
131	NC_021907	GC	3	6	78351	78356	0 %	0 %	50 %	50 %	528831175
132	NC_021907	CG	3	6	78376	78381	0 %	0 %	50 %	50 %	528831175
133	NC_021907	CG	3	6	78630	78635	0 %	0 %	50 %	50 %	528831175
134	NC_021907	TC	3	6	81120	81125	0 %	50 %	0 %	50 %	528831178
135	NC_021907	CG	3	6	83924	83929	0 %	0 %	50 %	50 %	528831180
136	NC_021907	CG	3	6	85188	85193	0 %	0 %	50 %	50 %	528831182
137	NC_021907	AC	3	6	85868	85873	50 %	0 %	0 %	50 %	528831182
138	NC_021907	GC	3	6	86230	86235	0 %	0 %	50 %	50 %	528831182
139	NC_021907	AG	3	6	86236	86241	50 %	0 %	50 %	0 %	528831182
140	NC_021907	CT	3	6	86986	86991	0 %	50 %	0 %	50 %	528831182
141	NC_021907	GC	3	6	87142	87147	0 %	0 %	50 %	50 %	528831182
142	NC_021907	TC	3	6	87309	87314	0 %	50 %	0 %	50 %	528831182
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.