MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1b

Total Repeats: 551

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021907	TACC	2	8	1327	1334	25 %	25 %	0 %	50 %	528831101
2	NC_021907	CGAT	2	8	2253	2260	25 %	25 %	25 %	25 %	528831102
3	NC_021907	CGGC	2	8	3225	3232	0 %	0 %	50 %	50 %	528831102
4	NC_021907	GCGA	2	8	3575	3582	25 %	0 %	50 %	25 %	528831103
5	NC_021907	CATG	2	8	3613	3620	25 %	25 %	25 %	25 %	528831103
6	NC_021907	ATCA	2	8	4217	4224	50 %	25 %	0 %	25 %	528831103
7	NC_021907	CACC	2	8	4974	4981	25 %	0 %	0 %	75 %	528831104
8	NC_021907	GTCG	2	8	5922	5929	0 %	25 %	50 %	25 %	528831105
9	NC_021907	ATCA	2	8	6241	6248	50 %	25 %	0 %	25 %	528831105
10	NC_021907	ACCA	2	8	7486	7493	50 %	0 %	0 %	50 %	528831106
11	NC_021907	CCCG	2	8	7860	7867	0 %	0 %	25 %	75 %	528831106
12	NC_021907	TGGC	2	8	8017	8024	0 %	25 %	50 %	25 %	528831107
13	NC_021907	ACCA	2	8	8502	8509	50 %	0 %	0 %	50 %	528831107
14	NC_021907	CGCA	2	8	8644	8651	25 %	0 %	25 %	50 %	528831107
15	NC_021907	GATC	2	8	8721	8728	25 %	25 %	25 %	25 %	528831107
16	NC_021907	CTTT	2	8	9103	9110	0 %	75 %	0 %	25 %	528831108
17	NC_021907	GCCG	3	12	9251	9262	0 %	0 %	50 %	50 %	528831108
18	NC_021907	CGGC	2	8	9486	9493	0 %	0 %	50 %	50 %	528831108
19	NC_021907	GCCG	2	8	9497	9504	0 %	0 %	50 %	50 %	528831108
20	NC_021907	CGAC	2	8	10604	10611	25 %	0 %	25 %	50 %	528831109
21	NC_021907	GATC	2	8	11015	11022	25 %	25 %	25 %	25 %	528831110
22	NC_021907	ATGA	2	8	11320	11327	50 %	25 %	25 %	0 %	528831111
23	NC_021907	TTGC	2	8	12539	12546	0 %	50 %	25 %	25 %	528831115
24	NC_021907	TCTG	2	8	13059	13066	0 %	50 %	25 %	25 %	528831116
25	NC_021907	GGCC	2	8	13291	13298	0 %	0 %	50 %	50 %	528831116
26	NC_021907	CGAA	2	8	13905	13912	50 %	0 %	25 %	25 %	528831117
27	NC_021907	AAGA	2	8	14018	14025	75 %	0 %	25 %	0 %	528831117
28	NC_021907	GATC	2	8	14516	14523	25 %	25 %	25 %	25 %	528831118
29	NC_021907	TCGA	2	8	14637	14644	25 %	25 %	25 %	25 %	528831118
30	NC_021907	GACC	2	8	14854	14861	25 %	0 %	25 %	50 %	528831118
31	NC_021907	GGAA	2	8	15051	15058	50 %	0 %	50 %	0 %	528831118
32	NC_021907	GCAA	2	8	16270	16277	50 %	0 %	25 %	25 %	528831119
33	NC_021907	GCCG	3	12	16664	16675	0 %	0 %	50 %	50 %	528831120
34	NC_021907	GGTC	2	8	17278	17285	0 %	25 %	50 %	25 %	528831120
35	NC_021907	GGCC	2	8	17317	17324	0 %	0 %	50 %	50 %	528831120
36	NC_021907	CTGG	2	8	17573	17580	0 %	25 %	50 %	25 %	528831120
37	NC_021907	GCGG	2	8	18626	18633	0 %	0 %	75 %	25 %	528831121
38	NC_021907	GGGC	2	8	19088	19095	0 %	0 %	75 %	25 %	528831122
39	NC_021907	CGGT	2	8	19181	19188	0 %	25 %	50 %	25 %	528831122
40	NC_021907	GCCG	2	8	19443	19450	0 %	0 %	50 %	50 %	528831122
41	NC_021907	GGGC	2	8	19485	19492	0 %	0 %	75 %	25 %	528831122
42	NC_021907	GATC	2	8	19602	19609	25 %	25 %	25 %	25 %	528831123
43	NC_021907	CGGC	2	8	19767	19774	0 %	0 %	50 %	50 %	528831123
44	NC_021907	CTGC	2	8	19823	19830	0 %	25 %	25 %	50 %	528831123
45	NC_021907	GCAA	2	8	20011	20018	50 %	0 %	25 %	25 %	528831123
46	NC_021907	AAGG	2	8	20069	20076	50 %	0 %	50 %	0 %	528831123
47	NC_021907	GCAA	2	8	20911	20918	50 %	0 %	25 %	25 %	528831124
48	NC_021907	CCGA	2	8	21043	21050	25 %	0 %	25 %	50 %	528831124
49	NC_021907	GCCA	2	8	21399	21406	25 %	0 %	25 %	50 %	528831125
50	NC_021907	GCAT	2	8	21466	21473	25 %	25 %	25 %	25 %	528831125
51	NC_021907	CAGC	2	8	22854	22861	25 %	0 %	25 %	50 %	528831126
52	NC_021907	AGGC	2	8	22976	22983	25 %	0 %	50 %	25 %	528831126
53	NC_021907	TCGA	2	8	23422	23429	25 %	25 %	25 %	25 %	528831126
54	NC_021907	CGAC	2	8	24421	24428	25 %	0 %	25 %	50 %	528831128
55	NC_021907	TGCC	2	8	24766	24773	0 %	25 %	25 %	50 %	528831128
56	NC_021907	GATC	2	8	25807	25814	25 %	25 %	25 %	25 %	528831129
57	NC_021907	CTGG	2	8	26389	26396	0 %	25 %	50 %	25 %	528831130
58	NC_021907	GTTC	2	8	26533	26540	0 %	50 %	25 %	25 %	528831130
59	NC_021907	TCGA	2	8	26739	26746	25 %	25 %	25 %	25 %	528831130
60	NC_021907	GGTG	2	8	27319	27326	0 %	25 %	75 %	0 %	528831131
61	NC_021907	CACG	2	8	27616	27623	25 %	0 %	25 %	50 %	528831131
62	NC_021907	GCCG	2	8	28565	28572	0 %	0 %	50 %	50 %	528831132
63	NC_021907	AAAC	2	8	31417	31424	75 %	0 %	0 %	25 %	528831135
64	NC_021907	CTCC	2	8	31506	31513	0 %	25 %	0 %	75 %	528831136
65	NC_021907	GCGA	2	8	32159	32166	25 %	0 %	50 %	25 %	528831136
66	NC_021907	GGCA	2	8	34452	34459	25 %	0 %	50 %	25 %	528831139
67	NC_021907	GCTG	2	8	34571	34578	0 %	25 %	50 %	25 %	528831139
68	NC_021907	GGGC	2	8	34595	34602	0 %	0 %	75 %	25 %	528831139
69	NC_021907	GAAC	2	8	34937	34944	50 %	0 %	25 %	25 %	528831139
70	NC_021907	AGCC	2	8	35999	36006	25 %	0 %	25 %	50 %	528831140
71	NC_021907	CGGC	2	8	36234	36241	0 %	0 %	50 %	50 %	528831140
72	NC_021907	TGGA	2	8	36475	36482	25 %	25 %	50 %	0 %	528831140
73	NC_021907	AGGA	2	8	36737	36744	50 %	0 %	50 %	0 %	528831140
74	NC_021907	CAGC	2	8	36757	36764	25 %	0 %	25 %	50 %	528831140
75	NC_021907	AAAT	2	8	37382	37389	75 %	25 %	0 %	0 %	528831140
76	NC_021907	TCGA	2	8	38021	38028	25 %	25 %	25 %	25 %	528831141
77	NC_021907	CTTC	2	8	38269	38276	0 %	50 %	0 %	50 %	528831141
78	NC_021907	CGGT	2	8	38478	38485	0 %	25 %	50 %	25 %	528831141
79	NC_021907	TTGC	2	8	38564	38571	0 %	50 %	25 %	25 %	528831141
80	NC_021907	GGCG	2	8	39618	39625	0 %	0 %	75 %	25 %	528831142
81	NC_021907	CGAT	2	8	40403	40410	25 %	25 %	25 %	25 %	528831143
82	NC_021907	CGTC	2	8	40809	40816	0 %	25 %	25 %	50 %	528831143
83	NC_021907	CCGG	2	8	40848	40855	0 %	0 %	50 %	50 %	528831143
84	NC_021907	GAGG	2	8	40874	40881	25 %	0 %	75 %	0 %	528831143
85	NC_021907	TCGC	2	8	41564	41571	0 %	25 %	25 %	50 %	528831144
86	NC_021907	GGCG	2	8	41711	41718	0 %	0 %	75 %	25 %	528831144
87	NC_021907	TCAT	2	8	42322	42329	25 %	50 %	0 %	25 %	528831144
88	NC_021907	ATCT	2	8	42435	42442	25 %	50 %	0 %	25 %	528831144
89	NC_021907	GGTC	2	8	43374	43381	0 %	25 %	50 %	25 %	528831145
90	NC_021907	GGCC	2	8	43863	43870	0 %	0 %	50 %	50 %	528831145
91	NC_021907	CGTC	2	8	44545	44552	0 %	25 %	25 %	50 %	528831146
92	NC_021907	GTCC	2	8	44695	44702	0 %	25 %	25 %	50 %	528831146
93	NC_021907	CTGG	2	8	44783	44790	0 %	25 %	50 %	25 %	528831146
94	NC_021907	GACA	2	8	45414	45421	50 %	0 %	25 %	25 %	528831147
95	NC_021907	GTCC	2	8	47111	47118	0 %	25 %	25 %	50 %	528831148
96	NC_021907	GAAC	2	8	49114	49121	50 %	0 %	25 %	25 %	528831150
97	NC_021907	CGGC	2	8	49138	49145	0 %	0 %	50 %	50 %	528831150
98	NC_021907	AAGC	2	8	49486	49493	50 %	0 %	25 %	25 %	528831150
99	NC_021907	CCGC	2	8	49596	49603	0 %	0 %	25 %	75 %	528831150
100	NC_021907	CGGG	3	12	50215	50226	0 %	0 %	75 %	25 %	528831151
101	NC_021907	CTGC	2	8	50270	50277	0 %	25 %	25 %	50 %	528831151
102	NC_021907	CGGT	2	8	50595	50602	0 %	25 %	50 %	25 %	528831151
103	NC_021907	GGCA	2	8	51466	51473	25 %	0 %	50 %	25 %	528831152
104	NC_021907	CGGC	2	8	51586	51593	0 %	0 %	50 %	50 %	528831152
105	NC_021907	GAAG	2	8	51679	51686	50 %	0 %	50 %	0 %	528831152
106	NC_021907	CGAT	2	8	51958	51965	25 %	25 %	25 %	25 %	528831152
107	NC_021907	TTGC	2	8	52415	52422	0 %	50 %	25 %	25 %	528831152
108	NC_021907	CGAG	2	8	52867	52874	25 %	0 %	50 %	25 %	528831152
109	NC_021907	ATCG	2	8	53027	53034	25 %	25 %	25 %	25 %	528831152
110	NC_021907	GGCG	2	8	53056	53063	0 %	0 %	75 %	25 %	528831152
111	NC_021907	GACA	2	8	53183	53190	50 %	0 %	25 %	25 %	528831152
112	NC_021907	CGAC	2	8	53575	53582	25 %	0 %	25 %	50 %	528831152
113	NC_021907	CGGA	2	8	54559	54566	25 %	0 %	50 %	25 %	528831153
114	NC_021907	CCAC	2	8	55195	55202	25 %	0 %	0 %	75 %	528831153
115	NC_021907	AGGA	2	8	55659	55666	50 %	0 %	50 %	0 %	528831154
116	NC_021907	CGAC	2	8	55971	55978	25 %	0 %	25 %	50 %	528831154
117	NC_021907	GTCC	2	8	56239	56246	0 %	25 %	25 %	50 %	528831154
118	NC_021907	CCGG	2	8	56620	56627	0 %	0 %	50 %	50 %	528831155
119	NC_021907	CCGG	2	8	57071	57078	0 %	0 %	50 %	50 %	528831155
120	NC_021907	CGGG	2	8	57351	57358	0 %	0 %	75 %	25 %	528831155
121	NC_021907	CAGG	2	8	57444	57451	25 %	0 %	50 %	25 %	528831155
122	NC_021907	AGCC	2	8	58091	58098	25 %	0 %	25 %	50 %	528831156
123	NC_021907	CTCG	2	8	58157	58164	0 %	25 %	25 %	50 %	528831156
124	NC_021907	TCGC	2	8	58926	58933	0 %	25 %	25 %	50 %	528831156
125	NC_021907	TGAT	2	8	59307	59314	25 %	50 %	25 %	0 %	528831157
126	NC_021907	GGAT	2	8	59331	59338	25 %	25 %	50 %	0 %	528831157
127	NC_021907	ATCG	2	8	59426	59433	25 %	25 %	25 %	25 %	528831157
128	NC_021907	GAGC	3	12	59468	59479	25 %	0 %	50 %	25 %	528831157
129	NC_021907	CGGC	2	8	59539	59546	0 %	0 %	50 %	50 %	528831157
130	NC_021907	CCGA	2	8	60215	60222	25 %	0 %	25 %	50 %	528831158
131	NC_021907	CGGC	2	8	60422	60429	0 %	0 %	50 %	50 %	528831158
132	NC_021907	GTCG	2	8	60959	60966	0 %	25 %	50 %	25 %	528831159
133	NC_021907	CTGC	2	8	61922	61929	0 %	25 %	25 %	50 %	528831159
134	NC_021907	GAAA	2	8	62041	62048	75 %	0 %	25 %	0 %	528831159
135	NC_021907	GGAT	2	8	62059	62066	25 %	25 %	50 %	0 %	528831159
136	NC_021907	CAGA	2	8	62111	62118	50 %	0 %	25 %	25 %	528831159
137	NC_021907	CAGG	2	8	62352	62359	25 %	0 %	50 %	25 %	528831160
138	NC_021907	GGCG	2	8	62423	62430	0 %	0 %	75 %	25 %	528831160
139	NC_021907	CGAT	2	8	63886	63893	25 %	25 %	25 %	25 %	528831160
140	NC_021907	CCCG	2	8	63928	63935	0 %	0 %	25 %	75 %	528831161
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