MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1b

Total Repeats: 5334

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021907	CG	3	6	168083	168088	0 %	0 %	50 %	50 %	528831251
3502	NC_021907	CAT	2	6	168132	168137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831251
3503	NC_021907	CGGC	2	8	168176	168183	0 %	0 %	50 %	50 %	528831251
3504	NC_021907	TCG	2	6	168190	168195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831251
3505	NC_021907	CGC	2	6	168213	168218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831251
3506	NC_021907	CAA	2	6	168234	168239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528831251
3507	NC_021907	CTT	3	9	168301	168309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528831251
3508	NC_021907	CAT	2	6	168381	168386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831251
3509	NC_021907	GC	4	8	168411	168418	0 %	0 %	50 %	50 %	528831251
3510	NC_021907	GGT	2	6	168447	168452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528831251
3511	NC_021907	GAA	2	6	168472	168477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528831251
3512	NC_021907	ATCA	2	8	168481	168488	50 %	25 %	0 %	25 %	528831251
3513	NC_021907	GCT	2	6	168522	168527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831251
3514	NC_021907	GCCA	2	8	168541	168548	25 %	0 %	25 %	50 %	528831251
3515	NC_021907	GGT	2	6	168574	168579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528831251
3516	NC_021907	ACG	2	6	168580	168585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831251
3517	NC_021907	GC	3	6	168586	168591	0 %	0 %	50 %	50 %	528831251
3518	NC_021907	CG	3	6	168596	168601	0 %	0 %	50 %	50 %	528831251
3519	NC_021907	CAGC	2	8	168603	168610	25 %	0 %	25 %	50 %	528831251
3520	NC_021907	GAA	2	6	168637	168642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528831251
3521	NC_021907	CCGGG	2	10	168655	168664	0 %	0 %	60 %	40 %	528831251
3522	NC_021907	GCC	2	6	168681	168686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831251
3523	NC_021907	GGC	2	6	168703	168708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831251
3524	NC_021907	CTG	2	6	168724	168729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831251
3525	NC_021907	TCG	2	6	168865	168870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831251
3526	NC_021907	ACG	2	6	168889	168894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831251
3527	NC_021907	GCC	2	6	168920	168925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831251
3528	NC_021907	GCC	2	6	168928	168933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831251
3529	NC_021907	CTG	2	6	168940	168945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831251
3530	NC_021907	CGA	2	6	168978	168983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831251
3531	NC_021907	GTC	2	6	169006	169011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831251
3532	NC_021907	TGC	2	6	169085	169090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831252
3533	NC_021907	TCGC	2	8	169093	169100	0 %	25 %	25 %	50 %	528831252
3534	NC_021907	GGC	2	6	169110	169115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831252
3535	NC_021907	AGC	2	6	169147	169152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831252
3536	NC_021907	GC	3	6	169170	169175	0 %	0 %	50 %	50 %	528831252
3537	NC_021907	CGA	2	6	169247	169252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831252
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3539	NC_021907	GC	3	6	169333	169338	0 %	0 %	50 %	50 %	528831252
3540	NC_021907	CCGC	2	8	169340	169347	0 %	0 %	25 %	75 %	528831252
3541	NC_021907	ATG	2	6	169369	169374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831252
3542	NC_021907	GGC	2	6	169401	169406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831252
3543	NC_021907	CGG	2	6	169412	169417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831252
3544	NC_021907	CGC	2	6	169448	169453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831252
3545	NC_021907	CG	3	6	169520	169525	0 %	0 %	50 %	50 %	528831252
3546	NC_021907	AGC	2	6	169585	169590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831252
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3548	NC_021907	GCC	2	6	169716	169721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831252
3549	NC_021907	CGGCAT	2	12	169731	169742	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	528831252
3550	NC_021907	CTG	2	6	169779	169784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831252
3551	NC_021907	CGGC	2	8	169815	169822	0 %	0 %	50 %	50 %	528831252
3552	NC_021907	ATC	2	6	169912	169917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831252
3553	NC_021907	GCC	2	6	169944	169949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831252
3554	NC_021907	TAA	2	6	169957	169962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528831252
3555	NC_021907	CCG	2	6	169984	169989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831252
3556	NC_021907	GGC	2	6	170061	170066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831252
3557	NC_021907	ATGA	2	8	170067	170074	50 %	25 %	25 %	0 %	528831252
3558	NC_021907	ACG	2	6	170102	170107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831253
3559	NC_021907	GTG	2	6	170200	170205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528831253
3560	NC_021907	GCA	2	6	170211	170216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831253
3561	NC_021907	CCT	2	6	170322	170327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528831253
3562	NC_021907	CG	3	6	170343	170348	0 %	0 %	50 %	50 %	528831253
3563	NC_021907	TGA	2	6	170400	170405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831253
3564	NC_021907	TCG	2	6	170412	170417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831253
3565	NC_021907	CGA	2	6	170589	170594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831253
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3567	NC_021907	TGCCG	2	10	170687	170696	0 %	20 %	40 %	40 %	528831253
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3571	NC_021907	CGC	2	6	170880	170885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831253
3572	NC_021907	TGC	2	6	170907	170912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831253
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3580	NC_021907	GCT	3	9	171507	171515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831254
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3585	NC_021907	CG	3	6	171680	171685	0 %	0 %	50 %	50 %	528831254
3586	NC_021907	CGC	2	6	171752	171757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831254
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3589	NC_021907	GCC	2	6	171853	171858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831254
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3592	NC_021907	CGA	2	6	171948	171953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831255
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3594	NC_021907	CGA	2	6	172129	172134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831255
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3598	NC_021907	GGC	2	6	172255	172260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831255
3599	NC_021907	GGGC	2	8	172261	172268	0 %	0 %	75 %	25 %	528831255
3600	NC_021907	GTTT	2	8	172276	172283	0 %	75 %	25 %	0 %	528831255
3601	NC_021907	CG	3	6	172296	172301	0 %	0 %	50 %	50 %	528831255
3602	NC_021907	CTG	2	6	172307	172312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831255
3603	NC_021907	CAGC	2	8	172363	172370	25 %	0 %	25 %	50 %	528831255
3604	NC_021907	GCC	2	6	172384	172389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831255
3605	NC_021907	GAT	2	6	172436	172441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831255
3606	NC_021907	TGG	2	6	172443	172448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528831255
3607	NC_021907	GAG	2	6	172460	172465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528831255
3608	NC_021907	AGGG	2	8	172485	172492	25 %	0 %	75 %	0 %	528831255
3609	NC_021907	CAT	2	6	172541	172546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831256
3610	NC_021907	ATC	2	6	172557	172562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831256
3611	NC_021907	CGC	2	6	172649	172654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831256
3612	NC_021907	GGA	2	6	172664	172669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528831256
3613	NC_021907	TG	3	6	172692	172697	0 %	50 %	50 %	0 %	528831256
3614	NC_021907	CGTG	2	8	172721	172728	0 %	25 %	50 %	25 %	528831256
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3617	NC_021907	GGCAT	2	10	172851	172860	20 %	20 %	40 %	20 %	528831256
3618	NC_021907	GCG	2	6	172882	172887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831256
3619	NC_021907	CGG	2	6	172925	172930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831256
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3977	NC_021907	GTC	2	6	188387	188392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831271
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3979	NC_021907	GCT	2	6	188487	188492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831272
3980	NC_021907	GCT	2	6	188520	188525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831272
3981	NC_021907	GTG	2	6	188536	188541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528831272
3982	NC_021907	TCA	2	6	188549	188554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831272
3983	NC_021907	GCG	2	6	188585	188590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831272
3984	NC_021907	GCT	2	6	188604	188609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831272
3985	NC_021907	CTT	2	6	188628	188633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528831272
3986	NC_021907	CGC	2	6	188642	188647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831272
3987	NC_021907	TGC	2	6	188690	188695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831272
3988	NC_021907	CTT	3	9	188748	188756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528831272
3989	NC_021907	GCC	2	6	188758	188763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831272
3990	NC_021907	GCG	2	6	188810	188815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831272
3991	NC_021907	CTTG	2	8	188817	188824	0 %	50 %	25 %	25 %	528831272
3992	NC_021907	GCCG	2	8	188848	188855	0 %	0 %	50 %	50 %	528831272
3993	NC_021907	CG	3	6	188903	188908	0 %	0 %	50 %	50 %	528831272
3994	NC_021907	GA	3	6	188939	188944	50 %	0 %	50 %	0 %	528831272
3995	NC_021907	ACGGTG	2	12	188980	188991	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	528831272
3996	NC_021907	CAA	2	6	189012	189017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528831272
3997	NC_021907	GCT	2	6	189033	189038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831272
3998	NC_021907	GCT	2	6	189051	189056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831272
3999	NC_021907	GTC	2	6	189058	189063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831272
4000	NC_021907	CAC	2	6	189226	189231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528831273

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