MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1b

Total Repeats: 5334

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_021907	AG	3	6	146770	146775	50 %	0 %	50 %	0 %	528831234
3002	NC_021907	ACCG	2	8	146779	146786	25 %	0 %	25 %	50 %	528831234
3003	NC_021907	CGT	2	6	146808	146813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831234
3004	NC_021907	CCG	2	6	146825	146830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831234
3005	NC_021907	GGCG	2	8	146901	146908	0 %	0 %	75 %	25 %	528831234
3006	NC_021907	TGC	2	6	147020	147025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831234
3007	NC_021907	AAG	2	6	147037	147042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528831234
3008	NC_021907	AGC	2	6	147107	147112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831234
3009	NC_021907	GC	3	6	147176	147181	0 %	0 %	50 %	50 %	528831234
3010	NC_021907	CGA	2	6	147183	147188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831234
3011	NC_021907	CAA	2	6	147213	147218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528831234
3012	NC_021907	CGG	4	12	147278	147289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831234
3013	NC_021907	CGG	2	6	147297	147302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831234
3014	NC_021907	TCG	2	6	147371	147376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831234
3015	NC_021907	GGT	2	6	147390	147395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528831234
3016	NC_021907	GC	4	8	147407	147414	0 %	0 %	50 %	50 %	528831234
3017	NC_021907	ATC	2	6	147415	147420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831234
3018	NC_021907	GGA	2	6	147426	147431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528831234
3019	NC_021907	AAG	2	6	147439	147444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528831234
3020	NC_021907	GGC	2	6	147490	147495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831235
3021	NC_021907	CGG	3	9	147502	147510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831235
3022	NC_021907	CGG	3	9	147517	147525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831235
3023	NC_021907	CGA	2	6	147601	147606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831235
3024	NC_021907	GC	3	6	147648	147653	0 %	0 %	50 %	50 %	528831235
3025	NC_021907	GCC	2	6	147658	147663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831235
3026	NC_021907	GCGTG	2	10	147757	147766	0 %	20 %	60 %	20 %	528831235
3027	NC_021907	GCC	2	6	147782	147787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831235
3028	NC_021907	GC	3	6	147788	147793	0 %	0 %	50 %	50 %	528831235
3029	NC_021907	CTG	2	6	147827	147832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831235
3030	NC_021907	TCG	2	6	147876	147881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831235
3031	NC_021907	CTG	2	6	147905	147910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831235
3032	NC_021907	TCG	2	6	147924	147929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831235
3033	NC_021907	GCG	2	6	147930	147935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831235
3034	NC_021907	AGA	2	6	147936	147941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528831235
3035	NC_021907	CGG	2	6	147945	147950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831235
3036	NC_021907	GGC	2	6	147961	147966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831235
3037	NC_021907	GCC	2	6	147979	147984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831235
3038	NC_021907	TCG	2	6	148029	148034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831235
3039	NC_021907	GCT	2	6	148042	148047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831235
3040	NC_021907	GAC	2	6	148085	148090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831235
3041	NC_021907	CGA	2	6	148111	148116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831235
3042	NC_021907	CGG	2	6	148183	148188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831235
3043	NC_021907	GTC	2	6	148262	148267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831235
3044	NC_021907	CGA	2	6	148273	148278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831235
3045	NC_021907	GCC	2	6	148319	148324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831235
3046	NC_021907	CG	3	6	148337	148342	0 %	0 %	50 %	50 %	528831235
3047	NC_021907	CGA	2	6	148357	148362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831235
3048	NC_021907	TCG	2	6	148368	148373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831235
3049	NC_021907	TCC	2	6	148377	148382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528831235
3050	NC_021907	GCT	2	6	148429	148434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831235
3051	NC_021907	GCT	2	6	148606	148611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831235
3052	NC_021907	GGCGA	2	10	148691	148700	20 %	0 %	60 %	20 %	528831235
3053	NC_021907	CCG	2	6	148740	148745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831235
3054	NC_021907	CA	3	6	148769	148774	50 %	0 %	0 %	50 %	528831235
3055	NC_021907	CCG	2	6	148809	148814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831235
3056	NC_021907	TGC	3	9	148821	148829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831235
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3058	NC_021907	GGC	2	6	148858	148863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831235
3059	NC_021907	CGC	2	6	148867	148872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831235
3060	NC_021907	GCCG	2	8	148934	148941	0 %	0 %	50 %	50 %	528831235
3061	NC_021907	AGG	2	6	148962	148967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528831235
3062	NC_021907	GAA	2	6	148992	148997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528831236
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3064	NC_021907	TCG	2	6	149029	149034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831236
3065	NC_021907	GGA	2	6	149153	149158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528831236
3066	NC_021907	CGG	2	6	149162	149167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831236
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3068	NC_021907	GCTC	2	8	149221	149228	0 %	25 %	25 %	50 %	528831236
3069	NC_021907	TCT	2	6	149239	149244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528831236
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3079	NC_021907	GAG	2	6	149490	149495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528831236
3080	NC_021907	AAG	3	9	149514	149522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528831236
3081	NC_021907	TCG	2	6	149536	149541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831236
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3083	NC_021907	CGC	2	6	149720	149725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831236
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3085	NC_021907	GCAG	2	8	149785	149792	25 %	0 %	50 %	25 %	528831236
3086	NC_021907	GCC	2	6	149886	149891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831236
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3088	NC_021907	AATC	2	8	149980	149987	50 %	25 %	0 %	25 %	528831236
3089	NC_021907	CGG	2	6	149996	150001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831236
3090	NC_021907	GC	3	6	150048	150053	0 %	0 %	50 %	50 %	528831236
3091	NC_021907	ATC	2	6	150096	150101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831236
3092	NC_021907	CCCG	2	8	150146	150153	0 %	0 %	25 %	75 %	528831237
3093	NC_021907	CGG	2	6	150192	150197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831237
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3096	NC_021907	GCCC	2	8	150321	150328	0 %	0 %	25 %	75 %	528831237
3097	NC_021907	CGC	2	6	150336	150341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831237
3098	NC_021907	TCG	2	6	150344	150349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831237
3099	NC_021907	CG	3	6	150392	150397	0 %	0 %	50 %	50 %	528831237
3100	NC_021907	CCGGCG	2	12	150398	150409	0 %	0 %	50 %	50 %	528831237
3101	NC_021907	CGG	2	6	150446	150451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831237
3102	NC_021907	GCA	2	6	150474	150479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831237
3103	NC_021907	CGGC	2	8	150494	150501	0 %	0 %	50 %	50 %	528831237
3104	NC_021907	TCC	2	6	150622	150627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528831237
3105	NC_021907	GGCA	2	8	150687	150694	25 %	0 %	50 %	25 %	528831237
3106	NC_021907	GC	3	6	150728	150733	0 %	0 %	50 %	50 %	528831237
3107	NC_021907	CGG	2	6	150755	150760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831237
3108	NC_021907	TC	3	6	150789	150794	0 %	50 %	0 %	50 %	528831237
3109	NC_021907	CCA	2	6	150812	150817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528831237
3110	NC_021907	GAA	2	6	150831	150836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528831237
3111	NC_021907	GTC	2	6	150841	150846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831237
3112	NC_021907	GCG	2	6	150883	150888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831237
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3117	NC_021907	GCA	2	6	151125	151130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831237
3118	NC_021907	GCG	2	6	151143	151148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831237
3119	NC_021907	CAGA	2	8	151222	151229	50 %	0 %	25 %	25 %	528831237
3120	NC_021907	TCG	2	6	151271	151276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831237
3121	NC_021907	ACG	2	6	151324	151329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831237
3122	NC_021907	GC	3	6	151364	151369	0 %	0 %	50 %	50 %	528831237
3123	NC_021907	CCGA	2	8	151418	151425	25 %	0 %	25 %	50 %	528831237
3124	NC_021907	TCG	2	6	151442	151447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831237
3125	NC_021907	CGC	2	6	151488	151493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831237
3126	NC_021907	GCT	2	6	151533	151538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831237
3127	NC_021907	GCC	2	6	151603	151608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831237
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3130	NC_021907	CGT	2	6	151737	151742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831237
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3132	NC_021907	TCG	2	6	151811	151816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831237
3133	NC_021907	AGA	2	6	151817	151822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528831237
3134	NC_021907	TCG	2	6	151850	151855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831237
3135	NC_021907	GCGG	2	8	151900	151907	0 %	0 %	75 %	25 %	528831237
3136	NC_021907	TCG	2	6	151913	151918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831237
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3140	NC_021907	GGCC	2	8	152023	152030	0 %	0 %	50 %	50 %	528831237
3141	NC_021907	GGA	2	6	152106	152111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528831237
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3144	NC_021907	ACG	2	6	152221	152226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831238
3145	NC_021907	CGG	2	6	152230	152235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831238
3146	NC_021907	GTC	2	6	152246	152251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831238
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3149	NC_021907	CGG	2	6	152452	152457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831238
3150	NC_021907	CAA	2	6	152479	152484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528831238
3151	NC_021907	GCG	3	9	152517	152525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831238
3152	NC_021907	ATC	2	6	152555	152560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831238
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3155	NC_021907	GA	3	6	152756	152761	50 %	0 %	50 %	0 %	528831238
3156	NC_021907	CTG	2	6	152780	152785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831238
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3200	NC_021907	ATC	2	6	155239	155244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831240
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3225	NC_021907	TGA	2	6	156124	156129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831241
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3232	NC_021907	TCCT	2	8	156417	156424	0 %	50 %	0 %	50 %	528831241
3233	NC_021907	GCC	2	6	156440	156445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831241
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3236	NC_021907	ATC	2	6	156489	156494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831241
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3357	NC_021907	CG	3	6	161639	161644	0 %	0 %	50 %	50 %	528831245
3358	NC_021907	TGG	2	6	161671	161676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528831245
3359	NC_021907	CG	3	6	161793	161798	0 %	0 %	50 %	50 %	528831245
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3361	NC_021907	CGGCA	2	10	161922	161931	20 %	0 %	40 %	40 %	528831245
3362	NC_021907	CGAT	2	8	161972	161979	25 %	25 %	25 %	25 %	528831245
3363	NC_021907	GAT	2	6	162031	162036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831245
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3365	NC_021907	CTGCGG	2	12	162067	162078	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	528831245
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3367	NC_021907	CGGC	2	8	162105	162112	0 %	0 %	50 %	50 %	528831245
3368	NC_021907	TCG	2	6	162113	162118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831245
3369	NC_021907	CGT	2	6	162159	162164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831245
3370	NC_021907	GCATC	2	10	162273	162282	20 %	20 %	20 %	40 %	528831245
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3374	NC_021907	CGA	2	6	162411	162416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831245
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3382	NC_021907	GACCTG	2	12	162636	162647	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	528831245
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3465	NC_021907	CGA	2	6	165851	165856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831249
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3471	NC_021907	CG	3	6	166129	166134	0 %	0 %	50 %	50 %	528831249
3472	NC_021907	CAA	2	6	166154	166159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528831249
3473	NC_021907	GAT	2	6	166241	166246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831249
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3482	NC_021907	TCGT	2	8	166582	166589	0 %	50 %	25 %	25 %	528831249
3483	NC_021907	CAGC	2	8	166604	166611	25 %	0 %	25 %	50 %	528831249
3484	NC_021907	TGA	2	6	166926	166931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831250
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3486	NC_021907	CCTTC	2	10	167056	167065	0 %	40 %	0 %	60 %	528831250
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3491	NC_021907	CGT	2	6	167415	167420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831250
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