MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1b

Total Repeats: 5334

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_021907	CGG	2	6	122234	122239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831208
2502	NC_021907	GGC	2	6	122247	122252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831208
2503	NC_021907	ACC	2	6	122258	122263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528831208
2504	NC_021907	ATC	2	6	122296	122301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831208
2505	NC_021907	TGG	2	6	122321	122326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528831208
2506	NC_021907	CAG	2	6	122331	122336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831208
2507	NC_021907	ATTC	2	8	122351	122358	25 %	50 %	0 %	25 %	528831208
2508	NC_021907	GCC	2	6	122386	122391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831208
2509	NC_021907	CGA	2	6	122456	122461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831208
2510	NC_021907	CCT	2	6	122468	122473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528831208
2511	NC_021907	TGG	2	6	122489	122494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528831208
2512	NC_021907	GAC	2	6	122517	122522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831208
2513	NC_021907	AGC	2	6	122575	122580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831208
2514	NC_021907	GAC	2	6	122619	122624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831208
2515	NC_021907	ATG	2	6	122632	122637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831208
2516	NC_021907	GAA	2	6	122649	122654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528831208
2517	NC_021907	GGC	2	6	122715	122720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831208
2518	NC_021907	GAT	2	6	122763	122768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831208
2519	NC_021907	TCG	2	6	122797	122802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831208
2520	NC_021907	GA	3	6	122834	122839	50 %	0 %	50 %	0 %	528831208
2521	NC_021907	CGAG	2	8	122843	122850	25 %	0 %	50 %	25 %	528831208
2522	NC_021907	CCA	2	6	123012	123017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528831208
2523	NC_021907	CCCG	2	8	123032	123039	0 %	0 %	25 %	75 %	528831208
2524	NC_021907	TCA	2	6	123109	123114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831209
2525	NC_021907	CGA	3	9	123127	123135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831209
2526	NC_021907	CTC	2	6	123232	123237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528831209
2527	NC_021907	TGA	3	9	123259	123267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831209
2528	NC_021907	GAGCTT	2	12	123275	123286	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	528831209
2529	NC_021907	GAT	2	6	123290	123295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831209
2530	NC_021907	ATC	2	6	123300	123305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831209
2531	NC_021907	GCA	2	6	123325	123330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831209
2532	NC_021907	TGG	2	6	123367	123372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528831209
2533	NC_021907	GCC	2	6	123387	123392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831209
2534	NC_021907	CCTC	2	8	123400	123407	0 %	25 %	0 %	75 %	528831209
2535	NC_021907	AGC	2	6	123429	123434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831209
2536	NC_021907	ATC	2	6	123438	123443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831209
2537	NC_021907	GAATG	2	10	123446	123455	40 %	20 %	40 %	0 %	528831209
2538	NC_021907	CATGAT	2	12	123470	123481	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	528831209
2539	NC_021907	AAGG	2	8	123513	123520	50 %	0 %	50 %	0 %	528831209
2540	NC_021907	CCA	2	6	123589	123594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528831209
2541	NC_021907	GAG	2	6	123677	123682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528831209
2542	NC_021907	ATC	2	6	123777	123782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831209
2543	NC_021907	CCGA	2	8	123812	123819	25 %	0 %	25 %	50 %	528831209
2544	NC_021907	AGA	2	6	123821	123826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528831209
2545	NC_021907	AGC	2	6	123867	123872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831209
2546	NC_021907	ACC	2	6	123879	123884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528831209
2547	NC_021907	ACG	2	6	123891	123896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831209
2548	NC_021907	GCC	2	6	123903	123908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831209
2549	NC_021907	GAC	2	6	123950	123955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831209
2550	NC_021907	GCC	2	6	124006	124011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831209
2551	NC_021907	GC	3	6	124084	124089	0 %	0 %	50 %	50 %	528831209
2552	NC_021907	CG	3	6	124103	124108	0 %	0 %	50 %	50 %	528831209
2553	NC_021907	ACG	2	6	124118	124123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831209
2554	NC_021907	GGC	3	9	124327	124335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831210
2555	NC_021907	TCC	2	6	124397	124402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528831210
2556	NC_021907	AGT	2	6	124410	124415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831210
2557	NC_021907	GGT	2	6	124458	124463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528831210
2558	NC_021907	GGAT	2	8	124573	124580	25 %	25 %	50 %	0 %	528831210
2559	NC_021907	GCC	2	6	124609	124614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831210
2560	NC_021907	GCC	2	6	124637	124642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831210
2561	NC_021907	T	6	6	124648	124653	0 %	100 %	0 %	0 %	528831210
2562	NC_021907	TCG	2	6	124655	124660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831210
2563	NC_021907	CGA	2	6	124803	124808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831210
2564	NC_021907	CAC	2	6	124850	124855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528831210
2565	NC_021907	GGT	2	6	124897	124902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528831210
2566	NC_021907	TGATC	2	10	124917	124926	20 %	40 %	20 %	20 %	528831210
2567	NC_021907	GCG	2	6	124943	124948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831210
2568	NC_021907	GTT	2	6	124990	124995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528831210
2569	NC_021907	GAAGCC	2	12	125086	125097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831210
2570	NC_021907	CGG	2	6	125206	125211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831210
2571	NC_021907	AGT	2	6	125244	125249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831210
2572	NC_021907	GTC	2	6	125347	125352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831210
2573	NC_021907	TCG	2	6	125387	125392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831210
2574	NC_021907	CGG	2	6	125406	125411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831210
2575	NC_021907	GC	3	6	125427	125432	0 %	0 %	50 %	50 %	528831210
2576	NC_021907	CTG	2	6	125476	125481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831210
2577	NC_021907	GTT	2	6	125593	125598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528831210
2578	NC_021907	CTTG	2	8	125637	125644	0 %	50 %	25 %	25 %	528831210
2579	NC_021907	CGTC	2	8	125697	125704	0 %	25 %	25 %	50 %	528831210
2580	NC_021907	GC	3	6	125744	125749	0 %	0 %	50 %	50 %	528831210
2581	NC_021907	ATC	2	6	125752	125757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831210
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2585	NC_021907	TCG	2	6	126333	126338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831211
2586	NC_021907	GTCC	2	8	126339	126346	0 %	25 %	25 %	50 %	528831211
2587	NC_021907	TGC	2	6	126366	126371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831211
2588	NC_021907	CGG	2	6	126400	126405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831211
2589	NC_021907	CGG	2	6	126418	126423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831211
2590	NC_021907	CAA	2	6	126433	126438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528831211
2591	NC_021907	GCC	2	6	126442	126447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831211
2592	NC_021907	TGCGC	2	10	126526	126535	0 %	20 %	40 %	40 %	528831211
2593	NC_021907	AGC	2	6	126543	126548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831211
2594	NC_021907	TCA	2	6	126558	126563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831211
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2596	NC_021907	GGC	3	9	126577	126585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831211
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2598	NC_021907	CGA	2	6	126703	126708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831211
2599	NC_021907	CCA	2	6	126769	126774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528831211
2600	NC_021907	ACG	2	6	126788	126793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831211
2601	NC_021907	TCG	2	6	126843	126848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831211
2602	NC_021907	GGC	2	6	126857	126862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831211
2603	NC_021907	CTG	2	6	126953	126958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831211
2604	NC_021907	GGC	2	6	127097	127102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831211
2605	NC_021907	GTCAG	2	10	127273	127282	20 %	20 %	40 %	20 %	528831211
2606	NC_021907	GCG	2	6	127288	127293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831211
2607	NC_021907	CCGG	2	8	127415	127422	0 %	0 %	50 %	50 %	528831212
2608	NC_021907	TCG	2	6	127431	127436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831212
2609	NC_021907	GCCT	2	8	127487	127494	0 %	25 %	25 %	50 %	528831212
2610	NC_021907	TCC	2	6	127515	127520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528831212
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2612	NC_021907	TCGC	2	8	127559	127566	0 %	25 %	25 %	50 %	528831212
2613	NC_021907	GAC	2	6	127622	127627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831212
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2618	NC_021907	GC	3	6	127769	127774	0 %	0 %	50 %	50 %	528831212
2619	NC_021907	GAT	2	6	127838	127843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831212
2620	NC_021907	CTT	2	6	127895	127900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528831212
2621	NC_021907	AGC	2	6	127932	127937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831212
2622	NC_021907	CGA	2	6	127996	128001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831212
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2625	NC_021907	CGA	2	6	128141	128146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831212
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2732	NC_021907	GTC	2	6	133761	133766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831219
2733	NC_021907	GCA	2	6	133784	133789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831219
2734	NC_021907	TCA	2	6	133877	133882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831219
2735	NC_021907	CTG	2	6	134018	134023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831220
2736	NC_021907	GCCA	2	8	134032	134039	25 %	0 %	25 %	50 %	528831220
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2738	NC_021907	GCGG	2	8	134156	134163	0 %	0 %	75 %	25 %	528831220
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2741	NC_021907	GAG	2	6	134202	134207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528831220
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2978	NC_021907	CTG	2	6	145691	145696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831233
2979	NC_021907	GCT	2	6	145762	145767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831233
2980	NC_021907	CTC	2	6	145775	145780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528831233
2981	NC_021907	GCG	2	6	145836	145841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831233
2982	NC_021907	TCG	2	6	145851	145856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831233
2983	NC_021907	GGAA	2	8	145861	145868	50 %	0 %	50 %	0 %	528831233
2984	NC_021907	GCT	2	6	145870	145875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831233
2985	NC_021907	TGCCGT	2	12	145920	145931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831233
2986	NC_021907	GTC	2	6	145974	145979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831233
2987	NC_021907	TCC	2	6	146055	146060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528831233
2988	NC_021907	CAG	2	6	146105	146110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831233
2989	NC_021907	AACG	2	8	146135	146142	50 %	0 %	25 %	25 %	528831233
2990	NC_021907	GTC	3	9	146241	146249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831233
2991	NC_021907	GC	3	6	146299	146304	0 %	0 %	50 %	50 %	528831233
2992	NC_021907	CAG	2	6	146315	146320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831233
2993	NC_021907	GCGAT	2	10	146346	146355	20 %	20 %	40 %	20 %	528831233
2994	NC_021907	GATCAG	2	12	146387	146398	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	528831233
2995	NC_021907	GCA	2	6	146452	146457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831233
2996	NC_021907	TCA	2	6	146591	146596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831234
2997	NC_021907	CGC	2	6	146685	146690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831234
2998	NC_021907	GTT	2	6	146707	146712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528831234
2999	NC_021907	GCC	2	6	146743	146748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831234
3000	NC_021907	GCC	2	6	146750	146755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831234

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