MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1b

Total Repeats: 5334

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021907	GGC	2	6	47071	47076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831148
1002	NC_021907	TAC	2	6	47077	47082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831148
1003	NC_021907	GTCC	2	8	47111	47118	0 %	25 %	25 %	50 %	528831148
1004	NC_021907	GAG	2	6	47137	47142	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528831148
1005	NC_021907	GCT	2	6	47154	47159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831148
1006	NC_021907	TCA	2	6	48007	48012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831149
1007	NC_021907	CTG	2	6	48025	48030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831149
1008	NC_021907	CCG	2	6	48042	48047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831149
1009	NC_021907	GTG	2	6	48068	48073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528831149
1010	NC_021907	CGG	2	6	48105	48110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831149
1011	NC_021907	TTG	2	6	48221	48226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528831149
1012	NC_021907	GGT	2	6	48283	48288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528831149
1013	NC_021907	CGA	2	6	48315	48320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831149
1014	NC_021907	GCG	2	6	48346	48351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831149
1015	NC_021907	GGGCA	2	10	48512	48521	20 %	0 %	60 %	20 %	528831149
1016	NC_021907	GGC	2	6	48597	48602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831149
1017	NC_021907	GC	3	6	48601	48606	0 %	0 %	50 %	50 %	528831149
1018	NC_021907	TCGCCA	2	12	48617	48628	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	528831149
1019	NC_021907	TGC	2	6	48713	48718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831149
1020	NC_021907	AGCGA	2	10	48784	48793	40 %	0 %	40 %	20 %	528831149
1021	NC_021907	GCG	2	6	48829	48834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831149
1022	NC_021907	GCG	3	9	48854	48862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831149
1023	NC_021907	GCC	2	6	48877	48882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831149
1024	NC_021907	GAT	3	9	48883	48891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831149
1025	NC_021907	AAT	2	6	49078	49083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528831150
1026	NC_021907	GAAC	2	8	49114	49121	50 %	0 %	25 %	25 %	528831150
1027	NC_021907	CGGC	2	8	49138	49145	0 %	0 %	50 %	50 %	528831150
1028	NC_021907	CCA	2	6	49146	49151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528831150
1029	NC_021907	CGA	2	6	49218	49223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831150
1030	NC_021907	GC	3	6	49243	49248	0 %	0 %	50 %	50 %	528831150
1031	NC_021907	AGG	2	6	49290	49295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528831150
1032	NC_021907	GGC	2	6	49315	49320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831150
1033	NC_021907	CAC	2	6	49338	49343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528831150
1034	NC_021907	AAGC	2	8	49486	49493	50 %	0 %	25 %	25 %	528831150
1035	NC_021907	CCGGC	2	10	49506	49515	0 %	0 %	40 %	60 %	528831150
1036	NC_021907	CCGC	2	8	49596	49603	0 %	0 %	25 %	75 %	528831150
1037	NC_021907	GC	3	6	49611	49616	0 %	0 %	50 %	50 %	528831150
1038	NC_021907	ATT	2	6	49640	49645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528831150
1039	NC_021907	GC	3	6	49646	49651	0 %	0 %	50 %	50 %	528831150
1040	NC_021907	GAC	2	6	49673	49678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831150
1041	NC_021907	GCC	2	6	49911	49916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831151
1042	NC_021907	GCG	2	6	49954	49959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831151
1043	NC_021907	G	6	6	50000	50005	0 %	0 %	100 %	0 %	528831151
1044	NC_021907	GC	5	10	50049	50058	0 %	0 %	50 %	50 %	528831151
1045	NC_021907	CAG	2	6	50102	50107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831151
1046	NC_021907	TTC	2	6	50163	50168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528831151
1047	NC_021907	CGG	2	6	50179	50184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831151
1048	NC_021907	CGGG	3	12	50215	50226	0 %	0 %	75 %	25 %	528831151
1049	NC_021907	CTG	2	6	50237	50242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831151
1050	NC_021907	CTGC	2	8	50270	50277	0 %	25 %	25 %	50 %	528831151
1051	NC_021907	CCG	2	6	50304	50309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831151
1052	NC_021907	CGC	2	6	50314	50319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831151
1053	NC_021907	GC	3	6	50370	50375	0 %	0 %	50 %	50 %	528831151
1054	NC_021907	CGG	2	6	50383	50388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831151
1055	NC_021907	CGA	2	6	50468	50473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831151
1056	NC_021907	CG	4	8	50509	50516	0 %	0 %	50 %	50 %	528831151
1057	NC_021907	CGA	2	6	50531	50536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831151
1058	NC_021907	CCGCGC	2	12	50540	50551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831151
1059	NC_021907	GCC	2	6	50568	50573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831151
1060	NC_021907	CGGT	2	8	50595	50602	0 %	25 %	50 %	25 %	528831151
1061	NC_021907	GAT	2	6	50603	50608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831151
1062	NC_021907	CGGCG	2	10	50612	50621	0 %	0 %	60 %	40 %	528831151
1063	NC_021907	GC	3	6	50634	50639	0 %	0 %	50 %	50 %	528831151
1064	NC_021907	CCTCG	2	10	51150	51159	0 %	20 %	20 %	60 %	528831152
1065	NC_021907	CTC	2	6	51209	51214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528831152
1066	NC_021907	GTC	2	6	51275	51280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831152
1067	NC_021907	AGC	2	6	51318	51323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831152
1068	NC_021907	CGC	2	6	51337	51342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831152
1069	NC_021907	CAC	2	6	51347	51352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528831152
1070	NC_021907	GCC	2	6	51402	51407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831152
1071	NC_021907	TGG	2	6	51433	51438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528831152
1072	NC_021907	GGCA	2	8	51466	51473	25 %	0 %	50 %	25 %	528831152
1073	NC_021907	CCA	2	6	51475	51480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528831152
1074	NC_021907	TGG	2	6	51504	51509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528831152
1075	NC_021907	TTC	2	6	51546	51551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528831152
1076	NC_021907	CAC	2	6	51554	51559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528831152
1077	NC_021907	CGGC	2	8	51586	51593	0 %	0 %	50 %	50 %	528831152
1078	NC_021907	ACG	2	6	51615	51620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831152
1079	NC_021907	CAG	2	6	51662	51667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831152
1080	NC_021907	GAAG	2	8	51679	51686	50 %	0 %	50 %	0 %	528831152
1081	NC_021907	ACG	2	6	51699	51704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831152
1082	NC_021907	CAA	2	6	51793	51798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528831152
1083	NC_021907	CGG	2	6	51809	51814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831152
1084	NC_021907	TCGAT	2	10	51912	51921	20 %	40 %	20 %	20 %	528831152
1085	NC_021907	GCC	2	6	51938	51943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831152
1086	NC_021907	CGAT	2	8	51958	51965	25 %	25 %	25 %	25 %	528831152
1087	NC_021907	GTC	2	6	52013	52018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831152
1088	NC_021907	GAC	2	6	52049	52054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831152
1089	NC_021907	GGA	2	6	52097	52102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528831152
1090	NC_021907	TCG	2	6	52114	52119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831152
1091	NC_021907	GCG	2	6	52164	52169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831152
1092	NC_021907	GC	3	6	52172	52177	0 %	0 %	50 %	50 %	528831152
1093	NC_021907	GCC	2	6	52215	52220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831152
1094	NC_021907	CGT	2	6	52300	52305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831152
1095	NC_021907	GCC	4	12	52340	52351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831152
1096	NC_021907	GGA	2	6	52372	52377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528831152
1097	NC_021907	TTGC	2	8	52415	52422	0 %	50 %	25 %	25 %	528831152
1098	NC_021907	TCG	2	6	52431	52436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831152
1099	NC_021907	GCA	2	6	52444	52449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831152
1100	NC_021907	GTG	2	6	52482	52487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528831152
1101	NC_021907	GCC	3	9	52499	52507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831152
1102	NC_021907	GAG	2	6	52509	52514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528831152
1103	NC_021907	CGG	2	6	52525	52530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831152
1104	NC_021907	TGG	2	6	52606	52611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528831152
1105	NC_021907	CGT	2	6	52648	52653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831152
1106	NC_021907	CAG	2	6	52679	52684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831152
1107	NC_021907	ACG	3	9	52710	52718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831152
1108	NC_021907	GTC	2	6	52734	52739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831152
1109	NC_021907	CGG	2	6	52743	52748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831152
1110	NC_021907	GGC	2	6	52754	52759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831152
1111	NC_021907	AT	3	6	52771	52776	50 %	50 %	0 %	0 %	528831152
1112	NC_021907	GGC	2	6	52832	52837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831152
1113	NC_021907	CAT	2	6	52838	52843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831152
1114	NC_021907	CAG	2	6	52850	52855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831152
1115	NC_021907	GC	3	6	52856	52861	0 %	0 %	50 %	50 %	528831152
1116	NC_021907	CGAG	2	8	52867	52874	25 %	0 %	50 %	25 %	528831152
1117	NC_021907	CGG	3	9	52888	52896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831152
1118	NC_021907	GGT	2	6	52976	52981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528831152
1119	NC_021907	GCT	2	6	53010	53015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831152
1120	NC_021907	ATCG	2	8	53027	53034	25 %	25 %	25 %	25 %	528831152
1121	NC_021907	GGCG	2	8	53056	53063	0 %	0 %	75 %	25 %	528831152
1122	NC_021907	TCTCGA	2	12	53068	53079	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	528831152
1123	NC_021907	TCG	2	6	53088	53093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831152
1124	NC_021907	ACC	2	6	53106	53111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528831152
1125	NC_021907	AGC	2	6	53124	53129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831152
1126	NC_021907	ATG	2	6	53163	53168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831152
1127	NC_021907	GACA	2	8	53183	53190	50 %	0 %	25 %	25 %	528831152
1128	NC_021907	TCG	2	6	53215	53220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831152
1129	NC_021907	GAC	2	6	53246	53251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831152
1130	NC_021907	GAT	2	6	53252	53257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831152
1131	NC_021907	GAT	2	6	53309	53314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831152
1132	NC_021907	TCG	2	6	53337	53342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831152
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1156	NC_021907	CGGA	2	8	54559	54566	25 %	0 %	50 %	25 %	528831153
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1496	NC_021907	GGC	2	6	69101	69106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831167
1497	NC_021907	TGA	2	6	69137	69142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831167
1498	NC_021907	GCT	2	6	69167	69172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831167
1499	NC_021907	GGC	2	6	69198	69203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831167
1500	NC_021907	CGT	2	6	69215	69220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831167

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