MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1b

Total Repeats: 5334

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_021907	ATC	2	6	212400	212405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831292
4502	NC_021907	GTTG	2	8	212429	212436	0 %	50 %	50 %	0 %	528831292
4503	NC_021907	TCA	2	6	212441	212446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831292
4504	NC_021907	ATC	2	6	212457	212462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831292
4505	NC_021907	CCA	2	6	212531	212536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528831292
4506	NC_021907	GGCC	2	8	212575	212582	0 %	0 %	50 %	50 %	528831292
4507	NC_021907	ATG	2	6	212784	212789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831293
4508	NC_021907	CGC	2	6	212828	212833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831293
4509	NC_021907	CGA	2	6	212854	212859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831293
4510	NC_021907	GTC	2	6	212870	212875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831293
4511	NC_021907	GCG	2	6	212887	212892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831293
4512	NC_021907	TCA	2	6	212911	212916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831293
4513	NC_021907	GCG	2	6	212935	212940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831293
4514	NC_021907	TCC	2	6	212955	212960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528831293
4515	NC_021907	GCC	2	6	212985	212990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831293
4516	NC_021907	TCG	2	6	213004	213009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831293
4517	NC_021907	TGC	2	6	213050	213055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831293
4518	NC_021907	CGA	2	6	213092	213097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831293
4519	NC_021907	GCC	3	9	213102	213110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831293
4520	NC_021907	ATG	2	6	213160	213165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831293
4521	NC_021907	TCT	2	6	213211	213216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528831293
4522	NC_021907	AGG	2	6	213223	213228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528831293
4523	NC_021907	GCC	2	6	213303	213308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831293
4524	NC_021907	GGC	2	6	213330	213335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831293
4525	NC_021907	GCA	2	6	213344	213349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831293
4526	NC_021907	GACAAG	2	12	213417	213428	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	528831293
4527	NC_021907	AGA	2	6	213454	213459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528831293
4528	NC_021907	GCG	2	6	213504	213509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831293
4529	NC_021907	GTC	2	6	213741	213746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831293
4530	NC_021907	AAG	2	6	213780	213785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528831293
4531	NC_021907	GC	3	6	213835	213840	0 %	0 %	50 %	50 %	528831293
4532	NC_021907	TGA	2	6	213856	213861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831293
4533	NC_021907	CGC	2	6	213901	213906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831293
4534	NC_021907	CGA	2	6	213923	213928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831293
4535	NC_021907	TCG	2	6	213931	213936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831293
4536	NC_021907	GCG	2	6	213949	213954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831293
4537	NC_021907	ACG	2	6	213961	213966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831293
4538	NC_021907	CGG	2	6	213967	213972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831293
4539	NC_021907	TTC	2	6	213987	213992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528831293
4540	NC_021907	ATC	2	6	214143	214148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831294
4541	NC_021907	TGGC	2	8	214299	214306	0 %	25 %	50 %	25 %	528831294
4542	NC_021907	TCT	2	6	214370	214375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528831294
4543	NC_021907	GCC	2	6	214377	214382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831294
4544	NC_021907	GTG	2	6	214455	214460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528831294
4545	NC_021907	GCGT	2	8	214513	214520	0 %	25 %	50 %	25 %	528831294
4546	NC_021907	GGT	2	6	214553	214558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528831294
4547	NC_021907	TGGTCA	2	12	214618	214629	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	528831294
4548	NC_021907	GCG	2	6	214674	214679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831294
4549	NC_021907	CG	3	6	214678	214683	0 %	0 %	50 %	50 %	528831294
4550	NC_021907	ATC	2	6	214719	214724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831294
4551	NC_021907	CGC	2	6	214748	214753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831294
4552	NC_021907	TGC	2	6	214762	214767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831294
4553	NC_021907	TCG	3	9	214798	214806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831294
4554	NC_021907	GGC	2	6	214818	214823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831294
4555	NC_021907	TCA	2	6	214855	214860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831294
4556	NC_021907	CAG	2	6	214900	214905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831294
4557	NC_021907	TCA	2	6	214930	214935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831294
4558	NC_021907	GGAG	2	8	214982	214989	25 %	0 %	75 %	0 %	528831294
4559	NC_021907	TGA	2	6	214995	215000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831294
4560	NC_021907	CGA	2	6	215031	215036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831295
4561	NC_021907	CGG	2	6	215040	215045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831295
4562	NC_021907	CGC	3	9	215074	215082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831295
4563	NC_021907	CTTC	2	8	215089	215096	0 %	50 %	0 %	50 %	528831295
4564	NC_021907	GTC	2	6	215114	215119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831295
4565	NC_021907	GGC	2	6	215340	215345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831295
4566	NC_021907	CG	3	6	215346	215351	0 %	0 %	50 %	50 %	528831295
4567	NC_021907	CGG	2	6	215383	215388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831295
4568	NC_021907	CAT	2	6	215467	215472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831295
4569	NC_021907	GGA	2	6	215542	215547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528831295
4570	NC_021907	GGC	2	6	215557	215562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831295
4571	NC_021907	GC	3	6	215561	215566	0 %	0 %	50 %	50 %	528831295
4572	NC_021907	TCT	2	6	215592	215597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528831295
4573	NC_021907	TGC	2	6	215607	215612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831295
4574	NC_021907	GTC	2	6	215630	215635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831295
4575	NC_021907	TGC	2	6	215646	215651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831295
4576	NC_021907	CAA	2	6	215731	215736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528831295
4577	NC_021907	GGC	2	6	215782	215787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831295
4578	NC_021907	TCC	2	6	215805	215810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528831295
4579	NC_021907	CGGC	2	8	215859	215866	0 %	0 %	50 %	50 %	528831295
4580	NC_021907	CCG	2	6	215896	215901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831296
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4582	NC_021907	TCGA	2	8	215958	215965	25 %	25 %	25 %	25 %	528831296
4583	NC_021907	TGC	2	6	215989	215994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831296
4584	NC_021907	CGG	2	6	216058	216063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831296
4585	NC_021907	GAG	2	6	216099	216104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528831296
4586	NC_021907	CGGCAT	2	12	216116	216127	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	528831296
4587	NC_021907	TC	3	6	216176	216181	0 %	50 %	0 %	50 %	528831296
4588	NC_021907	GC	3	6	216225	216230	0 %	0 %	50 %	50 %	528831296
4589	NC_021907	CCG	2	6	216241	216246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831296
4590	NC_021907	CTC	2	6	216249	216254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528831296
4591	NC_021907	GCT	2	6	216266	216271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831296
4592	NC_021907	CAGCGC	2	12	216303	216314	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	528831296
4593	NC_021907	CGA	2	6	216362	216367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831296
4594	NC_021907	AT	3	6	216453	216458	50 %	50 %	0 %	0 %	528831296
4595	NC_021907	ATCGC	2	10	216496	216505	20 %	20 %	20 %	40 %	528831296
4596	NC_021907	CAT	2	6	216506	216511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831296
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4598	NC_021907	CTC	2	6	216536	216541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528831296
4599	NC_021907	CGG	2	6	216544	216549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831296
4600	NC_021907	CCG	2	6	216557	216562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831296
4601	NC_021907	TCG	2	6	216577	216582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831296
4602	NC_021907	GTC	2	6	216672	216677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831296
4603	NC_021907	TC	3	6	216680	216685	0 %	50 %	0 %	50 %	528831296
4604	NC_021907	CGG	2	6	216709	216714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831296
4605	NC_021907	CCA	2	6	216781	216786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528831296
4606	NC_021907	CGT	2	6	216803	216808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831296
4607	NC_021907	CGT	2	6	216830	216835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831296
4608	NC_021907	ATG	2	6	217072	217077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831297
4609	NC_021907	CGGCG	2	10	217094	217103	0 %	0 %	60 %	40 %	528831297
4610	NC_021907	TGC	3	9	217147	217155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831297
4611	NC_021907	GGCCG	2	10	217160	217169	0 %	0 %	60 %	40 %	528831297
4612	NC_021907	GC	3	6	217197	217202	0 %	0 %	50 %	50 %	528831297
4613	NC_021907	AAG	2	6	217203	217208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528831297
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4615	NC_021907	GC	3	6	217238	217243	0 %	0 %	50 %	50 %	528831297
4616	NC_021907	GC	4	8	217275	217282	0 %	0 %	50 %	50 %	528831297
4617	NC_021907	CTT	2	6	217286	217291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528831297
4618	NC_021907	CTT	2	6	217310	217315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528831297
4619	NC_021907	ACG	2	6	217341	217346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831297
4620	NC_021907	GCG	2	6	217387	217392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831297
4621	NC_021907	TGC	3	9	217417	217425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831297
4622	NC_021907	CGA	2	6	217433	217438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831297
4623	NC_021907	CAA	2	6	217547	217552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528831297
4624	NC_021907	CGT	2	6	217661	217666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831297
4625	NC_021907	GAC	2	6	217727	217732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831297
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4627	NC_021907	CGT	2	6	217760	217765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831297
4628	NC_021907	CGC	2	6	217767	217772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831297
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4633	NC_021907	TCGGCA	2	12	217911	217922	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	528831297
4634	NC_021907	TCCG	2	8	218066	218073	0 %	25 %	25 %	50 %	528831297
4635	NC_021907	CGC	2	6	218108	218113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831297
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4644	NC_021907	CGG	2	6	218360	218365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831297
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4652	NC_021907	GGA	2	6	218946	218951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528831298
4653	NC_021907	GTC	2	6	218971	218976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831298
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4658	NC_021907	GCG	2	6	219137	219142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831298
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4660	NC_021907	CTGC	2	8	219196	219203	0 %	25 %	25 %	50 %	528831298
4661	NC_021907	CCGA	2	8	219205	219212	25 %	0 %	25 %	50 %	528831298
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4729	NC_021907	GC	3	6	222553	222558	0 %	0 %	50 %	50 %	528831302
4730	NC_021907	GTC	2	6	222577	222582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831302
4731	NC_021907	TCGA	2	8	222748	222755	25 %	25 %	25 %	25 %	528831303
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4734	NC_021907	GC	3	6	222948	222953	0 %	0 %	50 %	50 %	528831303
4735	NC_021907	GCG	2	6	223016	223021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831303
4736	NC_021907	AGC	2	6	223037	223042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831303
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4738	NC_021907	CGT	2	6	223242	223247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831303
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4740	NC_021907	TCC	2	6	223371	223376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528831304
4741	NC_021907	GC	3	6	223398	223403	0 %	0 %	50 %	50 %	528831304
4742	NC_021907	ATC	2	6	223445	223450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831304
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4744	NC_021907	CG	3	6	223543	223548	0 %	0 %	50 %	50 %	528831305
4745	NC_021907	CAG	2	6	223569	223574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831305
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4762	NC_021907	AAG	2	6	226203	226208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528831308
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4768	NC_021907	TGC	2	6	226546	226551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831308
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4849	NC_021907	GGCGC	2	10	230099	230108	0 %	0 %	60 %	40 %	528831312
4850	NC_021907	GATC	2	8	230134	230141	25 %	25 %	25 %	25 %	528831312
4851	NC_021907	GCCG	2	8	230161	230168	0 %	0 %	50 %	50 %	528831312
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4857	NC_021907	TCC	2	6	230399	230404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528831312
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4859	NC_021907	GGC	2	6	230472	230477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831312
4860	NC_021907	GC	3	6	230503	230508	0 %	0 %	50 %	50 %	528831312
4861	NC_021907	CGG	2	6	230559	230564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831312
4862	NC_021907	AGC	2	6	230578	230583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831312
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4864	NC_021907	GCCG	2	8	230828	230835	0 %	0 %	50 %	50 %	528831312
4865	NC_021907	GAC	2	6	230860	230865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831312
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4872	NC_021907	GC	3	6	231258	231263	0 %	0 %	50 %	50 %	528831313
4873	NC_021907	GCC	2	6	231308	231313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831313
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4966	NC_021907	CGGCAG	2	12	234966	234977	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	528831315
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4979	NC_021907	TGA	2	6	235422	235427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831316
4980	NC_021907	GCC	2	6	235432	235437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831316
4981	NC_021907	TCA	2	6	235473	235478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831316
4982	NC_021907	GGC	2	6	235564	235569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831316
4983	NC_021907	TTG	2	6	235571	235576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528831316
4984	NC_021907	CCG	2	6	235592	235597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831316
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