MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1a

Total Repeats: 3959

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021906	GCT	2	6	160051	160056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831078
3502	NC_021906	GGC	2	6	160067	160072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831078
3503	NC_021906	CGCC	2	8	160135	160142	0 %	0 %	25 %	75 %	528831078
3504	NC_021906	ACC	2	6	160281	160286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528831078
3505	NC_021906	CGA	2	6	160318	160323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831078
3506	NC_021906	CGA	2	6	160330	160335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831078
3507	NC_021906	TCG	2	6	160350	160355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831078
3508	NC_021906	GCG	2	6	160366	160371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831078
3509	NC_021906	GC	3	6	160395	160400	0 %	0 %	50 %	50 %	528831078
3510	NC_021906	ACG	2	6	160404	160409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831078
3511	NC_021906	ATC	2	6	160458	160463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831078
3512	NC_021906	GCT	2	6	160474	160479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831078
3513	NC_021906	TCG	2	6	160545	160550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831078
3514	NC_021906	CACG	2	8	160570	160577	25 %	0 %	25 %	50 %	528831078
3515	NC_021906	CG	3	6	160580	160585	0 %	0 %	50 %	50 %	528831078
3516	NC_021906	CGCTGG	2	12	160599	160610	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	528831078
3517	NC_021906	CCG	2	6	160611	160616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831078
3518	NC_021906	GCT	2	6	160621	160626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831078
3519	NC_021906	GCC	2	6	160630	160635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831078
3520	NC_021906	TCA	2	6	160639	160644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831078
3521	NC_021906	ACGC	2	8	160676	160683	25 %	0 %	25 %	50 %	528831078
3522	NC_021906	CGG	2	6	160801	160806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831078
3523	NC_021906	CGT	2	6	160813	160818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831078
3524	NC_021906	GAC	2	6	160820	160825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831078
3525	NC_021906	GCC	2	6	160829	160834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831078
3526	NC_021906	CGA	2	6	160915	160920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831078
3527	NC_021906	GAC	2	6	160922	160927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831078
3528	NC_021906	GAT	2	6	160964	160969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831078
3529	NC_021906	GCC	2	6	160976	160981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831078
3530	NC_021906	CGG	2	6	161050	161055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831079
3531	NC_021906	GCA	2	6	161080	161085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831079
3532	NC_021906	CAG	2	6	161114	161119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831079
3533	NC_021906	TCA	2	6	161194	161199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831079
3534	NC_021906	CAG	2	6	161219	161224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831079
3535	NC_021906	GCC	2	6	161274	161279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831079
3536	NC_021906	TCG	2	6	161281	161286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831079
3537	NC_021906	GC	3	6	161288	161293	0 %	0 %	50 %	50 %	528831079
3538	NC_021906	CAT	2	6	161372	161377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831079
3539	NC_021906	GGC	2	6	161424	161429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831079
3540	NC_021906	CG	3	6	161467	161472	0 %	0 %	50 %	50 %	528831079
3541	NC_021906	CCA	2	6	161473	161478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528831079
3542	NC_021906	TGA	2	6	161479	161484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831079
3543	NC_021906	GAC	2	6	161495	161500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831079
3544	NC_021906	GAT	2	6	161531	161536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831079
3545	NC_021906	GAC	2	6	161543	161548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831079
3546	NC_021906	CGA	2	6	161557	161562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831079
3547	NC_021906	GAT	2	6	161624	161629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831079
3548	NC_021906	CGA	2	6	161698	161703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831079
3549	NC_021906	CAT	2	6	161774	161779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831079
3550	NC_021906	GCG	2	6	161809	161814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831079
3551	NC_021906	GGCG	2	8	161839	161846	0 %	0 %	75 %	25 %	528831079
3552	NC_021906	TCCC	2	8	161879	161886	0 %	25 %	0 %	75 %	528831080
3553	NC_021906	ACG	2	6	161912	161917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831080
3554	NC_021906	GGC	2	6	161923	161928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831080
3555	NC_021906	GCC	3	9	162013	162021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831080
3556	NC_021906	GCC	2	6	162025	162030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831080
3557	NC_021906	TGA	2	6	162039	162044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831080
3558	NC_021906	CAC	2	6	162088	162093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528831080
3559	NC_021906	AGA	2	6	162096	162101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528831080
3560	NC_021906	GAT	2	6	162103	162108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831080
3561	NC_021906	CTG	2	6	162142	162147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831080
3562	NC_021906	TGC	2	6	162172	162177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831080
3563	NC_021906	TCG	2	6	162188	162193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831080
3564	NC_021906	GAT	3	9	162217	162225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831080
3565	NC_021906	GAT	2	6	162262	162267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831080
3566	NC_021906	CGC	2	6	162277	162282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831080
3567	NC_021906	ATC	2	6	162329	162334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831080
3568	NC_021906	TTG	2	6	162335	162340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528831080
3569	NC_021906	CGA	2	6	162399	162404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831080
3570	NC_021906	AAG	2	6	162416	162421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528831080
3571	NC_021906	GCG	2	6	162453	162458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831080
3572	NC_021906	AGC	2	6	162464	162469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831080
3573	NC_021906	GAT	2	6	162520	162525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831080
3574	NC_021906	AGA	2	6	162564	162569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528831080
3575	NC_021906	CAG	2	6	162679	162684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831080
3576	NC_021906	CATT	2	8	162814	162821	25 %	50 %	0 %	25 %	528831081
3577	NC_021906	GGC	2	6	162859	162864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831081
3578	NC_021906	TCG	2	6	162866	162871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831081
3579	NC_021906	GCC	2	6	162875	162880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831081
3580	NC_021906	CCG	2	6	162896	162901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831081
3581	NC_021906	GAA	2	6	162904	162909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528831081
3582	NC_021906	GCC	2	6	163018	163023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831081
3583	NC_021906	AGC	2	6	163070	163075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831081
3584	NC_021906	TGACC	2	10	163107	163116	20 %	20 %	20 %	40 %	528831081
3585	NC_021906	TTG	2	6	163163	163168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528831081
3586	NC_021906	CGA	2	6	163192	163197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831081
3587	NC_021906	CCG	2	6	163199	163204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831081
3588	NC_021906	GCC	2	6	163309	163314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831081
3589	NC_021906	CGG	2	6	163338	163343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831081
3590	NC_021906	GTCG	2	8	163462	163469	0 %	25 %	50 %	25 %	528831081
3591	NC_021906	GGC	2	6	163561	163566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831081
3592	NC_021906	TCT	2	6	163572	163577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528831081
3593	NC_021906	CGG	2	6	163581	163586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831081
3594	NC_021906	ATC	2	6	163594	163599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831081
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3597	NC_021906	GGCAT	2	10	163685	163694	20 %	20 %	40 %	20 %	528831081
3598	NC_021906	CGG	2	6	163755	163760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831081
3599	NC_021906	AGA	2	6	163809	163814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528831081
3600	NC_021906	CGC	2	6	163860	163865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831081
3601	NC_021906	CAGC	2	8	163878	163885	25 %	0 %	25 %	50 %	528831081
3602	NC_021906	TCC	2	6	163916	163921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528831081
3603	NC_021906	TTG	2	6	163949	163954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528831081
3604	NC_021906	CG	3	6	164206	164211	0 %	0 %	50 %	50 %	528831082
3605	NC_021906	CCGGC	2	10	164219	164228	0 %	0 %	40 %	60 %	528831082
3606	NC_021906	CAG	2	6	164231	164236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831082
3607	NC_021906	CGA	2	6	164251	164256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831082
3608	NC_021906	GAT	2	6	164442	164447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831082
3609	NC_021906	TTC	2	6	164484	164489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528831082
3610	NC_021906	TGA	2	6	164524	164529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831082
3611	NC_021906	GCT	2	6	164540	164545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831082
3612	NC_021906	GCC	2	6	164562	164567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831082
3613	NC_021906	CG	3	6	164582	164587	0 %	0 %	50 %	50 %	528831082
3614	NC_021906	TGA	2	6	164639	164644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831082
3615	NC_021906	TGC	3	9	164647	164655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831082
3616	NC_021906	GAC	2	6	164690	164695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831082
3617	NC_021906	GAC	2	6	164702	164707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831082
3618	NC_021906	CG	3	6	164756	164761	0 %	0 %	50 %	50 %	528831082
3619	NC_021906	CGC	2	6	164777	164782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831082
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3740	NC_021906	GTA	2	6	170896	170901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831088
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3851	NC_021906	GCA	2	6	175839	175844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831092
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3859	NC_021906	CAG	2	6	176198	176203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831092
3860	NC_021906	GCGAG	2	10	176254	176263	20 %	0 %	60 %	20 %	528831092
3861	NC_021906	ATG	2	6	176274	176279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831092
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3958	NC_021906	CGC	2	6	181224	181229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831097
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