MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1a

Total Repeats: 3959

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021906	GCT	2	6	24497	24502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830952
502	NC_021906	GCC	2	6	24518	24523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830952
503	NC_021906	CTT	2	6	24542	24547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528830952
504	NC_021906	CGA	2	6	24674	24679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830952
505	NC_021906	TTCC	2	8	24701	24708	0 %	50 %	0 %	50 %	528830952
506	NC_021906	CTT	2	6	24713	24718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528830952
507	NC_021906	GCG	2	6	24748	24753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830952
508	NC_021906	CTT	2	6	24767	24772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528830952
509	NC_021906	CTG	2	6	24801	24806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830952
510	NC_021906	GAC	3	9	24818	24826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830952
511	NC_021906	GGC	2	6	24827	24832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830952
512	NC_021906	GCC	2	6	24870	24875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830952
513	NC_021906	CAT	2	6	24917	24922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528830952
514	NC_021906	GC	3	6	24928	24933	0 %	0 %	50 %	50 %	528830952
515	NC_021906	GAG	2	6	24991	24996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528830952
516	NC_021906	TTC	2	6	25047	25052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528830953
517	NC_021906	T	7	7	25095	25101	0 %	100 %	0 %	0 %	528830953
518	NC_021906	CGC	2	6	25114	25119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830953
519	NC_021906	TGC	2	6	25129	25134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830953
520	NC_021906	ACC	2	6	25143	25148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528830953
521	NC_021906	GCT	2	6	25172	25177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830953
522	NC_021906	TTCA	2	8	25188	25195	25 %	50 %	0 %	25 %	528830953
523	NC_021906	TGG	2	6	25230	25235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528830953
524	NC_021906	TAT	2	6	25362	25367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528830954
525	NC_021906	GAC	3	9	25383	25391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830954
526	NC_021906	CTG	3	9	25399	25407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830954
527	NC_021906	AGGAAA	2	12	25502	25513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528830954
528	NC_021906	TCG	2	6	25523	25528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830954
529	NC_021906	GGT	2	6	25563	25568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528830954
530	NC_021906	CAC	2	6	25581	25586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528830954
531	NC_021906	AT	3	6	25717	25722	50 %	50 %	0 %	0 %	528830954
532	NC_021906	CAG	2	6	25771	25776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830954
533	NC_021906	TCGATG	2	12	25835	25846	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	528830954
534	NC_021906	CAG	2	6	25906	25911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830954
535	NC_021906	GAA	2	6	25956	25961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528830954
536	NC_021906	TTC	2	6	26041	26046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528830954
537	NC_021906	AAG	2	6	26068	26073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528830954
538	NC_021906	AAG	2	6	26098	26103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528830954
539	NC_021906	CGA	2	6	26190	26195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830954
540	NC_021906	GC	3	6	26245	26250	0 %	0 %	50 %	50 %	528830954
541	NC_021906	GGC	2	6	26251	26256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830954
542	NC_021906	CGGCC	2	10	26265	26274	0 %	0 %	40 %	60 %	528830954
543	NC_021906	TCCA	2	8	26284	26291	25 %	25 %	0 %	50 %	528830954
544	NC_021906	CTGGA	2	10	26299	26308	20 %	20 %	40 %	20 %	528830954
545	NC_021906	CAG	2	6	26389	26394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830954
546	NC_021906	CCG	2	6	26417	26422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830954
547	NC_021906	AAGG	2	8	26431	26438	50 %	0 %	50 %	0 %	528830954
548	NC_021906	GTC	2	6	26446	26451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830954
549	NC_021906	TGA	2	6	26555	26560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528830954
550	NC_021906	GGC	2	6	26586	26591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830954
551	NC_021906	GAA	2	6	26634	26639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528830954
552	NC_021906	ACCG	2	8	26695	26702	25 %	0 %	25 %	50 %	528830954
553	NC_021906	CG	3	6	26701	26706	0 %	0 %	50 %	50 %	528830954
554	NC_021906	CGG	2	6	26715	26720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830954
555	NC_021906	TGG	2	6	26809	26814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528830954
556	NC_021906	TCC	2	6	26833	26838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528830954
557	NC_021906	TGC	2	6	26894	26899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830954
558	NC_021906	GAA	2	6	26988	26993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528830954
559	NC_021906	ACG	2	6	27056	27061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830954
560	NC_021906	AGA	2	6	27080	27085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528830954
561	NC_021906	ACG	2	6	27274	27279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830955
562	NC_021906	ATC	2	6	27292	27297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528830955
563	NC_021906	GCG	2	6	27302	27307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830955
564	NC_021906	TGC	2	6	27381	27386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830955
565	NC_021906	CGT	2	6	27402	27407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830955
566	NC_021906	GCC	2	6	27448	27453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830955
567	NC_021906	ACCA	2	8	27475	27482	50 %	0 %	0 %	50 %	528830955
568	NC_021906	GTC	2	6	27496	27501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830955
569	NC_021906	CGC	2	6	27521	27526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830955
570	NC_021906	CG	3	6	27532	27537	0 %	0 %	50 %	50 %	528830955
571	NC_021906	CGG	2	6	27560	27565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830955
572	NC_021906	CTG	2	6	27625	27630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830955
573	NC_021906	GCTG	2	8	27662	27669	0 %	25 %	50 %	25 %	528830955
574	NC_021906	AGGCGG	2	12	27698	27709	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	528830955
575	NC_021906	GT	3	6	27715	27720	0 %	50 %	50 %	0 %	528830955
576	NC_021906	CGG	2	6	27759	27764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830955
577	NC_021906	GCT	2	6	27804	27809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830955
578	NC_021906	GCC	2	6	27868	27873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830955
579	NC_021906	GAT	2	6	27901	27906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528830955
580	NC_021906	CGA	2	6	27918	27923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830955
581	NC_021906	CAG	2	6	27970	27975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830955
582	NC_021906	GCG	3	9	27976	27984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830955
583	NC_021906	ATG	2	6	28012	28017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528830955
584	NC_021906	GCT	2	6	28037	28042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830955
585	NC_021906	TCG	2	6	28078	28083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830955
586	NC_021906	GAC	2	6	28095	28100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830955
587	NC_021906	GCC	2	6	28109	28114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830955
588	NC_021906	ACC	2	6	28126	28131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528830955
589	NC_021906	GCC	2	6	28165	28170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830955
590	NC_021906	GCA	2	6	28251	28256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830955
591	NC_021906	GC	3	6	28289	28294	0 %	0 %	50 %	50 %	528830955
592	NC_021906	GTG	2	6	28316	28321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528830955
593	NC_021906	CGG	2	6	28352	28357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830955
594	NC_021906	TGC	2	6	28454	28459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830955
595	NC_021906	GGC	2	6	28468	28473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830955
596	NC_021906	GGC	2	6	28476	28481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830955
597	NC_021906	GAC	2	6	28551	28556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830955
598	NC_021906	GCC	2	6	28567	28572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830955
599	NC_021906	ATC	2	6	28687	28692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528830955
600	NC_021906	GAA	2	6	28698	28703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528830955
601	NC_021906	GAT	2	6	28716	28721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528830955
602	NC_021906	CGG	2	6	28733	28738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830955
603	NC_021906	GAT	2	6	28842	28847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528830956
604	NC_021906	GA	3	6	28861	28866	50 %	0 %	50 %	0 %	528830956
605	NC_021906	ACC	2	6	28886	28891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528830956
606	NC_021906	GAA	2	6	28974	28979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528830956
607	NC_021906	GCC	2	6	28995	29000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830956
608	NC_021906	GCG	2	6	29013	29018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830956
609	NC_021906	TCA	2	6	29084	29089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528830956
610	NC_021906	CCG	2	6	29117	29122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830956
611	NC_021906	GCG	2	6	29123	29128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830956
612	NC_021906	TGC	2	6	29252	29257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830956
613	NC_021906	TCGGCA	2	12	29275	29286	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	528830956
614	NC_021906	GCG	2	6	29312	29317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830956
615	NC_021906	GGA	2	6	29456	29461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528830956
616	NC_021906	TCG	2	6	29482	29487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830956
617	NC_021906	GCAG	2	8	29501	29508	25 %	0 %	50 %	25 %	528830956
618	NC_021906	AAG	2	6	29537	29542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528830956
619	NC_021906	AG	3	6	29552	29557	50 %	0 %	50 %	0 %	528830956
620	NC_021906	TGC	2	6	29566	29571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830956
621	NC_021906	CCG	2	6	29890	29895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830957
622	NC_021906	TGCCGG	2	12	29958	29969	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	528830957
623	NC_021906	CGAG	2	8	30021	30028	25 %	0 %	50 %	25 %	528830957
624	NC_021906	CCG	2	6	30036	30041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830957
625	NC_021906	CGA	2	6	30051	30056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830957
626	NC_021906	CGG	2	6	30141	30146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830957
627	NC_021906	CGA	2	6	30156	30161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830957
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754	NC_021906	ATC	2	6	35388	35393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528830962
755	NC_021906	TCT	2	6	35422	35427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528830962
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757	NC_021906	CTT	2	6	35495	35500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528830962
758	NC_021906	GCCGAA	2	12	35504	35515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830962
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762	NC_021906	CG	3	6	35697	35702	0 %	0 %	50 %	50 %	528830962
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1000	NC_021906	CGAT	2	8	45251	45258	25 %	25 %	25 %	25 %	528830971

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