MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1

Total Repeats: 89164

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_021905	CAGCGC	2	12	194047	194058	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	528827031
4002	NC_021905	CCGG	2	8	194085	194092	0 %	0 %	50 %	50 %	528827031
4003	NC_021905	CTG	2	6	194095	194100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827031
4004	NC_021905	CGA	2	6	194106	194111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827031
4005	NC_021905	ACA	2	6	194116	194121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528827031
4006	NC_021905	GCT	2	6	194193	194198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827031
4007	NC_021905	TCA	2	6	194201	194206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528827031
4008	NC_021905	TCG	2	6	194270	194275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827031
4009	NC_021905	GAG	2	6	194290	194295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528827031
4010	NC_021905	TCT	2	6	194331	194336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528827031
4011	NC_021905	CG	3	6	194348	194353	0 %	0 %	50 %	50 %	528827031
4012	NC_021905	GCC	2	6	194358	194363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827031
4013	NC_021905	GGT	2	6	194385	194390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528827031
4014	NC_021905	CGT	2	6	194448	194453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827031
4015	NC_021905	GC	3	6	194493	194498	0 %	0 %	50 %	50 %	528827031
4016	NC_021905	GTC	2	6	194515	194520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827031
4017	NC_021905	TCG	2	6	194575	194580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827031
4018	NC_021905	GTC	2	6	194662	194667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827031
4019	NC_021905	GTCG	2	8	194703	194710	0 %	25 %	50 %	25 %	528827031
4020	NC_021905	GC	3	6	194745	194750	0 %	0 %	50 %	50 %	528827031
4021	NC_021905	GAG	2	6	194761	194766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528827031
4022	NC_021905	CTG	2	6	194781	194786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827031
4023	NC_021905	GGA	2	6	194793	194798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528827031
4024	NC_021905	GGC	2	6	194848	194853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827031
4025	NC_021905	CAGCGC	2	12	194854	194865	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	528827031
4026	NC_021905	CGA	2	6	194913	194918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827031
4027	NC_021905	GTC	2	6	194956	194961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827031
4028	NC_021905	CCT	2	6	194964	194969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528827031
4029	NC_021905	TCA	2	6	195008	195013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528827031
4030	NC_021905	GGT	2	6	195027	195032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528827031
4031	NC_021905	ACG	2	6	195047	195052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827031
4032	NC_021905	GGT	2	6	195075	195080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528827031
4033	NC_021905	CG	3	6	195109	195114	0 %	0 %	50 %	50 %	528827031
4034	NC_021905	CGCC	2	8	195176	195183	0 %	0 %	25 %	75 %	528827031
4035	NC_021905	GCA	2	6	195186	195191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827031
4036	NC_021905	TCC	2	6	195215	195220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528827032
4037	NC_021905	TCG	2	6	195226	195231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827032
4038	NC_021905	GCA	2	6	195292	195297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827032
4039	NC_021905	TCT	2	6	195409	195414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528827032
4040	NC_021905	GCG	2	6	195418	195423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827032
4041	NC_021905	CAT	2	6	195437	195442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528827032
4042	NC_021905	TCGT	2	8	195472	195479	0 %	50 %	25 %	25 %	528827032
4043	NC_021905	TCG	2	6	195481	195486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827032
4044	NC_021905	GAC	2	6	195497	195502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827032
4045	NC_021905	GTC	2	6	195519	195524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827032
4046	NC_021905	GCG	3	9	195575	195583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827032
4047	NC_021905	ATTG	2	8	195596	195603	25 %	50 %	25 %	0 %	528827032
4048	NC_021905	GCG	2	6	195612	195617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827032
4049	NC_021905	GAC	2	6	195818	195823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827032
4050	NC_021905	AAG	2	6	195849	195854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528827032
4051	NC_021905	CCG	2	6	195857	195862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827032
4052	NC_021905	TCA	2	6	195889	195894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528827032
4053	NC_021905	GCCG	2	8	195897	195904	0 %	0 %	50 %	50 %	528827032
4054	NC_021905	AGG	2	6	195946	195951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528827032
4055	NC_021905	CGG	2	6	195959	195964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827032
4056	NC_021905	TC	3	6	195969	195974	0 %	50 %	0 %	50 %	528827032
4057	NC_021905	TCA	2	6	196036	196041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528827032
4058	NC_021905	GAG	2	6	196065	196070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528827032
4059	NC_021905	GCG	2	6	196117	196122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827032
4060	NC_021905	GATC	2	8	196139	196146	25 %	25 %	25 %	25 %	528827032
4061	NC_021905	GCC	2	6	196149	196154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827032
4062	NC_021905	TTA	2	6	196157	196162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528827032
4063	NC_021905	GAT	2	6	196304	196309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528827033
4064	NC_021905	CCG	2	6	196374	196379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827033
4065	NC_021905	TGC	2	6	196423	196428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827033
4066	NC_021905	GCC	2	6	196480	196485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827033
4067	NC_021905	GCA	2	6	196508	196513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827033
4068	NC_021905	CAG	3	9	196530	196538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827033
4069	NC_021905	GCA	2	6	196548	196553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827033
4070	NC_021905	CGA	2	6	196561	196566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827033
4071	NC_021905	GC	3	6	196624	196629	0 %	0 %	50 %	50 %	528827033
4072	NC_021905	ATC	2	6	196894	196899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528827034
4073	NC_021905	GCT	2	6	196929	196934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827034
4074	NC_021905	GAT	2	6	196944	196949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528827034
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4076	NC_021905	TCA	2	6	196988	196993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528827034
4077	NC_021905	CGA	2	6	197028	197033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827034
4078	NC_021905	AAG	2	6	197083	197088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528827034
4079	NC_021905	GAT	2	6	197091	197096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528827034
4080	NC_021905	TGGC	2	8	197098	197105	0 %	25 %	50 %	25 %	528827034
4081	NC_021905	CG	3	6	197125	197130	0 %	0 %	50 %	50 %	528827034
4082	NC_021905	GAA	2	6	197196	197201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528827034
4083	NC_021905	GGAA	2	8	197237	197244	50 %	0 %	50 %	0 %	528827034
4084	NC_021905	ACC	2	6	197245	197250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528827034
4085	NC_021905	CGC	2	6	197425	197430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827034
4086	NC_021905	GAAG	2	8	197472	197479	50 %	0 %	50 %	0 %	528827034
4087	NC_021905	TGG	2	6	197573	197578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528827034
4088	NC_021905	GCC	2	6	197581	197586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827034
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4090	NC_021905	GGC	2	6	197656	197661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827034
4091	NC_021905	CTG	2	6	197665	197670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827034
4092	NC_021905	GC	3	6	197759	197764	0 %	0 %	50 %	50 %	528827034
4093	NC_021905	ATC	2	6	197788	197793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528827034
4094	NC_021905	TGG	2	6	197797	197802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528827034
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4098	NC_021905	GCC	2	6	198020	198025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827034
4099	NC_021905	CGG	2	6	198026	198031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827034
4100	NC_021905	GCCG	2	8	198069	198076	0 %	0 %	50 %	50 %	528827034
4101	NC_021905	TTC	2	6	198097	198102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528827034
4102	NC_021905	GC	3	6	198146	198151	0 %	0 %	50 %	50 %	528827035
4103	NC_021905	CGC	2	6	198154	198159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827035
4104	NC_021905	CGC	2	6	198198	198203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827035
4105	NC_021905	TCGA	2	8	198245	198252	25 %	25 %	25 %	25 %	528827035
4106	NC_021905	GCC	2	6	198739	198744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827036
4107	NC_021905	TAA	2	6	198778	198783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528827036
4108	NC_021905	GCC	2	6	198799	198804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827036
4109	NC_021905	CTC	2	6	198849	198854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528827036
4110	NC_021905	GCC	2	6	198878	198883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827036
4111	NC_021905	TGA	2	6	198911	198916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528827036
4112	NC_021905	TTC	2	6	198936	198941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528827036
4113	NC_021905	TCGAT	2	10	200423	200432	20 %	40 %	20 %	20 %	528827037
4114	NC_021905	TGC	2	6	200442	200447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827037
4115	NC_021905	CCG	2	6	200450	200455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827037
4116	NC_021905	CTA	2	6	200532	200537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528827037
4117	NC_021905	ATCC	2	8	200539	200546	25 %	25 %	0 %	50 %	528827037
4118	NC_021905	T	6	6	200621	200626	0 %	100 %	0 %	0 %	528827037
4119	NC_021905	GAT	2	6	200628	200633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528827037
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4121	NC_021905	CCG	2	6	200647	200652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827037
4122	NC_021905	A	6	6	201091	201096	100 %	0 %	0 %	0 %	528827038
4123	NC_021905	CGA	2	6	201131	201136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827038
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4152	NC_021905	GGC	2	6	202490	202495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827039
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4229	NC_021905	CGGC	2	8	205388	205395	0 %	0 %	50 %	50 %	528827041
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4232	NC_021905	CGGC	2	8	205508	205515	0 %	0 %	50 %	50 %	528827041
4233	NC_021905	GGC	2	6	205533	205538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827041
4234	NC_021905	GCCT	2	8	205579	205586	0 %	25 %	25 %	50 %	528827041
4235	NC_021905	CCG	2	6	205732	205737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827041
4236	NC_021905	GCCGA	2	10	205932	205941	20 %	0 %	40 %	40 %	528827042
4237	NC_021905	GCG	2	6	205966	205971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827042
4238	NC_021905	TCG	2	6	205981	205986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827042
4239	NC_021905	GCCC	2	8	206020	206027	0 %	0 %	25 %	75 %	528827042
4240	NC_021905	GCG	2	6	206029	206034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827042
4241	NC_021905	GCC	2	6	206038	206043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827042
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4244	NC_021905	ATCT	2	8	206079	206086	25 %	50 %	0 %	25 %	528827042
4245	NC_021905	GGCG	2	8	206096	206103	0 %	0 %	75 %	25 %	528827042
4246	NC_021905	AGA	2	6	206107	206112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528827042
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4345	NC_021905	GCCGAA	2	12	210605	210616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827048
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4347	NC_021905	CTTC	2	8	210703	210710	0 %	50 %	0 %	50 %	528827048
4348	NC_021905	GCGAA	2	10	210727	210736	40 %	0 %	40 %	20 %	528827048
4349	NC_021905	GC	3	6	210834	210839	0 %	0 %	50 %	50 %	528827048
4350	NC_021905	TGCG	2	8	210853	210860	0 %	25 %	50 %	25 %	528827048
4351	NC_021905	ATGG	2	8	210917	210924	25 %	25 %	50 %	0 %	528827048
4352	NC_021905	TTGGCC	2	12	211125	211136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827048
4353	NC_021905	AT	3	6	211162	211167	50 %	50 %	0 %	0 %	528827048
4354	NC_021905	TCG	2	6	211251	211256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827048
4355	NC_021905	TCAG	2	8	211266	211273	25 %	25 %	25 %	25 %	528827048
4356	NC_021905	TCC	2	6	211284	211289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528827048
4357	NC_021905	GC	3	6	211400	211405	0 %	0 %	50 %	50 %	528827048
4358	NC_021905	CTT	2	6	211463	211468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528827048
4359	NC_021905	CGGCC	2	10	211501	211510	0 %	0 %	40 %	60 %	528827049
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4361	NC_021905	CG	3	6	211620	211625	0 %	0 %	50 %	50 %	528827049
4362	NC_021905	CGG	2	6	211665	211670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827049
4363	NC_021905	CTT	2	6	211699	211704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528827049
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4365	NC_021905	CGA	2	6	211794	211799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827049
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4369	NC_021905	GCCG	2	8	211947	211954	0 %	0 %	50 %	50 %	528827049
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4389	NC_021905	CGT	2	6	213014	213019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827050
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4392	NC_021905	CGAC	2	8	213133	213140	25 %	0 %	25 %	50 %	528827050
4393	NC_021905	TGC	3	9	213174	213182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827050
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4467	NC_021905	CCGAC	2	10	217221	217230	20 %	0 %	20 %	60 %	528827056
4468	NC_021905	AAG	2	6	217280	217285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528827056
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4475	NC_021905	CGA	3	9	217524	217532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827056
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4481	NC_021905	AGC	2	6	217689	217694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827056
4482	NC_021905	TCC	2	6	217721	217726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528827056
4483	NC_021905	CGG	3	9	217783	217791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827056
4484	NC_021905	GGC	2	6	217795	217800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827056
4485	NC_021905	GGT	2	6	217867	217872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528827056
4486	NC_021905	GGC	2	6	217915	217920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827056
4487	NC_021905	CGG	2	6	217933	217938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827056
4488	NC_021905	CAG	2	6	217940	217945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827056
4489	NC_021905	CGA	2	6	217953	217958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827056
4490	NC_021905	GTC	2	6	218032	218037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827056
4491	NC_021905	CGG	2	6	218118	218123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827056
4492	NC_021905	GGC	2	6	218147	218152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827056
4493	NC_021905	GGCC	2	8	218164	218171	0 %	0 %	50 %	50 %	528827056
4494	NC_021905	GGC	2	6	218201	218206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827056
4495	NC_021905	GCT	2	6	218230	218235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827056
4496	NC_021905	TCA	2	6	218286	218291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528827056
4497	NC_021905	CCGG	2	8	218338	218345	0 %	0 %	50 %	50 %	528827056
4498	NC_021905	CTT	2	6	218380	218385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528827056
4499	NC_021905	GCC	2	6	218412	218417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827056
4500	NC_021905	GCA	2	6	218491	218496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827057

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