MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1

Total Repeats: 89164

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021905	TGCGGA	2	12	47247	47258	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	528826907
1002	NC_021905	GACC	2	8	47274	47281	25 %	0 %	25 %	50 %	528826907
1003	NC_021905	CGC	2	6	47305	47310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826907
1004	NC_021905	CCG	2	6	47313	47318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826907
1005	NC_021905	GCA	2	6	47345	47350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528826907
1006	NC_021905	CGC	2	6	47371	47376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826907
1007	NC_021905	AAGCC	2	10	47407	47416	40 %	0 %	20 %	40 %	528826907
1008	NC_021905	CGC	2	6	47487	47492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826907
1009	NC_021905	TCG	2	6	47565	47570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826908
1010	NC_021905	GATC	2	8	47595	47602	25 %	25 %	25 %	25 %	528826908
1011	NC_021905	CG	3	6	47620	47625	0 %	0 %	50 %	50 %	528826908
1012	NC_021905	TGG	2	6	47657	47662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528826908
1013	NC_021905	TTG	2	6	47663	47668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528826908
1014	NC_021905	GAA	2	6	47725	47730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528826908
1015	NC_021905	CCG	2	6	47820	47825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826908
1016	NC_021905	TCGTC	2	10	47835	47844	0 %	40 %	20 %	40 %	528826908
1017	NC_021905	GATC	2	8	47853	47860	25 %	25 %	25 %	25 %	528826908
1018	NC_021905	CGG	2	6	47882	47887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826908
1019	NC_021905	ATG	2	6	47944	47949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528826908
1020	NC_021905	TCG	2	6	47951	47956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826908
1021	NC_021905	GAA	2	6	48031	48036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528826908
1022	NC_021905	ACGGAA	2	12	48083	48094	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	528826908
1023	NC_021905	TGC	2	6	48139	48144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826908
1024	NC_021905	ACA	2	6	48335	48340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528826909
1025	NC_021905	GGC	2	6	48359	48364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826909
1026	NC_021905	GGT	2	6	48367	48372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528826909
1027	NC_021905	GGCG	2	8	48376	48383	0 %	0 %	75 %	25 %	528826909
1028	NC_021905	GCG	2	6	48436	48441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826909
1029	NC_021905	AAG	2	6	48518	48523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528826909
1030	NC_021905	GC	3	6	48550	48555	0 %	0 %	50 %	50 %	528826909
1031	NC_021905	ATG	2	6	48614	48619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528826909
1032	NC_021905	TCG	2	6	48621	48626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826909
1033	NC_021905	ACG	2	6	48689	48694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528826909
1034	NC_021905	GGC	2	6	48707	48712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826909
1035	NC_021905	CGC	3	9	48724	48732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826909
1036	NC_021905	GC	3	6	48778	48783	0 %	0 %	50 %	50 %	528826909
1037	NC_021905	CGC	2	6	48793	48798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826909
1038	NC_021905	ACCA	2	8	48815	48822	50 %	0 %	0 %	50 %	528826909
1039	NC_021905	GTG	2	6	48830	48835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528826909
1040	NC_021905	GAC	2	6	48967	48972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528826910
1041	NC_021905	C	6	6	48978	48983	0 %	0 %	0 %	100 %	528826910
1042	NC_021905	ATC	2	6	49013	49018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528826910
1043	NC_021905	ATG	2	6	49026	49031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528826910
1044	NC_021905	TGCGC	2	10	49051	49060	0 %	20 %	40 %	40 %	528826910
1045	NC_021905	CAG	2	6	49076	49081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528826910
1046	NC_021905	CGA	2	6	49099	49104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528826910
1047	NC_021905	TGA	2	6	49125	49130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528826910
1048	NC_021905	CGC	2	6	49166	49171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826910
1049	NC_021905	GC	3	6	49188	49193	0 %	0 %	50 %	50 %	528826910
1050	NC_021905	CCA	2	6	49212	49217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528826910
1051	NC_021905	ATC	2	6	49259	49264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528826910
1052	NC_021905	GAA	2	6	49303	49308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528826910
1053	NC_021905	CAC	2	6	49375	49380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528826910
1054	NC_021905	CGCC	2	8	49386	49393	0 %	0 %	25 %	75 %	528826910
1055	NC_021905	AAG	2	6	49412	49417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528826910
1056	NC_021905	CGA	2	6	49435	49440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528826910
1057	NC_021905	GGC	2	6	49484	49489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826910
1058	NC_021905	AAG	2	6	49574	49579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528826910
1059	NC_021905	ACG	2	6	49586	49591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528826910
1060	NC_021905	CCT	2	6	49599	49604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528826910
1061	NC_021905	CG	3	6	49673	49678	0 %	0 %	50 %	50 %	528826910
1062	NC_021905	CGC	2	6	49723	49728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826910
1063	NC_021905	CGG	2	6	49735	49740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826910
1064	NC_021905	CG	3	6	49758	49763	0 %	0 %	50 %	50 %	528826910
1065	NC_021905	CTG	2	6	49781	49786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826910
1066	NC_021905	TCG	2	6	49791	49796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826910
1067	NC_021905	ACG	2	6	49802	49807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528826910
1068	NC_021905	TCT	2	6	49891	49896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528826910
1069	NC_021905	GCC	2	6	49911	49916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826910
1070	NC_021905	AGG	2	6	49950	49955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528826910
1071	NC_021905	AAGC	2	8	49983	49990	50 %	0 %	25 %	25 %	528826910
1072	NC_021905	GAC	2	6	50048	50053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528826910
1073	NC_021905	CGAT	2	8	50055	50062	25 %	25 %	25 %	25 %	528826910
1074	NC_021905	CTC	2	6	50092	50097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528826910
1075	NC_021905	CGAT	2	8	50196	50203	25 %	25 %	25 %	25 %	528826910
1076	NC_021905	CGTC	2	8	50582	50589	0 %	25 %	25 %	50 %	528826911
1077	NC_021905	CGC	2	6	50590	50595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826911
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1079	NC_021905	CTT	2	6	50647	50652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528826911
1080	NC_021905	GTC	2	6	50722	50727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826911
1081	NC_021905	AC	3	6	50745	50750	50 %	0 %	0 %	50 %	528826911
1082	NC_021905	TAT	2	6	50785	50790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528826911
1083	NC_021905	GAT	2	6	50851	50856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528826911
1084	NC_021905	GCG	2	6	50966	50971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826911
1085	NC_021905	CAA	2	6	50982	50987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528826911
1086	NC_021905	TCT	2	6	51002	51007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528826911
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1088	NC_021905	TCGC	2	8	51166	51173	0 %	25 %	25 %	50 %	528826911
1089	NC_021905	TCG	2	6	51176	51181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826911
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1091	NC_021905	CGA	2	6	51204	51209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528826911
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1095	NC_021905	ATC	2	6	51529	51534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528826912
1096	NC_021905	ATC	2	6	51538	51543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528826912
1097	NC_021905	TTC	2	6	51607	51612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528826912
1098	NC_021905	AC	3	6	51618	51623	50 %	0 %	0 %	50 %	528826912
1099	NC_021905	GCC	2	6	51673	51678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826912
1100	NC_021905	TGC	2	6	51710	51715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826912
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1103	NC_021905	TGC	2	6	51830	51835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826912
1104	NC_021905	GC	4	8	52044	52051	0 %	0 %	50 %	50 %	528826912
1105	NC_021905	CCT	2	6	52052	52057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528826912
1106	NC_021905	CGG	2	6	52080	52085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826912
1107	NC_021905	CGC	3	9	52164	52172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826912
1108	NC_021905	GGA	2	6	52176	52181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528826912
1109	NC_021905	GCT	2	6	52191	52196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826912
1110	NC_021905	GAG	3	9	52228	52236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528826912
1111	NC_021905	GAC	2	6	52278	52283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528826912
1112	NC_021905	GAC	2	6	52371	52376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528826912
1113	NC_021905	GCG	2	6	52423	52428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826912
1114	NC_021905	GAA	2	6	52432	52437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528826912
1115	NC_021905	CCG	2	6	52453	52458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826912
1116	NC_021905	CGC	2	6	52476	52481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528826912
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1119	NC_021905	CG	3	6	52598	52603	0 %	0 %	50 %	50 %	528826912
1120	NC_021905	CG	3	6	52682	52687	0 %	0 %	50 %	50 %	528826912
1121	NC_021905	AGG	2	6	52715	52720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528826912
1122	NC_021905	TGA	2	6	52739	52744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528826912
1123	NC_021905	CCGTTT	2	12	52749	52760	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	528826912
1124	NC_021905	ACC	2	6	52774	52779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528826912
1125	NC_021905	GAC	2	6	52803	52808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528826912
1126	NC_021905	AGG	2	6	53016	53021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528826913
1127	NC_021905	CGAT	2	8	53037	53044	25 %	25 %	25 %	25 %	528826913
1128	NC_021905	CG	3	6	53102	53107	0 %	0 %	50 %	50 %	528826913
1129	NC_021905	CTG	2	6	53108	53113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826913
1130	NC_021905	CGA	2	6	53122	53127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528826913
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1132	NC_021905	GCA	2	6	53205	53210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528826913
1133	NC_021905	CCT	2	6	53218	53223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528826913
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1137	NC_021905	ACG	2	6	53400	53405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528826913
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1495	NC_021905	CGG	2	6	77128	77133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826926
1496	NC_021905	GC	3	6	77137	77142	0 %	0 %	50 %	50 %	528826926
1497	NC_021905	ATC	2	6	77148	77153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528826926
1498	NC_021905	CTG	2	6	77328	77333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528826926
1499	NC_021905	GGC	2	6	77368	77373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826926
1500	NC_021905	GCG	2	6	77407	77412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528826926

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