MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1

Total Repeats: 89164

< Previous12...167168169170171172173174175176177178179Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
89001	NC_021905	GCC	2	6	4276364	4276369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830918
89002	NC_021905	CAC	2	6	4276423	4276428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528830918
89003	NC_021905	GTC	2	6	4276486	4276491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830918
89004	NC_021905	GAA	2	6	4276492	4276497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528830918
89005	NC_021905	ATC	2	6	4276541	4276546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528830918
89006	NC_021905	GTC	2	6	4276629	4276634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830918
89007	NC_021905	TCAT	2	8	4276649	4276656	25 %	50 %	0 %	25 %	528830918
89008	NC_021905	CAT	2	6	4276871	4276876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528830919
89009	NC_021905	ACC	2	6	4276879	4276884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528830919
89010	NC_021905	TTG	2	6	4276897	4276902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528830919
89011	NC_021905	CGA	2	6	4276960	4276965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830919
89012	NC_021905	CTGA	2	8	4276968	4276975	25 %	25 %	25 %	25 %	528830919
89013	NC_021905	GCC	2	6	4277050	4277055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830919
89014	NC_021905	CAG	2	6	4277070	4277075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830919
89015	NC_021905	AAG	2	6	4277081	4277086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528830919
89016	NC_021905	GAA	2	6	4277099	4277104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528830919
89017	NC_021905	GGA	2	6	4277130	4277135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528830919
89018	NC_021905	CTG	2	6	4277169	4277174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830919
89019	NC_021905	AGG	2	6	4277291	4277296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528830919
89020	NC_021905	CGAT	2	8	4277314	4277321	25 %	25 %	25 %	25 %	528830919
89021	NC_021905	CGA	2	6	4277360	4277365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830919
89022	NC_021905	GCG	2	6	4277386	4277391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830919
89023	NC_021905	GGT	2	6	4277415	4277420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528830919
89024	NC_021905	TTA	2	6	4277456	4277461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528830919
89025	NC_021905	GCCA	2	8	4277475	4277482	25 %	0 %	25 %	50 %	528830919
89026	NC_021905	TC	3	6	4277612	4277617	0 %	50 %	0 %	50 %	528830920
89027	NC_021905	TTCGA	2	10	4277761	4277770	20 %	40 %	20 %	20 %	528830920
89028	NC_021905	GCT	2	6	4277825	4277830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830920
89029	NC_021905	T	6	6	4277830	4277835	0 %	100 %	0 %	0 %	528830920
89030	NC_021905	C	6	6	4277864	4277869	0 %	0 %	0 %	100 %	528830920
89031	NC_021905	AAG	2	6	4277882	4277887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528830920
89032	NC_021905	ACC	3	9	4277911	4277919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528830920
89033	NC_021905	CCA	2	6	4278021	4278026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528830920
89034	NC_021905	GTC	2	6	4278075	4278080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830920
89035	NC_021905	CTG	2	6	4278169	4278174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830921
89036	NC_021905	CGC	2	6	4278232	4278237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830921
89037	NC_021905	AGC	2	6	4278259	4278264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830921
89038	NC_021905	GTTC	2	8	4278282	4278289	0 %	50 %	25 %	25 %	528830921
89039	NC_021905	CCG	2	6	4278331	4278336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830921
89040	NC_021905	CTC	2	6	4278337	4278342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528830921
89041	NC_021905	GTT	2	6	4278348	4278353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528830921
89042	NC_021905	CGC	3	9	4278364	4278372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830921
89043	NC_021905	TCC	2	6	4278449	4278454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528830921
89044	NC_021905	GCG	2	6	4278473	4278478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830921
89045	NC_021905	CG	3	6	4278550	4278555	0 %	0 %	50 %	50 %	528830921
89046	NC_021905	GC	3	6	4278641	4278646	0 %	0 %	50 %	50 %	528830921
89047	NC_021905	CA	3	6	4278655	4278660	50 %	0 %	0 %	50 %	528830921
89048	NC_021905	GTC	2	6	4278781	4278786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830921
89049	NC_021905	ATC	2	6	4278788	4278793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528830921
89050	NC_021905	GGC	2	6	4278853	4278858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830921
89051	NC_021905	CCT	2	6	4278891	4278896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528830921
89052	NC_021905	GGT	2	6	4278904	4278909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528830921
89053	NC_021905	CT	3	6	4278973	4278978	0 %	50 %	0 %	50 %	528830921
89054	NC_021905	TAA	2	6	4279053	4279058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528830921
89055	NC_021905	TCA	2	6	4279115	4279120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528830921
89056	NC_021905	AAGA	2	8	4279138	4279145	75 %	0 %	25 %	0 %	528830921
89057	NC_021905	GGAC	2	8	4279192	4279199	25 %	0 %	50 %	25 %	528830921
89058	NC_021905	GGT	2	6	4279285	4279290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528830921
89059	NC_021905	CGC	2	6	4279299	4279304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830921
89060	NC_021905	GTG	2	6	4279319	4279324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528830921
89061	NC_021905	CTC	2	6	4279357	4279362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528830921
89062	NC_021905	GCCGG	2	10	4279413	4279422	0 %	0 %	60 %	40 %	528830921
89063	NC_021905	ATG	2	6	4279607	4279612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528830921
89064	NC_021905	ATA	2	6	4279664	4279669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528830921
89065	NC_021905	GCG	2	6	4279694	4279699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830921
89066	NC_021905	CCAT	2	8	4279823	4279830	25 %	25 %	0 %	50 %	528830921
89067	NC_021905	CCG	2	6	4279868	4279873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830921
89068	NC_021905	AGC	2	6	4279948	4279953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830921
89069	NC_021905	GCC	2	6	4279961	4279966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830921
89070	NC_021905	CCG	2	6	4279985	4279990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830921
89071	NC_021905	AGC	2	6	4280129	4280134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830922
89072	NC_021905	AGAC	2	8	4280302	4280309	50 %	0 %	25 %	25 %	528830922
89073	NC_021905	CTT	2	6	4280425	4280430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528830922
89074	NC_021905	ATC	2	6	4280477	4280482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528830922
89075	NC_021905	CAG	2	6	4280503	4280508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830922
89076	NC_021905	GC	3	6	4280540	4280545	0 %	0 %	50 %	50 %	528830922
89077	NC_021905	GTC	2	6	4280569	4280574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830922
89078	NC_021905	CGG	2	6	4280589	4280594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830922
89079	NC_021905	GCA	2	6	4280640	4280645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830922
89080	NC_021905	CG	3	6	4280649	4280654	0 %	0 %	50 %	50 %	528830922
89081	NC_021905	CAC	2	6	4280746	4280751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528830922
89082	NC_021905	GAT	2	6	4280767	4280772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528830922
89083	NC_021905	CGCC	2	8	4280775	4280782	0 %	0 %	25 %	75 %	528830922
89084	NC_021905	TCG	2	6	4280810	4280815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830922
89085	NC_021905	CGT	2	6	4280865	4280870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830922
89086	NC_021905	TCG	2	6	4280873	4280878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830922
89087	NC_021905	AGCCCG	2	12	4280905	4280916	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	528830922
89088	NC_021905	ACC	2	6	4280956	4280961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528830922
89089	NC_021905	CTCGAC	2	12	4281028	4281039	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	528830922
89090	NC_021905	CGC	2	6	4281068	4281073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830922
89091	NC_021905	CGA	2	6	4281123	4281128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830922
89092	NC_021905	GCC	2	6	4281134	4281139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830922
89093	NC_021905	A	6	6	4281208	4281213	100 %	0 %	0 %	0 %	528830922
89094	NC_021905	GTT	2	6	4281241	4281246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528830922
89095	NC_021905	AT	3	6	4281312	4281317	50 %	50 %	0 %	0 %	528830922
89096	NC_021905	GAA	2	6	4281534	4281539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528830923
89097	NC_021905	ATT	2	6	4281546	4281551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528830923
89098	NC_021905	ACG	2	6	4281618	4281623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830923
89099	NC_021905	TCT	2	6	4281635	4281640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528830923
89100	NC_021905	AAG	2	6	4281660	4281665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528830923
89101	NC_021905	TTC	2	6	4281771	4281776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528830923
89102	NC_021905	GAT	2	6	4281825	4281830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528830923
89103	NC_021905	ACC	2	6	4281840	4281845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528830923
89104	NC_021905	GC	3	6	4281858	4281863	0 %	0 %	50 %	50 %	528830923
89105	NC_021905	GAA	2	6	4281870	4281875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528830923
89106	NC_021905	CGC	2	6	4281908	4281913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830923
89107	NC_021905	GGA	2	6	4281930	4281935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528830923
89108	NC_021905	AATCG	2	10	4281972	4281981	40 %	20 %	20 %	20 %	528830923
89109	NC_021905	GAC	2	6	4281990	4281995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830923
89110	NC_021905	GCTTT	2	10	4282019	4282028	0 %	60 %	20 %	20 %	528830923
89111	NC_021905	TCG	2	6	4282072	4282077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830923
89112	NC_021905	GAG	2	6	4282084	4282089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528830923
89113	NC_021905	TCG	2	6	4282141	4282146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830923
89114	NC_021905	GCG	3	9	4282232	4282240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830923
89115	NC_021905	CGA	2	6	4282241	4282246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830923
89116	NC_021905	CCA	2	6	4282277	4282282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528830923
89117	NC_021905	GCG	2	6	4282358	4282363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830923
89118	NC_021905	TCG	2	6	4282405	4282410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830923
89119	NC_021905	AGC	2	6	4282432	4282437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830923
89120	NC_021905	CCTT	2	8	4282453	4282460	0 %	50 %	0 %	50 %	528830923
89121	NC_021905	CGG	2	6	4282510	4282515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830923
89122	NC_021905	GTC	2	6	4282539	4282544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830923
89123	NC_021905	CGAA	2	8	4282572	4282579	50 %	0 %	25 %	25 %	528830923
89124	NC_021905	CGA	2	6	4282607	4282612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830923
89125	NC_021905	GAT	2	6	4282623	4282628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528830923
89126	NC_021905	AGA	2	6	4282729	4282734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528830923
89127	NC_021905	CAC	2	6	4282996	4283001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528830924
89128	NC_021905	ATC	2	6	4283021	4283026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528830924
89129	NC_021905	GC	3	6	4283062	4283067	0 %	0 %	50 %	50 %	528830924
89130	NC_021905	CG	3	6	4283095	4283100	0 %	0 %	50 %	50 %	528830924
89131	NC_021905	GCT	2	6	4283107	4283112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830924
89132	NC_021905	GAA	2	6	4283113	4283118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528830924
89133	NC_021905	CAG	2	6	4283134	4283139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830924
89134	NC_021905	CAC	2	6	4283140	4283145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528830924
89135	NC_021905	TGCA	2	8	4283158	4283165	25 %	25 %	25 %	25 %	528830924
89136	NC_021905	GCC	2	6	4283170	4283175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830924
89137	NC_021905	GACC	2	8	4283188	4283195	25 %	0 %	25 %	50 %	528830924
89138	NC_021905	CAT	2	6	4283227	4283232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528830924
89139	NC_021905	ATG	3	9	4283243	4283251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528830924
89140	NC_021905	AGC	2	6	4283255	4283260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830924
89141	NC_021905	AAC	2	6	4283327	4283332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528830924
89142	NC_021905	GAT	2	6	4283374	4283379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528830924
89143	NC_021905	AGAGAT	2	12	4283397	4283408	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	528830924
89144	NC_021905	AAG	2	6	4283450	4283455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528830924
89145	NC_021905	GC	3	6	4283469	4283474	0 %	0 %	50 %	50 %	528830924
89146	NC_021905	GCG	2	6	4283591	4283596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830925
89147	NC_021905	GAT	2	6	4283639	4283644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528830925
89148	NC_021905	TCG	2	6	4283653	4283658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830925
89149	NC_021905	CTT	2	6	4283663	4283668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528830925
89150	NC_021905	GCC	2	6	4283679	4283684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830925
89151	NC_021905	CGA	2	6	4283687	4283692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830925
89152	NC_021905	GGAC	2	8	4283759	4283766	25 %	0 %	50 %	25 %	528830925
89153	NC_021905	TCT	2	6	4283795	4283800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528830925
89154	NC_021905	CG	3	6	4283849	4283854	0 %	0 %	50 %	50 %	528830925
89155	NC_021905	CGC	2	6	4283863	4283868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830925
89156	NC_021905	ATC	2	6	4283884	4283889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528830925
89157	NC_021905	AGC	2	6	4284022	4284027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830925
89158	NC_021905	CAG	2	6	4284030	4284035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528830925
89159	NC_021905	GC	3	6	4284134	4284139	0 %	0 %	50 %	50 %	528830925
89160	NC_021905	CCG	2	6	4284186	4284191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528830925
89161	NC_021905	TCG	2	6	4284229	4284234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528830925
89162	NC_021905	ATCG	2	8	4284261	4284268	25 %	25 %	25 %	25 %	528830925
89163	NC_021905	CGG	2	6	4284373	4284378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528830925
89164	NC_021905	CCTG	2	8	4284481	4284488	0 %	25 %	25 %	50 %	528830925

< Previous12...167168169170171172173174175176177178179Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.