MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Roseburia intestinalis M50/1 draft genome

Total Repeats: 8226

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021040	GAAA	2	8	822	829	75 %	0 %	25 %	0 %	479201825
2	NC_021040	TAAA	2	8	1316	1323	75 %	25 %	0 %	0 %	479201825
3	NC_021040	TGTC	2	8	1648	1655	0 %	50 %	25 %	25 %	479201826
4	NC_021040	TGAA	2	8	1717	1724	50 %	25 %	25 %	0 %	479201826
5	NC_021040	AGAT	2	8	2311	2318	50 %	25 %	25 %	0 %	479201826
6	NC_021040	ATAA	2	8	4535	4542	75 %	25 %	0 %	0 %	479201828
7	NC_021040	AGTT	2	8	4834	4841	25 %	50 %	25 %	0 %	479201828
8	NC_021040	CAAC	2	8	4863	4870	50 %	0 %	0 %	50 %	479201828
9	NC_021040	TAAA	2	8	6126	6133	75 %	25 %	0 %	0 %	479201829
10	NC_021040	GAAA	3	12	7030	7041	75 %	0 %	25 %	0 %	479201831
11	NC_021040	CATA	2	8	7179	7186	50 %	25 %	0 %	25 %	479201832
12	NC_021040	TATT	2	8	7298	7305	25 %	75 %	0 %	0 %	479201832
13	NC_021040	AAAT	2	8	8089	8096	75 %	25 %	0 %	0 %	479201835
14	NC_021040	TATT	2	8	8510	8517	25 %	75 %	0 %	0 %	479201835
15	NC_021040	TGTA	2	8	8637	8644	25 %	50 %	25 %	0 %	479201835
16	NC_021040	AGTA	2	8	8695	8702	50 %	25 %	25 %	0 %	479201835
17	NC_021040	ACAG	2	8	9215	9222	50 %	0 %	25 %	25 %	479201835
18	NC_021040	TGAG	2	8	9961	9968	25 %	25 %	50 %	0 %	479201836
19	NC_021040	AAGT	2	8	10430	10437	50 %	25 %	25 %	0 %	479201836
20	NC_021040	ATAA	2	8	10723	10730	75 %	25 %	0 %	0 %	479201837
21	NC_021040	TTTG	2	8	12965	12972	0 %	75 %	25 %	0 %	479201839
22	NC_021040	CAGC	2	8	13643	13650	25 %	0 %	25 %	50 %	479201840
23	NC_021040	ACAG	2	8	13712	13719	50 %	0 %	25 %	25 %	479201840
24	NC_021040	AATG	2	8	13843	13850	50 %	25 %	25 %	0 %	479201840
25	NC_021040	AGAC	2	8	14248	14255	50 %	0 %	25 %	25 %	479201840
26	NC_021040	TATG	2	8	14630	14637	25 %	50 %	25 %	0 %	479201840
27	NC_021040	AGTA	2	8	15024	15031	50 %	25 %	25 %	0 %	479201841
28	NC_021040	CCGT	2	8	16044	16051	0 %	25 %	25 %	50 %	479201843
29	NC_021040	ATTG	2	8	16090	16097	25 %	50 %	25 %	0 %	479201843
30	NC_021040	CAAT	2	8	16196	16203	50 %	25 %	0 %	25 %	479201843
31	NC_021040	TTAT	2	8	18159	18166	25 %	75 %	0 %	0 %	479201844
32	NC_021040	GTAT	2	8	18622	18629	25 %	50 %	25 %	0 %	479201844
33	NC_021040	GATA	2	8	18970	18977	50 %	25 %	25 %	0 %	479201844
34	NC_021040	AATA	2	8	19046	19053	75 %	25 %	0 %	0 %	479201844
35	NC_021040	CCAG	2	8	19294	19301	25 %	0 %	25 %	50 %	479201845
36	NC_021040	AAAG	2	8	20375	20382	75 %	0 %	25 %	0 %	479201845
37	NC_021040	TGGC	2	8	21599	21606	0 %	25 %	50 %	25 %	479201846
38	NC_021040	ATCT	2	8	21621	21628	25 %	50 %	0 %	25 %	479201846
39	NC_021040	TTGT	2	8	21729	21736	0 %	75 %	25 %	0 %	479201846
40	NC_021040	TGGA	2	8	22592	22599	25 %	25 %	50 %	0 %	479201848
41	NC_021040	AAGA	2	8	22727	22734	75 %	0 %	25 %	0 %	479201848
42	NC_021040	AAGA	2	8	22811	22818	75 %	0 %	25 %	0 %	479201848
43	NC_021040	GAAG	2	8	22942	22949	50 %	0 %	50 %	0 %	479201848
44	NC_021040	AAAG	2	8	22954	22961	75 %	0 %	25 %	0 %	479201848
45	NC_021040	AACA	2	8	23216	23223	75 %	0 %	0 %	25 %	479201849
46	NC_021040	ACTG	2	8	23279	23286	25 %	25 %	25 %	25 %	479201849
47	NC_021040	TCTT	2	8	23615	23622	0 %	75 %	0 %	25 %	479201849
48	NC_021040	GATG	2	8	24083	24090	25 %	25 %	50 %	0 %	479201850
49	NC_021040	TGAT	2	8	24121	24128	25 %	50 %	25 %	0 %	479201850
50	NC_021040	TTAT	2	8	24217	24224	25 %	75 %	0 %	0 %	479201850
51	NC_021040	AAGA	2	8	24521	24528	75 %	0 %	25 %	0 %	479201850
52	NC_021040	AGAA	2	8	24734	24741	75 %	0 %	25 %	0 %	479201850
53	NC_021040	GCAG	2	8	24956	24963	25 %	0 %	50 %	25 %	479201850
54	NC_021040	AAAG	2	8	25064	25071	75 %	0 %	25 %	0 %	479201850
55	NC_021040	AGGC	2	8	25258	25265	25 %	0 %	50 %	25 %	479201850
56	NC_021040	CAGT	2	8	25923	25930	25 %	25 %	25 %	25 %	479201851
57	NC_021040	AGAA	2	8	25971	25978	75 %	0 %	25 %	0 %	479201851
58	NC_021040	ATCA	2	8	26314	26321	50 %	25 %	0 %	25 %	479201852
59	NC_021040	TGGA	2	8	27201	27208	25 %	25 %	50 %	0 %	479201852
60	NC_021040	TGAA	2	8	27807	27814	50 %	25 %	25 %	0 %	479201852
61	NC_021040	TACC	2	8	27979	27986	25 %	25 %	0 %	50 %	479201852
62	NC_021040	GACA	2	8	28210	28217	50 %	0 %	25 %	25 %	479201852
63	NC_021040	ATGA	2	8	28445	28452	50 %	25 %	25 %	0 %	479201852
64	NC_021040	AATA	2	8	29031	29038	75 %	25 %	0 %	0 %	479201853
65	NC_021040	GATG	2	8	29063	29070	25 %	25 %	50 %	0 %	479201853
66	NC_021040	ATGG	2	8	29085	29092	25 %	25 %	50 %	0 %	479201853
67	NC_021040	ACGG	2	8	29502	29509	25 %	0 %	50 %	25 %	479201853
68	NC_021040	GCAT	2	8	29666	29673	25 %	25 %	25 %	25 %	479201854
69	NC_021040	TTAT	2	8	29675	29682	25 %	75 %	0 %	0 %	479201854
70	NC_021040	GGCA	2	8	29719	29726	25 %	0 %	50 %	25 %	479201854
71	NC_021040	ATTT	2	8	29786	29793	25 %	75 %	0 %	0 %	479201854
72	NC_021040	GGCA	2	8	31048	31055	25 %	0 %	50 %	25 %	479201855
73	NC_021040	GCAT	2	8	31368	31375	25 %	25 %	25 %	25 %	479201856
74	NC_021040	ACTG	2	8	31760	31767	25 %	25 %	25 %	25 %	479201856
75	NC_021040	CAGA	2	8	32031	32038	50 %	0 %	25 %	25 %	479201856
76	NC_021040	TTGT	2	8	32056	32063	0 %	75 %	25 %	0 %	479201856
77	NC_021040	ATCC	2	8	32221	32228	25 %	25 %	0 %	50 %	479201856
78	NC_021040	CAAT	2	8	32707	32714	50 %	25 %	0 %	25 %	479201856
79	NC_021040	CAAC	2	8	32905	32912	50 %	0 %	0 %	50 %	479201856
80	NC_021040	CATC	2	8	33283	33290	25 %	25 %	0 %	50 %	479201856
81	NC_021040	CTTT	2	8	33372	33379	0 %	75 %	0 %	25 %	479201856
82	NC_021040	AAAC	2	8	33595	33602	75 %	0 %	0 %	25 %	479201856
83	NC_021040	CTTC	2	8	33709	33716	0 %	50 %	0 %	50 %	479201856
84	NC_021040	ACCA	2	8	33897	33904	50 %	0 %	0 %	50 %	479201856
85	NC_021040	GTAA	2	8	34304	34311	50 %	25 %	25 %	0 %	479201857
86	NC_021040	CTTT	2	8	35476	35483	0 %	75 %	0 %	25 %	479201858
87	NC_021040	CTTT	2	8	35491	35498	0 %	75 %	0 %	25 %	479201858
88	NC_021040	ATAA	2	8	35574	35581	75 %	25 %	0 %	0 %	479201858
89	NC_021040	AATG	2	8	35947	35954	50 %	25 %	25 %	0 %	479201859
90	NC_021040	GATC	2	8	36047	36054	25 %	25 %	25 %	25 %	479201859
91	NC_021040	CAGA	2	8	36195	36202	50 %	0 %	25 %	25 %	479201859
92	NC_021040	CTAT	2	8	36232	36239	25 %	50 %	0 %	25 %	479201859
93	NC_021040	GGAC	2	8	36407	36414	25 %	0 %	50 %	25 %	479201859
94	NC_021040	GATC	2	8	36491	36498	25 %	25 %	25 %	25 %	479201859
95	NC_021040	AATG	2	8	36632	36639	50 %	25 %	25 %	0 %	479201859
96	NC_021040	AGGA	2	8	37072	37079	50 %	0 %	50 %	0 %	479201860
97	NC_021040	TCAG	2	8	37084	37091	25 %	25 %	25 %	25 %	479201860
98	NC_021040	TGTT	2	8	38550	38557	0 %	75 %	25 %	0 %	479201862
99	NC_021040	TCCG	2	8	38712	38719	0 %	25 %	25 %	50 %	479201862
100	NC_021040	TGTT	2	8	38787	38794	0 %	75 %	25 %	0 %	479201862
101	NC_021040	TCCG	2	8	38865	38872	0 %	25 %	25 %	50 %	479201862
102	NC_021040	AGAA	2	8	39688	39695	75 %	0 %	25 %	0 %	479201863
103	NC_021040	GCAG	2	8	39855	39862	25 %	0 %	50 %	25 %	479201864
104	NC_021040	AGAC	2	8	40026	40033	50 %	0 %	25 %	25 %	479201864
105	NC_021040	GCAG	2	8	40071	40078	25 %	0 %	50 %	25 %	479201864
106	NC_021040	ATCA	2	8	40753	40760	50 %	25 %	0 %	25 %	479201864
107	NC_021040	TGAA	2	8	41108	41115	50 %	25 %	25 %	0 %	479201864
108	NC_021040	AAAT	2	8	41242	41249	75 %	25 %	0 %	0 %	479201864
109	NC_021040	ATGG	2	8	41331	41338	25 %	25 %	50 %	0 %	479201865
110	NC_021040	TGCT	2	8	42666	42673	0 %	50 %	25 %	25 %	479201866
111	NC_021040	AAGG	2	8	43537	43544	50 %	0 %	50 %	0 %	479201867
112	NC_021040	TTAC	2	8	43877	43884	25 %	50 %	0 %	25 %	479201867
113	NC_021040	AAAG	2	8	44553	44560	75 %	0 %	25 %	0 %	479201867
114	NC_021040	AGGA	2	8	45383	45390	50 %	0 %	50 %	0 %	479201867
115	NC_021040	GCCA	2	8	45947	45954	25 %	0 %	25 %	50 %	479201867
116	NC_021040	ATGT	2	8	45964	45971	25 %	50 %	25 %	0 %	479201867
117	NC_021040	CAGT	2	8	46214	46221	25 %	25 %	25 %	25 %	479201867
118	NC_021040	AGGA	2	8	46346	46353	50 %	0 %	50 %	0 %	479201867
119	NC_021040	ACCA	2	8	47689	47696	50 %	0 %	0 %	50 %	479201868
120	NC_021040	TATC	2	8	47760	47767	25 %	50 %	0 %	25 %	479201868
121	NC_021040	ATTT	2	8	47793	47800	25 %	75 %	0 %	0 %	479201868
122	NC_021040	TATT	2	8	48485	48492	25 %	75 %	0 %	0 %	479201868
123	NC_021040	ATCG	2	8	48507	48514	25 %	25 %	25 %	25 %	479201868
124	NC_021040	GATG	2	8	48630	48637	25 %	25 %	50 %	0 %	479201868
125	NC_021040	ATTT	2	8	48681	48688	25 %	75 %	0 %	0 %	479201868
126	NC_021040	GAAA	2	8	48721	48728	75 %	0 %	25 %	0 %	479201868
127	NC_021040	CAGC	2	8	49449	49456	25 %	0 %	25 %	50 %	479201869
128	NC_021040	ATGG	2	8	50029	50036	25 %	25 %	50 %	0 %	479201870
129	NC_021040	TGAA	2	8	50285	50292	50 %	25 %	25 %	0 %	479201870
130	NC_021040	TGGA	2	8	50312	50319	25 %	25 %	50 %	0 %	479201870
131	NC_021040	GACG	2	8	53456	53463	25 %	0 %	50 %	25 %	479201871
132	NC_021040	AGCA	2	8	55323	55330	50 %	0 %	25 %	25 %	479201873
133	NC_021040	CGAT	2	8	55727	55734	25 %	25 %	25 %	25 %	479201873
134	NC_021040	TCAT	2	8	56039	56046	25 %	50 %	0 %	25 %	479201873
135	NC_021040	AGTA	2	8	56230	56237	50 %	25 %	25 %	0 %	479201874
136	NC_021040	TGGA	2	8	56774	56781	25 %	25 %	50 %	0 %	479201874
137	NC_021040	AAAG	2	8	59107	59114	75 %	0 %	25 %	0 %	479201877
138	NC_021040	TCAA	2	8	59563	59570	50 %	25 %	0 %	25 %	479201878
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140	NC_021040	CGGA	2	8	61715	61722	25 %	0 %	50 %	25 %	479201880
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