MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Roseburia intestinalis M50/1 draft genome

Total Repeats: 65450

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_021040	ATC	2	6	253613	253618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202040
4002	NC_021040	CGG	2	6	253636	253641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479202040
4003	NC_021040	AT	3	6	253643	253648	50 %	50 %	0 %	0 %	479202040
4004	NC_021040	GAAAAA	2	12	253668	253679	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	479202040
4005	NC_021040	CGC	2	6	253685	253690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479202040
4006	NC_021040	TG	3	6	253754	253759	0 %	50 %	50 %	0 %	479202040
4007	NC_021040	GAT	3	9	253781	253789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202040
4008	NC_021040	CATC	2	8	253792	253799	25 %	25 %	0 %	50 %	479202040
4009	NC_021040	TCGAG	2	10	253810	253819	20 %	20 %	40 %	20 %	479202040
4010	NC_021040	CG	3	6	253824	253829	0 %	0 %	50 %	50 %	479202040
4011	NC_021040	CCT	2	6	253837	253842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479202040
4012	NC_021040	TGTGG	2	10	254093	254102	0 %	40 %	60 %	0 %	479202041
4013	NC_021040	GCT	2	6	254111	254116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202041
4014	NC_021040	TGG	2	6	254127	254132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479202041
4015	NC_021040	TGT	2	6	254161	254166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479202041
4016	NC_021040	GAAAA	2	10	254175	254184	80 %	0 %	20 %	0 %	479202041
4017	NC_021040	TGGA	2	8	254198	254205	25 %	25 %	50 %	0 %	479202042
4018	NC_021040	A	6	6	254228	254233	100 %	0 %	0 %	0 %	479202042
4019	NC_021040	GAAG	2	8	254238	254245	50 %	0 %	50 %	0 %	479202042
4020	NC_021040	AGGC	2	8	254254	254261	25 %	0 %	50 %	25 %	479202042
4021	NC_021040	GA	3	6	254317	254322	50 %	0 %	50 %	0 %	479202042
4022	NC_021040	T	6	6	254438	254443	0 %	100 %	0 %	0 %	479202042
4023	NC_021040	GTG	2	6	254571	254576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479202042
4024	NC_021040	AGA	2	6	254633	254638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202042
4025	NC_021040	GA	3	6	254676	254681	50 %	0 %	50 %	0 %	479202042
4026	NC_021040	AAG	2	6	254704	254709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202042
4027	NC_021040	GAA	2	6	254739	254744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202042
4028	NC_021040	TGT	2	6	254795	254800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479202042
4029	NC_021040	GCA	2	6	254978	254983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202042
4030	NC_021040	GC	3	6	254997	255002	0 %	0 %	50 %	50 %	479202042
4031	NC_021040	GGA	2	6	255014	255019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479202042
4032	NC_021040	GCG	2	6	255076	255081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479202042
4033	NC_021040	ATG	2	6	255088	255093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202042
4034	NC_021040	CCG	2	6	255108	255113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479202042
4035	NC_021040	CGG	2	6	255200	255205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479202042
4036	NC_021040	GGC	2	6	255272	255277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479202042
4037	NC_021040	GCA	2	6	255282	255287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202042
4038	NC_021040	CA	3	6	255286	255291	50 %	0 %	0 %	50 %	479202042
4039	NC_021040	ATC	2	6	255331	255336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202042
4040	NC_021040	TTA	2	6	255374	255379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479202042
4041	NC_021040	GTC	2	6	255402	255407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202042
4042	NC_021040	TTG	2	6	256090	256095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479202043
4043	NC_021040	GAA	2	6	256199	256204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202043
4044	NC_021040	CTT	2	6	256287	256292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479202043
4045	NC_021040	GAA	2	6	256296	256301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202043
4046	NC_021040	A	8	8	256303	256310	100 %	0 %	0 %	0 %	479202043
4047	NC_021040	TGA	2	6	256367	256372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202043
4048	NC_021040	AT	3	6	256412	256417	50 %	50 %	0 %	0 %	479202043
4049	NC_021040	GT	3	6	256490	256495	0 %	50 %	50 %	0 %	479202044
4050	NC_021040	ATT	2	6	256733	256738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479202044
4051	NC_021040	CA	3	6	256837	256842	50 %	0 %	0 %	50 %	479202044
4052	NC_021040	TGA	2	6	256862	256867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202044
4053	NC_021040	AGA	2	6	256898	256903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202044
4054	NC_021040	GAA	2	6	256941	256946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202044
4055	NC_021040	AT	3	6	256969	256974	50 %	50 %	0 %	0 %	479202044
4056	NC_021040	TG	3	6	256993	256998	0 %	50 %	50 %	0 %	479202044
4057	NC_021040	TA	3	6	257005	257010	50 %	50 %	0 %	0 %	479202044
4058	NC_021040	GAA	2	6	257023	257028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202044
4059	NC_021040	TTC	2	6	257053	257058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479202044
4060	NC_021040	ATT	2	6	257072	257077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479202044
4061	NC_021040	AT	3	6	257142	257147	50 %	50 %	0 %	0 %	479202044
4062	NC_021040	TAT	2	6	257178	257183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479202044
4063	NC_021040	TTA	2	6	257233	257238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479202044
4064	NC_021040	ATG	2	6	257241	257246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202044
4065	NC_021040	CAG	2	6	257315	257320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202045
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4067	NC_021040	TGG	2	6	257451	257456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479202045
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4069	NC_021040	GGA	2	6	257648	257653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479202045
4070	NC_021040	AT	3	6	257666	257671	50 %	50 %	0 %	0 %	479202045
4071	NC_021040	AGA	2	6	257686	257691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202045
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4073	NC_021040	AAAATA	2	12	257790	257801	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	479202045
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4075	NC_021040	A	8	8	257831	257838	100 %	0 %	0 %	0 %	479202045
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4077	NC_021040	GAA	2	6	257876	257881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202045
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4079	NC_021040	AGT	2	6	257939	257944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202045
4080	NC_021040	CTT	2	6	257982	257987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479202045
4081	NC_021040	ATC	2	6	258100	258105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202046
4082	NC_021040	ATAC	2	8	258114	258121	50 %	25 %	0 %	25 %	479202046
4083	NC_021040	A	6	6	258136	258141	100 %	0 %	0 %	0 %	479202046
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4085	NC_021040	ATTG	2	8	258292	258299	25 %	50 %	25 %	0 %	479202046
4086	NC_021040	A	6	6	258333	258338	100 %	0 %	0 %	0 %	479202046
4087	NC_021040	GGC	2	6	258400	258405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479202046
4088	NC_021040	GTA	2	6	258417	258422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202046
4089	NC_021040	AGTTTA	2	12	258438	258449	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	479202046
4090	NC_021040	AAT	2	6	258452	258457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479202046
4091	NC_021040	GA	3	6	258489	258494	50 %	0 %	50 %	0 %	479202046
4092	NC_021040	GA	3	6	258527	258532	50 %	0 %	50 %	0 %	479202046
4093	NC_021040	AAAGAA	2	12	258545	258556	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	479202046
4094	NC_021040	A	7	7	258560	258566	100 %	0 %	0 %	0 %	479202046
4095	NC_021040	AGGT	2	8	258606	258613	25 %	25 %	50 %	0 %	479202046
4096	NC_021040	GAA	2	6	258776	258781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202047
4097	NC_021040	AAT	2	6	258800	258805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479202047
4098	NC_021040	GTTGTG	2	12	258823	258834	0 %	50 %	50 %	0 %	479202047
4099	NC_021040	TCA	2	6	259099	259104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202048
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4102	NC_021040	AT	3	6	259255	259260	50 %	50 %	0 %	0 %	479202048
4103	NC_021040	GAT	2	6	259415	259420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202048
4104	NC_021040	CTA	2	6	259449	259454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202048
4105	NC_021040	A	6	6	259461	259466	100 %	0 %	0 %	0 %	479202048
4106	NC_021040	GTAT	2	8	259501	259508	25 %	50 %	25 %	0 %	479202048
4107	NC_021040	GAT	2	6	259511	259516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202048
4108	NC_021040	AG	3	6	259519	259524	50 %	0 %	50 %	0 %	479202048
4109	NC_021040	GAA	2	6	259553	259558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202048
4110	NC_021040	TAAA	2	8	259569	259576	75 %	25 %	0 %	0 %	479202048
4111	NC_021040	TGA	2	6	259582	259587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202048
4112	NC_021040	GGA	2	6	259772	259777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479202048
4113	NC_021040	AAG	2	6	259813	259818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202048
4114	NC_021040	A	6	6	259860	259865	100 %	0 %	0 %	0 %	479202048
4115	NC_021040	TAAA	2	8	259959	259966	75 %	25 %	0 %	0 %	479202049
4116	NC_021040	GATT	2	8	259969	259976	25 %	50 %	25 %	0 %	479202049
4117	NC_021040	A	6	6	259994	259999	100 %	0 %	0 %	0 %	479202049
4118	NC_021040	A	6	6	260052	260057	100 %	0 %	0 %	0 %	479202049
4119	NC_021040	CAG	2	6	260149	260154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202049
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4122	NC_021040	AGAC	2	8	260232	260239	50 %	0 %	25 %	25 %	479202049
4123	NC_021040	AAG	2	6	260241	260246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202049
4124	NC_021040	TGC	2	6	260251	260256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202049
4125	NC_021040	GA	3	6	260257	260262	50 %	0 %	50 %	0 %	479202049
4126	NC_021040	TTA	2	6	260461	260466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479202050
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4129	NC_021040	GAT	2	6	260669	260674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202050
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4132	NC_021040	GAA	2	6	260897	260902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202050
4133	NC_021040	A	6	6	260927	260932	100 %	0 %	0 %	0 %	479202050
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4143	NC_021040	TAC	2	6	261532	261537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202051
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4154	NC_021040	GAA	2	6	262040	262045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202051
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4160	NC_021040	T	6	6	262345	262350	0 %	100 %	0 %	0 %	479202052
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4233	NC_021040	A	6	6	266715	266720	100 %	0 %	0 %	0 %	479202056
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4237	NC_021040	GACA	2	8	266979	266986	50 %	0 %	25 %	25 %	479202056
4238	NC_021040	GGA	2	6	267074	267079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479202056
4239	NC_021040	T	7	7	267155	267161	0 %	100 %	0 %	0 %	479202056
4240	NC_021040	AAT	3	9	267183	267191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479202056
4241	NC_021040	TC	3	6	267200	267205	0 %	50 %	0 %	50 %	479202056
4242	NC_021040	A	6	6	267400	267405	100 %	0 %	0 %	0 %	479202057
4243	NC_021040	CTT	2	6	267423	267428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479202057
4244	NC_021040	GAG	2	6	267434	267439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479202057
4245	NC_021040	TAA	2	6	267448	267453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479202057
4246	NC_021040	GAA	2	6	267485	267490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202057
4247	NC_021040	AGT	2	6	267502	267507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202057
4248	NC_021040	AGA	2	6	268536	268541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202058
4249	NC_021040	GCA	2	6	268788	268793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202058
4250	NC_021040	GGA	2	6	268795	268800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479202058
4251	NC_021040	TGA	2	6	268845	268850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202058
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4259	NC_021040	TGAA	2	8	269428	269435	50 %	25 %	25 %	0 %	479202059
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4281	NC_021040	ATAAA	2	10	270683	270692	80 %	20 %	0 %	0 %	479202060
4282	NC_021040	GAA	2	6	270927	270932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202061
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4286	NC_021040	A	6	6	271066	271071	100 %	0 %	0 %	0 %	479202061
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4303	NC_021040	GACT	2	8	272950	272957	25 %	25 %	25 %	25 %	479202064
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4362	NC_021040	GA	3	6	275758	275763	50 %	0 %	50 %	0 %	479202069
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4364	NC_021040	A	6	6	275905	275910	100 %	0 %	0 %	0 %	479202069
4365	NC_021040	GGC	2	6	275917	275922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479202069
4366	NC_021040	A	6	6	275964	275969	100 %	0 %	0 %	0 %	479202069
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4490	NC_021040	GAT	3	9	283587	283595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202073
4491	NC_021040	ATC	2	6	283596	283601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202073
4492	NC_021040	TGA	2	6	283667	283672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202073
4493	NC_021040	GAA	2	6	283746	283751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202073
4494	NC_021040	TAA	2	6	283829	283834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479202073
4495	NC_021040	GTT	2	6	283860	283865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479202073
4496	NC_021040	AGG	2	6	283921	283926	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479202073
4497	NC_021040	AAG	2	6	283957	283962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202073
4498	NC_021040	GAT	2	6	284129	284134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202073
4499	NC_021040	TGT	2	6	284231	284236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479202073
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