MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Roseburia intestinalis M50/1 draft genome

Total Repeats: 65450

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_021040	TAA	2	6	194719	194724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479201986
3003	NC_021040	TGA	2	6	194749	194754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201986
3004	NC_021040	GAAT	2	8	194760	194767	50 %	25 %	25 %	0 %	479201986
3005	NC_021040	ATTT	2	8	194786	194793	25 %	75 %	0 %	0 %	479201986
3006	NC_021040	AGA	2	6	194809	194814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201986
3007	NC_021040	ATT	2	6	194815	194820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201986
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3009	NC_021040	GAG	2	6	194883	194888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479201986
3010	NC_021040	TAA	2	6	194950	194955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479201986
3011	NC_021040	TGAA	2	8	194982	194989	50 %	25 %	25 %	0 %	479201986
3012	NC_021040	A	6	6	195019	195024	100 %	0 %	0 %	0 %	479201986
3013	NC_021040	TA	3	6	195029	195034	50 %	50 %	0 %	0 %	479201986
3014	NC_021040	AGAT	2	8	195039	195046	50 %	25 %	25 %	0 %	479201986
3015	NC_021040	ATT	2	6	195080	195085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201986
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3017	NC_021040	TTGG	2	8	195128	195135	0 %	50 %	50 %	0 %	479201986
3018	NC_021040	TAA	2	6	195141	195146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479201986
3019	NC_021040	TGA	2	6	195157	195162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201986
3020	NC_021040	A	6	6	195182	195187	100 %	0 %	0 %	0 %	479201986
3021	NC_021040	TAT	2	6	195209	195214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201986
3022	NC_021040	ATT	2	6	195221	195226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201986
3023	NC_021040	GTA	2	6	195258	195263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201986
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3027	NC_021040	ATGG	2	8	196017	196024	25 %	25 %	50 %	0 %	479201987
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3031	NC_021040	GAAAG	2	10	196123	196132	60 %	0 %	40 %	0 %	479201987
3032	NC_021040	CAA	2	6	196210	196215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479201987
3033	NC_021040	ATA	2	6	196268	196273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479201987
3034	NC_021040	GAA	2	6	196317	196322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201987
3035	NC_021040	TGA	2	6	196350	196355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201987
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3037	NC_021040	T	6	6	196495	196500	0 %	100 %	0 %	0 %	479201988
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3039	NC_021040	GCT	2	6	196596	196601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479201988
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3041	NC_021040	AT	3	6	196617	196622	50 %	50 %	0 %	0 %	479201988
3042	NC_021040	TGA	2	6	196749	196754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201988
3043	NC_021040	GAT	2	6	196810	196815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201988
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3045	NC_021040	CCGT	2	8	196901	196908	0 %	25 %	25 %	50 %	479201989
3046	NC_021040	A	8	8	196920	196927	100 %	0 %	0 %	0 %	479201989
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3048	NC_021040	TGGC	2	8	196994	197001	0 %	25 %	50 %	25 %	479201989
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3052	NC_021040	A	6	6	197099	197104	100 %	0 %	0 %	0 %	479201989
3053	NC_021040	CA	3	6	197130	197135	50 %	0 %	0 %	50 %	479201989
3054	NC_021040	CCAC	2	8	197182	197189	25 %	0 %	0 %	75 %	479201989
3055	NC_021040	AGA	2	6	197244	197249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201989
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3057	NC_021040	TAAA	2	8	197369	197376	75 %	25 %	0 %	0 %	479201989
3058	NC_021040	GCA	2	6	197432	197437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201989
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3060	NC_021040	AGA	2	6	197582	197587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201989
3061	NC_021040	GGC	2	6	197631	197636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479201989
3062	NC_021040	TGA	2	6	197705	197710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201989
3063	NC_021040	TG	3	6	197726	197731	0 %	50 %	50 %	0 %	479201989
3064	NC_021040	GAA	2	6	197748	197753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201989
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3068	NC_021040	ACA	2	6	197899	197904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479201989
3069	NC_021040	CGA	2	6	197984	197989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201989
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3071	NC_021040	TGA	2	6	198038	198043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201989
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3083	NC_021040	AT	3	6	199806	199811	50 %	50 %	0 %	0 %	479201991
3084	NC_021040	CAG	2	6	199826	199831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201991
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3088	NC_021040	TGC	2	6	199998	200003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479201992
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3090	NC_021040	CGT	2	6	200178	200183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479201992
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3092	NC_021040	CGA	2	6	200257	200262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201992
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3105	NC_021040	AAGC	2	8	201094	201101	50 %	0 %	25 %	25 %	479201993
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3108	NC_021040	GT	3	6	201140	201145	0 %	50 %	50 %	0 %	479201993
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3110	NC_021040	GCA	2	6	201186	201191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201993
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3112	NC_021040	GGA	2	6	201428	201433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479201993
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3124	NC_021040	A	6	6	202324	202329	100 %	0 %	0 %	0 %	479201994
3125	NC_021040	CAA	2	6	202400	202405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479201994
3126	NC_021040	GGT	2	6	202418	202423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479201994
3127	NC_021040	ATCCGG	2	12	202444	202455	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	479201994
3128	NC_021040	GTA	2	6	202476	202481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201994
3129	NC_021040	TGG	2	6	202517	202522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479201994
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3131	NC_021040	CAA	2	6	202778	202783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479201995
3132	NC_021040	AAT	2	6	202825	202830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479201995
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3231	NC_021040	CA	3	6	210518	210523	50 %	0 %	0 %	50 %	479202001
3232	NC_021040	CGG	2	6	210673	210678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479202001
3233	NC_021040	GA	3	6	210686	210691	50 %	0 %	50 %	0 %	479202001
3234	NC_021040	AC	3	6	210707	210712	50 %	0 %	0 %	50 %	479202001
3235	NC_021040	TCG	2	6	210726	210731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202001
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3238	NC_021040	CTT	2	6	211004	211009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479202001
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3241	NC_021040	A	7	7	211162	211168	100 %	0 %	0 %	0 %	479202001
3242	NC_021040	ATC	2	6	211259	211264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202002
3243	NC_021040	GA	3	6	211277	211282	50 %	0 %	50 %	0 %	479202002
3244	NC_021040	GCG	2	6	211325	211330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479202002
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3490	NC_021040	AGG	2	6	222527	222532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479202009
3491	NC_021040	CAG	2	6	222536	222541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202009
3492	NC_021040	TTAT	2	8	222578	222585	25 %	75 %	0 %	0 %	479202009
3493	NC_021040	TGC	2	6	222587	222592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202009
3494	NC_021040	GCA	2	6	223143	223148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202010
3495	NC_021040	AT	3	6	223155	223160	50 %	50 %	0 %	0 %	479202010
3496	NC_021040	GACAAA	2	12	223200	223211	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	479202010
3497	NC_021040	GGT	2	6	223215	223220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479202010
3498	NC_021040	ATC	2	6	223249	223254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202010
3499	NC_021040	A	6	6	223270	223275	100 %	0 %	0 %	0 %	479202010
3500	NC_021040	TGC	2	6	223372	223377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202010

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