MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Roseburia intestinalis M50/1 draft genome

Total Repeats: 65450

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021040	GATG	2	8	29063	29070	25 %	25 %	50 %	0 %	479201853
502	NC_021040	GAAAT	2	10	29073	29082	60 %	20 %	20 %	0 %	479201853
503	NC_021040	ATGG	2	8	29085	29092	25 %	25 %	50 %	0 %	479201853
504	NC_021040	GGA	2	6	29105	29110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479201853
505	NC_021040	GTC	2	6	29133	29138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479201853
506	NC_021040	TCA	2	6	29146	29151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479201853
507	NC_021040	A	7	7	29268	29274	100 %	0 %	0 %	0 %	479201853
508	NC_021040	GAT	2	6	29285	29290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201853
509	NC_021040	TAT	2	6	29340	29345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201853
510	NC_021040	CA	3	6	29376	29381	50 %	0 %	0 %	50 %	479201853
511	NC_021040	ACA	2	6	29400	29405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479201853
512	NC_021040	GAA	2	6	29424	29429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201853
513	NC_021040	TCA	2	6	29473	29478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479201853
514	NC_021040	ACGG	2	8	29502	29509	25 %	0 %	50 %	25 %	479201853
515	NC_021040	AGC	2	6	29530	29535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201853
516	NC_021040	GC	3	6	29550	29555	0 %	0 %	50 %	50 %	479201853
517	NC_021040	A	6	6	29556	29561	100 %	0 %	0 %	0 %	479201853
518	NC_021040	GAA	2	6	29571	29576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201853
519	NC_021040	ATG	2	6	29606	29611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201853
520	NC_021040	GCAT	2	8	29666	29673	25 %	25 %	25 %	25 %	479201854
521	NC_021040	TTAT	2	8	29675	29682	25 %	75 %	0 %	0 %	479201854
522	NC_021040	GGCA	2	8	29719	29726	25 %	0 %	50 %	25 %	479201854
523	NC_021040	GGC	2	6	29731	29736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479201854
524	NC_021040	GT	3	6	29754	29759	0 %	50 %	50 %	0 %	479201854
525	NC_021040	GAT	2	6	29774	29779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201854
526	NC_021040	ATTT	2	8	29786	29793	25 %	75 %	0 %	0 %	479201854
527	NC_021040	GCT	2	6	29847	29852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479201854
528	NC_021040	GCC	2	6	29873	29878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479201854
529	NC_021040	GAT	2	6	29887	29892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201854
530	NC_021040	T	6	6	29948	29953	0 %	100 %	0 %	0 %	479201854
531	NC_021040	TGG	2	6	29972	29977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479201854
532	NC_021040	TCT	2	6	29989	29994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479201854
533	NC_021040	AT	3	6	30088	30093	50 %	50 %	0 %	0 %	479201854
534	NC_021040	CCG	2	6	30096	30101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479201854
535	NC_021040	TAG	2	6	30207	30212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201854
536	NC_021040	TGC	2	6	30300	30305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479201854
537	NC_021040	GA	4	8	30334	30341	50 %	0 %	50 %	0 %	479201854
538	NC_021040	GAT	2	6	30407	30412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201854
539	NC_021040	A	6	6	30416	30421	100 %	0 %	0 %	0 %	479201854
540	NC_021040	GAA	2	6	30425	30430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201854
541	NC_021040	GGA	2	6	30445	30450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479201854
542	NC_021040	GCA	2	6	30606	30611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201854
543	NC_021040	TCC	2	6	30717	30722	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479201854
544	NC_021040	ATT	2	6	30732	30737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201854
545	NC_021040	AGG	2	6	30759	30764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479201854
546	NC_021040	A	6	6	30782	30787	100 %	0 %	0 %	0 %	479201854
547	NC_021040	CAA	2	6	30835	30840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479201854
548	NC_021040	GA	3	6	30907	30912	50 %	0 %	50 %	0 %	479201854
549	NC_021040	GGCA	2	8	31048	31055	25 %	0 %	50 %	25 %	479201855
550	NC_021040	A	7	7	31159	31165	100 %	0 %	0 %	0 %	479201855
551	NC_021040	TGGTA	2	10	31200	31209	20 %	40 %	40 %	0 %	479201855
552	NC_021040	ATT	2	6	31353	31358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201856
553	NC_021040	GCAT	2	8	31368	31375	25 %	25 %	25 %	25 %	479201856
554	NC_021040	A	6	6	31383	31388	100 %	0 %	0 %	0 %	479201856
555	NC_021040	GCA	2	6	31437	31442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201856
556	NC_021040	A	6	6	31586	31591	100 %	0 %	0 %	0 %	479201856
557	NC_021040	CCA	2	6	31651	31656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479201856
558	NC_021040	TGG	2	6	31667	31672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479201856
559	NC_021040	ACA	3	9	31707	31715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479201856
560	NC_021040	GGT	2	6	31722	31727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479201856
561	NC_021040	ACTG	2	8	31760	31767	25 %	25 %	25 %	25 %	479201856
562	NC_021040	CAG	2	6	31843	31848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201856
563	NC_021040	ACTGA	2	10	31860	31869	40 %	20 %	20 %	20 %	479201856
564	NC_021040	TGG	2	6	31922	31927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479201856
565	NC_021040	ATT	2	6	32014	32019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201856
566	NC_021040	CAGA	2	8	32031	32038	50 %	0 %	25 %	25 %	479201856
567	NC_021040	TTGT	2	8	32056	32063	0 %	75 %	25 %	0 %	479201856
568	NC_021040	GTT	2	6	32082	32087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479201856
569	NC_021040	TA	3	6	32089	32094	50 %	50 %	0 %	0 %	479201856
570	NC_021040	ATCC	2	8	32221	32228	25 %	25 %	0 %	50 %	479201856
571	NC_021040	ACA	2	6	32278	32283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479201856
572	NC_021040	GAA	3	9	32352	32360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201856
573	NC_021040	CAA	2	6	32362	32367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479201856
574	NC_021040	CAG	3	9	32425	32433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201856
575	NC_021040	GTAACA	2	12	32556	32567	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	479201856
576	NC_021040	ACT	2	6	32577	32582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479201856
577	NC_021040	TGG	2	6	32630	32635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479201856
578	NC_021040	CAAT	2	8	32707	32714	50 %	25 %	0 %	25 %	479201856
579	NC_021040	AGA	3	9	32726	32734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201856
580	NC_021040	CA	3	6	32815	32820	50 %	0 %	0 %	50 %	479201856
581	NC_021040	ATG	2	6	32866	32871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201856
582	NC_021040	AAT	2	6	32874	32879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479201856
583	NC_021040	GAT	2	6	32892	32897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201856
584	NC_021040	CAAC	2	8	32905	32912	50 %	0 %	0 %	50 %	479201856
585	NC_021040	TC	3	6	32945	32950	0 %	50 %	0 %	50 %	479201856
586	NC_021040	GCAACA	2	12	32976	32987	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	479201856
587	NC_021040	ACA	2	6	33040	33045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479201856
588	NC_021040	TGA	2	6	33080	33085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201856
589	NC_021040	A	6	6	33104	33109	100 %	0 %	0 %	0 %	479201856
590	NC_021040	ATG	3	9	33145	33153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201856
591	NC_021040	CTT	2	6	33168	33173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479201856
592	NC_021040	GCA	2	6	33234	33239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201856
593	NC_021040	CATC	2	8	33283	33290	25 %	25 %	0 %	50 %	479201856
594	NC_021040	AAC	2	6	33294	33299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479201856
595	NC_021040	CTTT	2	8	33372	33379	0 %	75 %	0 %	25 %	479201856
596	NC_021040	AGATG	2	10	33404	33413	40 %	20 %	40 %	0 %	479201856
597	NC_021040	TAT	2	6	33483	33488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201856
598	NC_021040	AGA	2	6	33491	33496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201856
599	NC_021040	TC	3	6	33503	33508	0 %	50 %	0 %	50 %	479201856
600	NC_021040	AT	3	6	33563	33568	50 %	50 %	0 %	0 %	479201856
601	NC_021040	AAAC	2	8	33595	33602	75 %	0 %	0 %	25 %	479201856
602	NC_021040	AAG	2	6	33682	33687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201856
603	NC_021040	CTTC	2	8	33709	33716	0 %	50 %	0 %	50 %	479201856
604	NC_021040	TGA	2	6	33776	33781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201856
605	NC_021040	ACT	2	6	33811	33816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479201856
606	NC_021040	GGT	2	6	33858	33863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479201856
607	NC_021040	ATACG	2	10	33884	33893	40 %	20 %	20 %	20 %	479201856
608	NC_021040	ACCA	2	8	33897	33904	50 %	0 %	0 %	50 %	479201856
609	NC_021040	TGA	2	6	34021	34026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201856
610	NC_021040	ATC	2	6	34056	34061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479201856
611	NC_021040	TCT	2	6	34078	34083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479201856
612	NC_021040	A	6	6	34110	34115	100 %	0 %	0 %	0 %	479201856
613	NC_021040	GCA	2	6	34119	34124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201856
614	NC_021040	GAA	2	6	34125	34130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201856
615	NC_021040	CAG	2	6	34156	34161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201856
616	NC_021040	AGT	2	6	34217	34222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201857
617	NC_021040	A	6	6	34225	34230	100 %	0 %	0 %	0 %	479201857
618	NC_021040	GTAA	2	8	34304	34311	50 %	25 %	25 %	0 %	479201857
619	NC_021040	ATT	2	6	34411	34416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201857
620	NC_021040	ATG	2	6	34449	34454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201857
621	NC_021040	GCA	2	6	34551	34556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201857
622	NC_021040	CGG	2	6	34705	34710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479201857
623	NC_021040	T	6	6	35063	35068	0 %	100 %	0 %	0 %	479201858
624	NC_021040	CTTTTT	2	12	35101	35112	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	479201858
625	NC_021040	CTT	2	6	35245	35250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479201858
626	NC_021040	T	6	6	35249	35254	0 %	100 %	0 %	0 %	479201858
627	NC_021040	TCA	2	6	35280	35285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479201858
628	NC_021040	CAT	2	6	35348	35353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479201858
629	NC_021040	CTT	2	6	35411	35416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479201858
630	NC_021040	GCGGCA	2	12	35445	35456	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	479201858
631	NC_021040	CTTT	2	8	35476	35483	0 %	75 %	0 %	25 %	479201858
632	NC_021040	CTTT	2	8	35491	35498	0 %	75 %	0 %	25 %	479201858
633	NC_021040	GAT	2	6	35525	35530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201858
634	NC_021040	CAATA	2	10	35552	35561	60 %	20 %	0 %	20 %	479201858
635	NC_021040	ATAA	2	8	35574	35581	75 %	25 %	0 %	0 %	479201858
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637	NC_021040	TTATC	2	10	36020	36029	20 %	60 %	0 %	20 %	479201859
638	NC_021040	TGG	2	6	36032	36037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479201859
639	NC_021040	A	6	6	36038	36043	100 %	0 %	0 %	0 %	479201859
640	NC_021040	GATC	2	8	36047	36054	25 %	25 %	25 %	25 %	479201859
641	NC_021040	A	6	6	36099	36104	100 %	0 %	0 %	0 %	479201859
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645	NC_021040	CAGA	2	8	36195	36202	50 %	0 %	25 %	25 %	479201859
646	NC_021040	CTAT	2	8	36232	36239	25 %	50 %	0 %	25 %	479201859
647	NC_021040	ATT	2	6	36304	36309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201859
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650	NC_021040	GATC	2	8	36491	36498	25 %	25 %	25 %	25 %	479201859
651	NC_021040	GAA	3	9	36513	36521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201859
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654	NC_021040	AT	3	6	36560	36565	50 %	50 %	0 %	0 %	479201859
655	NC_021040	TAA	3	9	36575	36583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479201859
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658	NC_021040	AATG	2	8	36632	36639	50 %	25 %	25 %	0 %	479201859
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661	NC_021040	TAT	2	6	36821	36826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201859
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663	NC_021040	A	6	6	36896	36901	100 %	0 %	0 %	0 %	479201859
664	NC_021040	AGGA	2	8	37072	37079	50 %	0 %	50 %	0 %	479201860
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741	NC_021040	ATT	2	6	41319	41324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201865
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747	NC_021040	ATCATT	2	12	41671	41682	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	479201865
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749	NC_021040	AAT	2	6	41718	41723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479201865
750	NC_021040	ATA	2	6	41740	41745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479201865
751	NC_021040	ATG	2	6	41812	41817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201865
752	NC_021040	CAG	2	6	41819	41824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201865
753	NC_021040	ACT	2	6	41971	41976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479201866
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757	NC_021040	ATC	2	6	42269	42274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479201866
758	NC_021040	ATC	3	9	42282	42290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479201866
759	NC_021040	CGA	2	6	42351	42356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201866
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