MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Roseburia intestinalis M50/1 draft genome

Total Repeats: 65450

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_021040	ATG	2	6	363064	363069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202129
5502	NC_021040	GCAG	2	8	363096	363103	25 %	0 %	50 %	25 %	479202129
5503	NC_021040	AGA	3	9	363141	363149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202129
5504	NC_021040	GAA	2	6	363220	363225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202129
5505	NC_021040	GAAG	2	8	363228	363235	50 %	0 %	50 %	0 %	479202129
5506	NC_021040	ACA	2	6	363246	363251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479202129
5507	NC_021040	CAGAC	2	10	363278	363287	40 %	0 %	20 %	40 %	479202129
5508	NC_021040	CTT	2	6	363292	363297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479202129
5509	NC_021040	ATC	2	6	363390	363395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202129
5510	NC_021040	CTT	2	6	363464	363469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479202129
5511	NC_021040	ATG	2	6	363512	363517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202129
5512	NC_021040	TACA	2	8	363524	363531	50 %	25 %	0 %	25 %	479202129
5513	NC_021040	GCA	2	6	363606	363611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202129
5514	NC_021040	ATT	2	6	363629	363634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479202129
5515	NC_021040	ATGG	2	8	363649	363656	25 %	25 %	50 %	0 %	479202129
5516	NC_021040	GAAG	2	8	363669	363676	50 %	0 %	50 %	0 %	479202129
5517	NC_021040	AGT	2	6	363678	363683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202129
5518	NC_021040	AT	3	6	363696	363701	50 %	50 %	0 %	0 %	479202129
5519	NC_021040	ATC	2	6	363781	363786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202129
5520	NC_021040	CA	3	6	363848	363853	50 %	0 %	0 %	50 %	479202130
5521	NC_021040	TTA	2	6	363854	363859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479202130
5522	NC_021040	A	6	6	363872	363877	100 %	0 %	0 %	0 %	479202130
5523	NC_021040	T	6	6	363924	363929	0 %	100 %	0 %	0 %	479202130
5524	NC_021040	TGC	2	6	363939	363944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202130
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5530	NC_021040	AAC	2	6	364181	364186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479202130
5531	NC_021040	GCA	2	6	364257	364262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202130
5532	NC_021040	TGA	2	6	364264	364269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202130
5533	NC_021040	AAAT	2	8	364312	364319	75 %	25 %	0 %	0 %	479202130
5534	NC_021040	CAG	2	6	364379	364384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202130
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5536	NC_021040	GAG	2	6	364598	364603	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479202130
5537	NC_021040	TGA	2	6	364659	364664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202130
5538	NC_021040	AGA	2	6	364678	364683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202130
5539	NC_021040	GGC	2	6	364690	364695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479202130
5540	NC_021040	AGG	2	6	364722	364727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479202130
5541	NC_021040	AAG	2	6	364758	364763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202130
5542	NC_021040	CAG	2	6	364778	364783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202130
5543	NC_021040	GC	3	6	364802	364807	0 %	0 %	50 %	50 %	479202130
5544	NC_021040	GC	3	6	364818	364823	0 %	0 %	50 %	50 %	479202130
5545	NC_021040	T	7	7	364965	364971	0 %	100 %	0 %	0 %	479202130
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5549	NC_021040	A	6	6	367488	367493	100 %	0 %	0 %	0 %	479202131
5550	NC_021040	GAT	2	6	367514	367519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202131
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5552	NC_021040	TTCCGG	2	12	367535	367546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202131
5553	NC_021040	TGT	2	6	367568	367573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479202131
5554	NC_021040	GGA	2	6	367583	367588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479202131
5555	NC_021040	GAT	2	6	367641	367646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202131
5556	NC_021040	CGG	2	6	367660	367665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479202131
5557	NC_021040	GGAG	2	8	367679	367686	25 %	0 %	75 %	0 %	479202131
5558	NC_021040	GTTA	2	8	367784	367791	25 %	50 %	25 %	0 %	479202131
5559	NC_021040	CGG	2	6	367801	367806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479202131
5560	NC_021040	AGA	2	6	367817	367822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202131
5561	NC_021040	GAG	2	6	367842	367847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479202131
5562	NC_021040	GTAT	2	8	367854	367861	25 %	50 %	25 %	0 %	479202131
5563	NC_021040	AG	3	6	367887	367892	50 %	0 %	50 %	0 %	479202131
5564	NC_021040	TCAGGA	2	12	367958	367969	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	479202131
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5569	NC_021040	TGT	2	6	368039	368044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479202131
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5572	NC_021040	ATC	2	6	368149	368154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202131
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5574	NC_021040	GA	3	6	368186	368191	50 %	0 %	50 %	0 %	479202131
5575	NC_021040	ATG	2	6	368206	368211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202131
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5583	NC_021040	CAGG	2	8	368662	368669	25 %	0 %	50 %	25 %	479202131
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5588	NC_021040	AAAG	2	8	368858	368865	75 %	0 %	25 %	0 %	479202131
5589	NC_021040	GGTGCT	2	12	370041	370052	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	479202132
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5593	NC_021040	TGA	2	6	370188	370193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202132
5594	NC_021040	GT	3	6	370207	370212	0 %	50 %	50 %	0 %	479202132
5595	NC_021040	T	6	6	370222	370227	0 %	100 %	0 %	0 %	479202132
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5602	NC_021040	TCT	2	6	370596	370601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479202132
5603	NC_021040	T	6	6	370691	370696	0 %	100 %	0 %	0 %	479202132
5604	NC_021040	GA	3	6	370811	370816	50 %	0 %	50 %	0 %	479202132
5605	NC_021040	GGT	2	6	370828	370833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479202132
5606	NC_021040	CTG	2	6	370918	370923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202132
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5622	NC_021040	AT	3	6	371514	371519	50 %	50 %	0 %	0 %	479202134
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5859	NC_021040	A	6	6	385545	385550	100 %	0 %	0 %	0 %	479202152
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5989	NC_021040	ATG	2	6	395365	395370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202159
5990	NC_021040	GAA	2	6	395390	395395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202159
5991	NC_021040	CAG	2	6	395615	395620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202159
5992	NC_021040	GAA	2	6	395621	395626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202159
5993	NC_021040	GAT	2	6	395664	395669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202159
5994	NC_021040	TCT	2	6	395680	395685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479202159
5995	NC_021040	A	7	7	395774	395780	100 %	0 %	0 %	0 %	479202159
5996	NC_021040	GACA	3	12	396600	396611	50 %	0 %	25 %	25 %	479202161
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5998	NC_021040	GT	3	6	396639	396644	0 %	50 %	50 %	0 %	479202161
5999	NC_021040	AAAG	2	8	396662	396669	75 %	0 %	25 %	0 %	479202161
6000	NC_021040	GCA	2	6	396716	396721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202161

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