MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Roseburia intestinalis M50/1 draft genome

Total Repeats: 65450

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021040	AAG	2	6	321586	321591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202101
5002	NC_021040	GCA	2	6	321652	321657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202101
5003	NC_021040	AAAG	2	8	321750	321757	75 %	0 %	25 %	0 %	479202101
5004	NC_021040	TTTTG	2	10	321804	321813	0 %	80 %	20 %	0 %	479202101
5005	NC_021040	AGC	2	6	321957	321962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202101
5006	NC_021040	A	6	6	322012	322017	100 %	0 %	0 %	0 %	479202101
5007	NC_021040	A	7	7	322195	322201	100 %	0 %	0 %	0 %	479202102
5008	NC_021040	GTT	2	6	322211	322216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479202102
5009	NC_021040	GAA	2	6	322268	322273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202102
5010	NC_021040	ATG	2	6	322563	322568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202103
5011	NC_021040	T	6	6	322642	322647	0 %	100 %	0 %	0 %	479202103
5012	NC_021040	GAT	2	6	322684	322689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202103
5013	NC_021040	ACAG	2	8	322704	322711	50 %	0 %	25 %	25 %	479202103
5014	NC_021040	A	6	6	322774	322779	100 %	0 %	0 %	0 %	479202103
5015	NC_021040	GT	3	6	322830	322835	0 %	50 %	50 %	0 %	479202103
5016	NC_021040	A	9	9	322894	322902	100 %	0 %	0 %	0 %	479202103
5017	NC_021040	GCT	2	6	322906	322911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202103
5018	NC_021040	GT	3	6	322914	322919	0 %	50 %	50 %	0 %	479202103
5019	NC_021040	AGA	2	6	322928	322933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202103
5020	NC_021040	TGA	2	6	322937	322942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202103
5021	NC_021040	GCT	2	6	322952	322957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202104
5022	NC_021040	AAAT	2	8	322992	322999	75 %	25 %	0 %	0 %	479202104
5023	NC_021040	TTGTTT	2	12	323214	323225	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	479202105
5024	NC_021040	GCG	2	6	323240	323245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479202105
5025	NC_021040	TGG	2	6	323461	323466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479202105
5026	NC_021040	ATG	2	6	323550	323555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202105
5027	NC_021040	TG	3	6	323563	323568	0 %	50 %	50 %	0 %	479202105
5028	NC_021040	GAG	2	6	323601	323606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479202105
5029	NC_021040	ATG	2	6	323619	323624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202105
5030	NC_021040	T	6	6	323652	323657	0 %	100 %	0 %	0 %	479202105
5031	NC_021040	CAA	2	6	323735	323740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479202105
5032	NC_021040	GGAATG	2	12	323775	323786	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	479202105
5033	NC_021040	CAG	2	6	323799	323804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202105
5034	NC_021040	TTGAGA	2	12	323965	323976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202105
5035	NC_021040	GGA	2	6	324020	324025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479202105
5036	NC_021040	GGA	2	6	324065	324070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479202105
5037	NC_021040	CAG	2	6	324092	324097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202105
5038	NC_021040	GAA	2	6	324174	324179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202105
5039	NC_021040	GCG	2	6	324240	324245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479202105
5040	NC_021040	AAGG	2	8	324254	324261	50 %	0 %	50 %	0 %	479202105
5041	NC_021040	TG	3	6	324403	324408	0 %	50 %	50 %	0 %	479202105
5042	NC_021040	AGAAA	2	10	324603	324612	80 %	0 %	20 %	0 %	479202106
5043	NC_021040	A	7	7	324610	324616	100 %	0 %	0 %	0 %	479202106
5044	NC_021040	GAT	2	6	324626	324631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202106
5045	NC_021040	GC	3	6	324635	324640	0 %	0 %	50 %	50 %	479202106
5046	NC_021040	AGAA	2	8	324667	324674	75 %	0 %	25 %	0 %	479202106
5047	NC_021040	TG	3	6	324690	324695	0 %	50 %	50 %	0 %	479202106
5048	NC_021040	CGG	2	6	324727	324732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479202106
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5050	NC_021040	GATG	2	8	324824	324831	25 %	25 %	50 %	0 %	479202106
5051	NC_021040	T	7	7	324834	324840	0 %	100 %	0 %	0 %	479202106
5052	NC_021040	A	6	6	324879	324884	100 %	0 %	0 %	0 %	479202106
5053	NC_021040	TTA	2	6	324953	324958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479202106
5054	NC_021040	AAG	2	6	324976	324981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202106
5055	NC_021040	TGA	2	6	325006	325011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202106
5056	NC_021040	A	6	6	325011	325016	100 %	0 %	0 %	0 %	479202106
5057	NC_021040	T	6	6	325043	325048	0 %	100 %	0 %	0 %	479202106
5058	NC_021040	AGA	2	6	325079	325084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202106
5059	NC_021040	GTCTG	2	10	325117	325126	0 %	40 %	40 %	20 %	479202106
5060	NC_021040	TTA	2	6	325226	325231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479202106
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5062	NC_021040	CGG	2	6	325282	325287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479202106
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5065	NC_021040	TAT	2	6	325383	325388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479202106
5066	NC_021040	TGG	2	6	325422	325427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479202106
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5069	NC_021040	TCT	2	6	325565	325570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479202106
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5071	NC_021040	CGG	2	6	325705	325710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479202106
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5073	NC_021040	A	6	6	326070	326075	100 %	0 %	0 %	0 %	479202107
5074	NC_021040	GCG	2	6	326133	326138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479202107
5075	NC_021040	TGA	2	6	326173	326178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202107
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5080	NC_021040	GAAA	2	8	326277	326284	75 %	0 %	25 %	0 %	479202107
5081	NC_021040	A	6	6	326282	326287	100 %	0 %	0 %	0 %	479202107
5082	NC_021040	GAT	2	6	326329	326334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202107
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5088	NC_021040	CA	3	6	326565	326570	50 %	0 %	0 %	50 %	479202107
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5090	NC_021040	GAA	2	6	326639	326644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202107
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5092	NC_021040	GT	3	6	326760	326765	0 %	50 %	50 %	0 %	479202107
5093	NC_021040	CGGG	2	8	326860	326867	0 %	0 %	75 %	25 %	479202107
5094	NC_021040	GGC	2	6	326873	326878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479202107
5095	NC_021040	A	6	6	326891	326896	100 %	0 %	0 %	0 %	479202107
5096	NC_021040	A	7	7	326908	326914	100 %	0 %	0 %	0 %	479202107
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5099	NC_021040	CTG	2	6	327194	327199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202107
5100	NC_021040	CGA	2	6	327204	327209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202107
5101	NC_021040	CTG	2	6	327230	327235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202107
5102	NC_021040	AGT	2	6	327291	327296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202107
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5104	NC_021040	CT	4	8	327367	327374	0 %	50 %	0 %	50 %	479202108
5105	NC_021040	ACG	2	6	327437	327442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202108
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5108	NC_021040	AG	3	6	327508	327513	50 %	0 %	50 %	0 %	479202108
5109	NC_021040	TCA	2	6	327521	327526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202108
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5113	NC_021040	TCA	2	6	327704	327709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202108
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5115	NC_021040	GCT	2	6	327756	327761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202108
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5118	NC_021040	T	7	7	327887	327893	0 %	100 %	0 %	0 %	479202108
5119	NC_021040	TGTGG	2	10	327925	327934	0 %	40 %	60 %	0 %	479202108
5120	NC_021040	ATGT	2	8	328007	328014	25 %	50 %	25 %	0 %	479202108
5121	NC_021040	T	6	6	328180	328185	0 %	100 %	0 %	0 %	479202108
5122	NC_021040	T	7	7	328192	328198	0 %	100 %	0 %	0 %	479202108
5123	NC_021040	TTC	2	6	328246	328251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479202108
5124	NC_021040	TTG	2	6	328311	328316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479202108
5125	NC_021040	TTG	2	6	328329	328334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479202108
5126	NC_021040	A	6	6	328530	328535	100 %	0 %	0 %	0 %	479202109
5127	NC_021040	TAA	2	6	328545	328550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479202109
5128	NC_021040	A	7	7	328567	328573	100 %	0 %	0 %	0 %	479202109
5129	NC_021040	A	7	7	328577	328583	100 %	0 %	0 %	0 %	479202109
5130	NC_021040	AGGA	2	8	328588	328595	50 %	0 %	50 %	0 %	479202109
5131	NC_021040	CTG	2	6	328720	328725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202109
5132	NC_021040	TGC	2	6	328754	328759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202109
5133	NC_021040	GATC	2	8	328830	328837	25 %	25 %	25 %	25 %	479202109
5134	NC_021040	GAT	2	6	328840	328845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202109
5135	NC_021040	GCT	2	6	328860	328865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202109
5136	NC_021040	ATG	2	6	328901	328906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202109
5137	NC_021040	GAT	2	6	328926	328931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202109
5138	NC_021040	GAA	2	6	329011	329016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202109
5139	NC_021040	TGA	2	6	329073	329078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202109
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5141	NC_021040	T	6	6	329191	329196	0 %	100 %	0 %	0 %	479202109
5142	NC_021040	A	6	6	329206	329211	100 %	0 %	0 %	0 %	479202109
5143	NC_021040	CCG	2	6	329356	329361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479202109
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5145	NC_021040	TGG	2	6	329440	329445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479202109
5146	NC_021040	TAT	2	6	329518	329523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479202109
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5148	NC_021040	GAA	2	6	329549	329554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202109
5149	NC_021040	GAAA	2	8	329579	329586	75 %	0 %	25 %	0 %	479202109
5150	NC_021040	AC	3	6	329620	329625	50 %	0 %	0 %	50 %	479202109
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5153	NC_021040	GAT	2	6	329731	329736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202109
5154	NC_021040	TTG	2	6	329816	329821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479202109
5155	NC_021040	GCTT	2	8	329850	329857	0 %	50 %	25 %	25 %	479202109
5156	NC_021040	AGA	2	6	329889	329894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202109
5157	NC_021040	TGA	2	6	329966	329971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202109
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5159	NC_021040	TGAG	2	8	330050	330057	25 %	25 %	50 %	0 %	479202109
5160	NC_021040	GAT	2	6	330101	330106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202109
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5163	NC_021040	GTG	2	6	333041	333046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479202110
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5165	NC_021040	TAA	2	6	333216	333221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479202110
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5189	NC_021040	TAT	2	6	335530	335535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479202111
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5209	NC_021040	GCT	2	6	336485	336490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202112
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5213	NC_021040	T	7	7	336727	336733	0 %	100 %	0 %	0 %	479202112
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5219	NC_021040	TTC	2	6	337096	337101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479202113
5220	NC_021040	G	6	6	337228	337233	0 %	0 %	100 %	0 %	479202113
5221	NC_021040	A	7	7	337282	337288	100 %	0 %	0 %	0 %	479202113
5222	NC_021040	GCA	2	6	339441	339446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202114
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5225	NC_021040	CCG	2	6	339662	339667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479202114
5226	NC_021040	TGG	2	6	339692	339697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479202114
5227	NC_021040	GA	3	6	339763	339768	50 %	0 %	50 %	0 %	479202114
5228	NC_021040	TA	3	6	339784	339789	50 %	50 %	0 %	0 %	479202114
5229	NC_021040	T	6	6	339796	339801	0 %	100 %	0 %	0 %	479202114
5230	NC_021040	CGA	2	6	339810	339815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202114
5231	NC_021040	CTT	2	6	339930	339935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479202114
5232	NC_021040	CCA	2	6	339940	339945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479202114
5233	NC_021040	GCA	2	6	339986	339991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479202114
5234	NC_021040	CTG	2	6	340133	340138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479202114
5235	NC_021040	CCG	2	6	340186	340191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479202114
5236	NC_021040	TCC	2	6	340199	340204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479202114
5237	NC_021040	TCCA	2	8	340292	340299	25 %	25 %	0 %	50 %	479202114
5238	NC_021040	TCC	3	9	340340	340348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479202114
5239	NC_021040	ATA	2	6	340450	340455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479202114
5240	NC_021040	TAT	2	6	340506	340511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479202114
5241	NC_021040	AGCGG	2	10	340514	340523	20 %	0 %	60 %	20 %	479202114
5242	NC_021040	ATC	2	6	340643	340648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202114
5243	NC_021040	ATC	2	6	340762	340767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479202114
5244	NC_021040	GAA	2	6	340917	340922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202114
5245	NC_021040	AAT	2	6	340944	340949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479202114
5246	NC_021040	GTCC	2	8	340959	340966	0 %	25 %	25 %	50 %	479202114
5247	NC_021040	A	6	6	341028	341033	100 %	0 %	0 %	0 %	479202114
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5255	NC_021040	TG	3	6	341345	341350	0 %	50 %	50 %	0 %	479202114
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5355	NC_021040	T	6	6	347314	347319	0 %	100 %	0 %	0 %	479202122
5356	NC_021040	TCT	2	6	347387	347392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479202122
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5361	NC_021040	TTTTC	2	10	347549	347558	0 %	80 %	0 %	20 %	479202122
5362	NC_021040	AT	4	8	347564	347571	50 %	50 %	0 %	0 %	479202122
5363	NC_021040	ATGT	2	8	347597	347604	25 %	50 %	25 %	0 %	479202122
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5491	NC_021040	AT	3	6	362377	362382	50 %	50 %	0 %	0 %	479202129
5492	NC_021040	TTG	2	6	362417	362422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479202129
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5494	NC_021040	GAA	2	6	362455	362460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479202129
5495	NC_021040	ATG	2	6	362471	362476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479202129
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5499	NC_021040	AAAG	2	8	362772	362779	75 %	0 %	25 %	0 %	479202129
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