MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruminococcus champanellensis 18P13

Total Repeats: 41603

< Previous12...72737475767778798081828384Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41501	NC_021039	GTG	2	6	2567697	2567702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479201393
41502	NC_021039	G	6	6	2567725	2567730	0 %	0 %	100 %	0 %	479201393
41503	NC_021039	CGC	2	6	2567809	2567814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479201393
41504	NC_021039	TCC	2	6	2567843	2567848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479201393
41505	NC_021039	CTG	2	6	2567872	2567877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479201393
41506	NC_021039	TCA	2	6	2567886	2567891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479201393
41507	NC_021039	GCT	2	6	2568004	2568009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479201393
41508	NC_021039	GAT	2	6	2568013	2568018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201393
41509	NC_021039	AGC	2	6	2568047	2568052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201393
41510	NC_021039	CAG	2	6	2568055	2568060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201393
41511	NC_021039	GCC	2	6	2568077	2568082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479201393
41512	NC_021039	ATG	2	6	2568134	2568139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201393
41513	NC_021039	GCT	2	6	2568243	2568248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479201393
41514	NC_021039	GCA	2	6	2568270	2568275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201393
41515	NC_021039	TCC	2	6	2568287	2568292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479201393
41516	NC_021039	GAAA	2	8	2568308	2568315	75 %	0 %	25 %	0 %	479201393
41517	NC_021039	AGT	2	6	2568360	2568365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201393
41518	NC_021039	CTC	2	6	2568412	2568417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479201393
41519	NC_021039	AGC	2	6	2568499	2568504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201393
41520	NC_021039	GCA	2	6	2568615	2568620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201393
41521	NC_021039	CAG	2	6	2568667	2568672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201393
41522	NC_021039	AGC	2	6	2568744	2568749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201393
41523	NC_021039	CAC	2	6	2568766	2568771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479201393
41524	NC_021039	GGC	2	6	2568800	2568805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479201393
41525	NC_021039	CAG	2	6	2568850	2568855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201393
41526	NC_021039	AGA	2	6	2568887	2568892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201393
41527	NC_021039	CGGA	2	8	2568908	2568915	25 %	0 %	50 %	25 %	479201393
41528	NC_021039	CAC	2	6	2568949	2568954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479201393
41529	NC_021039	CTC	2	6	2569039	2569044	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479201393
41530	NC_021039	GCT	2	6	2569051	2569056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479201393
41531	NC_021039	TCC	2	6	2569085	2569090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479201393
41532	NC_021039	CAC	2	6	2569294	2569299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479201393
41533	NC_021039	GGA	2	6	2569303	2569308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479201393
41534	NC_021039	GCC	2	6	2569415	2569420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479201393
41535	NC_021039	CAG	2	6	2569426	2569431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201393
41536	NC_021039	TCC	2	6	2569448	2569453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479201393
41537	NC_021039	GCC	2	6	2569496	2569501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479201393
41538	NC_021039	TCACA	2	10	2569557	2569566	40 %	20 %	0 %	40 %	479201393
41539	NC_021039	TCC	2	6	2569604	2569609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479201393
41540	NC_021039	GCAC	2	8	2569752	2569759	25 %	0 %	25 %	50 %	479201393
41541	NC_021039	GCG	2	6	2569769	2569774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479201393
41542	NC_021039	GAAA	2	8	2569775	2569782	75 %	0 %	25 %	0 %	479201393
41543	NC_021039	TGCA	2	8	2569789	2569796	25 %	25 %	25 %	25 %	479201393
41544	NC_021039	CTT	2	6	2569816	2569821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479201393
41545	NC_021039	CAG	2	6	2569864	2569869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201393
41546	NC_021039	CCG	2	6	2569878	2569883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479201393
41547	NC_021039	T	6	6	2569888	2569893	0 %	100 %	0 %	0 %	479201393
41548	NC_021039	TCC	2	6	2569922	2569927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479201393
41549	NC_021039	CCT	2	6	2570031	2570036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479201393
41550	NC_021039	GCG	2	6	2570063	2570068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479201393
41551	NC_021039	GCT	2	6	2570085	2570090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479201393
41552	NC_021039	TTC	2	6	2570161	2570166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479201394
41553	NC_021039	TGC	2	6	2570207	2570212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479201394
41554	NC_021039	AAGG	2	8	2570217	2570224	50 %	0 %	50 %	0 %	479201394
41555	NC_021039	T	6	6	2570247	2570252	0 %	100 %	0 %	0 %	479201394
41556	NC_021039	CTT	2	6	2570265	2570270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479201394
41557	NC_021039	TCC	2	6	2570299	2570304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479201394
41558	NC_021039	GCT	2	6	2570363	2570368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479201394
41559	NC_021039	CTC	2	6	2570373	2570378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479201394
41560	NC_021039	ATTTC	2	10	2570396	2570405	20 %	60 %	0 %	20 %	479201394
41561	NC_021039	CAG	2	6	2570406	2570411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201394
41562	NC_021039	GGT	2	6	2570463	2570468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479201394
41563	NC_021039	CCT	2	6	2570474	2570479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479201394
41564	NC_021039	GCA	2	6	2570498	2570503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201394
41565	NC_021039	TGCG	2	8	2570612	2570619	0 %	25 %	50 %	25 %	479201394
41566	NC_021039	GCC	2	6	2570632	2570637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479201394
41567	NC_021039	CAC	2	6	2570659	2570664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479201394
41568	NC_021039	CTC	2	6	2570667	2570672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479201394
41569	NC_021039	GCG	2	6	2570690	2570695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479201394
41570	NC_021039	CCT	2	6	2570735	2570740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479201394
41571	NC_021039	TGCA	2	8	2570763	2570770	25 %	25 %	25 %	25 %	479201394
41572	NC_021039	CCT	3	9	2570780	2570788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479201394
41573	NC_021039	GTT	2	6	2570792	2570797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479201394
41574	NC_021039	TCCG	2	8	2570806	2570813	0 %	25 %	25 %	50 %	479201394
41575	NC_021039	GCC	3	9	2570854	2570862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479201394
41576	NC_021039	CAG	2	6	2570910	2570915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201394
41577	NC_021039	CCA	2	6	2570930	2570935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479201394
41578	NC_021039	GCC	2	6	2570937	2570942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479201394
41579	NC_021039	TA	3	6	2570951	2570956	50 %	50 %	0 %	0 %	479201394
41580	NC_021039	ACC	2	6	2570980	2570985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479201394
41581	NC_021039	GCT	2	6	2571007	2571012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479201394
41582	NC_021039	TCTG	2	8	2571013	2571020	0 %	50 %	25 %	25 %	479201394
41583	NC_021039	CCA	2	6	2571293	2571298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479201395
41584	NC_021039	TCC	2	6	2571304	2571309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479201395
41585	NC_021039	CA	3	6	2571349	2571354	50 %	0 %	0 %	50 %	479201395
41586	NC_021039	CAG	2	6	2571371	2571376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201395
41587	NC_021039	GCC	2	6	2571397	2571402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479201395
41588	NC_021039	TCC	2	6	2571442	2571447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479201395
41589	NC_021039	CCTTGC	2	12	2571461	2571472	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	479201395
41590	NC_021039	CGCC	2	8	2571527	2571534	0 %	0 %	25 %	75 %	479201395
41591	NC_021039	CTC	2	6	2571752	2571757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479201396
41592	NC_021039	TGC	2	6	2571771	2571776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479201396
41593	NC_021039	CCG	2	6	2572002	2572007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479201396
41594	NC_021039	CCA	2	6	2572024	2572029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479201396
41595	NC_021039	CAG	2	6	2572052	2572057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201396
41596	NC_021039	ATC	2	6	2572065	2572070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479201396
41597	NC_021039	TGC	2	6	2572087	2572092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479201396
41598	NC_021039	TAA	2	6	2572325	2572330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479201397
41599	NC_021039	AGA	2	6	2572354	2572359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201397
41600	NC_021039	GAAA	2	8	2572414	2572421	75 %	0 %	25 %	0 %	479201397
41601	NC_021039	CTC	2	6	2572463	2572468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479201397
41602	NC_021039	CTC	2	6	2572509	2572514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479201397
41603	NC_021039	TCC	3	9	2572618	2572626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479201397

< Previous12...72737475767778798081828384Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.