MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruminococcus champanellensis 18P13

Total Repeats: 41603

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_021039	CGC	2	6	212827	212832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479199446
3002	NC_021039	TCCTGT	2	12	214250	214261	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	479199447
3003	NC_021039	GGA	2	6	214300	214305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479199447
3004	NC_021039	CCG	2	6	214338	214343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479199447
3005	NC_021039	GCC	3	9	214439	214447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479199447
3006	NC_021039	GGC	2	6	214496	214501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479199447
3007	NC_021039	TCC	2	6	214511	214516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479199447
3008	NC_021039	CAG	2	6	214531	214536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479199447
3009	NC_021039	CAG	2	6	214540	214545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479199447
3010	NC_021039	GCC	2	6	214548	214553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479199447
3011	NC_021039	CTC	2	6	214669	214674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479199447
3012	NC_021039	CTG	2	6	214681	214686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479199447
3013	NC_021039	GCT	2	6	214750	214755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479199447
3014	NC_021039	GCCT	2	8	214756	214763	0 %	25 %	25 %	50 %	479199447
3015	NC_021039	AAG	2	6	214783	214788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479199447
3016	NC_021039	TCA	2	6	214799	214804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479199447
3017	NC_021039	CTC	2	6	214807	214812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479199447
3018	NC_021039	ATC	2	6	214937	214942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479199447
3019	NC_021039	ATT	2	6	214969	214974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479199447
3020	NC_021039	CTC	2	6	214999	215004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479199447
3021	NC_021039	GCC	2	6	215025	215030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479199447
3022	NC_021039	AGC	2	6	215063	215068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479199447
3023	NC_021039	CTC	2	6	215161	215166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479199447
3024	NC_021039	CA	3	6	215167	215172	50 %	0 %	0 %	50 %	479199447
3025	NC_021039	GCA	2	6	215184	215189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479199447
3026	NC_021039	C	6	6	215199	215204	0 %	0 %	0 %	100 %	479199447
3027	NC_021039	CCG	2	6	215217	215222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479199447
3028	NC_021039	ATT	2	6	215717	215722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479199448
3029	NC_021039	CCCA	2	8	215882	215889	25 %	0 %	0 %	75 %	479199448
3030	NC_021039	TCA	2	6	215943	215948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479199448
3031	NC_021039	CCG	2	6	215967	215972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479199448
3032	NC_021039	TGA	2	6	216028	216033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479199448
3033	NC_021039	CAG	2	6	216041	216046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479199448
3034	NC_021039	CGA	2	6	216049	216054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479199448
3035	NC_021039	GCGCTG	2	12	216092	216103	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	479199448
3036	NC_021039	AAG	2	6	216113	216118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479199448
3037	NC_021039	CCA	2	6	216166	216171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479199448
3038	NC_021039	AT	3	6	216190	216195	50 %	50 %	0 %	0 %	479199448
3039	NC_021039	TCC	2	6	216350	216355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479199448
3040	NC_021039	GGC	2	6	216371	216376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479199448
3041	NC_021039	CTG	2	6	216419	216424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479199448
3042	NC_021039	TG	3	6	216443	216448	0 %	50 %	50 %	0 %	479199448
3043	NC_021039	CCG	2	6	216456	216461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479199448
3044	NC_021039	AAG	2	6	216521	216526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479199448
3045	NC_021039	TCC	2	6	216554	216559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479199448
3046	NC_021039	AAG	2	6	216641	216646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479199448
3047	NC_021039	CGC	2	6	216661	216666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479199448
3048	NC_021039	CTGTT	2	10	216687	216696	0 %	60 %	20 %	20 %	479199448
3049	NC_021039	CGG	2	6	216700	216705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479199448
3050	NC_021039	CGA	2	6	216721	216726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479199448
3051	NC_021039	CGTG	2	8	216727	216734	0 %	25 %	50 %	25 %	479199448
3052	NC_021039	CTT	2	6	216757	216762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479199448
3053	NC_021039	CAA	2	6	216787	216792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479199448
3054	NC_021039	GAG	2	6	216866	216871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479199448
3055	NC_021039	CTG	2	6	216872	216877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479199448
3056	NC_021039	CCTC	2	8	217430	217437	0 %	25 %	0 %	75 %	479199449
3057	NC_021039	CTT	2	6	217448	217453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479199449
3058	NC_021039	ATG	2	6	217512	217517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479199449
3059	NC_021039	GCC	2	6	217581	217586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479199449
3060	NC_021039	GATCC	2	10	217646	217655	20 %	20 %	20 %	40 %	479199449
3061	NC_021039	T	6	6	217657	217662	0 %	100 %	0 %	0 %	479199449
3062	NC_021039	TCA	2	6	217766	217771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479199450
3063	NC_021039	GGA	2	6	217774	217779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479199450
3064	NC_021039	GCC	2	6	217816	217821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479199450
3065	NC_021039	TAT	2	6	217846	217851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479199450
3066	NC_021039	GCC	2	6	217861	217866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479199450
3067	NC_021039	CAG	2	6	217870	217875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479199450
3068	NC_021039	GCC	2	6	217879	217884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479199450
3069	NC_021039	GTGCC	2	10	217892	217901	0 %	20 %	40 %	40 %	479199450
3070	NC_021039	GCC	2	6	217936	217941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479199450
3071	NC_021039	GCAGA	2	10	217945	217954	40 %	0 %	40 %	20 %	479199450
3072	NC_021039	CCG	3	9	217958	217966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479199450
3073	NC_021039	GCT	2	6	217977	217982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479199450
3074	NC_021039	AAC	2	6	217987	217992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479199450
3075	NC_021039	GCC	2	6	218041	218046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479199450
3076	NC_021039	GCG	2	6	218074	218079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479199450
3077	NC_021039	CGG	2	6	218089	218094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479199450
3078	NC_021039	CCT	2	6	218168	218173	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479199450
3079	NC_021039	GCG	2	6	218200	218205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479199450
3080	NC_021039	AGG	2	6	218234	218239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479199450
3081	NC_021039	GGA	2	6	218316	218321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479199450
3082	NC_021039	GGA	2	6	218337	218342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479199450
3083	NC_021039	GGA	2	6	218370	218375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479199450
3084	NC_021039	GGC	3	9	218385	218393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479199450
3085	NC_021039	GCC	2	6	218413	218418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479199450
3086	NC_021039	TCA	2	6	218420	218425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479199450
3087	NC_021039	TCTGA	2	10	218457	218466	20 %	40 %	20 %	20 %	479199450
3088	NC_021039	GCA	2	6	218674	218679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479199451
3089	NC_021039	CGG	3	9	218681	218689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479199451
3090	NC_021039	A	6	6	218722	218727	100 %	0 %	0 %	0 %	479199451
3091	NC_021039	GCT	3	9	218732	218740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479199451
3092	NC_021039	GAC	2	6	218767	218772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479199451
3093	NC_021039	TGC	2	6	218779	218784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479199451
3094	NC_021039	GAC	2	6	218824	218829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479199451
3095	NC_021039	GTGGAC	2	12	218845	218856	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	479199451
3096	NC_021039	AATGC	2	10	219281	219290	40 %	20 %	20 %	20 %	479199452
3097	NC_021039	TGC	2	6	219339	219344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479199452
3098	NC_021039	CAC	2	6	219391	219396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479199452
3099	NC_021039	GGCA	2	8	219400	219407	25 %	0 %	50 %	25 %	479199452
3100	NC_021039	AG	3	6	219485	219490	50 %	0 %	50 %	0 %	479199452
3101	NC_021039	CAT	2	6	219502	219507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479199452
3102	NC_021039	TGG	2	6	219687	219692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479199452
3103	NC_021039	CAT	2	6	219694	219699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479199452
3104	NC_021039	TGA	2	6	219753	219758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479199452
3105	NC_021039	CAC	2	6	219790	219795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479199452
3106	NC_021039	AGG	2	6	219801	219806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479199452
3107	NC_021039	TGG	2	6	219849	219854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479199452
3108	NC_021039	CTG	2	6	219947	219952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479199452
3109	NC_021039	GCG	2	6	219954	219959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479199452
3110	NC_021039	TGCTGG	2	12	220026	220037	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	479199452
3111	NC_021039	CAT	2	6	220063	220068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479199452
3112	NC_021039	CAC	2	6	220210	220215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479199452
3113	NC_021039	CGG	2	6	220309	220314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479199452
3114	NC_021039	CTG	2	6	220382	220387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479199452
3115	NC_021039	AGG	2	6	220506	220511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479199452
3116	NC_021039	AAG	2	6	220517	220522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479199452
3117	NC_021039	GTG	2	6	220565	220570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479199452
3118	NC_021039	GCG	2	6	220593	220598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479199452
3119	NC_021039	CAC	2	6	220979	220984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479199453
3120	NC_021039	GTG	2	6	221010	221015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479199453
3121	NC_021039	TTC	2	6	221028	221033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479199453
3122	NC_021039	ACG	2	6	221056	221061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479199453
3123	NC_021039	C	6	6	221076	221081	0 %	0 %	0 %	100 %	479199453
3124	NC_021039	CCG	2	6	221116	221121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479199453
3125	NC_021039	CTG	2	6	221139	221144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479199453
3126	NC_021039	GCT	2	6	221156	221161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479199453
3127	NC_021039	GAACCG	2	12	221171	221182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479199453
3128	NC_021039	TGC	2	6	221229	221234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479199453
3129	NC_021039	CTG	2	6	221286	221291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479199453
3130	NC_021039	CGC	3	9	221300	221308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479199453
3131	NC_021039	TTC	2	6	221310	221315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479199453
3132	NC_021039	TCC	2	6	221323	221328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479199453
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3134	NC_021039	TGA	2	6	221431	221436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479199454
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3136	NC_021039	GATC	2	8	221477	221484	25 %	25 %	25 %	25 %	479199454
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3140	NC_021039	TGC	2	6	221700	221705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479199455
3141	NC_021039	C	6	6	221930	221935	0 %	0 %	0 %	100 %	479199455
3142	NC_021039	GGC	2	6	221967	221972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479199455
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3145	NC_021039	CTT	3	9	222063	222071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479199455
3146	NC_021039	CTGCC	2	10	222095	222104	0 %	20 %	20 %	60 %	479199455
3147	NC_021039	TGCC	2	8	222109	222116	0 %	25 %	25 %	50 %	479199455
3148	NC_021039	GCT	2	6	222135	222140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479199455
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3150	NC_021039	CTG	2	6	222262	222267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479199455
3151	NC_021039	CTG	3	9	222277	222285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479199455
3152	NC_021039	TGA	2	6	222347	222352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479199455
3153	NC_021039	CTG	2	6	222370	222375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479199455
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3242	NC_021039	CATGCC	2	12	230039	230050	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	479199460
3243	NC_021039	CGG	2	6	230077	230082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479199460
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3245	NC_021039	TGA	2	6	230182	230187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479199460
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3353	NC_021039	CTGC	2	8	237763	237770	0 %	25 %	25 %	50 %	479199466
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3357	NC_021039	TGA	2	6	237944	237949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479199466
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3359	NC_021039	CTC	2	6	238014	238019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479199466
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3362	NC_021039	GAT	2	6	238167	238172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479199466
3363	NC_021039	GCG	2	6	238181	238186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479199466
3364	NC_021039	TGC	2	6	238189	238194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479199466
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3402	NC_021039	GCCT	2	8	240359	240366	0 %	25 %	25 %	50 %	479199468
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3482	NC_021039	CCG	2	6	246783	246788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479199473
3483	NC_021039	GCA	2	6	246824	246829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479199473
3484	NC_021039	GCT	2	6	246846	246851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479199473
3485	NC_021039	CAG	2	6	246871	246876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479199473
3486	NC_021039	CTC	2	6	246889	246894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479199473
3487	NC_021039	G	6	6	247107	247112	0 %	0 %	100 %	0 %	479199473
3488	NC_021039	C	6	6	247115	247120	0 %	0 %	0 %	100 %	479199473
3489	NC_021039	GGC	2	6	247132	247137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479199473
3490	NC_021039	TGC	2	6	247160	247165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479199473
3491	NC_021039	TCG	2	6	247166	247171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479199473
3492	NC_021039	TGA	2	6	247173	247178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479199473
3493	NC_021039	CCA	2	6	247230	247235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479199473
3494	NC_021039	GGCA	2	8	247288	247295	25 %	0 %	50 %	25 %	479199473
3495	NC_021039	CAG	2	6	247306	247311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479199473
3496	NC_021039	G	6	6	247329	247334	0 %	0 %	100 %	0 %	479199473
3497	NC_021039	GCC	4	12	247433	247444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479199473
3498	NC_021039	CCG	2	6	247446	247451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479199473
3499	NC_021039	GCA	2	6	247476	247481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479199473
3500	NC_021039	GGCA	2	8	247489	247496	25 %	0 %	50 %	25 %	479199473

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