MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Ruminococcus obeum A2-162 draft genome

Total Repeats: 39523

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021022	CTG	2	6	869	874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176049
2	NC_021022	TTC	2	6	1066	1071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176049
3	NC_021022	TCA	2	6	1107	1112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176049
4	NC_021022	CTG	2	6	1133	1138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176049
5	NC_021022	TAA	2	6	1150	1155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479176049
6	NC_021022	GTT	2	6	1165	1170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479176049
7	NC_021022	TTC	2	6	1258	1263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176049
8	NC_021022	CTG	2	6	1396	1401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176049
9	NC_021022	CAT	2	6	1429	1434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176049
10	NC_021022	TCT	2	6	1454	1459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176049
11	NC_021022	CAG	2	6	1532	1537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176049
12	NC_021022	TCA	2	6	1614	1619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176049
13	NC_021022	GGT	2	6	1687	1692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479176049
14	NC_021022	TGT	2	6	1698	1703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479176049
15	NC_021022	CCA	2	6	1901	1906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479176049
16	NC_021022	TCA	2	6	1920	1925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176049
17	NC_021022	CTT	2	6	1972	1977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176049
18	NC_021022	TGT	2	6	2114	2119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479176049
19	NC_021022	CTT	2	6	2269	2274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176049
20	NC_021022	TGT	2	6	2275	2280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479176049
21	NC_021022	TCA	2	6	2368	2373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176049
22	NC_021022	AAC	2	6	2384	2389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479176049
23	NC_021022	GTA	2	6	2405	2410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176049
24	NC_021022	TTC	2	6	2426	2431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176049
25	NC_021022	ATG	2	6	2472	2477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176049
26	NC_021022	TGC	2	6	2488	2493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176049
27	NC_021022	GAC	2	6	2783	2788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176050
28	NC_021022	TCC	2	6	2867	2872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479176051
29	NC_021022	GAA	2	6	2908	2913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176051
30	NC_021022	AAG	2	6	2939	2944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176051
31	NC_021022	TCT	2	6	2963	2968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176051
32	NC_021022	TTC	2	6	3062	3067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176051
33	NC_021022	TGC	2	6	3082	3087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176051
34	NC_021022	CTC	2	6	3145	3150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479176051
35	NC_021022	TTG	2	6	3159	3164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479176051
36	NC_021022	TCC	2	6	3431	3436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479176052
37	NC_021022	AGA	2	6	4044	4049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176053
38	NC_021022	CTG	2	6	4069	4074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176053
39	NC_021022	AAG	2	6	4148	4153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176053
40	NC_021022	ATG	2	6	4187	4192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176053
41	NC_021022	CAG	2	6	4292	4297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176053
42	NC_021022	AAC	2	6	4298	4303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479176053
43	NC_021022	TAC	2	6	4482	4487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176054
44	NC_021022	TTG	2	6	4609	4614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479176054
45	NC_021022	AGA	3	9	4661	4669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176054
46	NC_021022	GCA	2	6	4889	4894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176054
47	NC_021022	GAT	2	6	4995	5000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176054
48	NC_021022	AAG	2	6	5189	5194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176054
49	NC_021022	ACG	2	6	5203	5208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176054
50	NC_021022	TTG	2	6	5260	5265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479176054
51	NC_021022	AGC	2	6	5297	5302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176054
52	NC_021022	AAC	2	6	5311	5316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479176054
53	NC_021022	ACC	2	6	5347	5352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479176054
54	NC_021022	ACT	2	6	5356	5361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176054
55	NC_021022	TAT	2	6	5391	5396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479176054
56	NC_021022	GCT	2	6	5604	5609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176054
57	NC_021022	CTT	2	6	5709	5714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176054
58	NC_021022	AGT	2	6	5720	5725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176054
59	NC_021022	CCG	2	6	5992	5997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479176055
60	NC_021022	CTT	2	6	6208	6213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176055
61	NC_021022	AAG	2	6	6245	6250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176055
62	NC_021022	ATT	2	6	6343	6348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479176055
63	NC_021022	GAT	2	6	6373	6378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176055
64	NC_021022	CTT	2	6	6412	6417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176055
65	NC_021022	AGC	2	6	6497	6502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176055
66	NC_021022	TAA	2	6	6555	6560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479176055
67	NC_021022	AGA	2	6	6561	6566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176055
68	NC_021022	AGA	2	6	6618	6623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176055
69	NC_021022	TGC	2	6	6639	6644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176055
70	NC_021022	TGA	2	6	6665	6670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176055
71	NC_021022	GCC	2	6	6887	6892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479176055
72	NC_021022	ATG	2	6	6922	6927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176055
73	NC_021022	CAC	2	6	6947	6952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479176055
74	NC_021022	GAT	2	6	7045	7050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176055
75	NC_021022	CAT	2	6	7056	7061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176055
76	NC_021022	GAT	2	6	7066	7071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176055
77	NC_021022	GAT	2	6	7074	7079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176055
78	NC_021022	TTC	2	6	7091	7096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176055
79	NC_021022	GAA	2	6	7162	7167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176055
80	NC_021022	CTT	2	6	7226	7231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176055
81	NC_021022	AGA	2	6	7257	7262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176055
82	NC_021022	GAA	2	6	7270	7275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176055
83	NC_021022	CTT	2	6	7276	7281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176055
84	NC_021022	ATG	2	6	7399	7404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176055
85	NC_021022	ATA	2	6	7412	7417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479176055
86	NC_021022	GCT	2	6	7477	7482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176055
87	NC_021022	TGC	2	6	7618	7623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176055
88	NC_021022	GAA	2	6	7625	7630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176055
89	NC_021022	ATT	2	6	7686	7691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479176056
90	NC_021022	ATT	2	6	7715	7720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479176056
91	NC_021022	ATT	2	6	8045	8050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479176056
92	NC_021022	ACT	2	6	8114	8119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176056
93	NC_021022	TAA	2	6	8136	8141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479176056
94	NC_021022	TCT	2	6	8153	8158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176056
95	NC_021022	ATA	2	6	8228	8233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479176056
96	NC_021022	TAC	2	6	8256	8261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176056
97	NC_021022	GAA	2	6	8272	8277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176056
98	NC_021022	ATG	2	6	8342	8347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176056
99	NC_021022	ACC	2	6	8349	8354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479176056
100	NC_021022	GCA	2	6	8362	8367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176056
101	NC_021022	ATG	2	6	8390	8395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176056
102	NC_021022	CGG	2	6	8590	8595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479176057
103	NC_021022	GAA	2	6	8634	8639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176057
104	NC_021022	AGA	2	6	8768	8773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176057
105	NC_021022	GAA	2	6	8838	8843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176057
106	NC_021022	TAT	2	6	8988	8993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479176057
107	NC_021022	TGA	2	6	9020	9025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176057
108	NC_021022	CAT	2	6	9064	9069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176057
109	NC_021022	GAT	2	6	9135	9140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176057
110	NC_021022	TGA	2	6	9191	9196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176057
111	NC_021022	GAA	2	6	9243	9248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176057
112	NC_021022	GCA	2	6	9358	9363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176057
113	NC_021022	GCA	2	6	9448	9453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176057
114	NC_021022	CAC	2	6	9575	9580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479176057
115	NC_021022	GGA	2	6	9787	9792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479176057
116	NC_021022	AAG	2	6	9928	9933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176057
117	NC_021022	AAC	2	6	10058	10063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479176057
118	NC_021022	ACC	2	6	10155	10160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479176057
119	NC_021022	GGT	2	6	10326	10331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479176057
120	NC_021022	ATG	2	6	10456	10461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176057
121	NC_021022	CGA	2	6	10471	10476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176057
122	NC_021022	CTT	2	6	10498	10503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176057
123	NC_021022	GAA	2	6	10506	10511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176057
124	NC_021022	AGA	2	6	10532	10537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176057
125	NC_021022	TAA	2	6	10625	10630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479176057
126	NC_021022	GAT	2	6	10845	10850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176057
127	NC_021022	TGA	2	6	10889	10894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176057
128	NC_021022	AGA	2	6	10961	10966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176057
129	NC_021022	ATA	2	6	11070	11075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479176057
130	NC_021022	ACA	2	6	11079	11084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479176057
131	NC_021022	GAG	2	6	11118	11123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479176057
132	NC_021022	ATG	2	6	11251	11256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176057
133	NC_021022	AGA	2	6	11369	11374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176057
134	NC_021022	TAT	2	6	11478	11483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479176057
135	NC_021022	GAA	2	6	11529	11534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176057
136	NC_021022	GTC	2	6	11577	11582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176057
137	NC_021022	GTG	2	6	12067	12072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479176057
138	NC_021022	AGA	2	6	12134	12139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176057
139	NC_021022	CCT	2	6	12325	12330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479176057
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141	NC_021022	TAC	2	6	12453	12458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176057
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144	NC_021022	TAT	2	6	12582	12587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479176057
145	NC_021022	GGT	2	6	12677	12682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479176057
146	NC_021022	TTA	2	6	12716	12721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479176057
147	NC_021022	TTG	2	6	12724	12729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479176057
148	NC_021022	GCA	2	6	12768	12773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176057
149	NC_021022	CTT	2	6	12811	12816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176057
150	NC_021022	AGA	2	6	13104	13109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176057
151	NC_021022	CAG	2	6	13215	13220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176057
152	NC_021022	GTT	2	6	13368	13373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479176057
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155	NC_021022	CAA	2	6	13525	13530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479176057
156	NC_021022	GGT	2	6	13541	13546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479176057
157	NC_021022	TTC	2	6	13571	13576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176057
158	NC_021022	TCC	2	6	13662	13667	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479176057
159	NC_021022	AAG	2	6	13671	13676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176057
160	NC_021022	GGA	3	9	16848	16856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479176058
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162	NC_021022	ATG	2	6	16924	16929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176058
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245	NC_021022	CAT	2	6	24493	24498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176067
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247	NC_021022	TAA	2	6	25125	25130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479176068
248	NC_021022	ATA	2	6	25166	25171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479176068
249	NC_021022	TGC	2	6	25250	25255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176068
250	NC_021022	CGG	2	6	25261	25266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479176068
251	NC_021022	ACG	2	6	25336	25341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176068
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253	NC_021022	AGA	2	6	25389	25394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176068
254	NC_021022	AGA	2	6	25402	25407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176068
255	NC_021022	TTG	2	6	25455	25460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479176068
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365	NC_021022	TTA	2	6	34649	34654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479176072
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