MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruminococcus obeum A2-162 draft genome

Total Repeats: 60580

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021022	CTG	2	6	869	874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176049
2	NC_021022	TTC	2	6	1066	1071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176049
3	NC_021022	CCCG	2	8	1074	1081	0 %	0 %	25 %	75 %	479176049
4	NC_021022	TCA	2	6	1107	1112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176049
5	NC_021022	CTG	2	6	1133	1138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176049
6	NC_021022	TAA	2	6	1150	1155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479176049
7	NC_021022	GTT	2	6	1165	1170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479176049
8	NC_021022	TTC	2	6	1258	1263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176049
9	NC_021022	CTGT	2	8	1348	1355	0 %	50 %	25 %	25 %	479176049
10	NC_021022	CTG	2	6	1396	1401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176049
11	NC_021022	CAT	2	6	1429	1434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176049
12	NC_021022	TCT	2	6	1454	1459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176049
13	NC_021022	CAG	2	6	1532	1537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176049
14	NC_021022	TCA	2	6	1614	1619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176049
15	NC_021022	TCTT	2	8	1621	1628	0 %	75 %	0 %	25 %	479176049
16	NC_021022	GGT	2	6	1687	1692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479176049
17	NC_021022	TGT	2	6	1698	1703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479176049
18	NC_021022	CCA	2	6	1901	1906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479176049
19	NC_021022	TCA	2	6	1920	1925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176049
20	NC_021022	CTT	2	6	1972	1977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176049
21	NC_021022	CA	3	6	2074	2079	50 %	0 %	0 %	50 %	479176049
22	NC_021022	TGT	2	6	2114	2119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479176049
23	NC_021022	AAGT	2	8	2242	2249	50 %	25 %	25 %	0 %	479176049
24	NC_021022	CTT	2	6	2269	2274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176049
25	NC_021022	TGT	2	6	2275	2280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479176049
26	NC_021022	CA	3	6	2362	2367	50 %	0 %	0 %	50 %	479176049
27	NC_021022	TCA	2	6	2368	2373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176049
28	NC_021022	AAC	2	6	2384	2389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479176049
29	NC_021022	GTA	2	6	2405	2410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176049
30	NC_021022	CCTG	2	8	2417	2424	0 %	25 %	25 %	50 %	479176049
31	NC_021022	TTC	2	6	2426	2431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176049
32	NC_021022	ATG	2	6	2472	2477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176049
33	NC_021022	TGC	2	6	2488	2493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176049
34	NC_021022	C	6	6	2540	2545	0 %	0 %	0 %	100 %	479176049
35	NC_021022	GAC	2	6	2783	2788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176050
36	NC_021022	A	6	6	2818	2823	100 %	0 %	0 %	0 %	479176050
37	NC_021022	ACTCC	2	10	2842	2851	20 %	20 %	0 %	60 %	479176050
38	NC_021022	TCC	2	6	2867	2872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479176051
39	NC_021022	GAA	2	6	2908	2913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176051
40	NC_021022	AAG	2	6	2939	2944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176051
41	NC_021022	TCT	2	6	2963	2968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176051
42	NC_021022	CACCG	2	10	2998	3007	20 %	0 %	20 %	60 %	479176051
43	NC_021022	T	7	7	3034	3040	0 %	100 %	0 %	0 %	479176051
44	NC_021022	TTC	2	6	3062	3067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176051
45	NC_021022	TGC	2	6	3082	3087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176051
46	NC_021022	T	6	6	3123	3128	0 %	100 %	0 %	0 %	479176051
47	NC_021022	CTC	2	6	3145	3150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479176051
48	NC_021022	TTG	2	6	3159	3164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479176051
49	NC_021022	TCC	2	6	3431	3436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479176052
50	NC_021022	TCCAC	2	10	3461	3470	20 %	20 %	0 %	60 %	479176052
51	NC_021022	TCTT	2	8	3536	3543	0 %	75 %	0 %	25 %	479176052
52	NC_021022	AGA	2	6	4044	4049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176053
53	NC_021022	CTG	2	6	4069	4074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176053
54	NC_021022	AAG	2	6	4148	4153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176053
55	NC_021022	ATG	2	6	4187	4192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176053
56	NC_021022	CAG	2	6	4292	4297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176053
57	NC_021022	AAC	2	6	4298	4303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479176053
58	NC_021022	AGAA	2	8	4461	4468	75 %	0 %	25 %	0 %	479176054
59	NC_021022	GAAA	2	8	4471	4478	75 %	0 %	25 %	0 %	479176054
60	NC_021022	TAC	2	6	4482	4487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176054
61	NC_021022	AGAA	2	8	4525	4532	75 %	0 %	25 %	0 %	479176054
62	NC_021022	TTG	2	6	4609	4614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479176054
63	NC_021022	AGA	3	9	4661	4669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176054
64	NC_021022	GCA	2	6	4889	4894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176054
65	NC_021022	A	6	6	4962	4967	100 %	0 %	0 %	0 %	479176054
66	NC_021022	GAT	2	6	4995	5000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176054
67	NC_021022	CA	3	6	5015	5020	50 %	0 %	0 %	50 %	479176054
68	NC_021022	GAAAA	2	10	5064	5073	80 %	0 %	20 %	0 %	479176054
69	NC_021022	AAG	2	6	5189	5194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176054
70	NC_021022	ACG	2	6	5203	5208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176054
71	NC_021022	GAAA	2	8	5245	5252	75 %	0 %	25 %	0 %	479176054
72	NC_021022	TTG	2	6	5260	5265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479176054
73	NC_021022	CTGA	2	8	5280	5287	25 %	25 %	25 %	25 %	479176054
74	NC_021022	AGC	2	6	5297	5302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176054
75	NC_021022	AAC	2	6	5311	5316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479176054
76	NC_021022	ACC	2	6	5347	5352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479176054
77	NC_021022	ACT	2	6	5356	5361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176054
78	NC_021022	TAT	2	6	5391	5396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479176054
79	NC_021022	TTGC	2	8	5506	5513	0 %	50 %	25 %	25 %	479176054
80	NC_021022	A	6	6	5525	5530	100 %	0 %	0 %	0 %	479176054
81	NC_021022	TTTCAC	2	12	5550	5561	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	479176054
82	NC_021022	GCT	2	6	5604	5609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176054
83	NC_021022	CTCA	2	8	5671	5678	25 %	25 %	0 %	50 %	479176054
84	NC_021022	CTT	2	6	5709	5714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176054
85	NC_021022	AGT	2	6	5720	5725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176054
86	NC_021022	CCG	2	6	5992	5997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479176055
87	NC_021022	A	6	6	6112	6117	100 %	0 %	0 %	0 %	479176055
88	NC_021022	CTT	2	6	6208	6213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176055
89	NC_021022	AAG	2	6	6245	6250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176055
90	NC_021022	A	6	6	6283	6288	100 %	0 %	0 %	0 %	479176055
91	NC_021022	AAAG	2	8	6324	6331	75 %	0 %	25 %	0 %	479176055
92	NC_021022	ATT	2	6	6343	6348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479176055
93	NC_021022	GAT	2	6	6373	6378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176055
94	NC_021022	CTT	2	6	6412	6417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176055
95	NC_021022	AGC	2	6	6497	6502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176055
96	NC_021022	TAA	2	6	6555	6560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479176055
97	NC_021022	AGA	2	6	6561	6566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176055
98	NC_021022	AGA	2	6	6618	6623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176055
99	NC_021022	GCAGA	2	10	6628	6637	40 %	0 %	40 %	20 %	479176055
100	NC_021022	TGC	2	6	6639	6644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176055
101	NC_021022	TGA	2	6	6665	6670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176055
102	NC_021022	GCAG	2	8	6684	6691	25 %	0 %	50 %	25 %	479176055
103	NC_021022	GCC	2	6	6887	6892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479176055
104	NC_021022	ATG	2	6	6922	6927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176055
105	NC_021022	CAC	2	6	6947	6952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479176055
106	NC_021022	GAT	2	6	7045	7050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176055
107	NC_021022	AT	3	6	7049	7054	50 %	50 %	0 %	0 %	479176055
108	NC_021022	CAT	2	6	7056	7061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176055
109	NC_021022	GAT	2	6	7066	7071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176055
110	NC_021022	GAT	2	6	7074	7079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176055
111	NC_021022	TTC	2	6	7091	7096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176055
112	NC_021022	GAA	2	6	7162	7167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176055
113	NC_021022	CTT	2	6	7226	7231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176055
114	NC_021022	GA	3	6	7236	7241	50 %	0 %	50 %	0 %	479176055
115	NC_021022	AGA	2	6	7257	7262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176055
116	NC_021022	GAA	2	6	7270	7275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176055
117	NC_021022	CTT	2	6	7276	7281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176055
118	NC_021022	ATGG	2	8	7306	7313	25 %	25 %	50 %	0 %	479176055
119	NC_021022	A	6	6	7342	7347	100 %	0 %	0 %	0 %	479176055
120	NC_021022	GA	3	6	7381	7386	50 %	0 %	50 %	0 %	479176055
121	NC_021022	ATG	2	6	7399	7404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176055
122	NC_021022	ATA	2	6	7412	7417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479176055
123	NC_021022	GCT	2	6	7477	7482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176055
124	NC_021022	AAAG	2	8	7560	7567	75 %	0 %	25 %	0 %	479176055
125	NC_021022	GTGGAA	2	12	7592	7603	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	479176055
126	NC_021022	TGC	2	6	7618	7623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176055
127	NC_021022	GAA	2	6	7625	7630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176055
128	NC_021022	ATT	2	6	7686	7691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479176056
129	NC_021022	ATT	2	6	7715	7720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479176056
130	NC_021022	ACTG	2	8	7731	7738	25 %	25 %	25 %	25 %	479176056
131	NC_021022	GA	3	6	7749	7754	50 %	0 %	50 %	0 %	479176056
132	NC_021022	A	6	6	7771	7776	100 %	0 %	0 %	0 %	479176056
133	NC_021022	A	7	7	7852	7858	100 %	0 %	0 %	0 %	479176056
134	NC_021022	ATT	2	6	8045	8050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479176056
135	NC_021022	ACT	2	6	8114	8119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176056
136	NC_021022	TAA	2	6	8136	8141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479176056
137	NC_021022	TCT	2	6	8153	8158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176056
138	NC_021022	ATA	2	6	8228	8233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479176056
139	NC_021022	TG	3	6	8234	8239	0 %	50 %	50 %	0 %	479176056
140	NC_021022	TAC	2	6	8256	8261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176056
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142	NC_021022	ATG	2	6	8342	8347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176056
143	NC_021022	ACC	2	6	8349	8354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479176056
144	NC_021022	GCA	2	6	8362	8367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176056
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146	NC_021022	GGAA	2	8	8582	8589	50 %	0 %	50 %	0 %	479176057
147	NC_021022	CGG	2	6	8590	8595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479176057
148	NC_021022	GAA	2	6	8634	8639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176057
149	NC_021022	GATAGC	2	12	8754	8765	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	479176057
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152	NC_021022	T	6	6	8890	8895	0 %	100 %	0 %	0 %	479176057
153	NC_021022	ACTG	2	8	8921	8928	25 %	25 %	25 %	25 %	479176057
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159	NC_021022	AT	3	6	9227	9232	50 %	50 %	0 %	0 %	479176057
160	NC_021022	GAA	2	6	9243	9248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176057
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166	NC_021022	AAG	2	6	9928	9933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176057
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257	NC_021022	GAA	2	6	17901	17906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176059
258	NC_021022	CAG	3	9	17917	17925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176059
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261	NC_021022	AG	3	6	18201	18206	50 %	0 %	50 %	0 %	479176060
262	NC_021022	TACA	2	8	18396	18403	50 %	25 %	0 %	25 %	479176061
263	NC_021022	GCA	3	9	18524	18532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176061
264	NC_021022	CTG	2	6	18545	18550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176061
265	NC_021022	A	6	6	18568	18573	100 %	0 %	0 %	0 %	479176061
266	NC_021022	GCA	2	6	18578	18583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176061
267	NC_021022	GCT	2	6	18619	18624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176061
268	NC_021022	ATT	2	6	18642	18647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479176061
269	NC_021022	TGTA	2	8	18774	18781	25 %	50 %	25 %	0 %	479176061
270	NC_021022	GGT	2	6	18803	18808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479176061
271	NC_021022	GGAA	2	8	18878	18885	50 %	0 %	50 %	0 %	479176061
272	NC_021022	CAG	2	6	19051	19056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176062
273	NC_021022	GAA	2	6	19071	19076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176062
274	NC_021022	TA	3	6	19116	19121	50 %	50 %	0 %	0 %	479176062
275	NC_021022	GAA	2	6	19164	19169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176062
276	NC_021022	CAG	2	6	19713	19718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176064
277	NC_021022	GACAG	2	10	19727	19736	40 %	0 %	40 %	20 %	479176064
278	NC_021022	TGCG	2	8	19789	19796	0 %	25 %	50 %	25 %	479176064
279	NC_021022	GATT	2	8	19855	19862	25 %	50 %	25 %	0 %	479176064
280	NC_021022	CAG	2	6	19926	19931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176064
281	NC_021022	AGG	2	6	19949	19954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479176064
282	NC_021022	TCT	2	6	19991	19996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176064
283	NC_021022	AT	3	6	20030	20035	50 %	50 %	0 %	0 %	479176064
284	NC_021022	AAT	2	6	20152	20157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479176064
285	NC_021022	AAAT	2	8	21091	21098	75 %	25 %	0 %	0 %	479176065
286	NC_021022	CGG	2	6	21186	21191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479176065
287	NC_021022	GAT	2	6	21253	21258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176065
288	NC_021022	ACAG	2	8	21284	21291	50 %	0 %	25 %	25 %	479176065
289	NC_021022	AAG	2	6	21500	21505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176065
290	NC_021022	ATC	2	6	21517	21522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176065
291	NC_021022	AGC	2	6	21523	21528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176065
292	NC_021022	TCTG	2	8	21589	21596	0 %	50 %	25 %	25 %	479176065
293	NC_021022	GCG	2	6	21615	21620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479176065
294	NC_021022	A	6	6	21643	21648	100 %	0 %	0 %	0 %	479176065
295	NC_021022	AGT	2	6	21654	21659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176065
296	NC_021022	TCC	2	6	21729	21734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479176065
297	NC_021022	CGT	2	6	21760	21765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176065
298	NC_021022	GAA	2	6	22064	22069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176066
299	NC_021022	TTG	2	6	22100	22105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479176066
300	NC_021022	GAT	2	6	22110	22115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176066
301	NC_021022	GGC	2	6	22140	22145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479176066
302	NC_021022	CGGATA	2	12	22184	22195	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	479176066
303	NC_021022	GAA	2	6	22210	22215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176066
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305	NC_021022	ACCT	2	8	22245	22252	25 %	25 %	0 %	50 %	479176066
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326	NC_021022	A	6	6	23154	23159	100 %	0 %	0 %	0 %	479176066
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332	NC_021022	TTC	2	6	23552	23557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176067
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338	NC_021022	CGG	2	6	23874	23879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479176067
339	NC_021022	GCA	2	6	23925	23930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176067
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356	NC_021022	GA	3	6	24760	24765	50 %	0 %	50 %	0 %	479176067
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381	NC_021022	A	6	6	25801	25806	100 %	0 %	0 %	0 %	479176068
382	NC_021022	AGC	2	6	25844	25849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176068
383	NC_021022	CA	3	6	25858	25863	50 %	0 %	0 %	50 %	479176068
384	NC_021022	TGACG	2	10	25870	25879	20 %	20 %	40 %	20 %	479176068
385	NC_021022	TCT	2	6	25881	25886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176068
386	NC_021022	TCG	2	6	25887	25892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176068
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390	NC_021022	GCC	2	6	26069	26074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479176068
391	NC_021022	GCA	2	6	26128	26133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176068
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393	NC_021022	ACCG	2	8	26210	26217	25 %	0 %	25 %	50 %	479176068
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500	NC_021022	T	6	6	32906	32911	0 %	100 %	0 %	0 %	479176071

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