MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruminococcus obeum A2-162 draft genome

Total Repeats: 60580

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_021022	AGG	2	6	240446	240451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479176242
4002	NC_021022	AT	3	6	240467	240472	50 %	50 %	0 %	0 %	479176242
4003	NC_021022	ATG	2	6	240479	240484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176242
4004	NC_021022	AT	3	6	240531	240536	50 %	50 %	0 %	0 %	479176242
4005	NC_021022	TA	3	6	240589	240594	50 %	50 %	0 %	0 %	479176242
4006	NC_021022	ATG	2	6	240622	240627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176242
4007	NC_021022	TGA	2	6	240672	240677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176242
4008	NC_021022	GAA	2	6	240708	240713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176242
4009	NC_021022	A	6	6	240736	240741	100 %	0 %	0 %	0 %	479176242
4010	NC_021022	TCC	2	6	240747	240752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479176242
4011	NC_021022	AAT	2	6	240753	240758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479176242
4012	NC_021022	TGG	2	6	240801	240806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479176242
4013	NC_021022	TTTGT	2	10	240937	240946	0 %	80 %	20 %	0 %	479176243
4014	NC_021022	A	6	6	240956	240961	100 %	0 %	0 %	0 %	479176243
4015	NC_021022	TGA	2	6	241017	241022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176243
4016	NC_021022	AATT	2	8	241041	241048	50 %	50 %	0 %	0 %	479176243
4017	NC_021022	AT	3	6	241061	241066	50 %	50 %	0 %	0 %	479176243
4018	NC_021022	AT	3	6	241112	241117	50 %	50 %	0 %	0 %	479176243
4019	NC_021022	GAC	2	6	241129	241134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176243
4020	NC_021022	TCA	3	9	241144	241152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176243
4021	NC_021022	AAT	2	6	241216	241221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479176243
4022	NC_021022	TAT	2	6	241284	241289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479176243
4023	NC_021022	TTA	2	6	241337	241342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479176243
4024	NC_021022	GATTTT	2	12	241394	241405	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	479176243
4025	NC_021022	CT	3	6	241418	241423	0 %	50 %	0 %	50 %	479176243
4026	NC_021022	TAA	2	6	241426	241431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479176243
4027	NC_021022	CAA	2	6	241467	241472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479176243
4028	NC_021022	A	6	6	241471	241476	100 %	0 %	0 %	0 %	479176243
4029	NC_021022	GTC	2	6	241480	241485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176243
4030	NC_021022	TACTG	2	10	241603	241612	20 %	40 %	20 %	20 %	479176243
4031	NC_021022	TGT	2	6	241619	241624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479176243
4032	NC_021022	AAG	2	6	241720	241725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176243
4033	NC_021022	GAC	2	6	241744	241749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176243
4034	NC_021022	ATT	2	6	241772	241777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479176243
4035	NC_021022	TAT	2	6	242050	242055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479176244
4036	NC_021022	CA	3	6	242065	242070	50 %	0 %	0 %	50 %	479176244
4037	NC_021022	GAA	2	6	242073	242078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176244
4038	NC_021022	GGA	2	6	242091	242096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479176244
4039	NC_021022	GTGA	2	8	242101	242108	25 %	25 %	50 %	0 %	479176244
4040	NC_021022	CAA	2	6	242190	242195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479176244
4041	NC_021022	GCGAC	2	10	242261	242270	20 %	0 %	40 %	40 %	479176244
4042	NC_021022	GAA	2	6	242272	242277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176244
4043	NC_021022	ATC	2	6	242329	242334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176244
4044	NC_021022	ATG	2	6	242380	242385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176244
4045	NC_021022	GAT	2	6	242476	242481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176245
4046	NC_021022	AGAGC	2	10	242571	242580	40 %	0 %	40 %	20 %	479176245
4047	NC_021022	AGC	2	6	242601	242606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176245
4048	NC_021022	CGGA	2	8	242608	242615	25 %	0 %	50 %	25 %	479176245
4049	NC_021022	CAC	3	9	242637	242645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479176245
4050	NC_021022	AC	3	6	242644	242649	50 %	0 %	0 %	50 %	479176245
4051	NC_021022	GCG	2	6	242692	242697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479176245
4052	NC_021022	GTT	2	6	242701	242706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479176245
4053	NC_021022	GCT	2	6	242736	242741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176245
4054	NC_021022	ACA	2	6	242773	242778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479176245
4055	NC_021022	AGC	2	6	242802	242807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176245
4056	NC_021022	ATG	2	6	242870	242875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176245
4057	NC_021022	ACA	2	6	242882	242887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479176245
4058	NC_021022	GAATG	2	10	242896	242905	40 %	20 %	40 %	0 %	479176245
4059	NC_021022	GAA	2	6	242947	242952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176245
4060	NC_021022	GCA	2	6	242983	242988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176245
4061	NC_021022	TGC	2	6	243033	243038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176245
4062	NC_021022	ATG	2	6	243074	243079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176245
4063	NC_021022	ATT	2	6	243098	243103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479176245
4064	NC_021022	CAAC	2	8	243107	243114	50 %	0 %	0 %	50 %	479176245
4065	NC_021022	AC	3	6	243113	243118	50 %	0 %	0 %	50 %	479176245
4066	NC_021022	GAA	2	6	243121	243126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176245
4067	NC_021022	AGAC	2	8	243152	243159	50 %	0 %	25 %	25 %	479176245
4068	NC_021022	ATGT	2	8	243271	243278	25 %	50 %	25 %	0 %	479176245
4069	NC_021022	CTGC	2	8	243288	243295	0 %	25 %	25 %	50 %	479176245
4070	NC_021022	CAG	2	6	243307	243312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176245
4071	NC_021022	TGA	2	6	243360	243365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176245
4072	NC_021022	CAGT	2	8	243388	243395	25 %	25 %	25 %	25 %	479176245
4073	NC_021022	GAC	2	6	243420	243425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176245
4074	NC_021022	AT	3	6	243446	243451	50 %	50 %	0 %	0 %	479176245
4075	NC_021022	CAG	2	6	243487	243492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176245
4076	NC_021022	TC	3	6	243504	243509	0 %	50 %	0 %	50 %	479176245
4077	NC_021022	TAT	2	6	243589	243594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479176245
4078	NC_021022	AT	3	6	243615	243620	50 %	50 %	0 %	0 %	479176245
4079	NC_021022	AGG	2	6	243650	243655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479176245
4080	NC_021022	GAT	2	6	243661	243666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176245
4081	NC_021022	GTGA	2	8	243775	243782	25 %	25 %	50 %	0 %	479176245
4082	NC_021022	ACGG	2	8	243871	243878	25 %	0 %	50 %	25 %	479176245
4083	NC_021022	ATC	2	6	243938	243943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176245
4084	NC_021022	GTA	2	6	243949	243954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176245
4085	NC_021022	GAA	2	6	244069	244074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176245
4086	NC_021022	GCT	2	6	244239	244244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176245
4087	NC_021022	TCCG	2	8	244320	244327	0 %	25 %	25 %	50 %	479176245
4088	NC_021022	ACCG	2	8	244339	244346	25 %	0 %	25 %	50 %	479176245
4089	NC_021022	TTTC	2	8	244364	244371	0 %	75 %	0 %	25 %	479176245
4090	NC_021022	GAA	2	6	244413	244418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176245
4091	NC_021022	TGA	2	6	244509	244514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176245
4092	NC_021022	GAC	2	6	244570	244575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176245
4093	NC_021022	GAAT	2	8	244707	244714	50 %	25 %	25 %	0 %	479176245
4094	NC_021022	AGA	2	6	244856	244861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176246
4095	NC_021022	AGG	2	6	244886	244891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479176246
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4097	NC_021022	ACA	2	6	244984	244989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479176246
4098	NC_021022	TGC	2	6	245027	245032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176246
4099	NC_021022	AGA	2	6	245096	245101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176246
4100	NC_021022	A	6	6	245145	245150	100 %	0 %	0 %	0 %	479176246
4101	NC_021022	TTC	2	6	245259	245264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176246
4102	NC_021022	AC	3	6	245288	245293	50 %	0 %	0 %	50 %	479176246
4103	NC_021022	GA	3	6	245329	245334	50 %	0 %	50 %	0 %	479176246
4104	NC_021022	TCC	2	6	245366	245371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479176246
4105	NC_021022	ATGA	2	8	245373	245380	50 %	25 %	25 %	0 %	479176246
4106	NC_021022	ACACG	2	10	245524	245533	40 %	0 %	20 %	40 %	479176246
4107	NC_021022	GCA	2	6	245538	245543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176246
4108	NC_021022	GAT	2	6	245552	245557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176246
4109	NC_021022	ACA	2	6	245590	245595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479176246
4110	NC_021022	AGA	2	6	245606	245611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176246
4111	NC_021022	GGA	2	6	245654	245659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479176246
4112	NC_021022	CTT	2	6	245666	245671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176246
4113	NC_021022	GTA	2	6	245715	245720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176246
4114	NC_021022	AAC	2	6	245775	245780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479176246
4115	NC_021022	CAGA	2	8	245820	245827	50 %	0 %	25 %	25 %	479176246
4116	NC_021022	CGG	2	6	245981	245986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479176246
4117	NC_021022	AG	4	8	245992	245999	50 %	0 %	50 %	0 %	479176246
4118	NC_021022	GAT	2	6	246000	246005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176246
4119	NC_021022	GAG	2	6	246051	246056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479176246
4120	NC_021022	CATTC	2	10	246170	246179	20 %	40 %	0 %	40 %	479176246
4121	NC_021022	AAC	2	6	246192	246197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479176246
4122	NC_021022	GA	4	8	246295	246302	50 %	0 %	50 %	0 %	479176247
4123	NC_021022	AGA	3	9	246300	246308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176247
4124	NC_021022	CCG	2	6	246324	246329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479176247
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4127	NC_021022	T	6	6	246541	246546	0 %	100 %	0 %	0 %	479176247
4128	NC_021022	GAA	2	6	246553	246558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176247
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4130	NC_021022	AAG	2	6	246620	246625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176247
4131	NC_021022	ATG	2	6	246641	246646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176247
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4145	NC_021022	A	6	6	247429	247434	100 %	0 %	0 %	0 %	479176248
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4241	NC_021022	TCG	2	6	253400	253405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176251
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4243	NC_021022	TG	3	6	253430	253435	0 %	50 %	50 %	0 %	479176251
4244	NC_021022	ACA	2	6	253436	253441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479176251
4245	NC_021022	AGT	2	6	253446	253451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176251
4246	NC_021022	GGAT	2	8	253582	253589	25 %	25 %	50 %	0 %	479176251
4247	NC_021022	ACA	2	6	253603	253608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479176251
4248	NC_021022	GC	3	6	253636	253641	0 %	0 %	50 %	50 %	479176251
4249	NC_021022	AGA	2	6	253649	253654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176251
4250	NC_021022	AGA	2	6	253675	253680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176251
4251	NC_021022	AG	3	6	253791	253796	50 %	0 %	50 %	0 %	479176251
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4253	NC_021022	TGA	3	9	254103	254111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176252
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4255	NC_021022	TGGC	2	8	254136	254143	0 %	25 %	50 %	25 %	479176252
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4350	NC_021022	TGCTT	2	10	259110	259119	0 %	60 %	20 %	20 %	479176256
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4354	NC_021022	CTGC	2	8	259297	259304	0 %	25 %	25 %	50 %	479176256
4355	NC_021022	TGC	3	9	259325	259333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176256
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4362	NC_021022	TACA	2	8	259776	259783	50 %	25 %	0 %	25 %	479176257
4363	NC_021022	GCA	2	6	259820	259825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176257
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4365	NC_021022	TTTC	2	8	259849	259856	0 %	75 %	0 %	25 %	479176257
4366	NC_021022	ATC	2	6	259976	259981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176257
4367	NC_021022	ATTCC	2	10	260046	260055	20 %	40 %	0 %	40 %	479176257
4368	NC_021022	ACA	2	6	260112	260117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479176257
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4370	NC_021022	GCA	2	6	260166	260171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176257
4371	NC_021022	ATG	2	6	260240	260245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176257
4372	NC_021022	ATC	2	6	260253	260258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176257
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4488	NC_021022	GA	3	6	268795	268800	50 %	0 %	50 %	0 %	479176263
4489	NC_021022	GAT	2	6	268857	268862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176263
4490	NC_021022	A	6	6	268872	268877	100 %	0 %	0 %	0 %	479176263
4491	NC_021022	CAT	2	6	268889	268894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176263
4492	NC_021022	ATC	2	6	268945	268950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176263
4493	NC_021022	TGT	2	6	269012	269017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479176263
4494	NC_021022	AGA	3	9	269021	269029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176263
4495	NC_021022	GGA	2	6	269069	269074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479176264
4496	NC_021022	AAT	2	6	269105	269110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479176264
4497	NC_021022	GAA	2	6	269147	269152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176264
4498	NC_021022	GAA	2	6	269168	269173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176264
4499	NC_021022	GAA	2	6	269258	269263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176264
4500	NC_021022	GAT	2	6	269276	269281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176264

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