MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruminococcus obeum A2-162 draft genome

Total Repeats: 60580

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021022	T	6	6	213207	213212	0 %	100 %	0 %	0 %	479176220
3502	NC_021022	CGG	2	6	213235	213240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479176220
3503	NC_021022	CAT	2	6	213253	213258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176220
3504	NC_021022	GGAC	2	8	213287	213294	25 %	0 %	50 %	25 %	479176220
3505	NC_021022	GCAG	2	8	213299	213306	25 %	0 %	50 %	25 %	479176220
3506	NC_021022	CAG	3	9	213304	213312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176220
3507	NC_021022	GTG	2	6	213319	213324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479176220
3508	NC_021022	TTC	2	6	213345	213350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176220
3509	NC_021022	A	6	6	213386	213391	100 %	0 %	0 %	0 %	479176220
3510	NC_021022	TGG	2	6	213434	213439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479176220
3511	NC_021022	ATT	2	6	213586	213591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479176221
3512	NC_021022	GAA	3	9	213603	213611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176221
3513	NC_021022	CTG	2	6	213705	213710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176221
3514	NC_021022	TAT	2	6	213714	213719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479176221
3515	NC_021022	ACATC	2	10	213721	213730	40 %	20 %	0 %	40 %	479176221
3516	NC_021022	ATTC	2	8	213803	213810	25 %	50 %	0 %	25 %	479176221
3517	NC_021022	CTG	2	6	213911	213916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176221
3518	NC_021022	ATC	3	9	213928	213936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176221
3519	NC_021022	A	6	6	214189	214194	100 %	0 %	0 %	0 %	479176221
3520	NC_021022	A	6	6	214260	214265	100 %	0 %	0 %	0 %	479176221
3521	NC_021022	AGAA	2	8	214273	214280	75 %	0 %	25 %	0 %	479176221
3522	NC_021022	TCC	2	6	214299	214304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479176221
3523	NC_021022	CAG	3	9	214339	214347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176221
3524	NC_021022	TTC	2	6	214357	214362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176221
3525	NC_021022	CGG	2	6	214399	214404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479176221
3526	NC_021022	GGA	2	6	214416	214421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479176221
3527	NC_021022	CAT	2	6	214424	214429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176221
3528	NC_021022	AGA	2	6	214471	214476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176221
3529	NC_021022	A	6	6	214508	214513	100 %	0 %	0 %	0 %	479176221
3530	NC_021022	TGA	2	6	214529	214534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176221
3531	NC_021022	AGC	2	6	214545	214550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176221
3532	NC_021022	AGG	2	6	214560	214565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479176221
3533	NC_021022	GA	3	6	214569	214574	50 %	0 %	50 %	0 %	479176221
3534	NC_021022	A	6	6	214612	214617	100 %	0 %	0 %	0 %	479176221
3535	NC_021022	CGT	2	6	214688	214693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176221
3536	NC_021022	CCG	2	6	214699	214704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479176221
3537	NC_021022	ATCT	2	8	214761	214768	25 %	50 %	0 %	25 %	479176221
3538	NC_021022	GCC	2	6	214806	214811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479176221
3539	NC_021022	TCCC	2	8	214824	214831	0 %	25 %	0 %	75 %	479176221
3540	NC_021022	CTG	2	6	214929	214934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176221
3541	NC_021022	T	7	7	214999	215005	0 %	100 %	0 %	0 %	479176221
3542	NC_021022	AAAAG	2	10	215315	215324	80 %	0 %	20 %	0 %	479176222
3543	NC_021022	TGGT	2	8	215335	215342	0 %	50 %	50 %	0 %	479176222
3544	NC_021022	AT	3	6	215343	215348	50 %	50 %	0 %	0 %	479176222
3545	NC_021022	TGT	2	6	215358	215363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479176222
3546	NC_021022	TA	3	6	215369	215374	50 %	50 %	0 %	0 %	479176222
3547	NC_021022	ATG	2	6	215399	215404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176222
3548	NC_021022	TCT	2	6	215484	215489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176222
3549	NC_021022	GCA	2	6	215536	215541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176222
3550	NC_021022	TG	3	6	215547	215552	0 %	50 %	50 %	0 %	479176222
3551	NC_021022	GAA	3	9	215587	215595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176222
3552	NC_021022	T	7	7	215634	215640	0 %	100 %	0 %	0 %	479176222
3553	NC_021022	GTT	2	6	215664	215669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479176222
3554	NC_021022	CAG	2	6	215671	215676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176222
3555	NC_021022	TGGC	2	8	215682	215689	0 %	25 %	50 %	25 %	479176222
3556	NC_021022	GCA	2	6	215692	215697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176222
3557	NC_021022	TAT	2	6	215737	215742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479176222
3558	NC_021022	GAAGCA	2	12	215766	215777	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	479176222
3559	NC_021022	GTT	2	6	215835	215840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479176222
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3561	NC_021022	TTG	2	6	215885	215890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479176222
3562	NC_021022	T	6	6	215937	215942	0 %	100 %	0 %	0 %	479176222
3563	NC_021022	GCT	2	6	215998	216003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176222
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3565	NC_021022	TTA	2	6	216062	216067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479176222
3566	NC_021022	AATA	2	8	216090	216097	75 %	25 %	0 %	0 %	479176222
3567	NC_021022	TTG	2	6	216130	216135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479176222
3568	NC_021022	TA	3	6	216209	216214	50 %	50 %	0 %	0 %	479176222
3569	NC_021022	AAT	2	6	216268	216273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479176222
3570	NC_021022	T	6	6	216301	216306	0 %	100 %	0 %	0 %	479176222
3571	NC_021022	AG	3	6	216348	216353	50 %	0 %	50 %	0 %	479176222
3572	NC_021022	GGC	2	6	216393	216398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479176222
3573	NC_021022	GTT	2	6	216513	216518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479176222
3574	NC_021022	TG	4	8	216557	216564	0 %	50 %	50 %	0 %	479176222
3575	NC_021022	AT	3	6	216565	216570	50 %	50 %	0 %	0 %	479176222
3576	NC_021022	TGC	2	6	216659	216664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176222
3577	NC_021022	GGA	2	6	216753	216758	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479176222
3578	NC_021022	GAA	2	6	216804	216809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176223
3579	NC_021022	A	7	7	216812	216818	100 %	0 %	0 %	0 %	479176223
3580	NC_021022	CCTGAT	2	12	216836	216847	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	479176223
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3582	NC_021022	GAT	2	6	216935	216940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176223
3583	NC_021022	AAT	2	6	217011	217016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479176223
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3585	NC_021022	ATC	2	6	217080	217085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176223
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3587	NC_021022	CAG	2	6	217159	217164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176223
3588	NC_021022	GAT	2	6	217199	217204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176223
3589	NC_021022	CAA	2	6	217220	217225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479176223
3590	NC_021022	TCTG	2	8	217241	217248	0 %	50 %	25 %	25 %	479176223
3591	NC_021022	T	7	7	217272	217278	0 %	100 %	0 %	0 %	479176223
3592	NC_021022	TAT	2	6	217284	217289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479176223
3593	NC_021022	ATG	2	6	217347	217352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176223
3594	NC_021022	TTC	2	6	217360	217365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176223
3595	NC_021022	ATC	2	6	217369	217374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176223
3596	NC_021022	AGA	2	6	217383	217388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176223
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3598	NC_021022	GCC	2	6	217487	217492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479176224
3599	NC_021022	A	6	6	217514	217519	100 %	0 %	0 %	0 %	479176224
3600	NC_021022	CAG	2	6	217591	217596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176224
3601	NC_021022	GAT	2	6	217601	217606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176224
3602	NC_021022	GTGC	2	8	217621	217628	0 %	25 %	50 %	25 %	479176224
3603	NC_021022	CCT	2	6	217636	217641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479176224
3604	NC_021022	GA	5	10	217811	217820	50 %	0 %	50 %	0 %	479176224
3605	NC_021022	TCA	2	6	217848	217853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176224
3606	NC_021022	TGT	2	6	217888	217893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479176224
3607	NC_021022	GAT	2	6	217921	217926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176224
3608	NC_021022	T	6	6	218015	218020	0 %	100 %	0 %	0 %	479176224
3609	NC_021022	CTG	2	6	218021	218026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176224
3610	NC_021022	T	6	6	218201	218206	0 %	100 %	0 %	0 %	479176225
3611	NC_021022	TTC	2	6	218309	218314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176225
3612	NC_021022	GCC	2	6	218326	218331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479176225
3613	NC_021022	A	8	8	218382	218389	100 %	0 %	0 %	0 %	479176225
3614	NC_021022	CAA	2	6	218393	218398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479176225
3615	NC_021022	ATGAA	2	10	218552	218561	60 %	20 %	20 %	0 %	479176225
3616	NC_021022	AGA	2	6	218562	218567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176225
3617	NC_021022	AGTAA	2	10	218575	218584	60 %	20 %	20 %	0 %	479176225
3618	NC_021022	TAA	2	6	218665	218670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479176226
3619	NC_021022	ATG	2	6	218676	218681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176226
3620	NC_021022	AGA	2	6	218740	218745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176226
3621	NC_021022	TCAG	2	8	218748	218755	25 %	25 %	25 %	25 %	479176226
3622	NC_021022	TCA	2	6	218763	218768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176226
3623	NC_021022	ATT	2	6	218796	218801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479176226
3624	NC_021022	ATT	2	6	218859	218864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479176226
3625	NC_021022	CCA	2	6	218877	218882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479176226
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3642	NC_021022	TTTGCC	2	12	219598	219609	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	479176227
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3653	NC_021022	GAG	2	6	220100	220105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479176227
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3733	NC_021022	TAT	2	6	225396	225401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479176234
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3735	NC_021022	A	6	6	225523	225528	100 %	0 %	0 %	0 %	479176234
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3737	NC_021022	GGTAA	2	10	225553	225562	40 %	20 %	40 %	0 %	479176234
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3740	NC_021022	CGA	2	6	225591	225596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176234
3741	NC_021022	CATC	2	8	225687	225694	25 %	25 %	0 %	50 %	479176234
3742	NC_021022	GCA	2	6	225934	225939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176234
3743	NC_021022	AAC	2	6	225961	225966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479176234
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3745	NC_021022	GCA	2	6	226048	226053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176234
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3863	NC_021022	AC	3	6	232531	232536	50 %	0 %	0 %	50 %	479176239
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3865	NC_021022	GA	3	6	232583	232588	50 %	0 %	50 %	0 %	479176239
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3993	NC_021022	GTT	2	6	240000	240005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479176242
3994	NC_021022	CAT	2	6	240023	240028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176242
3995	NC_021022	TGA	2	6	240042	240047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176242
3996	NC_021022	GAA	3	9	240154	240162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176242
3997	NC_021022	AT	3	6	240202	240207	50 %	50 %	0 %	0 %	479176242
3998	NC_021022	AGG	2	6	240243	240248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479176242
3999	NC_021022	G	6	6	240247	240252	0 %	0 %	100 %	0 %	479176242
4000	NC_021022	GAG	2	6	240265	240270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479176242

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