MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruminococcus obeum A2-162 draft genome

Total Repeats: 60580

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_021022	AGA	2	6	176219	176224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176191
3002	NC_021022	CTT	2	6	176376	176381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176191
3003	NC_021022	AG	4	8	176439	176446	50 %	0 %	50 %	0 %	479176191
3004	NC_021022	TGA	2	6	176468	176473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176191
3005	NC_021022	A	6	6	176484	176489	100 %	0 %	0 %	0 %	479176191
3006	NC_021022	TCA	2	6	176615	176620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176191
3007	NC_021022	GGT	2	6	176648	176653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479176191
3008	NC_021022	AGA	2	6	176678	176683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176191
3009	NC_021022	GAA	2	6	176712	176717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176191
3010	NC_021022	A	7	7	176801	176807	100 %	0 %	0 %	0 %	479176191
3011	NC_021022	TTA	2	6	176818	176823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479176191
3012	NC_021022	CGG	2	6	176860	176865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479176191
3013	NC_021022	GGT	2	6	176900	176905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479176191
3014	NC_021022	CAA	2	6	176996	177001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479176191
3015	NC_021022	CAG	2	6	177030	177035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176191
3016	NC_021022	GAG	2	6	177069	177074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479176191
3017	NC_021022	TTAC	2	8	177127	177134	25 %	50 %	0 %	25 %	479176191
3018	NC_021022	CCA	2	6	177143	177148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479176191
3019	NC_021022	ATGG	2	8	177189	177196	25 %	25 %	50 %	0 %	479176191
3020	NC_021022	AGA	2	6	177232	177237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176191
3021	NC_021022	GAA	2	6	177333	177338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176191
3022	NC_021022	GAA	2	6	177410	177415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176192
3023	NC_021022	ACA	2	6	177550	177555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479176192
3024	NC_021022	CA	3	6	177554	177559	50 %	0 %	0 %	50 %	479176192
3025	NC_021022	TG	3	6	177577	177582	0 %	50 %	50 %	0 %	479176192
3026	NC_021022	ATA	2	6	177586	177591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479176192
3027	NC_021022	A	7	7	177591	177597	100 %	0 %	0 %	0 %	479176192
3028	NC_021022	GAA	2	6	177617	177622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176192
3029	NC_021022	CAG	2	6	177691	177696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176192
3030	NC_021022	GCAA	2	8	177780	177787	50 %	0 %	25 %	25 %	479176192
3031	NC_021022	GAT	2	6	177830	177835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176192
3032	NC_021022	CAA	2	6	177836	177841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479176192
3033	NC_021022	ATCA	2	8	177861	177868	50 %	25 %	0 %	25 %	479176192
3034	NC_021022	A	6	6	177894	177899	100 %	0 %	0 %	0 %	479176192
3035	NC_021022	TGT	2	6	177908	177913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479176192
3036	NC_021022	GAT	2	6	178055	178060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176192
3037	NC_021022	AGT	2	6	178082	178087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176192
3038	NC_021022	TAT	2	6	178115	178120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479176192
3039	NC_021022	GGT	2	6	178122	178127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479176192
3040	NC_021022	CAG	2	6	178189	178194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176192
3041	NC_021022	GTT	2	6	178241	178246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479176192
3042	NC_021022	TTG	3	9	178309	178317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479176192
3043	NC_021022	GAA	2	6	178320	178325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176192
3044	NC_021022	AGG	2	6	178360	178365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479176192
3045	NC_021022	TAT	2	6	181174	181179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479176193
3046	NC_021022	A	6	6	181186	181191	100 %	0 %	0 %	0 %	479176193
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3050	NC_021022	AGA	2	6	181396	181401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176193
3051	NC_021022	AAAAT	2	10	181431	181440	80 %	20 %	0 %	0 %	479176193
3052	NC_021022	CAG	2	6	181451	181456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176193
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3054	NC_021022	AGAA	2	8	181473	181480	75 %	0 %	25 %	0 %	479176193
3055	NC_021022	GAT	2	6	181505	181510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176193
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3057	NC_021022	TTC	2	6	181610	181615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176193
3058	NC_021022	GTA	2	6	181640	181645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176193
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3060	NC_021022	CTT	2	6	181985	181990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176194
3061	NC_021022	ATC	2	6	182051	182056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176194
3062	NC_021022	AC	3	6	182112	182117	50 %	0 %	0 %	50 %	479176194
3063	NC_021022	ATGC	2	8	182144	182151	25 %	25 %	25 %	25 %	479176194
3064	NC_021022	GGC	2	6	182180	182185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479176194
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3068	NC_021022	TGA	2	6	182434	182439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176194
3069	NC_021022	GAAA	2	8	182443	182450	75 %	0 %	25 %	0 %	479176194
3070	NC_021022	TTC	2	6	182487	182492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176194
3071	NC_021022	GAT	2	6	182495	182500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176194
3072	NC_021022	TGA	2	6	182533	182538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176194
3073	NC_021022	TAT	2	6	182539	182544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479176194
3074	NC_021022	A	7	7	182565	182571	100 %	0 %	0 %	0 %	479176194
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3078	NC_021022	TCT	2	6	182743	182748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176194
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3081	NC_021022	GAA	2	6	182793	182798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176194
3082	NC_021022	GATC	2	8	182875	182882	25 %	25 %	25 %	25 %	479176194
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3086	NC_021022	CGAT	2	8	183069	183076	25 %	25 %	25 %	25 %	479176194
3087	NC_021022	AGC	2	6	183096	183101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176194
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3090	NC_021022	ATT	2	6	183319	183324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479176195
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3093	NC_021022	ATC	2	6	183400	183405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176195
3094	NC_021022	AGA	3	9	183487	183495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176195
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3099	NC_021022	GCAG	2	8	183729	183736	25 %	0 %	50 %	25 %	479176195
3100	NC_021022	AGC	2	6	183741	183746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176195
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3102	NC_021022	GGA	2	6	184008	184013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479176195
3103	NC_021022	CTG	2	6	184114	184119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176195
3104	NC_021022	GAA	2	6	184195	184200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176195
3105	NC_021022	CAG	2	6	184332	184337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176195
3106	NC_021022	CAG	2	6	184353	184358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176195
3107	NC_021022	AGA	3	9	184359	184367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176195
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3109	NC_021022	T	6	6	185883	185888	0 %	100 %	0 %	0 %	479176196
3110	NC_021022	TTC	2	6	185904	185909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176196
3111	NC_021022	CATGG	2	10	185934	185943	20 %	20 %	40 %	20 %	479176196
3112	NC_021022	TGT	2	6	185945	185950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479176196
3113	NC_021022	CAT	2	6	185987	185992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176196
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3118	NC_021022	T	6	6	186130	186135	0 %	100 %	0 %	0 %	479176196
3119	NC_021022	T	6	6	186173	186178	0 %	100 %	0 %	0 %	479176196
3120	NC_021022	AAG	2	6	186204	186209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176196
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3122	NC_021022	AG	3	6	186265	186270	50 %	0 %	50 %	0 %	479176196
3123	NC_021022	TCT	2	6	186334	186339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176196
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3231	NC_021022	GAA	2	6	192309	192314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176203
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3233	NC_021022	GAA	3	9	192342	192350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176203
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3238	NC_021022	TGAC	2	8	192516	192523	25 %	25 %	25 %	25 %	479176203
3239	NC_021022	TTA	2	6	192757	192762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479176204
3240	NC_021022	GTC	2	6	192820	192825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176204
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3242	NC_021022	AT	3	6	192956	192961	50 %	50 %	0 %	0 %	479176204
3243	NC_021022	AGA	2	6	192972	192977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176204
3244	NC_021022	ACT	2	6	193017	193022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176204
3245	NC_021022	AG	3	6	193040	193045	50 %	0 %	50 %	0 %	479176204
3246	NC_021022	GAT	2	6	193093	193098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176204
3247	NC_021022	TAT	2	6	193115	193120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479176204
3248	NC_021022	ACGA	2	8	193134	193141	50 %	0 %	25 %	25 %	479176204
3249	NC_021022	CATG	2	8	193177	193184	25 %	25 %	25 %	25 %	479176204
3250	NC_021022	GTG	2	6	193325	193330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479176204
3251	NC_021022	ATGTT	2	10	193350	193359	20 %	60 %	20 %	0 %	479176204
3252	NC_021022	ATCAGC	2	12	193400	193411	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	479176204
3253	NC_021022	ATGG	2	8	193422	193429	25 %	25 %	50 %	0 %	479176204
3254	NC_021022	T	6	6	193495	193500	0 %	100 %	0 %	0 %	479176204
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3259	NC_021022	AGC	2	6	193632	193637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176205
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3262	NC_021022	TA	3	6	193777	193782	50 %	50 %	0 %	0 %	479176205
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3265	NC_021022	AAAG	2	8	194028	194035	75 %	0 %	25 %	0 %	479176205
3266	NC_021022	TC	3	6	194045	194050	0 %	50 %	0 %	50 %	479176205
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3270	NC_021022	ATA	2	6	194348	194353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479176205
3271	NC_021022	GGGAA	2	10	194361	194370	40 %	0 %	60 %	0 %	479176205
3272	NC_021022	GAA	2	6	194449	194454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176205
3273	NC_021022	TAG	2	6	195451	195456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176206
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3277	NC_021022	ATC	3	9	195645	195653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176206
3278	NC_021022	TAA	2	6	195663	195668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479176206
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3281	NC_021022	TGA	2	6	196362	196367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176207
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3283	NC_021022	GAA	2	6	196420	196425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176207
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3347	NC_021022	TGA	2	6	202429	202434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176211
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3351	NC_021022	TCA	2	6	202642	202647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176211
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3366	NC_021022	ATTT	2	8	203724	203731	25 %	75 %	0 %	0 %	479176212
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3368	NC_021022	CAA	2	6	203868	203873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479176212
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3370	NC_021022	ACCTGT	2	12	204008	204019	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	479176212
3371	NC_021022	TGA	2	6	204053	204058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176212
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3373	NC_021022	ACT	2	6	204068	204073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176212
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3479	NC_021022	CGGT	2	8	212144	212151	0 %	25 %	50 %	25 %	479176218
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3491	NC_021022	CGG	2	6	212798	212803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479176219
3492	NC_021022	ATTTTT	2	12	212812	212823	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	479176219
3493	NC_021022	AGGT	2	8	212849	212856	25 %	25 %	50 %	0 %	479176219
3494	NC_021022	CTT	2	6	212872	212877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176219
3495	NC_021022	ATG	2	6	212893	212898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176219
3496	NC_021022	TGC	2	6	212936	212941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176219
3497	NC_021022	GCG	2	6	212944	212949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479176219
3498	NC_021022	T	6	6	213015	213020	0 %	100 %	0 %	0 %	479176219
3499	NC_021022	AGG	2	6	213036	213041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479176219
3500	NC_021022	GAA	2	6	213053	213058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176219

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