MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruminococcus obeum A2-162 draft genome

Total Repeats: 60580

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_021022	A	6	6	120604	120609	100 %	0 %	0 %	0 %	479176143
2002	NC_021022	GGCA	2	8	120636	120643	25 %	0 %	50 %	25 %	479176143
2003	NC_021022	A	7	7	120655	120661	100 %	0 %	0 %	0 %	479176143
2004	NC_021022	GATT	2	8	120711	120718	25 %	50 %	25 %	0 %	479176143
2005	NC_021022	CTAT	2	8	120830	120837	25 %	50 %	0 %	25 %	479176143
2006	NC_021022	A	6	6	120893	120898	100 %	0 %	0 %	0 %	479176143
2007	NC_021022	AGG	2	6	120900	120905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479176143
2008	NC_021022	GAA	2	6	120955	120960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176144
2009	NC_021022	ATC	2	6	121077	121082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176144
2010	NC_021022	TAC	2	6	121217	121222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176144
2011	NC_021022	A	6	6	121239	121244	100 %	0 %	0 %	0 %	479176144
2012	NC_021022	AG	3	6	121278	121283	50 %	0 %	50 %	0 %	479176144
2013	NC_021022	TCT	2	6	121310	121315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176144
2014	NC_021022	GAA	2	6	121338	121343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176144
2015	NC_021022	TG	3	6	121380	121385	0 %	50 %	50 %	0 %	479176144
2016	NC_021022	GAT	2	6	121466	121471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176144
2017	NC_021022	A	6	6	121513	121518	100 %	0 %	0 %	0 %	479176144
2018	NC_021022	TCT	2	6	121526	121531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176144
2019	NC_021022	A	8	8	121534	121541	100 %	0 %	0 %	0 %	479176144
2020	NC_021022	TAT	2	6	121596	121601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479176144
2021	NC_021022	TGGA	2	8	121606	121613	25 %	25 %	50 %	0 %	479176144
2022	NC_021022	AGTG	2	8	121662	121669	25 %	25 %	50 %	0 %	479176144
2023	NC_021022	CAG	2	6	121723	121728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176144
2024	NC_021022	GA	3	6	121739	121744	50 %	0 %	50 %	0 %	479176144
2025	NC_021022	GAA	2	6	121770	121775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176144
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2050	NC_021022	TCGA	2	8	123069	123076	25 %	25 %	25 %	25 %	479176147
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2109	NC_021022	CGTGT	2	10	126169	126178	0 %	40 %	40 %	20 %	479176149
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2114	NC_021022	AAAGA	2	10	126340	126349	80 %	0 %	20 %	0 %	479176149
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2118	NC_021022	ATC	3	9	126525	126533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176150
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2121	NC_021022	ATA	2	6	126705	126710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479176150
2122	NC_021022	AAG	2	6	126726	126731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176150
2123	NC_021022	CGG	2	6	126754	126759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479176150
2124	NC_021022	GCA	2	6	126790	126795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176150
2125	NC_021022	ATC	2	6	126798	126803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176150
2126	NC_021022	GCA	2	6	126814	126819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176150
2127	NC_021022	CAG	2	6	126896	126901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176150
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2129	NC_021022	CAG	2	6	126995	127000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176150
2130	NC_021022	GCG	2	6	127037	127042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479176150
2131	NC_021022	AAT	2	6	127067	127072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479176150
2132	NC_021022	ATC	2	6	127131	127136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176150
2133	NC_021022	AG	3	6	127195	127200	50 %	0 %	50 %	0 %	479176150
2134	NC_021022	GA	3	6	127218	127223	50 %	0 %	50 %	0 %	479176150
2135	NC_021022	CTG	2	6	127242	127247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176150
2136	NC_021022	CAGATA	2	12	127335	127346	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	479176150
2137	NC_021022	GAC	2	6	127388	127393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176150
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2139	NC_021022	TCT	2	6	127487	127492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176150
2140	NC_021022	GGC	2	6	127530	127535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479176150
2141	NC_021022	ACTG	2	8	127586	127593	25 %	25 %	25 %	25 %	479176150
2142	NC_021022	GAG	2	6	127692	127697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479176150
2143	NC_021022	GAA	2	6	127748	127753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176150
2144	NC_021022	TTC	2	6	127794	127799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176150
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2146	NC_021022	GCT	2	6	127823	127828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176150
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2148	NC_021022	TGT	2	6	127940	127945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479176150
2149	NC_021022	CTG	2	6	127992	127997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176150
2150	NC_021022	CTT	2	6	128048	128053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176150
2151	NC_021022	CCG	2	6	128104	128109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479176150
2152	NC_021022	CA	4	8	128148	128155	50 %	0 %	0 %	50 %	479176150
2153	NC_021022	GAT	2	6	128163	128168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176150
2154	NC_021022	AT	3	6	128198	128203	50 %	50 %	0 %	0 %	479176150
2155	NC_021022	AT	4	8	128314	128321	50 %	50 %	0 %	0 %	479176151
2156	NC_021022	CTGG	2	8	128399	128406	0 %	25 %	50 %	25 %	479176151
2157	NC_021022	GTTC	2	8	128553	128560	0 %	50 %	25 %	25 %	479176151
2158	NC_021022	A	8	8	128598	128605	100 %	0 %	0 %	0 %	479176151
2159	NC_021022	AC	3	6	128646	128651	50 %	0 %	0 %	50 %	479176151
2160	NC_021022	GAA	3	9	128673	128681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176151
2161	NC_021022	GCA	2	6	128721	128726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176151
2162	NC_021022	T	6	6	128727	128732	0 %	100 %	0 %	0 %	479176151
2163	NC_021022	CAGGA	2	10	128733	128742	40 %	0 %	40 %	20 %	479176151
2164	NC_021022	GGA	2	6	128777	128782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479176151
2165	NC_021022	CTT	2	6	128790	128795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176151
2166	NC_021022	AGA	2	6	128829	128834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176151
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2168	NC_021022	TGCA	2	8	128876	128883	25 %	25 %	25 %	25 %	479176151
2169	NC_021022	A	7	7	128964	128970	100 %	0 %	0 %	0 %	479176151
2170	NC_021022	GAA	2	6	128976	128981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176151
2171	NC_021022	GT	3	6	129001	129006	0 %	50 %	50 %	0 %	479176151
2172	NC_021022	AT	3	6	129074	129079	50 %	50 %	0 %	0 %	479176151
2173	NC_021022	GCA	2	6	129123	129128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176151
2174	NC_021022	AAG	2	6	129708	129713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176152
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2179	NC_021022	GGC	2	6	129934	129939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479176152
2180	NC_021022	GTA	2	6	129970	129975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176152
2181	NC_021022	GCT	2	6	129999	130004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176152
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2183	NC_021022	CTG	2	6	130093	130098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176152
2184	NC_021022	GGC	2	6	130147	130152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479176152
2185	NC_021022	GATC	2	8	130194	130201	25 %	25 %	25 %	25 %	479176152
2186	NC_021022	CAT	2	6	130207	130212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176152
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2188	NC_021022	TGG	2	6	130305	130310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479176152
2189	NC_021022	GAA	2	6	130412	130417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176153
2190	NC_021022	GAG	2	6	130422	130427	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479176153
2191	NC_021022	TGC	2	6	130457	130462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176153
2192	NC_021022	TTTCGG	2	12	130466	130477	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	479176153
2193	NC_021022	TCA	2	6	130667	130672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176153
2194	NC_021022	GAAG	2	8	130684	130691	50 %	0 %	50 %	0 %	479176153
2195	NC_021022	CGG	2	6	130701	130706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479176153
2196	NC_021022	TCA	2	6	130795	130800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176153
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2198	NC_021022	GAG	2	6	130936	130941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479176153
2199	NC_021022	AGG	2	6	130967	130972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479176153
2200	NC_021022	ATGC	2	8	130998	131005	25 %	25 %	25 %	25 %	479176153
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2202	NC_021022	CGG	2	6	131137	131142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479176153
2203	NC_021022	AGC	2	6	131175	131180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176153
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2205	NC_021022	CTG	2	6	131226	131231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176153
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2207	NC_021022	GA	3	6	131480	131485	50 %	0 %	50 %	0 %	479176153
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2209	NC_021022	TCT	2	6	131606	131611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176153
2210	NC_021022	CGT	2	6	131618	131623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176153
2211	NC_021022	TTC	2	6	131643	131648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176153
2212	NC_021022	CAT	2	6	131830	131835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176154
2213	NC_021022	TCT	2	6	131868	131873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176154
2214	NC_021022	TGA	2	6	131902	131907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176154
2215	NC_021022	ATACAG	2	12	131924	131935	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	479176154
2216	NC_021022	GAT	2	6	131936	131941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176154
2217	NC_021022	CAT	2	6	131945	131950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176154
2218	NC_021022	CTG	2	6	132002	132007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176154
2219	NC_021022	ATC	2	6	132056	132061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176154
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2222	NC_021022	CAC	2	6	132325	132330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479176154
2223	NC_021022	GAT	2	6	132350	132355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176154
2224	NC_021022	CAT	2	6	132389	132394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176154
2225	NC_021022	GGCA	2	8	132455	132462	25 %	0 %	50 %	25 %	479176154
2226	NC_021022	TTC	2	6	132464	132469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176154
2227	NC_021022	GTA	2	6	132554	132559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176154
2228	NC_021022	TGC	2	6	132599	132604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176154
2229	NC_021022	CAT	2	6	132647	132652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176154
2230	NC_021022	ATG	2	6	132741	132746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176154
2231	NC_021022	TGT	2	6	132777	132782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479176154
2232	NC_021022	AGC	2	6	133022	133027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176154
2233	NC_021022	CGG	2	6	133055	133060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479176154
2234	NC_021022	CTT	2	6	133135	133140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176154
2235	NC_021022	TG	4	8	133152	133159	0 %	50 %	50 %	0 %	479176154
2236	NC_021022	T	6	6	133163	133168	0 %	100 %	0 %	0 %	479176154
2237	NC_021022	AT	3	6	133206	133211	50 %	50 %	0 %	0 %	479176154
2238	NC_021022	GAT	2	6	133271	133276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176154
2239	NC_021022	TGT	2	6	133343	133348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479176154
2240	NC_021022	TTC	2	6	133349	133354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176154
2241	NC_021022	T	6	6	133379	133384	0 %	100 %	0 %	0 %	479176154
2242	NC_021022	GAT	2	6	133408	133413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176154
2243	NC_021022	AGAT	2	8	133464	133471	50 %	25 %	25 %	0 %	479176154
2244	NC_021022	ATAA	2	8	133490	133497	75 %	25 %	0 %	0 %	479176154
2245	NC_021022	TCC	2	6	133521	133526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479176155
2246	NC_021022	CCG	2	6	133618	133623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479176155
2247	NC_021022	TCT	2	6	133630	133635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176155
2248	NC_021022	TCT	2	6	133661	133666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176155
2249	NC_021022	GGAAA	2	10	133701	133710	60 %	0 %	40 %	0 %	479176155
2250	NC_021022	TCA	2	6	133720	133725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176155
2251	NC_021022	CTT	2	6	133745	133750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176155
2252	NC_021022	CTT	2	6	133832	133837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176155
2253	NC_021022	TTC	2	6	133842	133847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176155
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2256	NC_021022	ACG	2	6	133911	133916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176155
2257	NC_021022	CTTCTG	2	12	133940	133951	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	479176155
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2262	NC_021022	GAT	2	6	134235	134240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176156
2263	NC_021022	GAT	2	6	134277	134282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176156
2264	NC_021022	ACA	2	6	134347	134352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479176156
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2269	NC_021022	T	6	6	134769	134774	0 %	100 %	0 %	0 %	479176157
2270	NC_021022	GAT	2	6	134811	134816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176157
2271	NC_021022	ATTGCA	2	12	134827	134838	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	479176157
2272	NC_021022	AAT	2	6	134850	134855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479176157
2273	NC_021022	TATTT	2	10	134920	134929	20 %	80 %	0 %	0 %	479176158
2274	NC_021022	GC	3	6	134932	134937	0 %	0 %	50 %	50 %	479176158
2275	NC_021022	CAT	2	6	135143	135148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176158
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2279	NC_021022	GAA	2	6	135248	135253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176158
2280	NC_021022	CAG	2	6	135361	135366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176158
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2282	NC_021022	CAGT	2	8	135403	135410	25 %	25 %	25 %	25 %	479176158
2283	NC_021022	TGA	2	6	135493	135498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176158
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2285	NC_021022	CAT	2	6	135590	135595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176158
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2287	NC_021022	TGA	2	6	135697	135702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176158
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2291	NC_021022	CTG	2	6	135941	135946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176158
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2303	NC_021022	AT	3	6	136458	136463	50 %	50 %	0 %	0 %	479176158
2304	NC_021022	AG	3	6	136524	136529	50 %	0 %	50 %	0 %	479176158
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2309	NC_021022	CGATGG	2	12	136950	136961	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	479176159
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2332	NC_021022	GTTCCA	2	12	138126	138137	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	479176160
2333	NC_021022	CTG	2	6	138154	138159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176160
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2337	NC_021022	GTA	2	6	138553	138558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176161
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2339	NC_021022	TGC	2	6	138716	138721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176161
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2342	NC_021022	GA	3	6	138761	138766	50 %	0 %	50 %	0 %	479176161
2343	NC_021022	TG	4	8	138788	138795	0 %	50 %	50 %	0 %	479176161
2344	NC_021022	AGA	2	6	138892	138897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176161
2345	NC_021022	AGAC	2	8	138965	138972	50 %	0 %	25 %	25 %	479176161
2346	NC_021022	GAA	2	6	139000	139005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176161
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2348	NC_021022	CAT	2	6	139054	139059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176161
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2351	NC_021022	TCT	2	6	139111	139116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176161
2352	NC_021022	TTC	2	6	139148	139153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176161
2353	NC_021022	A	6	6	139317	139322	100 %	0 %	0 %	0 %	479176162
2354	NC_021022	GCAT	2	8	139335	139342	25 %	25 %	25 %	25 %	479176162
2355	NC_021022	GCT	2	6	139386	139391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176162
2356	NC_021022	GTC	2	6	139444	139449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176162
2357	NC_021022	A	7	7	139470	139476	100 %	0 %	0 %	0 %	479176162
2358	NC_021022	GAAA	2	8	139477	139484	75 %	0 %	25 %	0 %	479176162
2359	NC_021022	A	7	7	139488	139494	100 %	0 %	0 %	0 %	479176162
2360	NC_021022	ATT	3	9	139758	139766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479176163
2361	NC_021022	TCC	2	6	139799	139804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479176163
2362	NC_021022	TCT	2	6	139828	139833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176163
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2364	NC_021022	TAA	2	6	139956	139961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479176163
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2372	NC_021022	CCGC	2	8	140364	140371	0 %	0 %	25 %	75 %	479176163
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2488	NC_021022	GCA	2	6	149603	149608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176173
2489	NC_021022	GAA	2	6	149649	149654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176173
2490	NC_021022	ATC	2	6	149713	149718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176173
2491	NC_021022	AGA	2	6	149733	149738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176173
2492	NC_021022	CTGT	2	8	149749	149756	0 %	50 %	25 %	25 %	479176173
2493	NC_021022	CAG	2	6	149761	149766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176173
2494	NC_021022	GT	3	6	149771	149776	0 %	50 %	50 %	0 %	479176173
2495	NC_021022	GAA	2	6	149787	149792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176173
2496	NC_021022	GAA	2	6	149799	149804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176173
2497	NC_021022	AAG	2	6	149813	149818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176173
2498	NC_021022	GGAAT	2	10	149850	149859	40 %	20 %	40 %	0 %	479176173
2499	NC_021022	GAA	2	6	149896	149901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176173
2500	NC_021022	A	6	6	149924	149929	100 %	0 %	0 %	0 %	479176173

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