MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruminococcus obeum A2-162 draft genome

Total Repeats: 60580

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021022	T	6	6	59050	59055	0 %	100 %	0 %	0 %	479176094
1002	NC_021022	A	6	6	59100	59105	100 %	0 %	0 %	0 %	479176094
1003	NC_021022	A	6	6	59194	59199	100 %	0 %	0 %	0 %	479176094
1004	NC_021022	CTT	2	6	59208	59213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176094
1005	NC_021022	TTC	2	6	59263	59268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176094
1006	NC_021022	CTTT	2	8	59288	59295	0 %	75 %	0 %	25 %	479176094
1007	NC_021022	ATA	2	6	59296	59301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479176094
1008	NC_021022	GATAC	2	10	59307	59316	40 %	20 %	20 %	20 %	479176094
1009	NC_021022	TTG	2	6	59350	59355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479176094
1010	NC_021022	TGCT	2	8	59362	59369	0 %	50 %	25 %	25 %	479176094
1011	NC_021022	TTA	2	6	59413	59418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479176094
1012	NC_021022	GAA	2	6	59444	59449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176094
1013	NC_021022	GAA	2	6	59508	59513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176094
1014	NC_021022	GAT	2	6	59640	59645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176094
1015	NC_021022	AGA	2	6	59663	59668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176094
1016	NC_021022	GAAT	2	8	59695	59702	50 %	25 %	25 %	0 %	479176094
1017	NC_021022	CTGAAA	2	12	59718	59729	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	479176094
1018	NC_021022	GAA	2	6	59739	59744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176094
1019	NC_021022	GAG	2	6	59833	59838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479176094
1020	NC_021022	TGT	2	6	59849	59854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479176094
1021	NC_021022	AGAA	2	8	59872	59879	75 %	0 %	25 %	0 %	479176094
1022	NC_021022	TGA	2	6	59902	59907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176095
1023	NC_021022	GGAAT	2	10	59985	59994	40 %	20 %	40 %	0 %	479176095
1024	NC_021022	GAA	2	6	60083	60088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176095
1025	NC_021022	TCT	2	6	60187	60192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176095
1026	NC_021022	GGA	2	6	60205	60210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479176095
1027	NC_021022	AGT	2	6	60226	60231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176095
1028	NC_021022	ACA	2	6	60292	60297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479176095
1029	NC_021022	GA	3	6	60322	60327	50 %	0 %	50 %	0 %	479176095
1030	NC_021022	AATG	2	8	60338	60345	50 %	25 %	25 %	0 %	479176095
1031	NC_021022	GAA	2	6	60377	60382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176095
1032	NC_021022	ATA	2	6	60414	60419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479176095
1033	NC_021022	A	7	7	60458	60464	100 %	0 %	0 %	0 %	479176095
1034	NC_021022	AT	3	6	60491	60496	50 %	50 %	0 %	0 %	479176095
1035	NC_021022	A	6	6	60510	60515	100 %	0 %	0 %	0 %	479176095
1036	NC_021022	ATATA	2	10	60538	60547	60 %	40 %	0 %	0 %	479176095
1037	NC_021022	AGTA	2	8	60563	60570	50 %	25 %	25 %	0 %	479176095
1038	NC_021022	ACAG	2	8	60640	60647	50 %	0 %	25 %	25 %	479176095
1039	NC_021022	GTGG	2	8	60656	60663	0 %	25 %	75 %	0 %	479176095
1040	NC_021022	TTA	2	6	60672	60677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479176095
1041	NC_021022	AT	3	6	60784	60789	50 %	50 %	0 %	0 %	479176095
1042	NC_021022	TTC	2	6	60853	60858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176095
1043	NC_021022	TCAG	2	8	60927	60934	25 %	25 %	25 %	25 %	479176095
1044	NC_021022	ATT	2	6	61008	61013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479176095
1045	NC_021022	CTG	2	6	61017	61022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176095
1046	NC_021022	TGC	2	6	61071	61076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176095
1047	NC_021022	GAA	2	6	62322	62327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176096
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1049	NC_021022	AATC	2	8	62354	62361	50 %	25 %	0 %	25 %	479176096
1050	NC_021022	GAA	2	6	62388	62393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176096
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1052	NC_021022	CAGA	2	8	62406	62413	50 %	0 %	25 %	25 %	479176096
1053	NC_021022	A	6	6	62454	62459	100 %	0 %	0 %	0 %	479176096
1054	NC_021022	A	6	6	62466	62471	100 %	0 %	0 %	0 %	479176096
1055	NC_021022	AGA	2	6	62480	62485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176096
1056	NC_021022	CAG	2	6	62495	62500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176096
1057	NC_021022	AAG	2	6	62551	62556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176096
1058	NC_021022	TCTG	2	8	62569	62576	0 %	50 %	25 %	25 %	479176096
1059	NC_021022	GAA	2	6	62834	62839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176097
1060	NC_021022	CT	3	6	62948	62953	0 %	50 %	0 %	50 %	479176097
1061	NC_021022	AAG	2	6	63049	63054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176097
1062	NC_021022	TAT	2	6	63120	63125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479176097
1063	NC_021022	ACC	2	6	63130	63135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479176097
1064	NC_021022	GTTT	2	8	63192	63199	0 %	75 %	25 %	0 %	479176097
1065	NC_021022	GATT	2	8	63210	63217	25 %	50 %	25 %	0 %	479176097
1066	NC_021022	CAGA	2	8	63225	63232	50 %	0 %	25 %	25 %	479176097
1067	NC_021022	GGA	2	6	63273	63278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479176098
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1070	NC_021022	TGA	3	9	63300	63308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176098
1071	NC_021022	AGTGC	2	10	63317	63326	20 %	20 %	40 %	20 %	479176098
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1073	NC_021022	G	6	6	63353	63358	0 %	0 %	100 %	0 %	479176098
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1079	NC_021022	AGA	2	6	63579	63584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176098
1080	NC_021022	GAT	2	6	63588	63593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176098
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1084	NC_021022	CTG	2	6	63686	63691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176098
1085	NC_021022	AGT	2	6	63726	63731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176098
1086	NC_021022	ATC	2	6	63787	63792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176098
1087	NC_021022	AGT	2	6	63847	63852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176098
1088	NC_021022	TGA	3	9	63912	63920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176098
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1091	NC_021022	ACA	2	6	64034	64039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479176098
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1093	NC_021022	TGA	2	6	64176	64181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176098
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1107	NC_021022	CGGAGC	2	12	65410	65421	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	479176099
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1113	NC_021022	TGAAC	2	10	65809	65818	40 %	20 %	20 %	20 %	479176099
1114	NC_021022	AGAA	2	8	66015	66022	75 %	0 %	25 %	0 %	479176100
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1118	NC_021022	GAT	2	6	66091	66096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176100
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1122	NC_021022	TAT	2	6	66260	66265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479176101
1123	NC_021022	ATT	2	6	66284	66289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479176101
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1126	NC_021022	AG	3	6	66417	66422	50 %	0 %	50 %	0 %	479176101
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1252	NC_021022	TTC	2	6	73353	73358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176107
1253	NC_021022	CTTAC	2	10	73433	73442	20 %	40 %	0 %	40 %	479176107
1254	NC_021022	GACC	2	8	73477	73484	25 %	0 %	25 %	50 %	479176107
1255	NC_021022	TA	3	6	73498	73503	50 %	50 %	0 %	0 %	479176107
1256	NC_021022	TGA	2	6	73554	73559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176107
1257	NC_021022	ATC	2	6	73567	73572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176107
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1260	NC_021022	ATGCCG	2	12	73666	73677	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	479176107
1261	NC_021022	TGA	2	6	73703	73708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176107
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1265	NC_021022	TTCT	2	8	73946	73953	0 %	75 %	0 %	25 %	479176107
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