MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruminococcus obeum A2-162 draft genome

Total Repeats: 60580

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_021022	ATAC	2	8	329358	329365	50 %	25 %	0 %	25 %	479176319
5502	NC_021022	GTT	2	6	329419	329424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479176319
5503	NC_021022	T	6	6	329423	329428	0 %	100 %	0 %	0 %	479176319
5504	NC_021022	CAT	2	6	330805	330810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176320
5505	NC_021022	T	6	6	330816	330821	0 %	100 %	0 %	0 %	479176320
5506	NC_021022	GAA	2	6	330964	330969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176320
5507	NC_021022	GTTG	2	8	331039	331046	0 %	50 %	50 %	0 %	479176320
5508	NC_021022	CAT	2	6	331074	331079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176320
5509	NC_021022	GT	3	6	331126	331131	0 %	50 %	50 %	0 %	479176320
5510	NC_021022	CCG	2	6	331145	331150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479176320
5511	NC_021022	TGA	2	6	331166	331171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176320
5512	NC_021022	CCG	3	9	331184	331192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479176320
5513	NC_021022	CAG	2	6	331276	331281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176320
5514	NC_021022	CA	3	6	331393	331398	50 %	0 %	0 %	50 %	479176320
5515	NC_021022	TCTG	2	8	331406	331413	0 %	50 %	25 %	25 %	479176320
5516	NC_021022	GTAA	2	8	331429	331436	50 %	25 %	25 %	0 %	479176320
5517	NC_021022	TCA	2	6	331446	331451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176320
5518	NC_021022	TGA	2	6	331518	331523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176320
5519	NC_021022	GCAG	2	8	331585	331592	25 %	0 %	50 %	25 %	479176320
5520	NC_021022	TTCC	2	8	331717	331724	0 %	50 %	0 %	50 %	479176320
5521	NC_021022	AAC	2	6	331771	331776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479176320
5522	NC_021022	AAATC	2	10	331793	331802	60 %	20 %	0 %	20 %	479176320
5523	NC_021022	T	6	6	331819	331824	0 %	100 %	0 %	0 %	479176320
5524	NC_021022	ATC	2	6	331828	331833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176320
5525	NC_021022	GT	3	6	331956	331961	0 %	50 %	50 %	0 %	479176320
5526	NC_021022	ATA	2	6	331979	331984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479176320
5527	NC_021022	ATC	3	9	332261	332269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176321
5528	NC_021022	CGG	2	6	332280	332285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479176321
5529	NC_021022	TA	3	6	332301	332306	50 %	50 %	0 %	0 %	479176321
5530	NC_021022	CAA	2	6	332338	332343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479176321
5531	NC_021022	A	6	6	332370	332375	100 %	0 %	0 %	0 %	479176321
5532	NC_021022	TAT	2	6	332384	332389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479176321
5533	NC_021022	ATT	2	6	332465	332470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479176321
5534	NC_021022	AGA	2	6	332710	332715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176321
5535	NC_021022	CTG	2	6	332733	332738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176321
5536	NC_021022	GAT	2	6	332828	332833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176321
5537	NC_021022	ATG	2	6	332859	332864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176321
5538	NC_021022	CGG	2	6	332907	332912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479176321
5539	NC_021022	GCTGA	2	10	332972	332981	20 %	20 %	40 %	20 %	479176321
5540	NC_021022	ACA	2	6	333020	333025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479176321
5541	NC_021022	GAAG	2	8	333092	333099	50 %	0 %	50 %	0 %	479176321
5542	NC_021022	ATA	2	6	333157	333162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479176321
5543	NC_021022	GAA	3	9	333244	333252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176322
5544	NC_021022	TGAT	2	8	333278	333285	25 %	50 %	25 %	0 %	479176322
5545	NC_021022	CATG	2	8	333308	333315	25 %	25 %	25 %	25 %	479176322
5546	NC_021022	AGA	2	6	333333	333338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176322
5547	NC_021022	GCA	2	6	333399	333404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176322
5548	NC_021022	AAG	2	6	333452	333457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176322
5549	NC_021022	AGA	2	6	333486	333491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176322
5550	NC_021022	A	6	6	333496	333501	100 %	0 %	0 %	0 %	479176322
5551	NC_021022	AAT	2	6	333512	333517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479176322
5552	NC_021022	GCA	2	6	333556	333561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176323
5553	NC_021022	TGCAA	2	10	333562	333571	40 %	20 %	20 %	20 %	479176323
5554	NC_021022	AT	3	6	333573	333578	50 %	50 %	0 %	0 %	479176323
5555	NC_021022	AGG	2	6	333632	333637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479176323
5556	NC_021022	CTT	2	6	333640	333645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176323
5557	NC_021022	ATCA	2	8	333658	333665	50 %	25 %	0 %	25 %	479176323
5558	NC_021022	TTC	2	6	333782	333787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176323
5559	NC_021022	ATG	2	6	333827	333832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176323
5560	NC_021022	TGG	2	6	333875	333880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479176323
5561	NC_021022	TCT	2	6	333906	333911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176323
5562	NC_021022	GGGAA	2	10	333928	333937	40 %	0 %	60 %	0 %	479176323
5563	NC_021022	GAA	2	6	333976	333981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176323
5564	NC_021022	ATGG	2	8	333992	333999	25 %	25 %	50 %	0 %	479176323
5565	NC_021022	TGA	2	6	334007	334012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176323
5566	NC_021022	GAG	2	6	334048	334053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479176323
5567	NC_021022	TAT	2	6	334072	334077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479176323
5568	NC_021022	AGC	2	6	334081	334086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176323
5569	NC_021022	TCT	2	6	334120	334125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176323
5570	NC_021022	A	6	6	334132	334137	100 %	0 %	0 %	0 %	479176323
5571	NC_021022	A	7	7	334164	334170	100 %	0 %	0 %	0 %	479176323
5572	NC_021022	T	6	6	334180	334185	0 %	100 %	0 %	0 %	479176323
5573	NC_021022	AT	3	6	334266	334271	50 %	50 %	0 %	0 %	479176323
5574	NC_021022	TCT	2	6	334323	334328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479176323
5575	NC_021022	TGA	2	6	334332	334337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176323
5576	NC_021022	CAA	2	6	334400	334405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479176323
5577	NC_021022	TCA	2	6	334494	334499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176323
5578	NC_021022	CAGCTG	2	12	334588	334599	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	479176323
5579	NC_021022	AAAGAA	2	12	334666	334677	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	479176323
5580	NC_021022	TGG	2	6	334748	334753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479176323
5581	NC_021022	TAT	2	6	334759	334764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479176323
5582	NC_021022	AAAG	2	8	334857	334864	75 %	0 %	25 %	0 %	479176323
5583	NC_021022	GAA	2	6	334927	334932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176323
5584	NC_021022	AGA	2	6	334961	334966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176323
5585	NC_021022	AG	3	6	334987	334992	50 %	0 %	50 %	0 %	479176323
5586	NC_021022	A	6	6	334999	335004	100 %	0 %	0 %	0 %	479176323
5587	NC_021022	CGTC	2	8	335005	335012	0 %	25 %	25 %	50 %	479176323
5588	NC_021022	AAT	2	6	335155	335160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479176323
5589	NC_021022	A	8	8	335266	335273	100 %	0 %	0 %	0 %	479176324
5590	NC_021022	ATC	2	6	335279	335284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176324
5591	NC_021022	CAG	2	6	335286	335291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176324
5592	NC_021022	TCCTTG	2	12	335304	335315	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	479176324
5593	NC_021022	TTCT	2	8	335334	335341	0 %	75 %	0 %	25 %	479176324
5594	NC_021022	CTG	2	6	335345	335350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176324
5595	NC_021022	CAG	2	6	335409	335414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176325
5596	NC_021022	GCAG	2	8	335429	335436	25 %	0 %	50 %	25 %	479176325
5597	NC_021022	GTA	2	6	335472	335477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176325
5598	NC_021022	GAAAAA	2	12	335523	335534	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	479176325
5599	NC_021022	AGA	2	6	335606	335611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176325
5600	NC_021022	TGGA	2	8	335619	335626	25 %	25 %	50 %	0 %	479176325
5601	NC_021022	AGA	2	6	335654	335659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176325
5602	NC_021022	GCA	2	6	335874	335879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176325
5603	NC_021022	CA	3	6	335889	335894	50 %	0 %	0 %	50 %	479176325
5604	NC_021022	GCT	2	6	335912	335917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176325
5605	NC_021022	TCA	2	6	335960	335965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479176325
5606	NC_021022	AGGAA	2	10	335969	335978	60 %	0 %	40 %	0 %	479176325
5607	NC_021022	GAA	2	6	336047	336052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176326
5608	NC_021022	TG	3	6	336055	336060	0 %	50 %	50 %	0 %	479176326
5609	NC_021022	A	7	7	336194	336200	100 %	0 %	0 %	0 %	479176326
5610	NC_021022	TAT	2	6	336217	336222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479176326
5611	NC_021022	AAAG	2	8	336292	336299	75 %	0 %	25 %	0 %	479176326
5612	NC_021022	GAA	2	6	336313	336318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176326
5613	NC_021022	GAT	2	6	336357	336362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176326
5614	NC_021022	CA	3	6	336472	336477	50 %	0 %	0 %	50 %	479176326
5615	NC_021022	AAAT	2	8	336551	336558	75 %	25 %	0 %	0 %	479176327
5616	NC_021022	TGA	2	6	336611	336616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479176327
5617	NC_021022	AGACCG	2	12	336634	336645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479176327
5618	NC_021022	GATTCC	2	12	336723	336734	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	479176327
5619	NC_021022	T	7	7	336766	336772	0 %	100 %	0 %	0 %	479176327
5620	NC_021022	GGT	2	6	336774	336779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479176327
5621	NC_021022	AATCGT	2	12	336783	336794	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	479176327
5622	NC_021022	CTG	2	6	336846	336851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479176327
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5991	NC_021022	GAA	2	6	356748	356753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479176337
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