MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Ruminococcus torques L2-14 draft genome

Total Repeats: 2107

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021015	ATCAC	2	10	6482	6491	40 %	20 %	0 %	40 %	479155736
2	NC_021015	CAGCC	2	10	8760	8769	20 %	0 %	20 %	60 %	479155739
3	NC_021015	CGGGC	2	10	9035	9044	0 %	0 %	60 %	40 %	479155739
4	NC_021015	TTTTC	2	10	12246	12255	0 %	80 %	0 %	20 %	479155741
5	NC_021015	TATGA	2	10	13880	13889	40 %	40 %	20 %	0 %	479155743
6	NC_021015	GAGAA	2	10	16194	16203	60 %	0 %	40 %	0 %	479155746
7	NC_021015	CAGAA	2	10	16846	16855	60 %	0 %	20 %	20 %	479155746
8	NC_021015	GACAG	2	10	17831	17840	40 %	0 %	40 %	20 %	479155747
9	NC_021015	AAGGT	2	10	21229	21238	40 %	20 %	40 %	0 %	479155749
10	NC_021015	TTCTT	2	10	22947	22956	0 %	80 %	0 %	20 %	479155751
11	NC_021015	GACAG	2	10	29929	29938	40 %	0 %	40 %	20 %	479155756
12	NC_021015	CGAAT	2	10	30672	30681	40 %	20 %	20 %	20 %	479155757
13	NC_021015	GTATT	2	10	31757	31766	20 %	60 %	20 %	0 %	479155758
14	NC_021015	AGAAA	2	10	32415	32424	80 %	0 %	20 %	0 %	479155759
15	NC_021015	CAGTA	2	10	35679	35688	40 %	20 %	20 %	20 %	479155765
16	NC_021015	CAATG	2	10	36772	36781	40 %	20 %	20 %	20 %	479155765
17	NC_021015	TTATT	2	10	37514	37523	20 %	80 %	0 %	0 %	479155766
18	NC_021015	GAAAA	2	10	39561	39570	80 %	0 %	20 %	0 %	479155768
19	NC_021015	GTCAG	2	10	39748	39757	20 %	20 %	40 %	20 %	479155768
20	NC_021015	CGATA	2	10	42022	42031	40 %	20 %	20 %	20 %	479155770
21	NC_021015	GTCAG	2	10	42708	42717	20 %	20 %	40 %	20 %	479155771
22	NC_021015	GAGAA	2	10	45620	45629	60 %	0 %	40 %	0 %	479155773
23	NC_021015	GAAAA	2	10	47041	47050	80 %	0 %	20 %	0 %	479155774
24	NC_021015	TGCGT	2	10	47241	47250	0 %	40 %	40 %	20 %	479155774
25	NC_021015	TCTGT	2	10	48185	48194	0 %	60 %	20 %	20 %	479155774
26	NC_021015	GATCA	2	10	48259	48268	40 %	20 %	20 %	20 %	479155774
27	NC_021015	TCAGA	2	10	48616	48625	40 %	20 %	20 %	20 %	479155775
28	NC_021015	GTGAA	2	10	53974	53983	40 %	20 %	40 %	0 %	479155779
29	NC_021015	ATTCC	2	10	54425	54434	20 %	40 %	0 %	40 %	479155779
30	NC_021015	CACTT	2	10	54814	54823	20 %	40 %	0 %	40 %	479155779
31	NC_021015	CGCTG	2	10	54991	55000	0 %	20 %	40 %	40 %	479155780
32	NC_021015	AGCAC	2	10	55383	55392	40 %	0 %	20 %	40 %	479155780
33	NC_021015	AAGGC	2	10	57755	57764	40 %	0 %	40 %	20 %	479155784
34	NC_021015	TGCTG	2	10	58999	59008	0 %	40 %	40 %	20 %	479155786
35	NC_021015	AGCCC	2	10	66477	66486	20 %	0 %	20 %	60 %	479155790
36	NC_021015	GCCCC	2	10	67971	67980	0 %	0 %	20 %	80 %	479155792
37	NC_021015	CAAGG	2	10	69243	69252	40 %	0 %	40 %	20 %	479155792
38	NC_021015	TTGCT	2	10	70082	70091	0 %	60 %	20 %	20 %	479155792
39	NC_021015	GAAAA	2	10	70572	70581	80 %	0 %	20 %	0 %	479155792
40	NC_021015	ACTTT	2	10	70676	70685	20 %	60 %	0 %	20 %	479155793
41	NC_021015	GCAAC	2	10	71007	71016	40 %	0 %	20 %	40 %	479155794
42	NC_021015	ATCCA	2	10	72123	72132	40 %	20 %	0 %	40 %	479155794
43	NC_021015	GCTGT	2	10	74466	74475	0 %	40 %	40 %	20 %	479155794
44	NC_021015	TTTTC	2	10	80039	80048	0 %	80 %	0 %	20 %	479155796
45	NC_021015	TGTTA	2	10	80630	80639	20 %	60 %	20 %	0 %	479155796
46	NC_021015	CTTTG	2	10	80899	80908	0 %	60 %	20 %	20 %	479155797
47	NC_021015	ATTCA	2	10	83157	83166	40 %	40 %	0 %	20 %	479155800
48	NC_021015	GAACT	2	10	84086	84095	40 %	20 %	20 %	20 %	479155801
49	NC_021015	TTCCT	2	10	84122	84131	0 %	60 %	0 %	40 %	479155801
50	NC_021015	TCTCT	2	10	84172	84181	0 %	60 %	0 %	40 %	479155801
51	NC_021015	ATTTA	2	10	85749	85758	40 %	60 %	0 %	0 %	479155802
52	NC_021015	CACAC	2	10	86381	86390	40 %	0 %	0 %	60 %	479155802
53	NC_021015	ATGCC	2	10	86729	86738	20 %	20 %	20 %	40 %	479155802
54	NC_021015	CTTTT	2	10	87694	87703	0 %	80 %	0 %	20 %	479155802
55	NC_021015	GGTCA	2	10	89829	89838	20 %	20 %	40 %	20 %	479155806
56	NC_021015	CATAT	2	10	97828	97837	40 %	40 %	0 %	20 %	479155813
57	NC_021015	GTGCC	2	10	101578	101587	0 %	20 %	40 %	40 %	479155816
58	NC_021015	GTTCA	2	10	106493	106502	20 %	40 %	20 %	20 %	479155824
59	NC_021015	ATCTG	2	10	107252	107261	20 %	40 %	20 %	20 %	479155825
60	NC_021015	TTCAG	2	10	108816	108825	20 %	40 %	20 %	20 %	479155826
61	NC_021015	TTAAG	2	10	112919	112928	40 %	40 %	20 %	0 %	479155829
62	NC_021015	TCCTT	2	10	113371	113380	0 %	60 %	0 %	40 %	479155830
63	NC_021015	ACAAA	2	10	114173	114182	80 %	0 %	0 %	20 %	479155833
64	NC_021015	TGCAT	2	10	114637	114646	20 %	40 %	20 %	20 %	479155834
65	NC_021015	CTTGC	2	10	116368	116377	0 %	40 %	20 %	40 %	479155834
66	NC_021015	ATCTG	2	10	119057	119066	20 %	40 %	20 %	20 %	479155836
67	NC_021015	TACAA	2	10	121374	121383	60 %	20 %	0 %	20 %	479155840
68	NC_021015	ACCAA	2	10	123247	123256	60 %	0 %	0 %	40 %	479155843
69	NC_021015	ATCAG	2	10	126135	126144	40 %	20 %	20 %	20 %	479155846
70	NC_021015	ATCAA	2	10	131106	131115	60 %	20 %	0 %	20 %	479155853
71	NC_021015	GAATT	2	10	132492	132501	40 %	40 %	20 %	0 %	479155855
72	NC_021015	ATAAG	2	10	134721	134730	60 %	20 %	20 %	0 %	479155859
73	NC_021015	GCTTC	2	10	135416	135425	0 %	40 %	20 %	40 %	479155859
74	NC_021015	TGAGA	2	10	136829	136838	40 %	20 %	40 %	0 %	479155862
75	NC_021015	CTTTC	2	10	138799	138808	0 %	60 %	0 %	40 %	479155863
76	NC_021015	TCTGT	2	10	139541	139550	0 %	60 %	20 %	20 %	479155864
77	NC_021015	TTTAT	2	10	139751	139760	20 %	80 %	0 %	0 %	479155864
78	NC_021015	GTCCT	2	10	139872	139881	0 %	40 %	20 %	40 %	479155865
79	NC_021015	TTCTC	2	10	140284	140293	0 %	60 %	0 %	40 %	479155865
80	NC_021015	CAATC	2	10	142184	142193	40 %	20 %	0 %	40 %	479155865
81	NC_021015	ATATA	2	10	144735	144744	60 %	40 %	0 %	0 %	479155866
82	NC_021015	ATGAT	2	10	151419	151428	40 %	40 %	20 %	0 %	479155870
83	NC_021015	TCCTT	2	10	152415	152424	0 %	60 %	0 %	40 %	479155871
84	NC_021015	TCGTT	2	10	153103	153112	0 %	60 %	20 %	20 %	479155871
85	NC_021015	AAAAT	2	10	155217	155226	80 %	20 %	0 %	0 %	479155874
86	NC_021015	ATCTG	2	10	155959	155968	20 %	40 %	20 %	20 %	479155874
87	NC_021015	CTCTT	2	10	157097	157106	0 %	60 %	0 %	40 %	479155875
88	NC_021015	TTCTT	2	10	157431	157440	0 %	80 %	0 %	20 %	479155875
89	NC_021015	CAAAT	2	10	159667	159676	60 %	20 %	0 %	20 %	479155878
90	NC_021015	CTTTT	2	10	159984	159993	0 %	80 %	0 %	20 %	479155878
91	NC_021015	GTGCT	2	10	165619	165628	0 %	40 %	40 %	20 %	479155883
92	NC_021015	TGTTC	2	10	166106	166115	0 %	60 %	20 %	20 %	479155883
93	NC_021015	CTCCC	2	10	166128	166137	0 %	20 %	0 %	80 %	479155883
94	NC_021015	TTTCT	2	10	166207	166216	0 %	80 %	0 %	20 %	479155883
95	NC_021015	ATAGT	2	10	170914	170923	40 %	40 %	20 %	0 %	479155890
96	NC_021015	CTCTT	2	10	172146	172155	0 %	60 %	0 %	40 %	479155892
97	NC_021015	ATTCC	2	10	173199	173208	20 %	40 %	0 %	40 %	479155893
98	NC_021015	TCCCT	2	10	174072	174081	0 %	40 %	0 %	60 %	479155893
99	NC_021015	CATCG	2	10	174274	174283	20 %	20 %	20 %	40 %	479155893
100	NC_021015	TTCTG	2	10	174941	174950	0 %	60 %	20 %	20 %	479155893
101	NC_021015	CTTTT	2	10	176498	176507	0 %	80 %	0 %	20 %	479155896
102	NC_021015	ATTTG	2	10	178417	178426	20 %	60 %	20 %	0 %	479155897
103	NC_021015	CTCTT	2	10	178569	178578	0 %	60 %	0 %	40 %	479155897
104	NC_021015	GTATT	2	10	178640	178649	20 %	60 %	20 %	0 %	479155898
105	NC_021015	TCTTT	2	10	180358	180367	0 %	80 %	0 %	20 %	479155900
106	NC_021015	TTTCA	2	10	181814	181823	20 %	60 %	0 %	20 %	479155900
107	NC_021015	TTCTT	2	10	182356	182365	0 %	80 %	0 %	20 %	479155901
108	NC_021015	TCCAT	2	10	183534	183543	20 %	40 %	0 %	40 %	479155903
109	NC_021015	TCCAT	2	10	183762	183771	20 %	40 %	0 %	40 %	479155903
110	NC_021015	AATTT	2	10	185077	185086	40 %	60 %	0 %	0 %	479155903
111	NC_021015	TCTCT	2	10	185549	185558	0 %	60 %	0 %	40 %	479155904
112	NC_021015	TAAAT	2	10	186643	186652	60 %	40 %	0 %	0 %	479155904
113	NC_021015	AAACA	2	10	196137	196146	80 %	0 %	0 %	20 %	479155910
114	NC_021015	TTCTT	2	10	200361	200370	0 %	80 %	0 %	20 %	479155912
115	NC_021015	AACAC	2	10	202422	202431	60 %	0 %	0 %	40 %	479155914
116	NC_021015	TGTTC	2	10	202917	202926	0 %	60 %	20 %	20 %	479155914
117	NC_021015	TGGAT	2	10	204011	204020	20 %	40 %	40 %	0 %	479155916
118	NC_021015	CTGAT	2	10	205566	205575	20 %	40 %	20 %	20 %	479155917
119	NC_021015	ATGTC	2	10	208187	208196	20 %	40 %	20 %	20 %	479155920
120	NC_021015	CCTGG	2	10	212254	212263	0 %	20 %	40 %	40 %	479155924
121	NC_021015	AAAGG	2	10	212545	212554	60 %	0 %	40 %	0 %	479155924
122	NC_021015	ATGCA	2	10	212870	212879	40 %	20 %	20 %	20 %	479155924
123	NC_021015	TCCGT	2	10	213105	213114	0 %	40 %	20 %	40 %	479155925
124	NC_021015	TTCCT	2	10	214544	214553	0 %	60 %	0 %	40 %	479155927
125	NC_021015	TTGTC	2	10	216224	216233	0 %	60 %	20 %	20 %	479155929
126	NC_021015	TTCCA	2	10	216329	216338	20 %	40 %	0 %	40 %	479155929
127	NC_021015	CTCTG	2	10	216448	216457	0 %	40 %	20 %	40 %	479155929
128	NC_021015	AAATA	2	10	218393	218402	80 %	20 %	0 %	0 %	479155932
129	NC_021015	TGGAA	2	10	218407	218416	40 %	20 %	40 %	0 %	479155932
130	NC_021015	TCCAT	2	10	219378	219387	20 %	40 %	0 %	40 %	479155932
131	NC_021015	TTGAT	2	10	219462	219471	20 %	60 %	20 %	0 %	479155932
132	NC_021015	TCCTG	2	10	219533	219542	0 %	40 %	20 %	40 %	479155932
133	NC_021015	GATCA	2	10	221676	221685	40 %	20 %	20 %	20 %	479155934
134	NC_021015	ATATT	2	10	222575	222584	40 %	60 %	0 %	0 %	479155935
135	NC_021015	TTTCA	2	10	224602	224611	20 %	60 %	0 %	20 %	479155937
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