MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Ruminococcus torques L2-14 draft genome

Total Repeats: 37011

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021015	TCC	2	6	5999	6004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479155736
2	NC_021015	ACA	2	6	6121	6126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479155736
3	NC_021015	TCC	3	9	6211	6219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479155736
4	NC_021015	CTG	2	6	6273	6278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155736
5	NC_021015	CTG	2	6	6300	6305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155736
6	NC_021015	TTA	2	6	6386	6391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479155736
7	NC_021015	CAT	2	6	6493	6498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155736
8	NC_021015	CCT	2	6	6503	6508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479155736
9	NC_021015	CAC	2	6	6517	6522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479155736
10	NC_021015	GAT	2	6	6613	6618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155736
11	NC_021015	AAT	2	6	6733	6738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479155737
12	NC_021015	TCT	2	6	6778	6783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155737
13	NC_021015	TCC	2	6	6809	6814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479155737
14	NC_021015	CAA	2	6	6822	6827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479155737
15	NC_021015	GGT	2	6	7224	7229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479155738
16	NC_021015	ATG	2	6	7261	7266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155738
17	NC_021015	CAG	2	6	7410	7415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155738
18	NC_021015	AGT	2	6	7574	7579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155738
19	NC_021015	GAA	3	9	7632	7640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155738
20	NC_021015	AAT	2	6	7648	7653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479155738
21	NC_021015	TTC	2	6	7745	7750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155739
22	NC_021015	ATA	2	6	7771	7776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479155739
23	NC_021015	TGC	2	6	7807	7812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155739
24	NC_021015	CGC	2	6	7879	7884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479155739
25	NC_021015	CTC	2	6	7896	7901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479155739
26	NC_021015	ATC	2	6	8084	8089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155739
27	NC_021015	TGC	2	6	8242	8247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155739
28	NC_021015	AAT	2	6	8302	8307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479155739
29	NC_021015	CTT	2	6	8425	8430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155739
30	NC_021015	CTG	2	6	8454	8459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155739
31	NC_021015	GCC	2	6	8509	8514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479155739
32	NC_021015	CTG	2	6	8553	8558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155739
33	NC_021015	TCA	2	6	8706	8711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155739
34	NC_021015	ACT	2	6	8860	8865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155739
35	NC_021015	TGT	2	6	8973	8978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479155739
36	NC_021015	CTG	2	6	8983	8988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155739
37	NC_021015	GTC	2	6	9050	9055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155739
38	NC_021015	TTG	2	6	9081	9086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479155739
39	NC_021015	TAA	2	6	10707	10712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479155740
40	NC_021015	CTG	2	6	10751	10756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155740
41	NC_021015	TTC	2	6	10787	10792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155740
42	NC_021015	GGA	2	6	10811	10816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479155740
43	NC_021015	ATG	2	6	10869	10874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155740
44	NC_021015	ATG	2	6	10884	10889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155740
45	NC_021015	ATT	2	6	10922	10927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479155740
46	NC_021015	ATG	2	6	10961	10966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155740
47	NC_021015	AGA	2	6	11182	11187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155740
48	NC_021015	GCA	2	6	11222	11227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155740
49	NC_021015	GAA	2	6	11258	11263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155740
50	NC_021015	TGA	2	6	11392	11397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155740
51	NC_021015	GCG	2	6	11403	11408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479155740
52	NC_021015	TGA	2	6	11476	11481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155740
53	NC_021015	TGT	2	6	11523	11528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479155740
54	NC_021015	AGA	2	6	11683	11688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155740
55	NC_021015	CAT	2	6	11701	11706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155740
56	NC_021015	ATA	2	6	11814	11819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479155740
57	NC_021015	TTG	2	6	11858	11863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479155740
58	NC_021015	ATT	2	6	11876	11881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479155740
59	NC_021015	ATT	2	6	11895	11900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479155740
60	NC_021015	TCG	2	6	11943	11948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155740
61	NC_021015	TAA	2	6	12004	12009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479155740
62	NC_021015	GAA	2	6	12017	12022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155740
63	NC_021015	ATC	2	6	12048	12053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155740
64	NC_021015	AGT	2	6	12145	12150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155740
65	NC_021015	AGC	3	9	12287	12295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155741
66	NC_021015	GTT	2	6	12545	12550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479155741
67	NC_021015	ATG	2	6	12633	12638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155741
68	NC_021015	ATT	2	6	12767	12772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479155741
69	NC_021015	AAG	2	6	12826	12831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155741
70	NC_021015	GAT	2	6	12839	12844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155741
71	NC_021015	TCT	2	6	12852	12857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155741
72	NC_021015	CAG	2	6	13204	13209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155742
73	NC_021015	GTG	2	6	13294	13299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479155742
74	NC_021015	GAC	2	6	13328	13333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155742
75	NC_021015	AAG	2	6	13435	13440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155742
76	NC_021015	ATA	2	6	13454	13459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479155742
77	NC_021015	GAT	2	6	13579	13584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155743
78	NC_021015	AAG	2	6	13650	13655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155743
79	NC_021015	ATG	2	6	13704	13709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155743
80	NC_021015	CAC	2	6	13821	13826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479155743
81	NC_021015	TGA	2	6	13828	13833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155743
82	NC_021015	TGA	2	6	13861	13866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155743
83	NC_021015	TAT	2	6	14013	14018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479155743
84	NC_021015	TAT	2	6	14155	14160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479155744
85	NC_021015	ACA	2	6	14172	14177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479155744
86	NC_021015	CAA	2	6	14222	14227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479155744
87	NC_021015	GCC	2	6	14263	14268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479155744
88	NC_021015	GCT	2	6	14279	14284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155744
89	NC_021015	TTG	2	6	14341	14346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479155744
90	NC_021015	ATC	2	6	14364	14369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155744
91	NC_021015	ATC	2	6	14424	14429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155744
92	NC_021015	AGA	2	6	14472	14477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155744
93	NC_021015	AAG	2	6	14676	14681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155744
94	NC_021015	AAG	2	6	14745	14750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155744
95	NC_021015	AAT	2	6	14772	14777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479155744
96	NC_021015	AGT	2	6	14912	14917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155744
97	NC_021015	ATC	2	6	15058	15063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155744
98	NC_021015	CAA	2	6	15920	15925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479155745
99	NC_021015	ATC	2	6	16241	16246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155746
100	NC_021015	GAA	2	6	16251	16256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155746
101	NC_021015	AGG	2	6	16315	16320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479155746
102	NC_021015	AGA	2	6	16406	16411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155746
103	NC_021015	GTT	2	6	16428	16433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479155746
104	NC_021015	TAT	3	9	16458	16466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479155746
105	NC_021015	ATG	2	6	16504	16509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155746
106	NC_021015	CGA	2	6	16631	16636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155746
107	NC_021015	TGG	2	6	16662	16667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479155746
108	NC_021015	ACG	2	6	16669	16674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155746
109	NC_021015	GAA	2	6	16677	16682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155746
110	NC_021015	GAA	2	6	16688	16693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155746
111	NC_021015	GAA	3	9	16875	16883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155746
112	NC_021015	GTA	2	6	17013	17018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155746
113	NC_021015	TAA	2	6	17035	17040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479155746
114	NC_021015	AGA	2	6	17048	17053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155746
115	NC_021015	AGC	2	6	17084	17089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155747
116	NC_021015	AGT	2	6	17109	17114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155747
117	NC_021015	GTT	2	6	17137	17142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479155747
118	NC_021015	TGA	2	6	17291	17296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155747
119	NC_021015	TGG	2	6	17478	17483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479155747
120	NC_021015	ATT	2	6	17587	17592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479155747
121	NC_021015	TAT	2	6	17607	17612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479155747
122	NC_021015	CAG	2	6	17625	17630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155747
123	NC_021015	TGG	2	6	17895	17900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479155747
124	NC_021015	ATG	2	6	17932	17937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155747
125	NC_021015	TGA	2	6	17966	17971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155747
126	NC_021015	GGA	2	6	18009	18014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479155747
127	NC_021015	TGG	2	6	18279	18284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479155747
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132	NC_021015	AGC	2	6	18809	18814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155748
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498	NC_021015	GAT	2	6	50631	50636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155776
499	NC_021015	AGA	2	6	50696	50701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155776
500	NC_021015	CTG	2	6	50808	50813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155776

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