MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruminococcus torques L2-14 draft genome

Total Repeats: 55759

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021015	T	6	6	100795	100800	0 %	100 %	0 %	0 %	479155815
1502	NC_021015	TCA	2	6	100816	100821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155815
1503	NC_021015	TTC	2	6	100908	100913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155815
1504	NC_021015	ATC	2	6	100984	100989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155815
1505	NC_021015	CAG	2	6	101003	101008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155815
1506	NC_021015	TTAG	2	8	101309	101316	25 %	50 %	25 %	0 %	479155816
1507	NC_021015	TCA	2	6	101385	101390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155816
1508	NC_021015	AC	3	6	101422	101427	50 %	0 %	0 %	50 %	479155816
1509	NC_021015	GTCT	2	8	101460	101467	0 %	50 %	25 %	25 %	479155816
1510	NC_021015	TCA	2	6	101487	101492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155816
1511	NC_021015	GAA	2	6	101557	101562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155816
1512	NC_021015	GTGCC	2	10	101578	101587	0 %	20 %	40 %	40 %	479155816
1513	NC_021015	AGT	2	6	101651	101656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155816
1514	NC_021015	ATCA	2	8	101684	101691	50 %	25 %	0 %	25 %	479155816
1515	NC_021015	TCT	2	6	101708	101713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155816
1516	NC_021015	TGC	2	6	101747	101752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155816
1517	NC_021015	AACCGT	2	12	101812	101823	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	479155817
1518	NC_021015	AAC	2	6	102013	102018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479155817
1519	NC_021015	CAT	3	9	102048	102056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155817
1520	NC_021015	AAC	2	6	102157	102162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479155817
1521	NC_021015	TGC	2	6	102202	102207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155817
1522	NC_021015	TG	3	6	102221	102226	0 %	50 %	50 %	0 %	479155817
1523	NC_021015	CCG	2	6	102248	102253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479155817
1524	NC_021015	TGC	2	6	102325	102330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155817
1525	NC_021015	TTC	2	6	102359	102364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155817
1526	NC_021015	CAG	2	6	102387	102392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155817
1527	NC_021015	CAAC	2	8	102405	102412	50 %	0 %	0 %	50 %	479155817
1528	NC_021015	TCA	2	6	102431	102436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155817
1529	NC_021015	TTG	2	6	102446	102451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479155817
1530	NC_021015	CTT	2	6	102466	102471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155817
1531	NC_021015	CAT	2	6	102477	102482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155817
1532	NC_021015	ACC	2	6	102574	102579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479155817
1533	NC_021015	CAG	2	6	102612	102617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155817
1534	NC_021015	CAG	2	6	102651	102656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155817
1535	NC_021015	CTGT	2	8	102666	102673	0 %	50 %	25 %	25 %	479155817
1536	NC_021015	GT	3	6	102672	102677	0 %	50 %	50 %	0 %	479155817
1537	NC_021015	CAT	2	6	102708	102713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155817
1538	NC_021015	CTTG	2	8	102715	102722	0 %	50 %	25 %	25 %	479155817
1539	NC_021015	CAT	2	6	102723	102728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155817
1540	NC_021015	CAC	2	6	102813	102818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479155817
1541	NC_021015	TTC	2	6	102923	102928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155817
1542	NC_021015	TTG	2	6	102993	102998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479155817
1543	NC_021015	GCGGAT	2	12	103022	103033	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	479155817
1544	NC_021015	ACC	3	9	103093	103101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479155817
1545	NC_021015	TCA	2	6	103182	103187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155818
1546	NC_021015	CCA	2	6	103198	103203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479155818
1547	NC_021015	GCA	2	6	103281	103286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155818
1548	NC_021015	T	6	6	103302	103307	0 %	100 %	0 %	0 %	479155818
1549	NC_021015	ACC	2	6	103321	103326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479155819
1550	NC_021015	TTC	2	6	103372	103377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155819
1551	NC_021015	A	7	7	103408	103414	100 %	0 %	0 %	0 %	479155819
1552	NC_021015	ACC	2	6	103430	103435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479155819
1553	NC_021015	TGA	2	6	103436	103441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155819
1554	NC_021015	TGT	2	6	103480	103485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479155819
1555	NC_021015	GCT	2	6	103536	103541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155819
1556	NC_021015	GTT	3	9	103612	103620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479155819
1557	NC_021015	CAAG	2	8	103627	103634	50 %	0 %	25 %	25 %	479155819
1558	NC_021015	A	7	7	103639	103645	100 %	0 %	0 %	0 %	479155819
1559	NC_021015	CTTG	2	8	103662	103669	0 %	50 %	25 %	25 %	479155819
1560	NC_021015	TTC	2	6	103672	103677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155819
1561	NC_021015	ATC	2	6	103693	103698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155819
1562	NC_021015	AAC	2	6	103719	103724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479155819
1563	NC_021015	TCA	2	6	103835	103840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155820
1564	NC_021015	T	6	6	104032	104037	0 %	100 %	0 %	0 %	479155820
1565	NC_021015	ACC	2	6	104077	104082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479155820
1566	NC_021015	GCA	2	6	104098	104103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155820
1567	NC_021015	TCA	2	6	104131	104136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155820
1568	NC_021015	CTG	3	9	104157	104165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155820
1569	NC_021015	AAAC	2	8	104354	104361	75 %	0 %	0 %	25 %	479155821
1570	NC_021015	TGC	2	6	104385	104390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155821
1571	NC_021015	CTGA	2	8	104396	104403	25 %	25 %	25 %	25 %	479155821
1572	NC_021015	TTC	2	6	104469	104474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155821
1573	NC_021015	T	6	6	104494	104499	0 %	100 %	0 %	0 %	479155821
1574	NC_021015	TGC	2	6	104571	104576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155821
1575	NC_021015	TGA	2	6	104647	104652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155822
1576	NC_021015	AAG	2	6	104653	104658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155822
1577	NC_021015	TCA	2	6	104766	104771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155822
1578	NC_021015	AGA	2	6	104793	104798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155822
1579	NC_021015	CACC	2	8	104803	104810	25 %	0 %	0 %	75 %	479155822
1580	NC_021015	CAT	2	6	104848	104853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155822
1581	NC_021015	TGC	2	6	104878	104883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155822
1582	NC_021015	TTC	2	6	104915	104920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155822
1583	NC_021015	GTATCA	2	12	104967	104978	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	479155822
1584	NC_021015	ATA	2	6	105022	105027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479155823
1585	NC_021015	GAAACA	2	12	105160	105171	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	479155823
1586	NC_021015	GT	3	6	105194	105199	0 %	50 %	50 %	0 %	479155823
1587	NC_021015	CAA	2	6	105359	105364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479155823
1588	NC_021015	TAG	2	6	105368	105373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155823
1589	NC_021015	ATC	2	6	105381	105386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155823
1590	NC_021015	ATG	2	6	105388	105393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155823
1591	NC_021015	TAG	2	6	105491	105496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155823
1592	NC_021015	AACT	2	8	105516	105523	50 %	25 %	0 %	25 %	479155823
1593	NC_021015	TTG	2	6	105535	105540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479155823
1594	NC_021015	CATC	2	8	105581	105588	25 %	25 %	0 %	50 %	479155823
1595	NC_021015	TCA	2	6	105598	105603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155823
1596	NC_021015	GT	3	6	105604	105609	0 %	50 %	50 %	0 %	479155823
1597	NC_021015	CAA	2	6	105647	105652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479155823
1598	NC_021015	CTT	2	6	105666	105671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155823
1599	NC_021015	AC	3	6	105704	105709	50 %	0 %	0 %	50 %	479155823
1600	NC_021015	AGT	2	6	105752	105757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155823
1601	NC_021015	CTT	2	6	105769	105774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155823
1602	NC_021015	ACC	2	6	105795	105800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479155823
1603	NC_021015	CAT	2	6	105806	105811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155823
1604	NC_021015	GTT	2	6	105981	105986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479155823
1605	NC_021015	TCACCC	2	12	106227	106238	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	479155824
1606	NC_021015	CTG	3	9	106283	106291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155824
1607	NC_021015	CTG	2	6	106295	106300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155824
1608	NC_021015	TCA	2	6	106329	106334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155824
1609	NC_021015	CTT	2	6	106338	106343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155824
1610	NC_021015	CTTTGC	2	12	106439	106450	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	479155824
1611	NC_021015	GTTCA	2	10	106493	106502	20 %	40 %	20 %	20 %	479155824
1612	NC_021015	TCT	2	6	106552	106557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155824
1613	NC_021015	TCA	2	6	106701	106706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155824
1614	NC_021015	GAA	2	6	107098	107103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155825
1615	NC_021015	TCA	2	6	107126	107131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155825
1616	NC_021015	T	7	7	107136	107142	0 %	100 %	0 %	0 %	479155825
1617	NC_021015	CCA	2	6	107245	107250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479155825
1618	NC_021015	ATCTG	2	10	107252	107261	20 %	40 %	20 %	20 %	479155825
1619	NC_021015	TCT	2	6	107308	107313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155826
1620	NC_021015	TA	3	6	107333	107338	50 %	50 %	0 %	0 %	479155826
1621	NC_021015	AAC	2	6	107393	107398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479155826
1622	NC_021015	TTGA	2	8	107518	107525	25 %	50 %	25 %	0 %	479155826
1623	NC_021015	TCTT	2	8	107646	107653	0 %	75 %	0 %	25 %	479155826
1624	NC_021015	ATAC	2	8	107722	107729	50 %	25 %	0 %	25 %	479155826
1625	NC_021015	ACT	2	6	107732	107737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155826
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1629	NC_021015	ATC	2	6	107966	107971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155826
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1632	NC_021015	TCA	3	9	108111	108119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155826
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1634	NC_021015	AT	3	6	108223	108228	50 %	50 %	0 %	0 %	479155826
1635	NC_021015	TGC	2	6	108302	108307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155826
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1640	NC_021015	TGA	2	6	108520	108525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155826
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1642	NC_021015	TG	3	6	108599	108604	0 %	50 %	50 %	0 %	479155826
1643	NC_021015	ATA	2	6	108605	108610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479155826
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1645	NC_021015	GCT	2	6	108748	108753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155826
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1648	NC_021015	TTG	2	6	108977	108982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479155826
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1651	NC_021015	GGT	2	6	110891	110896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479155827
1652	NC_021015	ATC	2	6	110901	110906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155827
1653	NC_021015	TGA	2	6	110972	110977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155827
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1655	NC_021015	GTT	2	6	111033	111038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479155827
1656	NC_021015	CCTT	2	8	111053	111060	0 %	50 %	0 %	50 %	479155827
1657	NC_021015	CTG	2	6	111116	111121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155827
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1661	NC_021015	TCT	2	6	111320	111325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155827
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1666	NC_021015	TCA	2	6	111514	111519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155827
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1732	NC_021015	GGTT	2	8	114687	114694	0 %	50 %	50 %	0 %	479155834
1733	NC_021015	GTT	2	6	114744	114749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479155834
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1739	NC_021015	TGA	2	6	115016	115021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155834
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1741	NC_021015	GAAG	2	8	115115	115122	50 %	0 %	50 %	0 %	479155834
1742	NC_021015	TCA	2	6	115123	115128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155834
1743	NC_021015	ATC	2	6	115134	115139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155834
1744	NC_021015	CAT	2	6	115164	115169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155834
1745	NC_021015	TCT	2	6	115314	115319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155834
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1755	NC_021015	TA	3	6	115672	115677	50 %	50 %	0 %	0 %	479155834
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1758	NC_021015	CAT	2	6	115784	115789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155834
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1762	NC_021015	TTC	2	6	115872	115877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155834
1763	NC_021015	AGTCAG	2	12	115896	115907	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	479155834
1764	NC_021015	TTCC	2	8	115930	115937	0 %	50 %	0 %	50 %	479155834
1765	NC_021015	CAA	2	6	115955	115960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479155834
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1771	NC_021015	AAAG	2	8	116165	116172	75 %	0 %	25 %	0 %	479155834
1772	NC_021015	TTC	2	6	116217	116222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155834
1773	NC_021015	TCA	2	6	116231	116236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155834
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1854	NC_021015	ACTG	2	8	121435	121442	25 %	25 %	25 %	25 %	479155840
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1862	NC_021015	TTC	2	6	121688	121693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155841
1863	NC_021015	GAA	2	6	121756	121761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155841
1864	NC_021015	GCTT	2	8	121783	121790	0 %	50 %	25 %	25 %	479155841
1865	NC_021015	TGG	2	6	121825	121830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479155841
1866	NC_021015	TGC	3	9	121904	121912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155841
1867	NC_021015	ATG	2	6	121914	121919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155841
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1869	NC_021015	CTG	2	6	121978	121983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155841
1870	NC_021015	CAT	2	6	121985	121990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155841
1871	NC_021015	CTG	2	6	121998	122003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155841
1872	NC_021015	TGA	2	6	122004	122009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155841
1873	NC_021015	CAAG	2	8	122025	122032	50 %	0 %	25 %	25 %	479155841
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1877	NC_021015	CTT	2	6	122141	122146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155841
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1881	NC_021015	T	6	6	122259	122264	0 %	100 %	0 %	0 %	479155841
1882	NC_021015	T	7	7	122358	122364	0 %	100 %	0 %	0 %	479155842
1883	NC_021015	ACA	2	6	122402	122407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479155842
1884	NC_021015	T	7	7	122435	122441	0 %	100 %	0 %	0 %	479155842
1885	NC_021015	AGC	2	6	122553	122558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155842
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1888	NC_021015	T	6	6	122690	122695	0 %	100 %	0 %	0 %	479155843
1889	NC_021015	GCA	2	6	122737	122742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479155843
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1892	NC_021015	TGA	2	6	122887	122892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155843
1893	NC_021015	TGAT	2	8	122899	122906	25 %	50 %	25 %	0 %	479155843
1894	NC_021015	TGA	2	6	122936	122941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155843
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1898	NC_021015	TGT	2	6	123034	123039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479155843
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1910	NC_021015	AGTA	2	8	123607	123614	50 %	25 %	25 %	0 %	479155845
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1975	NC_021015	T	6	6	127954	127959	0 %	100 %	0 %	0 %	479155849
1976	NC_021015	T	6	6	127992	127997	0 %	100 %	0 %	0 %	479155849
1977	NC_021015	TTC	2	6	128002	128007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155849
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1980	NC_021015	AAG	2	6	128035	128040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479155849
1981	NC_021015	ATATCT	2	12	128048	128059	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	479155849
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1983	NC_021015	CCA	2	6	128083	128088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479155849
1984	NC_021015	TG	3	6	128102	128107	0 %	50 %	50 %	0 %	479155849
1985	NC_021015	TCA	2	6	128117	128122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155849
1986	NC_021015	TCCA	2	8	128173	128180	25 %	25 %	0 %	50 %	479155849
1987	NC_021015	CTG	2	6	128196	128201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155849
1988	NC_021015	ATA	2	6	128242	128247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479155849
1989	NC_021015	TCT	2	6	128361	128366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479155850
1990	NC_021015	TG	3	6	128378	128383	0 %	50 %	50 %	0 %	479155850
1991	NC_021015	ACT	2	6	128479	128484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479155850
1992	NC_021015	AT	3	6	128499	128504	50 %	50 %	0 %	0 %	479155850
1993	NC_021015	TGC	2	6	128507	128512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479155850
1994	NC_021015	ATG	2	6	128559	128564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155850
1995	NC_021015	CA	3	6	128584	128589	50 %	0 %	0 %	50 %	479155850
1996	NC_021015	TGAC	2	8	128591	128598	25 %	25 %	25 %	25 %	479155850
1997	NC_021015	ATT	2	6	128649	128654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479155850
1998	NC_021015	TGA	2	6	128656	128661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479155850
1999	NC_021015	AT	3	6	128679	128684	50 %	50 %	0 %	0 %	479155850
2000	NC_021015	T	6	6	128698	128703	0 %	100 %	0 %	0 %	479155850

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