MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruminococcus torques L2-14 draft genome

Total Repeats: 55759

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021015	TGT	2	6	314601	314606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479156014
5002	NC_021015	ATT	2	6	314699	314704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479156014
5003	NC_021015	TTTC	2	8	314711	314718	0 %	75 %	0 %	25 %	479156014
5004	NC_021015	T	6	6	314719	314724	0 %	100 %	0 %	0 %	479156014
5005	NC_021015	AAC	2	6	314728	314733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479156014
5006	NC_021015	TGCT	2	8	314772	314779	0 %	50 %	25 %	25 %	479156014
5007	NC_021015	GAT	2	6	314791	314796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479156014
5008	NC_021015	AT	3	6	314800	314805	50 %	50 %	0 %	0 %	479156014
5009	NC_021015	AGC	2	6	314857	314862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479156014
5010	NC_021015	GAT	2	6	314890	314895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479156014
5011	NC_021015	ATT	2	6	314903	314908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479156014
5012	NC_021015	TTAT	2	8	314942	314949	25 %	75 %	0 %	0 %	479156014
5013	NC_021015	ACA	3	9	314951	314959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479156014
5014	NC_021015	ATTC	2	8	315048	315055	25 %	50 %	0 %	25 %	479156014
5015	NC_021015	ACA	2	6	315057	315062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479156014
5016	NC_021015	TTG	2	6	315114	315119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479156014
5017	NC_021015	TTA	3	9	315141	315149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479156014
5018	NC_021015	AGG	2	6	315159	315164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479156014
5019	NC_021015	AAG	2	6	315184	315189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479156015
5020	NC_021015	TTTA	2	8	315231	315238	25 %	75 %	0 %	0 %	479156015
5021	NC_021015	GATTGT	2	12	315246	315257	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	479156015
5022	NC_021015	TTA	2	6	315287	315292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479156015
5023	NC_021015	T	6	6	315385	315390	0 %	100 %	0 %	0 %	479156015
5024	NC_021015	TTTA	2	8	315396	315403	25 %	75 %	0 %	0 %	479156015
5025	NC_021015	T	6	6	315421	315426	0 %	100 %	0 %	0 %	479156015
5026	NC_021015	TTG	2	6	315428	315433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479156015
5027	NC_021015	TTTGCT	2	12	315505	315516	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	479156015
5028	NC_021015	ATTT	2	8	315600	315607	25 %	75 %	0 %	0 %	479156015
5029	NC_021015	GAT	2	6	315690	315695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479156015
5030	NC_021015	GATG	2	8	315697	315704	25 %	25 %	50 %	0 %	479156015
5031	NC_021015	TAT	2	6	315708	315713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479156015
5032	NC_021015	ATG	2	6	315901	315906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479156015
5033	NC_021015	A	6	6	316019	316024	100 %	0 %	0 %	0 %	479156016
5034	NC_021015	TAT	2	6	316026	316031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479156016
5035	NC_021015	GAA	2	6	316049	316054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479156016
5036	NC_021015	GTT	2	6	316162	316167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479156016
5037	NC_021015	GGC	2	6	316190	316195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479156016
5038	NC_021015	GTA	2	6	316196	316201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479156016
5039	NC_021015	TGT	2	6	316209	316214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479156016
5040	NC_021015	GT	3	6	316230	316235	0 %	50 %	50 %	0 %	479156016
5041	NC_021015	ATGGA	2	10	316260	316269	40 %	20 %	40 %	0 %	479156016
5042	NC_021015	CAG	2	6	316307	316312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479156016
5043	NC_021015	TGGA	2	8	316331	316338	25 %	25 %	50 %	0 %	479156016
5044	NC_021015	GGACAT	2	12	316412	316423	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	479156016
5045	NC_021015	CAA	2	6	316431	316436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479156016
5046	NC_021015	GAA	2	6	316457	316462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479156016
5047	NC_021015	GCA	2	6	316463	316468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479156016
5048	NC_021015	GAT	3	9	316511	316519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479156016
5049	NC_021015	GAAA	2	8	316609	316616	75 %	0 %	25 %	0 %	479156016
5050	NC_021015	ATC	2	6	316663	316668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479156016
5051	NC_021015	GAAAT	2	10	316680	316689	60 %	20 %	20 %	0 %	479156016
5052	NC_021015	AAAG	2	8	316748	316755	75 %	0 %	25 %	0 %	479156016
5053	NC_021015	TCA	2	6	317161	317166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479156017
5054	NC_021015	T	7	7	317259	317265	0 %	100 %	0 %	0 %	479156017
5055	NC_021015	AGA	2	6	317316	317321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479156017
5056	NC_021015	ATAG	2	8	317359	317366	50 %	25 %	25 %	0 %	479156017
5057	NC_021015	TCCA	2	8	317375	317382	25 %	25 %	0 %	50 %	479156017
5058	NC_021015	CAG	2	6	317417	317422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479156017
5059	NC_021015	TGC	2	6	317428	317433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479156017
5060	NC_021015	ATG	2	6	317552	317557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479156017
5061	NC_021015	GCC	2	6	317569	317574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479156017
5062	NC_021015	AGAT	2	8	317600	317607	50 %	25 %	25 %	0 %	479156017
5063	NC_021015	GCC	2	6	317623	317628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479156017
5064	NC_021015	AGA	2	6	317629	317634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479156017
5065	NC_021015	CCG	2	6	317645	317650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479156017
5066	NC_021015	AGC	2	6	317677	317682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479156017
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5068	NC_021015	ATAA	2	8	317764	317771	75 %	25 %	0 %	0 %	479156017
5069	NC_021015	AG	3	6	317795	317800	50 %	0 %	50 %	0 %	479156017
5070	NC_021015	TGCC	2	8	317806	317813	0 %	25 %	25 %	50 %	479156017
5071	NC_021015	AT	3	6	317909	317914	50 %	50 %	0 %	0 %	479156017
5072	NC_021015	CAT	2	6	317950	317955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479156017
5073	NC_021015	CAG	2	6	318006	318011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479156017
5074	NC_021015	TTA	2	6	318041	318046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479156017
5075	NC_021015	AAGCAG	2	12	318051	318062	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	479156017
5076	NC_021015	AAGG	2	8	318130	318137	50 %	0 %	50 %	0 %	479156017
5077	NC_021015	ATCC	2	8	318149	318156	25 %	25 %	0 %	50 %	479156017
5078	NC_021015	ACA	2	6	318158	318163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479156017
5079	NC_021015	TGCAAG	2	12	318178	318189	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	479156017
5080	NC_021015	GGC	2	6	318289	318294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479156017
5081	NC_021015	CAAT	2	8	318333	318340	50 %	25 %	0 %	25 %	479156017
5082	NC_021015	AAATA	2	10	318346	318355	80 %	20 %	0 %	0 %	479156017
5083	NC_021015	ACC	2	6	318376	318381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479156017
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5085	NC_021015	AGAA	2	8	318654	318661	75 %	0 %	25 %	0 %	479156018
5086	NC_021015	TGC	2	6	318724	318729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479156018
5087	NC_021015	GA	3	6	318924	318929	50 %	0 %	50 %	0 %	479156018
5088	NC_021015	AATC	2	8	318985	318992	50 %	25 %	0 %	25 %	479156018
5089	NC_021015	GAA	2	6	319010	319015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479156018
5090	NC_021015	AGA	2	6	319061	319066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479156018
5091	NC_021015	CGG	2	6	319115	319120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479156018
5092	NC_021015	A	6	6	319140	319145	100 %	0 %	0 %	0 %	479156018
5093	NC_021015	CTT	2	6	319167	319172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479156018
5094	NC_021015	GCAG	2	8	319209	319216	25 %	0 %	50 %	25 %	479156018
5095	NC_021015	T	6	6	319227	319232	0 %	100 %	0 %	0 %	479156018
5096	NC_021015	AAG	2	6	319677	319682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479156019
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5103	NC_021015	GAG	2	6	320040	320045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479156019
5104	NC_021015	CAG	2	6	320061	320066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479156019
5105	NC_021015	GAG	2	6	320286	320291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479156019
5106	NC_021015	CAG	2	6	320295	320300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479156019
5107	NC_021015	AAC	2	6	320307	320312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479156019
5108	NC_021015	TG	3	6	320325	320330	0 %	50 %	50 %	0 %	479156019
5109	NC_021015	ATA	2	6	320347	320352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479156019
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5112	NC_021015	GAGAA	2	10	320404	320413	60 %	0 %	40 %	0 %	479156019
5113	NC_021015	AGA	2	6	320470	320475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479156019
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5118	NC_021015	A	6	6	320749	320754	100 %	0 %	0 %	0 %	479156019
5119	NC_021015	GAA	2	6	320819	320824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479156019
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5122	NC_021015	AAG	2	6	320866	320871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479156019
5123	NC_021015	GGA	2	6	320889	320894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479156019
5124	NC_021015	GGA	2	6	320949	320954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479156019
5125	NC_021015	GCA	2	6	320988	320993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479156019
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5127	NC_021015	ATG	2	6	321114	321119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479156019
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5133	NC_021015	CTG	2	6	321819	321824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479156020
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5144	NC_021015	GAA	2	6	322702	322707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479156021
5145	NC_021015	TTAT	2	8	322790	322797	25 %	75 %	0 %	0 %	479156021
5146	NC_021015	TTC	2	6	322956	322961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479156021
5147	NC_021015	TCT	2	6	323068	323073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479156021
5148	NC_021015	GAA	2	6	323297	323302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479156021
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5151	NC_021015	GAA	2	6	323413	323418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479156021
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5153	NC_021015	ATT	2	6	323661	323666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479156021
5154	NC_021015	GTA	2	6	323725	323730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479156021
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5161	NC_021015	TGG	2	6	324188	324193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479156022
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5164	NC_021015	GAA	2	6	324558	324563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479156022
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5177	NC_021015	GAA	2	6	325118	325123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479156023
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5223	NC_021015	TCA	2	6	327457	327462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479156024
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5232	NC_021015	CAG	2	6	327785	327790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479156024
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5239	NC_021015	ATC	2	6	327995	328000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479156025
5240	NC_021015	GGA	2	6	328018	328023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479156025
5241	NC_021015	GAT	2	6	328054	328059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479156025
5242	NC_021015	AAGATT	2	12	328116	328127	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	479156025
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5244	NC_021015	TTCT	2	8	328198	328205	0 %	75 %	0 %	25 %	479156026
5245	NC_021015	T	6	6	328258	328263	0 %	100 %	0 %	0 %	479156026
5246	NC_021015	TTGAAG	2	12	328273	328284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479156026
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5251	NC_021015	ACTGC	2	10	328508	328517	20 %	20 %	20 %	40 %	479156026
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5253	NC_021015	TG	3	6	328643	328648	0 %	50 %	50 %	0 %	479156026
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5261	NC_021015	ATC	2	6	329057	329062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479156027
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5367	NC_021015	GAA	2	6	334688	334693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479156033
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5370	NC_021015	TGA	2	6	334819	334824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479156033
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5479	NC_021015	A	6	6	340329	340334	100 %	0 %	0 %	0 %	479156038
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5481	NC_021015	A	6	6	340482	340487	100 %	0 %	0 %	0 %	479156038
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5488	NC_021015	TTA	2	6	341225	341230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479156039
5489	NC_021015	TA	3	6	341247	341252	50 %	50 %	0 %	0 %	479156039
5490	NC_021015	CAGGAT	2	12	341256	341267	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	479156039
5491	NC_021015	GCA	2	6	341297	341302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479156039
5492	NC_021015	ATTG	2	8	341308	341315	25 %	50 %	25 %	0 %	479156039
5493	NC_021015	ATC	2	6	341333	341338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479156039
5494	NC_021015	GT	3	6	341364	341369	0 %	50 %	50 %	0 %	479156039
5495	NC_021015	CTT	2	6	341375	341380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479156039
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5497	NC_021015	CATT	2	8	341562	341569	25 %	50 %	0 %	25 %	479156039
5498	NC_021015	CAG	2	6	341592	341597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479156039
5499	NC_021015	AGC	2	6	341599	341604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479156039
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