MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 34346

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021014	TCT	2	6	219	224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152296
2	NC_021014	AGT	2	6	375	380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152296
3	NC_021014	TGA	2	6	401	406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152296
4	NC_021014	AGT	2	6	442	447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152296
5	NC_021014	GAT	2	6	535	540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152296
6	NC_021014	CAA	2	6	576	581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479152296
7	NC_021014	GCA	2	6	617	622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152296
8	NC_021014	TTC	2	6	674	679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152296
9	NC_021014	CTT	2	6	723	728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152296
10	NC_021014	TAA	2	6	748	753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479152296
11	NC_021014	ATT	2	6	761	766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152296
12	NC_021014	AAC	2	6	1328	1333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479152297
13	NC_021014	AGT	2	6	1336	1341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152297
14	NC_021014	TTA	2	6	1361	1366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152297
15	NC_021014	GCA	2	6	1469	1474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152297
16	NC_021014	GAA	2	6	2768	2773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152298
17	NC_021014	TCT	2	6	2798	2803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152298
18	NC_021014	TCT	2	6	2902	2907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152298
19	NC_021014	GCG	2	6	2954	2959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152298
20	NC_021014	CGG	2	6	3001	3006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152298
21	NC_021014	CAG	2	6	3138	3143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152298
22	NC_021014	ATG	2	6	3260	3265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152298
23	NC_021014	TCT	2	6	3364	3369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152298
24	NC_021014	AGA	2	6	3546	3551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152298
25	NC_021014	TTA	2	6	3555	3560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152298
26	NC_021014	GCT	2	6	3571	3576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152298
27	NC_021014	CAA	2	6	3679	3684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479152298
28	NC_021014	TTG	2	6	3729	3734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152298
29	NC_021014	ACA	2	6	3783	3788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479152298
30	NC_021014	GAT	2	6	3790	3795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152298
31	NC_021014	CTG	2	6	3811	3816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152298
32	NC_021014	CAC	2	6	3849	3854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479152298
33	NC_021014	TAT	2	6	3910	3915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152298
34	NC_021014	GGT	2	6	4027	4032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152298
35	NC_021014	ATG	2	6	4115	4120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152298
36	NC_021014	ATG	2	6	4246	4251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152299
37	NC_021014	TCA	2	6	4280	4285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152299
38	NC_021014	AGA	2	6	4382	4387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152299
39	NC_021014	GCT	2	6	4469	4474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152299
40	NC_021014	CTT	2	6	4677	4682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152299
41	NC_021014	GGC	2	6	4702	4707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152299
42	NC_021014	GAA	2	6	4926	4931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152299
43	NC_021014	TGT	2	6	5162	5167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152299
44	NC_021014	ACC	2	6	5182	5187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479152299
45	NC_021014	GAA	2	6	5241	5246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152299
46	NC_021014	ATA	2	6	5385	5390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479152300
47	NC_021014	GAT	2	6	5526	5531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152300
48	NC_021014	GAA	2	6	5663	5668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152300
49	NC_021014	AGA	2	6	5689	5694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152300
50	NC_021014	TCA	2	6	5734	5739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152300
51	NC_021014	AGT	2	6	5748	5753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152300
52	NC_021014	AGA	3	9	5755	5763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152300
53	NC_021014	AGA	2	6	5842	5847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152300
54	NC_021014	CTT	2	6	5882	5887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152300
55	NC_021014	GGT	2	6	5901	5906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152300
56	NC_021014	GTC	3	9	5967	5975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152300
57	NC_021014	ACC	2	6	6241	6246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479152301
58	NC_021014	AGA	2	6	6359	6364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152301
59	NC_021014	TTC	2	6	6601	6606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152301
60	NC_021014	TTG	2	6	6641	6646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152301
61	NC_021014	AGC	2	6	6745	6750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152301
62	NC_021014	TGA	2	6	6836	6841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152301
63	NC_021014	CAG	3	9	7024	7032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152301
64	NC_021014	AGA	2	6	7043	7048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152301
65	NC_021014	CGG	2	6	7119	7124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152301
66	NC_021014	GCA	2	6	7192	7197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152301
67	NC_021014	AGG	2	6	7214	7219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152301
68	NC_021014	ATC	2	6	7703	7708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152302
69	NC_021014	TGA	2	6	7908	7913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152302
70	NC_021014	ATT	2	6	7937	7942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152302
71	NC_021014	TGG	2	6	7985	7990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152302
72	NC_021014	GAA	2	6	8040	8045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152302
73	NC_021014	ACC	2	6	8186	8191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479152302
74	NC_021014	CCA	2	6	8198	8203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479152302
75	NC_021014	GAA	2	6	8227	8232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152302
76	NC_021014	CAT	2	6	8259	8264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152302
77	NC_021014	GAA	2	6	8299	8304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152302
78	NC_021014	GAT	2	6	8313	8318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152302
79	NC_021014	GAA	2	6	8359	8364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152302
80	NC_021014	GTG	2	6	8745	8750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152303
81	NC_021014	AGA	2	6	8828	8833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152303
82	NC_021014	TAT	2	6	8889	8894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152303
83	NC_021014	AGA	2	6	8936	8941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152303
84	NC_021014	AAC	2	6	8984	8989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479152303
85	NC_021014	GGC	2	6	9083	9088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152304
86	NC_021014	TGG	2	6	9363	9368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152304
87	NC_021014	AGC	2	6	9479	9484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152304
88	NC_021014	TGA	2	6	9498	9503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152304
89	NC_021014	ATG	2	6	9603	9608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152304
90	NC_021014	GTG	2	6	9656	9661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152304
91	NC_021014	AGG	2	6	9689	9694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152304
92	NC_021014	TCC	2	6	9754	9759	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479152305
93	NC_021014	GTG	2	6	9858	9863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152305
94	NC_021014	GGA	2	6	9935	9940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152305
95	NC_021014	GTG	2	6	9993	9998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152305
96	NC_021014	CAG	2	6	10092	10097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152305
97	NC_021014	GAG	2	6	10186	10191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152305
98	NC_021014	TAT	2	6	10242	10247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152305
99	NC_021014	GAC	2	6	10366	10371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152305
100	NC_021014	ATG	2	6	10512	10517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152305
101	NC_021014	TTC	2	6	10678	10683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152305
102	NC_021014	CAA	2	6	10980	10985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479152306
103	NC_021014	GCA	3	9	11042	11050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152306
104	NC_021014	AGT	2	6	11053	11058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152306
105	NC_021014	GAA	3	9	11075	11083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152306
106	NC_021014	ACT	2	6	11262	11267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152306
107	NC_021014	GAA	2	6	11269	11274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152306
108	NC_021014	ATC	2	6	11305	11310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152306
109	NC_021014	GAA	2	6	11361	11366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152306
110	NC_021014	GCA	2	6	11440	11445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152306
111	NC_021014	TGA	2	6	11458	11463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152306
112	NC_021014	CAG	2	6	11489	11494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152306
113	NC_021014	GAA	2	6	12085	12090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152307
114	NC_021014	AAT	2	6	12124	12129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479152307
115	NC_021014	GTA	2	6	12184	12189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152307
116	NC_021014	GGA	2	6	12253	12258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152307
117	NC_021014	AGA	2	6	12309	12314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152307
118	NC_021014	AGA	2	6	12345	12350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152307
119	NC_021014	AGA	2	6	12456	12461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152307
120	NC_021014	GAA	2	6	12514	12519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152307
121	NC_021014	TGA	2	6	12524	12529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152307
122	NC_021014	GAA	2	6	12576	12581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152307
123	NC_021014	ATT	2	6	12807	12812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152308
124	NC_021014	TGA	2	6	12922	12927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152308
125	NC_021014	CGG	2	6	13015	13020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152308
126	NC_021014	GTG	2	6	13119	13124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152308
127	NC_021014	TTG	3	9	13128	13136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152308
128	NC_021014	TGA	2	6	13338	13343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152308
129	NC_021014	GCT	2	6	13397	13402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152308
130	NC_021014	GAA	2	6	13583	13588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152308
131	NC_021014	GAA	2	6	13631	13636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152309
132	NC_021014	CTT	2	6	13724	13729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152309
133	NC_021014	TAT	2	6	13745	13750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152309
134	NC_021014	TGC	2	6	13771	13776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152309
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144	NC_021014	CTT	2	6	14931	14936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152310
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151	NC_021014	CAG	2	6	15357	15362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152310
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153	NC_021014	GGT	2	6	15432	15437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152310
154	NC_021014	GGT	2	6	15468	15473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152310
155	NC_021014	TGA	2	6	15588	15593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152310
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162	NC_021014	CAT	2	6	16736	16741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152313
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240	NC_021014	TCT	2	6	24241	24246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152323
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246	NC_021014	ATG	2	6	25544	25549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152324
247	NC_021014	GAA	2	6	25652	25657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152324
248	NC_021014	TGC	2	6	25746	25751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152324
249	NC_021014	AGG	2	6	25767	25772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152324
250	NC_021014	GAT	2	6	25784	25789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152324
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252	NC_021014	GAA	2	6	25963	25968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152325
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500	NC_021014	GGT	2	6	45853	45858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152342

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