MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 52435

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_021014	CAT	2	6	269788	269793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152549
4003	NC_021014	GA	3	6	269795	269800	50 %	0 %	50 %	0 %	479152549
4004	NC_021014	TCAAG	2	10	269838	269847	40 %	20 %	20 %	20 %	479152549
4005	NC_021014	GACA	2	8	269907	269914	50 %	0 %	25 %	25 %	479152549
4006	NC_021014	AT	3	6	269955	269960	50 %	50 %	0 %	0 %	479152549
4007	NC_021014	ATC	2	6	269993	269998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152549
4008	NC_021014	CAA	2	6	270172	270177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479152549
4009	NC_021014	GCC	2	6	270179	270184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479152549
4010	NC_021014	GGA	2	6	270250	270255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152549
4011	NC_021014	GAA	2	6	270354	270359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152549
4012	NC_021014	CCA	2	6	270405	270410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479152549
4013	NC_021014	AAC	2	6	270440	270445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479152549
4014	NC_021014	TTC	2	6	270482	270487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152549
4015	NC_021014	ATG	2	6	270488	270493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152549
4016	NC_021014	TG	3	6	270497	270502	0 %	50 %	50 %	0 %	479152549
4017	NC_021014	GCA	2	6	270554	270559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152549
4018	NC_021014	ATT	2	6	270601	270606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152549
4019	NC_021014	A	6	6	271022	271027	100 %	0 %	0 %	0 %	479152550
4020	NC_021014	AGG	2	6	271036	271041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152550
4021	NC_021014	CAG	2	6	271044	271049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152550
4022	NC_021014	A	6	6	271069	271074	100 %	0 %	0 %	0 %	479152550
4023	NC_021014	AGA	2	6	271089	271094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152550
4024	NC_021014	A	7	7	271098	271104	100 %	0 %	0 %	0 %	479152550
4025	NC_021014	AGAAA	2	10	271107	271116	80 %	0 %	20 %	0 %	479152550
4026	NC_021014	AGAA	2	8	271134	271141	75 %	0 %	25 %	0 %	479152550
4027	NC_021014	CAG	2	6	271188	271193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152550
4028	NC_021014	TGC	2	6	271213	271218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152550
4029	NC_021014	GCTT	2	8	271289	271296	0 %	50 %	25 %	25 %	479152550
4030	NC_021014	TTC	2	6	271355	271360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152550
4031	NC_021014	ATCA	2	8	271383	271390	50 %	25 %	0 %	25 %	479152550
4032	NC_021014	AAT	2	6	271506	271511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479152550
4033	NC_021014	AG	3	6	271553	271558	50 %	0 %	50 %	0 %	479152550
4034	NC_021014	AAC	2	6	271608	271613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479152550
4035	NC_021014	TGC	2	6	271726	271731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152550
4036	NC_021014	GAA	2	6	271810	271815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152550
4037	NC_021014	TGGATG	2	12	271885	271896	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	479152550
4038	NC_021014	GAG	2	6	271995	272000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152550
4039	NC_021014	GAA	2	6	272075	272080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152550
4040	NC_021014	CTG	2	6	272082	272087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152550
4041	NC_021014	AAG	2	6	272151	272156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152550
4042	NC_021014	ATA	3	9	272170	272178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479152550
4043	NC_021014	CAG	2	6	272238	272243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152550
4044	NC_021014	AGC	2	6	272246	272251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152550
4045	NC_021014	AG	3	6	272296	272301	50 %	0 %	50 %	0 %	479152550
4046	NC_021014	TAT	2	6	272376	272381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152550
4047	NC_021014	CAA	2	6	272399	272404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479152550
4048	NC_021014	GAA	2	6	272432	272437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152550
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4052	NC_021014	TGG	2	6	272720	272725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152550
4053	NC_021014	CAT	2	6	272756	272761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152550
4054	NC_021014	TG	3	6	272769	272774	0 %	50 %	50 %	0 %	479152550
4055	NC_021014	GGA	2	6	272831	272836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152550
4056	NC_021014	TA	3	6	272839	272844	50 %	50 %	0 %	0 %	479152550
4057	NC_021014	TCT	2	6	272846	272851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152550
4058	NC_021014	ATC	2	6	272932	272937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152550
4059	NC_021014	CCA	2	6	273076	273081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479152550
4060	NC_021014	TCT	2	6	273104	273109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152550
4061	NC_021014	GGT	2	6	273171	273176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152550
4062	NC_021014	TCT	2	6	273365	273370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152550
4063	NC_021014	GAA	2	6	273413	273418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152550
4064	NC_021014	GGA	2	6	273449	273454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152550
4065	NC_021014	CAGG	2	8	273565	273572	25 %	0 %	50 %	25 %	479152551
4066	NC_021014	GAA	2	6	273585	273590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152551
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4069	NC_021014	GAT	2	6	276718	276723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152552
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4071	NC_021014	AGA	3	9	276744	276752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152552
4072	NC_021014	A	6	6	276775	276780	100 %	0 %	0 %	0 %	479152553
4073	NC_021014	GCTT	2	8	276783	276790	0 %	50 %	25 %	25 %	479152553
4074	NC_021014	GCA	2	6	276791	276796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152553
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4079	NC_021014	CAC	2	6	277219	277224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479152553
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4081	NC_021014	TTA	2	6	277354	277359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152553
4082	NC_021014	GCAG	2	8	277375	277382	25 %	0 %	50 %	25 %	479152553
4083	NC_021014	AAC	2	6	277459	277464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479152553
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4087	NC_021014	ATC	2	6	277664	277669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152553
4088	NC_021014	TGA	2	6	277728	277733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152553
4089	NC_021014	A	6	6	277796	277801	100 %	0 %	0 %	0 %	479152553
4090	NC_021014	GAA	2	6	277808	277813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152553
4091	NC_021014	GAT	2	6	277856	277861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152553
4092	NC_021014	AGG	2	6	277936	277941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152553
4093	NC_021014	ATG	2	6	277977	277982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152553
4094	NC_021014	GATGAA	2	12	278003	278014	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	479152553
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4096	NC_021014	GA	3	6	278092	278097	50 %	0 %	50 %	0 %	479152553
4097	NC_021014	GAA	2	6	278129	278134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152553
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4099	NC_021014	GAT	2	6	278148	278153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152553
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4101	NC_021014	A	6	6	278885	278890	100 %	0 %	0 %	0 %	479152554
4102	NC_021014	AAG	2	6	278954	278959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152554
4103	NC_021014	TGA	2	6	278982	278987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152554
4104	NC_021014	GA	3	6	278986	278991	50 %	0 %	50 %	0 %	479152554
4105	NC_021014	TGAA	2	8	279000	279007	50 %	25 %	25 %	0 %	479152554
4106	NC_021014	GCAG	2	8	279067	279074	25 %	0 %	50 %	25 %	479152554
4107	NC_021014	GAA	2	6	279116	279121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152554
4108	NC_021014	TAT	2	6	279164	279169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152554
4109	NC_021014	TCAG	2	8	279181	279188	25 %	25 %	25 %	25 %	479152554
4110	NC_021014	CTGG	2	8	279211	279218	0 %	25 %	50 %	25 %	479152554
4111	NC_021014	T	6	6	279240	279245	0 %	100 %	0 %	0 %	479152554
4112	NC_021014	TGTATC	2	12	279321	279332	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	479152554
4113	NC_021014	TAT	2	6	279334	279339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152554
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4116	NC_021014	T	7	7	279430	279436	0 %	100 %	0 %	0 %	479152554
4117	NC_021014	AT	3	6	279452	279457	50 %	50 %	0 %	0 %	479152554
4118	NC_021014	A	6	6	279501	279506	100 %	0 %	0 %	0 %	479152554
4119	NC_021014	TTTGG	2	10	279546	279555	0 %	60 %	40 %	0 %	479152554
4120	NC_021014	ATG	2	6	279576	279581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152554
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4122	NC_021014	TGG	2	6	279651	279656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152554
4123	NC_021014	AAAGG	2	10	279686	279695	60 %	0 %	40 %	0 %	479152554
4124	NC_021014	A	6	6	279726	279731	100 %	0 %	0 %	0 %	479152554
4125	NC_021014	AG	3	6	279737	279742	50 %	0 %	50 %	0 %	479152554
4126	NC_021014	GAA	2	6	279942	279947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152555
4127	NC_021014	TTA	2	6	279965	279970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152555
4128	NC_021014	ATTT	2	8	279991	279998	25 %	75 %	0 %	0 %	479152555
4129	NC_021014	T	7	7	280040	280046	0 %	100 %	0 %	0 %	479152555
4130	NC_021014	CTG	2	6	280051	280056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152555
4131	NC_021014	ATTGCG	2	12	280057	280068	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	479152555
4132	NC_021014	ATG	2	6	280090	280095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152555
4133	NC_021014	TGC	2	6	280163	280168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152555
4134	NC_021014	TAT	2	6	280191	280196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152555
4135	NC_021014	GTTTT	2	10	280202	280211	0 %	80 %	20 %	0 %	479152555
4136	NC_021014	AAAG	2	8	280260	280267	75 %	0 %	25 %	0 %	479152555
4137	NC_021014	ATT	2	6	280300	280305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152555
4138	NC_021014	TTG	2	6	280322	280327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152555
4139	NC_021014	CTT	2	6	280423	280428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152555
4140	NC_021014	GCG	2	6	280448	280453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152555
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4144	NC_021014	T	6	6	280793	280798	0 %	100 %	0 %	0 %	479152556
4145	NC_021014	GTT	2	6	280799	280804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152556
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4154	NC_021014	TGC	2	6	281107	281112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152557
4155	NC_021014	TTCTT	2	10	281187	281196	0 %	80 %	0 %	20 %	479152557
4156	NC_021014	TG	3	6	281202	281207	0 %	50 %	50 %	0 %	479152557
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4162	NC_021014	A	7	7	281525	281531	100 %	0 %	0 %	0 %	479152558
4163	NC_021014	T	6	6	281565	281570	0 %	100 %	0 %	0 %	479152558
4164	NC_021014	GAA	2	6	281622	281627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152558
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4169	NC_021014	AT	3	6	281916	281921	50 %	50 %	0 %	0 %	479152558
4170	NC_021014	CGG	3	9	281977	281985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152558
4171	NC_021014	CAGGG	2	10	282058	282067	20 %	0 %	60 %	20 %	479152558
4172	NC_021014	CGG	2	6	282160	282165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152558
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4189	NC_021014	ACTTT	2	10	283297	283306	20 %	60 %	0 %	20 %	479152560
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4203	NC_021014	AGC	2	6	284072	284077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152561
4204	NC_021014	CTG	2	6	284085	284090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152561
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4221	NC_021014	CTG	2	6	284673	284678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152561
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4224	NC_021014	TTG	2	6	284740	284745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152561
4225	NC_021014	TGA	2	6	284752	284757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152561
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4228	NC_021014	ATG	2	6	284938	284943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152561
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4230	NC_021014	G	6	6	285066	285071	0 %	0 %	100 %	0 %	479152561
4231	NC_021014	GAAA	2	8	285158	285165	75 %	0 %	25 %	0 %	479152561
4232	NC_021014	GAA	2	6	285198	285203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152561
4233	NC_021014	GCG	3	9	285210	285218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152561
4234	NC_021014	CTG	2	6	285227	285232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152561
4235	NC_021014	TGA	2	6	285233	285238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152561
4236	NC_021014	CGG	2	6	285302	285307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152561
4237	NC_021014	ATTGCG	2	12	285321	285332	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	479152561
4238	NC_021014	CTT	2	6	285450	285455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152561
4239	NC_021014	CCA	2	6	285475	285480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479152561
4240	NC_021014	CAGAT	2	10	285490	285499	40 %	20 %	20 %	20 %	479152561
4241	NC_021014	A	6	6	285510	285515	100 %	0 %	0 %	0 %	479152561
4242	NC_021014	TTG	2	6	285549	285554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152561
4243	NC_021014	GAA	2	6	285602	285607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152561
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4245	NC_021014	T	6	6	285713	285718	0 %	100 %	0 %	0 %	479152562
4246	NC_021014	CAG	2	6	285726	285731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152562
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4249	NC_021014	CT	3	6	285877	285882	0 %	50 %	0 %	50 %	479152562
4250	NC_021014	GCGG	2	8	285888	285895	0 %	0 %	75 %	25 %	479152562
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4493	NC_021014	AGT	2	6	302079	302084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152580
4494	NC_021014	TGC	2	6	302109	302114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152580
4495	NC_021014	TGC	2	6	302157	302162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152580
4496	NC_021014	ATT	2	6	302163	302168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152580
4497	NC_021014	ATC	2	6	302219	302224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152580
4498	NC_021014	TGC	2	6	302274	302279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152580
4499	NC_021014	A	7	7	302298	302304	100 %	0 %	0 %	0 %	479152580
4500	NC_021014	A	6	6	302326	302331	100 %	0 %	0 %	0 %	479152580

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