MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 52435

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021014	CGG	3	9	236715	236723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152520
3502	NC_021014	GGC	2	6	236764	236769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152520
3503	NC_021014	GGC	2	6	236857	236862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152520
3504	NC_021014	GGA	2	6	236902	236907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152520
3505	NC_021014	TGC	2	6	236910	236915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152520
3506	NC_021014	GGC	2	6	237049	237054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152520
3507	NC_021014	ATG	2	6	237086	237091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152520
3508	NC_021014	GCG	2	6	237263	237268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152520
3509	NC_021014	GAG	2	6	237313	237318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152520
3510	NC_021014	TGA	2	6	237435	237440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152520
3511	NC_021014	GGA	2	6	237451	237456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152520
3512	NC_021014	CTG	2	6	237596	237601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152520
3513	NC_021014	TGCGG	2	10	237607	237616	0 %	20 %	60 %	20 %	479152520
3514	NC_021014	TGG	2	6	237642	237647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152520
3515	NC_021014	ATGCC	2	10	237657	237666	20 %	20 %	20 %	40 %	479152520
3516	NC_021014	ATC	2	6	237731	237736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152520
3517	NC_021014	TGC	2	6	237823	237828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152520
3518	NC_021014	GAT	2	6	237841	237846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152520
3519	NC_021014	GGC	2	6	237892	237897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152520
3520	NC_021014	TTTA	2	8	237899	237906	25 %	75 %	0 %	0 %	479152520
3521	NC_021014	CGG	2	6	237990	237995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152520
3522	NC_021014	CGG	2	6	238038	238043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152520
3523	NC_021014	TAC	2	6	238108	238113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152520
3524	NC_021014	TGGAA	2	10	238151	238160	40 %	20 %	40 %	0 %	479152520
3525	NC_021014	TCTG	2	8	238211	238218	0 %	50 %	25 %	25 %	479152520
3526	NC_021014	TAC	2	6	238306	238311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152520
3527	NC_021014	TGA	2	6	238314	238319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152520
3528	NC_021014	ATT	2	6	238367	238372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152520
3529	NC_021014	TGGAA	2	10	238415	238424	40 %	20 %	40 %	0 %	479152520
3530	NC_021014	TCT	2	6	238439	238444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152520
3531	NC_021014	GTG	2	6	238445	238450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152520
3532	NC_021014	ATC	2	6	238610	238615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152520
3533	NC_021014	GGC	2	6	238810	238815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152520
3534	NC_021014	TGG	2	6	238839	238844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152520
3535	NC_021014	CGC	2	6	238848	238853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479152520
3536	NC_021014	CAG	2	6	238870	238875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152520
3537	NC_021014	TGA	2	6	238878	238883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152520
3538	NC_021014	GGC	2	6	238930	238935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152520
3539	NC_021014	CAG	2	6	238967	238972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152520
3540	NC_021014	GCT	2	6	239008	239013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152520
3541	NC_021014	CAG	2	6	239036	239041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152520
3542	NC_021014	GAG	2	6	239053	239058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152520
3543	NC_021014	AGAA	2	8	239532	239539	75 %	0 %	25 %	0 %	479152521
3544	NC_021014	AAG	2	6	239595	239600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152521
3545	NC_021014	AAATTG	2	12	239756	239767	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	479152521
3546	NC_021014	GAT	2	6	239870	239875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152522
3547	NC_021014	TGT	2	6	239903	239908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152522
3548	NC_021014	A	7	7	239990	239996	100 %	0 %	0 %	0 %	479152522
3549	NC_021014	GAT	3	9	240030	240038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152522
3550	NC_021014	ATT	2	6	240134	240139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152522
3551	NC_021014	TTTG	2	8	240169	240176	0 %	75 %	25 %	0 %	479152522
3552	NC_021014	TGA	2	6	240251	240256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152522
3553	NC_021014	TGA	2	6	242138	242143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152523
3554	NC_021014	GTC	2	6	242191	242196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152523
3555	NC_021014	TGA	2	6	242207	242212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152523
3556	NC_021014	CCT	2	6	242227	242232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479152523
3557	NC_021014	GAA	2	6	242251	242256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152523
3558	NC_021014	GAT	2	6	242299	242304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152523
3559	NC_021014	A	7	7	242378	242384	100 %	0 %	0 %	0 %	479152523
3560	NC_021014	GATT	2	8	242451	242458	25 %	50 %	25 %	0 %	479152523
3561	NC_021014	AT	3	6	242469	242474	50 %	50 %	0 %	0 %	479152523
3562	NC_021014	TG	3	6	242501	242506	0 %	50 %	50 %	0 %	479152523
3563	NC_021014	CAA	2	6	242598	242603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479152523
3564	NC_021014	TGA	2	6	242655	242660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152523
3565	NC_021014	TGG	2	6	242674	242679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152523
3566	NC_021014	TGA	2	6	242727	242732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152523
3567	NC_021014	AAT	2	6	242806	242811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479152523
3568	NC_021014	GCGAA	2	10	242832	242841	40 %	0 %	40 %	20 %	479152523
3569	NC_021014	ACC	2	6	242888	242893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479152523
3570	NC_021014	AAGA	2	8	242952	242959	75 %	0 %	25 %	0 %	479152523
3571	NC_021014	GAT	2	6	243021	243026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152523
3572	NC_021014	A	6	6	243028	243033	100 %	0 %	0 %	0 %	479152523
3573	NC_021014	ACT	2	6	243042	243047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152523
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3576	NC_021014	ATG	2	6	243146	243151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152523
3577	NC_021014	CAG	2	6	243179	243184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152523
3578	NC_021014	GAA	2	6	243254	243259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152523
3579	NC_021014	GCA	2	6	243265	243270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152523
3580	NC_021014	AGAA	2	8	243276	243283	75 %	0 %	25 %	0 %	479152523
3581	NC_021014	GCT	2	6	243292	243297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152523
3582	NC_021014	AGA	2	6	243316	243321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152523
3583	NC_021014	GAA	2	6	243338	243343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152523
3584	NC_021014	AGAC	2	8	243345	243352	50 %	0 %	25 %	25 %	479152523
3585	NC_021014	AACAG	2	10	243435	243444	60 %	0 %	20 %	20 %	479152523
3586	NC_021014	TTGA	2	8	243484	243491	25 %	50 %	25 %	0 %	479152523
3587	NC_021014	ACG	2	6	243516	243521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152523
3588	NC_021014	GAA	2	6	243530	243535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152523
3589	NC_021014	GAA	2	6	243563	243568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152523
3590	NC_021014	CGA	2	6	243613	243618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152523
3591	NC_021014	ATT	2	6	243706	243711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152523
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3593	NC_021014	CAA	2	6	244773	244778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479152524
3594	NC_021014	AAT	2	6	244795	244800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479152524
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3599	NC_021014	TCT	2	6	245102	245107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152524
3600	NC_021014	CCA	3	9	245114	245122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479152524
3601	NC_021014	A	6	6	245153	245158	100 %	0 %	0 %	0 %	479152524
3602	NC_021014	TGC	2	6	245163	245168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152524
3603	NC_021014	T	6	6	245289	245294	0 %	100 %	0 %	0 %	479152524
3604	NC_021014	ATA	2	6	245307	245312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479152524
3605	NC_021014	TCC	2	6	245440	245445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479152524
3606	NC_021014	GGAA	2	8	245516	245523	50 %	0 %	50 %	0 %	479152524
3607	NC_021014	CAG	2	6	245605	245610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152524
3608	NC_021014	TAG	2	6	245667	245672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152524
3609	NC_021014	AAT	2	6	245691	245696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479152524
3610	NC_021014	AAC	2	6	245945	245950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479152525
3611	NC_021014	TGG	2	6	245986	245991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152525
3612	NC_021014	T	6	6	246000	246005	0 %	100 %	0 %	0 %	479152525
3613	NC_021014	TACT	2	8	246019	246026	25 %	50 %	0 %	25 %	479152525
3614	NC_021014	T	6	6	246026	246031	0 %	100 %	0 %	0 %	479152525
3615	NC_021014	CAG	2	6	246037	246042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152525
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3618	NC_021014	TTG	2	6	246208	246213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152525
3619	NC_021014	A	6	6	246237	246242	100 %	0 %	0 %	0 %	479152525
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3621	NC_021014	AT	3	6	246290	246295	50 %	50 %	0 %	0 %	479152525
3622	NC_021014	TTG	2	6	246304	246309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152525
3623	NC_021014	GGAAC	2	10	246340	246349	40 %	0 %	40 %	20 %	479152525
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3626	NC_021014	TCTTAT	2	12	246556	246567	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	479152526
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3629	NC_021014	TGCG	2	8	246790	246797	0 %	25 %	50 %	25 %	479152526
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3646	NC_021014	TG	3	6	249125	249130	0 %	50 %	50 %	0 %	479152527
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3734	NC_021014	TCTG	2	8	254198	254205	0 %	50 %	25 %	25 %	479152531
3735	NC_021014	GGA	2	6	254283	254288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152531
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3739	NC_021014	GGCT	2	8	254380	254387	0 %	25 %	50 %	25 %	479152531
3740	NC_021014	GCT	2	6	254423	254428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152531
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3743	NC_021014	GTT	2	6	254580	254585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152531
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3866	NC_021014	GAT	2	6	261946	261951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152538
3867	NC_021014	GCT	2	6	261996	262001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152538
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3872	NC_021014	AGTC	2	8	262113	262120	25 %	25 %	25 %	25 %	479152538
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3971	NC_021014	T	7	7	268068	268074	0 %	100 %	0 %	0 %	479152547
3972	NC_021014	TTGA	2	8	268135	268142	25 %	50 %	25 %	0 %	479152547
3973	NC_021014	ACC	2	6	268170	268175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479152547
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3975	NC_021014	TA	3	6	268300	268305	50 %	50 %	0 %	0 %	479152547
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3982	NC_021014	A	6	6	268600	268605	100 %	0 %	0 %	0 %	479152547
3983	NC_021014	GGC	2	6	268614	268619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152547
3984	NC_021014	GA	3	6	268691	268696	50 %	0 %	50 %	0 %	479152547
3985	NC_021014	ATG	2	6	268706	268711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152547
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3987	NC_021014	TGC	2	6	268802	268807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152547
3988	NC_021014	TGG	2	6	268854	268859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152547
3989	NC_021014	TGA	2	6	268890	268895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152547
3990	NC_021014	TAT	2	6	268971	268976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152547
3991	NC_021014	TAC	2	6	269046	269051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152547
3992	NC_021014	TGG	2	6	269061	269066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152547
3993	NC_021014	GAG	2	6	269145	269150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152547
3994	NC_021014	TGA	2	6	269198	269203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152547
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3997	NC_021014	GTG	2	6	269255	269260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152547
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4000	NC_021014	T	6	6	269558	269563	0 %	100 %	0 %	0 %	479152548

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