MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 52435

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021014	AAAG	2	8	65196	65203	75 %	0 %	25 %	0 %	479152357
1002	NC_021014	T	6	6	65295	65300	0 %	100 %	0 %	0 %	479152357
1003	NC_021014	ATCT	2	8	65335	65342	25 %	50 %	0 %	25 %	479152358
1004	NC_021014	AAACAG	2	12	65347	65358	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	479152358
1005	NC_021014	GAA	2	6	65370	65375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152358
1006	NC_021014	TGA	2	6	65460	65465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152358
1007	NC_021014	AG	3	6	65540	65545	50 %	0 %	50 %	0 %	479152358
1008	NC_021014	GAT	2	6	65611	65616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152358
1009	NC_021014	GAA	2	6	65652	65657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152358
1010	NC_021014	GAA	2	6	65679	65684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152358
1011	NC_021014	CAT	2	6	65749	65754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152358
1012	NC_021014	CGG	2	6	65763	65768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152358
1013	NC_021014	TCT	2	6	65844	65849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152358
1014	NC_021014	CTT	2	6	65863	65868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152358
1015	NC_021014	ATG	2	6	65870	65875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152358
1016	NC_021014	ATGA	2	8	65908	65915	50 %	25 %	25 %	0 %	479152358
1017	NC_021014	CTT	2	6	65935	65940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152358
1018	NC_021014	CAT	2	6	66043	66048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152358
1019	NC_021014	A	6	6	66172	66177	100 %	0 %	0 %	0 %	479152358
1020	NC_021014	AAG	2	6	66216	66221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152358
1021	NC_021014	ATC	2	6	66376	66381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152359
1022	NC_021014	A	6	6	66387	66392	100 %	0 %	0 %	0 %	479152359
1023	NC_021014	CTATGG	2	12	66396	66407	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	479152359
1024	NC_021014	GGA	2	6	66478	66483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152359
1025	NC_021014	AGC	3	9	66509	66517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152359
1026	NC_021014	A	6	6	66648	66653	100 %	0 %	0 %	0 %	479152359
1027	NC_021014	ATC	2	6	66667	66672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152359
1028	NC_021014	GAA	2	6	66689	66694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152359
1029	NC_021014	CAT	2	6	66702	66707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152359
1030	NC_021014	AGATG	2	10	66861	66870	40 %	20 %	40 %	0 %	479152359
1031	NC_021014	GTCT	2	8	66874	66881	0 %	50 %	25 %	25 %	479152359
1032	NC_021014	TAA	2	6	66972	66977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479152359
1033	NC_021014	A	6	6	66976	66981	100 %	0 %	0 %	0 %	479152359
1034	NC_021014	CCT	2	6	67014	67019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479152359
1035	NC_021014	TA	3	6	67033	67038	50 %	50 %	0 %	0 %	479152359
1036	NC_021014	TC	3	6	67070	67075	0 %	50 %	0 %	50 %	479152359
1037	NC_021014	AG	3	6	67270	67275	50 %	0 %	50 %	0 %	479152359
1038	NC_021014	T	6	6	67309	67314	0 %	100 %	0 %	0 %	479152359
1039	NC_021014	TGC	2	6	67334	67339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152359
1040	NC_021014	GAA	2	6	67353	67358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152359
1041	NC_021014	TGA	2	6	67407	67412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152359
1042	NC_021014	TG	3	6	67505	67510	0 %	50 %	50 %	0 %	479152359
1043	NC_021014	GGA	2	6	67512	67517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152359
1044	NC_021014	CTA	2	6	67538	67543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152359
1045	NC_021014	TG	3	6	67578	67583	0 %	50 %	50 %	0 %	479152359
1046	NC_021014	AAAAT	2	10	67596	67605	80 %	20 %	0 %	0 %	479152359
1047	NC_021014	GAT	2	6	67882	67887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152360
1048	NC_021014	ATT	2	6	67896	67901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152360
1049	NC_021014	AG	4	8	67930	67937	50 %	0 %	50 %	0 %	479152360
1050	NC_021014	AT	3	6	67995	68000	50 %	50 %	0 %	0 %	479152360
1051	NC_021014	TCT	2	6	68014	68019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152360
1052	NC_021014	TGAA	2	8	68025	68032	50 %	25 %	25 %	0 %	479152360
1053	NC_021014	GAT	2	6	68111	68116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152360
1054	NC_021014	ATC	2	6	68127	68132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152360
1055	NC_021014	TTG	2	6	68211	68216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152360
1056	NC_021014	ATT	3	9	68227	68235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152360
1057	NC_021014	A	6	6	68256	68261	100 %	0 %	0 %	0 %	479152360
1058	NC_021014	AT	3	6	68265	68270	50 %	50 %	0 %	0 %	479152360
1059	NC_021014	TGA	2	6	71017	71022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152361
1060	NC_021014	AAG	2	6	71042	71047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152361
1061	NC_021014	GCA	2	6	71249	71254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152362
1062	NC_021014	GCC	2	6	71266	71271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479152362
1063	NC_021014	ATTTAT	2	12	71299	71310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152362
1064	NC_021014	ACG	2	6	71318	71323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152362
1065	NC_021014	TAAC	2	8	71340	71347	50 %	25 %	0 %	25 %	479152362
1066	NC_021014	GAT	2	6	71377	71382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152362
1067	NC_021014	CCG	2	6	71394	71399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479152362
1068	NC_021014	A	6	6	71401	71406	100 %	0 %	0 %	0 %	479152362
1069	NC_021014	AATA	2	8	71428	71435	75 %	25 %	0 %	0 %	479152362
1070	NC_021014	ATTC	2	8	71454	71461	25 %	50 %	0 %	25 %	479152362
1071	NC_021014	TGA	2	6	71616	71621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152363
1072	NC_021014	AGT	2	6	71644	71649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152363
1073	NC_021014	AGC	2	6	71667	71672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152363
1074	NC_021014	ATC	2	6	71746	71751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152364
1075	NC_021014	CAG	2	6	71778	71783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152364
1076	NC_021014	CAT	2	6	71808	71813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152364
1077	NC_021014	TCT	2	6	71817	71822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152364
1078	NC_021014	AGGAT	2	10	71930	71939	40 %	20 %	40 %	0 %	479152364
1079	NC_021014	TTGCAT	2	12	71973	71984	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	479152364
1080	NC_021014	AAG	2	6	71990	71995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152364
1081	NC_021014	CTTCAC	2	12	72102	72113	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	479152364
1082	NC_021014	AGC	2	6	72130	72135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152364
1083	NC_021014	CTCCAC	2	12	72242	72253	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	479152364
1084	NC_021014	CTTG	2	8	72299	72306	0 %	50 %	25 %	25 %	479152365
1085	NC_021014	AAG	2	6	72320	72325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152365
1086	NC_021014	AGC	2	6	72413	72418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152365
1087	NC_021014	CTC	2	6	72451	72456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479152365
1088	NC_021014	CTG	2	6	72461	72466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152365
1089	NC_021014	AGC	2	6	72494	72499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152365
1090	NC_021014	GGC	2	6	72500	72505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152365
1091	NC_021014	AAT	2	6	74642	74647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479152366
1092	NC_021014	CTG	2	6	74738	74743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152366
1093	NC_021014	TA	3	6	74790	74795	50 %	50 %	0 %	0 %	479152366
1094	NC_021014	GTC	2	6	74808	74813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152366
1095	NC_021014	GAA	2	6	74816	74821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152366
1096	NC_021014	AAAT	2	8	74841	74848	75 %	25 %	0 %	0 %	479152366
1097	NC_021014	TACT	2	8	74889	74896	25 %	50 %	0 %	25 %	479152366
1098	NC_021014	TGA	2	6	74905	74910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152366
1099	NC_021014	ATTTT	2	10	74939	74948	20 %	80 %	0 %	0 %	479152366
1100	NC_021014	AGA	2	6	75049	75054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152367
1101	NC_021014	TGG	2	6	75069	75074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152367
1102	NC_021014	TTGC	2	8	75085	75092	0 %	50 %	25 %	25 %	479152367
1103	NC_021014	GCT	2	6	75104	75109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152367
1104	NC_021014	CAT	2	6	75157	75162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152367
1105	NC_021014	GAT	2	6	75190	75195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152367
1106	NC_021014	GAA	2	6	75300	75305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152367
1107	NC_021014	TAT	2	6	75378	75383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152368
1108	NC_021014	GAT	2	6	75393	75398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152368
1109	NC_021014	ATT	2	6	75428	75433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152368
1110	NC_021014	GTT	2	6	75525	75530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152368
1111	NC_021014	TTG	2	6	75631	75636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152368
1112	NC_021014	GAT	2	6	75687	75692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152368
1113	NC_021014	AAG	2	6	75738	75743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152368
1114	NC_021014	CTT	2	6	75854	75859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152368
1115	NC_021014	TAA	3	9	75866	75874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479152368
1116	NC_021014	ATT	2	6	75911	75916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152368
1117	NC_021014	TAT	2	6	75935	75940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152368
1118	NC_021014	ATG	2	6	76006	76011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152368
1119	NC_021014	CTA	2	6	76126	76131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152368
1120	NC_021014	AT	3	6	76185	76190	50 %	50 %	0 %	0 %	479152368
1121	NC_021014	CGA	2	6	76201	76206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152368
1122	NC_021014	TCT	2	6	76208	76213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152368
1123	NC_021014	GTG	2	6	76354	76359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152368
1124	NC_021014	A	6	6	76376	76381	100 %	0 %	0 %	0 %	479152368
1125	NC_021014	AAT	2	6	76410	76415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479152368
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1485	NC_021014	GCTGAT	2	12	101764	101775	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	479152389
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1488	NC_021014	CTGTA	2	10	101855	101864	20 %	40 %	20 %	20 %	479152389
1489	NC_021014	TTCG	2	8	101877	101884	0 %	50 %	25 %	25 %	479152389
1490	NC_021014	AAG	2	6	101975	101980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152389
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1493	NC_021014	A	6	6	102178	102183	100 %	0 %	0 %	0 %	479152390
1494	NC_021014	AAAT	2	8	103646	103653	75 %	25 %	0 %	0 %	479152391
1495	NC_021014	A	6	6	103739	103744	100 %	0 %	0 %	0 %	479152391
1496	NC_021014	TGA	2	6	103803	103808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152391
1497	NC_021014	TAC	2	6	103839	103844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152391
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1499	NC_021014	ATCATG	2	12	103863	103874	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	479152391
1500	NC_021014	ATG	2	6	103896	103901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152391

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