MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 52435

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021014	GCA	2	6	31544	31549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152330
502	NC_021014	ATG	2	6	31558	31563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152330
503	NC_021014	ATC	2	6	31575	31580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152330
504	NC_021014	CA	3	6	31583	31588	50 %	0 %	0 %	50 %	479152330
505	NC_021014	CCATT	2	10	31598	31607	20 %	40 %	0 %	40 %	479152330
506	NC_021014	TCT	2	6	31616	31621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152330
507	NC_021014	GAT	2	6	31644	31649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152330
508	NC_021014	GGA	2	6	31670	31675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152330
509	NC_021014	AG	3	6	31714	31719	50 %	0 %	50 %	0 %	479152330
510	NC_021014	ATGTC	2	10	31720	31729	20 %	40 %	20 %	20 %	479152330
511	NC_021014	CGG	2	6	31775	31780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152330
512	NC_021014	CACGG	2	10	31896	31905	20 %	0 %	40 %	40 %	479152330
513	NC_021014	GAT	2	6	31980	31985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152330
514	NC_021014	ATCT	2	8	31992	31999	25 %	50 %	0 %	25 %	479152330
515	NC_021014	CAT	2	6	32036	32041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152330
516	NC_021014	ATG	2	6	32101	32106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152330
517	NC_021014	ATG	2	6	32181	32186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152330
518	NC_021014	CGTAT	2	10	32188	32197	20 %	40 %	20 %	20 %	479152330
519	NC_021014	TTA	2	6	32228	32233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152330
520	NC_021014	GCA	2	6	32235	32240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152330
521	NC_021014	A	6	6	32328	32333	100 %	0 %	0 %	0 %	479152330
522	NC_021014	AAG	2	6	32349	32354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152330
523	NC_021014	CGAT	2	8	32422	32429	25 %	25 %	25 %	25 %	479152330
524	NC_021014	AAGGCA	2	12	32436	32447	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	479152330
525	NC_021014	ATC	2	6	32460	32465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152330
526	NC_021014	GCA	2	6	32517	32522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152330
527	NC_021014	TGC	2	6	32537	32542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152330
528	NC_021014	GAT	2	6	32568	32573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152330
529	NC_021014	GATG	2	8	32615	32622	25 %	25 %	50 %	0 %	479152330
530	NC_021014	AT	3	6	32687	32692	50 %	50 %	0 %	0 %	479152330
531	NC_021014	TTC	2	6	32951	32956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152331
532	NC_021014	A	6	6	32979	32984	100 %	0 %	0 %	0 %	479152331
533	NC_021014	GAT	2	6	32989	32994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152331
534	NC_021014	TAT	2	6	33049	33054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152331
535	NC_021014	A	7	7	33078	33084	100 %	0 %	0 %	0 %	479152331
536	NC_021014	GAA	2	6	33088	33093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152331
537	NC_021014	GAG	2	6	33217	33222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152331
538	NC_021014	AAG	2	6	33254	33259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152331
539	NC_021014	TTG	2	6	33347	33352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152331
540	NC_021014	ATC	2	6	33356	33361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152331
541	NC_021014	TCA	2	6	33407	33412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152331
542	NC_021014	TGA	2	6	33422	33427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152331
543	NC_021014	ATG	2	6	33461	33466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152331
544	NC_021014	GCT	2	6	33481	33486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152331
545	NC_021014	GGAT	2	8	33558	33565	25 %	25 %	50 %	0 %	479152331
546	NC_021014	GAT	2	6	33616	33621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152331
547	NC_021014	GAA	2	6	33673	33678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152331
548	NC_021014	CCG	2	6	33744	33749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479152331
549	NC_021014	GTT	2	6	33776	33781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152331
550	NC_021014	GATC	2	8	33792	33799	25 %	25 %	25 %	25 %	479152331
551	NC_021014	CGGA	2	8	33824	33831	25 %	0 %	50 %	25 %	479152331
552	NC_021014	CTA	2	6	33863	33868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152331
553	NC_021014	TAC	2	6	33894	33899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152331
554	NC_021014	CTT	2	6	33973	33978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152331
555	NC_021014	TCT	2	6	34017	34022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152331
556	NC_021014	AAG	2	6	34064	34069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152331
557	NC_021014	ACC	2	6	34240	34245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479152331
558	NC_021014	TTATT	2	10	34254	34263	20 %	80 %	0 %	0 %	479152331
559	NC_021014	CTA	2	6	34299	34304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152331
560	NC_021014	TCT	2	6	34308	34313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152331
561	NC_021014	TGT	2	6	34326	34331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152331
562	NC_021014	GAT	2	6	34333	34338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152331
563	NC_021014	CAT	2	6	34377	34382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152331
564	NC_021014	GA	3	6	34415	34420	50 %	0 %	50 %	0 %	479152331
565	NC_021014	CGG	2	6	34458	34463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152331
566	NC_021014	GAA	2	6	34567	34572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152331
567	NC_021014	GATACC	2	12	34648	34659	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	479152331
568	NC_021014	AAGGA	2	10	34672	34681	60 %	0 %	40 %	0 %	479152331
569	NC_021014	ATC	2	6	34723	34728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152331
570	NC_021014	A	6	6	34735	34740	100 %	0 %	0 %	0 %	479152331
571	NC_021014	A	6	6	34809	34814	100 %	0 %	0 %	0 %	479152332
572	NC_021014	AGA	2	6	34819	34824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152332
573	NC_021014	A	7	7	34824	34830	100 %	0 %	0 %	0 %	479152332
574	NC_021014	GGGA	2	8	34884	34891	25 %	0 %	75 %	0 %	479152332
575	NC_021014	AAC	2	6	34928	34933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479152332
576	NC_021014	AG	3	6	34936	34941	50 %	0 %	50 %	0 %	479152332
577	NC_021014	GCA	2	6	34990	34995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152332
578	NC_021014	CGAT	2	8	35117	35124	25 %	25 %	25 %	25 %	479152332
579	NC_021014	AG	3	6	35165	35170	50 %	0 %	50 %	0 %	479152332
580	NC_021014	CA	3	6	35235	35240	50 %	0 %	0 %	50 %	479152332
581	NC_021014	GTTT	2	8	35283	35290	0 %	75 %	25 %	0 %	479152332
582	NC_021014	GTG	2	6	35300	35305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152332
583	NC_021014	TAT	2	6	35373	35378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152332
584	NC_021014	GAA	2	6	35419	35424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152332
585	NC_021014	TTC	2	6	35493	35498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152332
586	NC_021014	TGA	2	6	35499	35504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152332
587	NC_021014	AGA	2	6	35511	35516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152332
588	NC_021014	GAA	3	9	35536	35544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152332
589	NC_021014	TAT	2	6	35548	35553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152332
590	NC_021014	T	7	7	35678	35684	0 %	100 %	0 %	0 %	479152333
591	NC_021014	CGA	2	6	35699	35704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152333
592	NC_021014	TAA	2	6	35725	35730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479152333
593	NC_021014	CTGA	2	8	35799	35806	25 %	25 %	25 %	25 %	479152333
594	NC_021014	GAA	2	6	35810	35815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152333
595	NC_021014	TC	3	6	35827	35832	0 %	50 %	0 %	50 %	479152333
596	NC_021014	T	7	7	36085	36091	0 %	100 %	0 %	0 %	479152334
597	NC_021014	TTTG	2	8	36108	36115	0 %	75 %	25 %	0 %	479152334
598	NC_021014	CAG	2	6	36128	36133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152334
599	NC_021014	CTT	2	6	36194	36199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152334
600	NC_021014	GA	3	6	36231	36236	50 %	0 %	50 %	0 %	479152334
601	NC_021014	AAC	2	6	36268	36273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479152334
602	NC_021014	CCA	2	6	36286	36291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479152334
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606	NC_021014	ATTAT	2	10	37757	37766	40 %	60 %	0 %	0 %	479152335
607	NC_021014	GAT	2	6	37782	37787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152335
608	NC_021014	ACGG	2	8	37834	37841	25 %	0 %	50 %	25 %	479152335
609	NC_021014	GGC	2	6	37904	37909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152335
610	NC_021014	GGT	2	6	37947	37952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152335
611	NC_021014	CAG	2	6	38006	38011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152335
612	NC_021014	A	7	7	38035	38041	100 %	0 %	0 %	0 %	479152335
613	NC_021014	ATC	2	6	38049	38054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152335
614	NC_021014	ATT	2	6	38089	38094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152335
615	NC_021014	ATC	2	6	38112	38117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152335
616	NC_021014	TGG	2	6	38143	38148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152335
617	NC_021014	AAAAG	2	10	38153	38162	80 %	0 %	20 %	0 %	479152335
618	NC_021014	ATG	2	6	38236	38241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152335
619	NC_021014	ACG	2	6	38272	38277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152335
620	NC_021014	A	7	7	38334	38340	100 %	0 %	0 %	0 %	479152335
621	NC_021014	A	6	6	38355	38360	100 %	0 %	0 %	0 %	479152335
622	NC_021014	TAG	2	6	38643	38648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152336
623	NC_021014	CTT	2	6	38810	38815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152336
624	NC_021014	A	7	7	38836	38842	100 %	0 %	0 %	0 %	479152336
625	NC_021014	ATCT	2	8	38852	38859	25 %	50 %	0 %	25 %	479152336
626	NC_021014	CTGACC	2	12	38865	38876	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	479152336
627	NC_021014	CAG	2	6	38970	38975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152336
628	NC_021014	CAG	2	6	39029	39034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152336
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663	NC_021014	CGAT	2	8	41174	41181	25 %	25 %	25 %	25 %	479152338
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740	NC_021014	GGTATC	2	12	44755	44766	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	479152342
741	NC_021014	AGA	2	6	44799	44804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152342
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751	NC_021014	ACA	2	6	45469	45474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479152342
752	NC_021014	GTT	2	6	45478	45483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152342
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1000	NC_021014	TTG	2	6	64983	64988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152356

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