MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 52435

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_021014	TGATC	2	10	377911	377920	20 %	40 %	20 %	20 %	479152640
5502	NC_021014	TAT	2	6	377966	377971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152640
5503	NC_021014	TCA	2	6	377989	377994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152640
5504	NC_021014	TC	3	6	378006	378011	0 %	50 %	0 %	50 %	479152640
5505	NC_021014	GCA	2	6	378071	378076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152640
5506	NC_021014	AGA	2	6	378082	378087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152640
5507	NC_021014	GAG	2	6	378101	378106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152640
5508	NC_021014	CTT	2	6	378187	378192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152640
5509	NC_021014	GGT	2	6	378215	378220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152640
5510	NC_021014	GT	3	6	378223	378228	0 %	50 %	50 %	0 %	479152640
5511	NC_021014	GCG	2	6	378447	378452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152640
5512	NC_021014	CGG	2	6	378478	378483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152640
5513	NC_021014	AG	3	6	378574	378579	50 %	0 %	50 %	0 %	479152640
5514	NC_021014	GAA	2	6	378592	378597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152641
5515	NC_021014	TGC	2	6	378615	378620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152641
5516	NC_021014	TTC	2	6	378644	378649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152641
5517	NC_021014	CGG	2	6	378727	378732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152641
5518	NC_021014	GCA	2	6	378805	378810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152641
5519	NC_021014	CAGTA	2	10	378821	378830	40 %	20 %	20 %	20 %	479152641
5520	NC_021014	GAA	2	6	378911	378916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152641
5521	NC_021014	CAGA	2	8	378950	378957	50 %	0 %	25 %	25 %	479152641
5522	NC_021014	ACA	2	6	378980	378985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479152641
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5524	NC_021014	TGT	2	6	379048	379053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152641
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5526	NC_021014	CAGT	2	8	379128	379135	25 %	25 %	25 %	25 %	479152641
5527	NC_021014	GAG	2	6	379250	379255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152641
5528	NC_021014	CGG	2	6	379261	379266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152641
5529	NC_021014	AGA	2	6	379297	379302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152641
5530	NC_021014	CTT	2	6	379317	379322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152641
5531	NC_021014	TGC	2	6	379378	379383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152641
5532	NC_021014	GAA	2	6	379394	379399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152641
5533	NC_021014	CAA	2	6	379407	379412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479152641
5534	NC_021014	TGATCA	2	12	379452	379463	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	479152641
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5539	NC_021014	TGGCT	2	10	379757	379766	0 %	40 %	40 %	20 %	479152641
5540	NC_021014	TTA	2	6	379851	379856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152641
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5542	NC_021014	CGG	2	6	380053	380058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152641
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5544	NC_021014	GGA	2	6	380248	380253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152641
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5555	NC_021014	TGG	2	6	380752	380757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152641
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5589	NC_021014	GAA	2	6	383857	383862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152644
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5592	NC_021014	CT	3	6	383970	383975	0 %	50 %	0 %	50 %	479152644
5593	NC_021014	ATC	2	6	383984	383989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152644
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5607	NC_021014	ACA	2	6	384749	384754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479152644
5608	NC_021014	CA	3	6	385231	385236	50 %	0 %	0 %	50 %	479152644
5609	NC_021014	AAGA	2	8	385265	385272	75 %	0 %	25 %	0 %	479152644
5610	NC_021014	GAAG	2	8	385276	385283	50 %	0 %	50 %	0 %	479152644
5611	NC_021014	ATA	2	6	385284	385289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479152644
5612	NC_021014	AT	3	6	385349	385354	50 %	50 %	0 %	0 %	479152644
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5620	NC_021014	AAGAGG	2	12	385669	385680	50 %	0 %	50 %	0 %	479152644
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