MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 52435

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021014	CGT	2	6	340414	340419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152602
5002	NC_021014	GCG	2	6	340425	340430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152602
5003	NC_021014	AATG	2	8	340501	340508	50 %	25 %	25 %	0 %	479152602
5004	NC_021014	TC	3	6	340744	340749	0 %	50 %	0 %	50 %	479152602
5005	NC_021014	CGG	2	6	340750	340755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152602
5006	NC_021014	A	6	6	340764	340769	100 %	0 %	0 %	0 %	479152602
5007	NC_021014	CAT	2	6	340789	340794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152602
5008	NC_021014	CTA	2	6	340924	340929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152602
5009	NC_021014	AG	3	6	341025	341030	50 %	0 %	50 %	0 %	479152602
5010	NC_021014	GCC	2	6	341071	341076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479152602
5011	NC_021014	ATC	2	6	341198	341203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152602
5012	NC_021014	AAT	2	6	341207	341212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479152602
5013	NC_021014	GGTGA	2	10	341267	341276	20 %	20 %	60 %	0 %	479152602
5014	NC_021014	AGAC	2	8	341305	341312	50 %	0 %	25 %	25 %	479152602
5015	NC_021014	GGA	3	9	341395	341403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152602
5016	NC_021014	AGAC	2	8	341458	341465	50 %	0 %	25 %	25 %	479152602
5017	NC_021014	CGG	2	6	341482	341487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152602
5018	NC_021014	AGC	2	6	341493	341498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152602
5019	NC_021014	T	6	6	341543	341548	0 %	100 %	0 %	0 %	479152602
5020	NC_021014	GCT	2	6	341659	341664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152602
5021	NC_021014	TTG	2	6	341671	341676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152602
5022	NC_021014	CAT	2	6	341707	341712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152602
5023	NC_021014	A	6	6	341745	341750	100 %	0 %	0 %	0 %	479152602
5024	NC_021014	GAAG	2	8	341787	341794	50 %	0 %	50 %	0 %	479152602
5025	NC_021014	AAAG	2	8	341796	341803	75 %	0 %	25 %	0 %	479152603
5026	NC_021014	ATGGGG	2	12	341823	341834	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	479152603
5027	NC_021014	TAT	2	6	341865	341870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152603
5028	NC_021014	GTT	2	6	342013	342018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152603
5029	NC_021014	CA	3	6	342046	342051	50 %	0 %	0 %	50 %	479152603
5030	NC_021014	TCCG	2	8	342135	342142	0 %	25 %	25 %	50 %	479152603
5031	NC_021014	ACG	2	6	342154	342159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152603
5032	NC_021014	TTG	2	6	342161	342166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152603
5033	NC_021014	GTG	2	6	342304	342309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152603
5034	NC_021014	CCG	2	6	342326	342331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479152603
5035	NC_021014	AGGC	2	8	342371	342378	25 %	0 %	50 %	25 %	479152603
5036	NC_021014	AT	3	6	342405	342410	50 %	50 %	0 %	0 %	479152603
5037	NC_021014	GGT	2	6	342423	342428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152603
5038	NC_021014	CCG	2	6	342446	342451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479152603
5039	NC_021014	A	6	6	342460	342465	100 %	0 %	0 %	0 %	479152603
5040	NC_021014	ACT	2	6	342494	342499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152603
5041	NC_021014	ATT	2	6	342670	342675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152603
5042	NC_021014	CCTTTA	2	12	342680	342691	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	479152603
5043	NC_021014	GAA	2	6	342724	342729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152603
5044	NC_021014	CAGC	2	8	342732	342739	25 %	0 %	25 %	50 %	479152603
5045	NC_021014	GAA	2	6	342751	342756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152603
5046	NC_021014	ACA	2	6	342835	342840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479152603
5047	NC_021014	ATG	2	6	342851	342856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152603
5048	NC_021014	TCCGGC	2	12	342904	342915	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	479152603
5049	NC_021014	GCA	2	6	342965	342970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152603
5050	NC_021014	CGG	2	6	342978	342983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152603
5051	NC_021014	GCAG	2	8	343122	343129	25 %	0 %	50 %	25 %	479152603
5052	NC_021014	CAAA	2	8	343131	343138	75 %	0 %	0 %	25 %	479152603
5053	NC_021014	CGG	2	6	343215	343220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152603
5054	NC_021014	TTG	2	6	343394	343399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152603
5055	NC_021014	GCT	2	6	343461	343466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152603
5056	NC_021014	A	7	7	343560	343566	100 %	0 %	0 %	0 %	479152604
5057	NC_021014	GCAG	2	8	343578	343585	25 %	0 %	50 %	25 %	479152604
5058	NC_021014	AAG	2	6	343587	343592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152604
5059	NC_021014	A	7	7	343601	343607	100 %	0 %	0 %	0 %	479152604
5060	NC_021014	GCC	2	6	343656	343661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479152604
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5062	NC_021014	TGG	2	6	343810	343815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152604
5063	NC_021014	CAA	2	6	343871	343876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479152604
5064	NC_021014	CAA	2	6	343909	343914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479152604
5065	NC_021014	CAG	2	6	343936	343941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152604
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5067	NC_021014	GCG	3	9	344061	344069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152604
5068	NC_021014	CA	4	8	344115	344122	50 %	0 %	0 %	50 %	479152604
5069	NC_021014	TGT	2	6	344294	344299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152604
5070	NC_021014	CTGG	2	8	344342	344349	0 %	25 %	50 %	25 %	479152604
5071	NC_021014	CTT	2	6	344392	344397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152604
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5076	NC_021014	TGA	2	6	344758	344763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152604
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5088	NC_021014	TAT	2	6	345448	345453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152605
5089	NC_021014	A	6	6	345507	345512	100 %	0 %	0 %	0 %	479152605
5090	NC_021014	CTT	2	6	345529	345534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152605
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5092	NC_021014	TGCC	2	8	345586	345593	0 %	25 %	25 %	50 %	479152605
5093	NC_021014	GCA	2	6	346044	346049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152606
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5095	NC_021014	AGGA	2	8	346191	346198	50 %	0 %	50 %	0 %	479152606
5096	NC_021014	TCAGA	2	10	346248	346257	40 %	20 %	20 %	20 %	479152606
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5099	NC_021014	ATC	2	6	346324	346329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152606
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5101	NC_021014	GCT	2	6	346575	346580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152607
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5103	NC_021014	GAT	2	6	346705	346710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152608
5104	NC_021014	AG	3	6	346807	346812	50 %	0 %	50 %	0 %	479152608
5105	NC_021014	TGA	2	6	346841	346846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152608
5106	NC_021014	ATGG	2	8	346855	346862	25 %	25 %	50 %	0 %	479152608
5107	NC_021014	GAA	2	6	346876	346881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152608
5108	NC_021014	CGC	2	6	347032	347037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479152608
5109	NC_021014	ATC	2	6	347051	347056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152608
5110	NC_021014	TAC	2	6	347121	347126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152608
5111	NC_021014	ATTTG	2	10	347160	347169	20 %	60 %	20 %	0 %	479152608
5112	NC_021014	CAG	2	6	347212	347217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152608
5113	NC_021014	GAA	2	6	347239	347244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152608
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5116	NC_021014	TA	3	6	347326	347331	50 %	50 %	0 %	0 %	479152608
5117	NC_021014	TAA	2	6	347361	347366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479152608
5118	NC_021014	TGT	2	6	347417	347422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152609
5119	NC_021014	TCGTTC	2	12	347440	347451	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	479152609
5120	NC_021014	A	6	6	347459	347464	100 %	0 %	0 %	0 %	479152609
5121	NC_021014	CAA	2	6	347535	347540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479152610
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5123	NC_021014	AACC	2	8	347629	347636	50 %	0 %	0 %	50 %	479152610
5124	NC_021014	ATG	2	6	347661	347666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152610
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5127	NC_021014	GAT	2	6	347741	347746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152610
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5243	NC_021014	AT	3	6	356779	356784	50 %	50 %	0 %	0 %	479152619
5244	NC_021014	AAGA	2	8	356814	356821	75 %	0 %	25 %	0 %	479152619
5245	NC_021014	AGA	2	6	356854	356859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152619
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5495	NC_021014	AAG	2	6	377410	377415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152639
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5499	NC_021014	TGT	2	6	377836	377841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152640
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