MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 52435

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_021014	TCT	2	6	302343	302348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152580
4502	NC_021014	TTAC	2	8	302425	302432	25 %	50 %	0 %	25 %	479152580
4503	NC_021014	ACT	2	6	302437	302442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152580
4504	NC_021014	CCT	2	6	302494	302499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479152580
4505	NC_021014	GAA	2	6	302503	302508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152580
4506	NC_021014	GAG	2	6	302512	302517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152580
4507	NC_021014	AG	3	6	302526	302531	50 %	0 %	50 %	0 %	479152580
4508	NC_021014	ACA	2	6	302564	302569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479152580
4509	NC_021014	GGT	2	6	302580	302585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152580
4510	NC_021014	TGC	2	6	302651	302656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152580
4511	NC_021014	GAT	2	6	302683	302688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152580
4512	NC_021014	A	6	6	302724	302729	100 %	0 %	0 %	0 %	479152580
4513	NC_021014	CT	3	6	302769	302774	0 %	50 %	0 %	50 %	479152580
4514	NC_021014	AGA	2	6	302787	302792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152580
4515	NC_021014	GTT	2	6	302800	302805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152580
4516	NC_021014	AG	3	6	302824	302829	50 %	0 %	50 %	0 %	479152580
4517	NC_021014	TAT	2	6	302836	302841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152580
4518	NC_021014	AGA	2	6	302856	302861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152580
4519	NC_021014	CAA	2	6	302885	302890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479152580
4520	NC_021014	TTAT	2	8	302900	302907	25 %	75 %	0 %	0 %	479152580
4521	NC_021014	GGTGA	2	10	302965	302974	20 %	20 %	60 %	0 %	479152580
4522	NC_021014	TGC	2	6	303006	303011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152580
4523	NC_021014	A	6	6	303013	303018	100 %	0 %	0 %	0 %	479152580
4524	NC_021014	GGA	2	6	303066	303071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152580
4525	NC_021014	CT	3	6	303120	303125	0 %	50 %	0 %	50 %	479152580
4526	NC_021014	ATTT	2	8	303255	303262	25 %	75 %	0 %	0 %	479152580
4527	NC_021014	ATT	2	6	303373	303378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152580
4528	NC_021014	A	6	6	303416	303421	100 %	0 %	0 %	0 %	479152580
4529	NC_021014	TAAA	2	8	303475	303482	75 %	25 %	0 %	0 %	479152581
4530	NC_021014	GA	3	6	303490	303495	50 %	0 %	50 %	0 %	479152581
4531	NC_021014	AAT	2	6	303497	303502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479152581
4532	NC_021014	GTA	2	6	303543	303548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152581
4533	NC_021014	TGG	2	6	303596	303601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152581
4534	NC_021014	TAAAA	2	10	303659	303668	80 %	20 %	0 %	0 %	479152581
4535	NC_021014	T	6	6	303672	303677	0 %	100 %	0 %	0 %	479152581
4536	NC_021014	A	6	6	303756	303761	100 %	0 %	0 %	0 %	479152581
4537	NC_021014	AAG	2	6	303787	303792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152581
4538	NC_021014	A	6	6	303828	303833	100 %	0 %	0 %	0 %	479152581
4539	NC_021014	GGT	2	6	303849	303854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152581
4540	NC_021014	AAC	2	6	303856	303861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479152581
4541	NC_021014	AG	3	6	303862	303867	50 %	0 %	50 %	0 %	479152581
4542	NC_021014	ATG	2	6	303885	303890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152581
4543	NC_021014	A	6	6	303891	303896	100 %	0 %	0 %	0 %	479152581
4544	NC_021014	TGT	2	6	303902	303907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152581
4545	NC_021014	GAA	2	6	303984	303989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152581
4546	NC_021014	TAT	2	6	304025	304030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152581
4547	NC_021014	TGT	2	6	304046	304051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152581
4548	NC_021014	AGAA	2	8	304544	304551	75 %	0 %	25 %	0 %	479152582
4549	NC_021014	GGC	2	6	304604	304609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152582
4550	NC_021014	CCGT	2	8	304707	304714	0 %	25 %	25 %	50 %	479152582
4551	NC_021014	ACCA	2	8	304733	304740	50 %	0 %	0 %	50 %	479152582
4552	NC_021014	AAGCG	2	10	304803	304812	40 %	0 %	40 %	20 %	479152582
4553	NC_021014	GCC	2	6	304836	304841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479152583
4554	NC_021014	GCG	2	6	304906	304911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152583
4555	NC_021014	GAAT	2	8	305048	305055	50 %	25 %	25 %	0 %	479152583
4556	NC_021014	TGG	2	6	305122	305127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152583
4557	NC_021014	CCAG	2	8	305144	305151	25 %	0 %	25 %	50 %	479152583
4558	NC_021014	CGG	2	6	305162	305167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152583
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4560	NC_021014	GGC	2	6	305359	305364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152583
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4562	NC_021014	GAA	2	6	305501	305506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152583
4563	NC_021014	CCA	2	6	305551	305556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479152583
4564	NC_021014	AAG	2	6	305577	305582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152583
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4566	NC_021014	TGC	2	6	305816	305821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152583
4567	NC_021014	AG	3	6	305825	305830	50 %	0 %	50 %	0 %	479152583
4568	NC_021014	GAA	2	6	305834	305839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152583
4569	NC_021014	AGC	2	6	305878	305883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152583
4570	NC_021014	GCT	2	6	305898	305903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152583
4571	NC_021014	CGC	2	6	306008	306013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479152583
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4573	NC_021014	GCC	2	6	306180	306185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479152583
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4577	NC_021014	CCGT	2	8	306390	306397	0 %	25 %	25 %	50 %	479152584
4578	NC_021014	GGC	2	6	306431	306436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152584
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4581	NC_021014	AACAG	2	10	306572	306581	60 %	0 %	20 %	20 %	479152584
4582	NC_021014	CAA	2	6	306622	306627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479152584
4583	NC_021014	TTG	2	6	306633	306638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479152584
4584	NC_021014	TCT	2	6	306646	306651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152584
4585	NC_021014	GCG	2	6	306912	306917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152584
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4587	NC_021014	ATC	2	6	307370	307375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479152584
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4589	NC_021014	AC	3	6	307473	307478	50 %	0 %	0 %	50 %	479152584
4590	NC_021014	AAC	2	6	307523	307528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479152584
4591	NC_021014	CGG	2	6	307731	307736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152584
4592	NC_021014	GCC	2	6	307819	307824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479152584
4593	NC_021014	CTT	2	6	307904	307909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152584
4594	NC_021014	GACA	2	8	307915	307922	50 %	0 %	25 %	25 %	479152584
4595	NC_021014	CGGA	2	8	307980	307987	25 %	0 %	50 %	25 %	479152584
4596	NC_021014	ACA	2	6	308134	308139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479152584
4597	NC_021014	TGAA	2	8	308274	308281	50 %	25 %	25 %	0 %	479152585
4598	NC_021014	CAAC	2	8	308290	308297	50 %	0 %	0 %	50 %	479152585
4599	NC_021014	GGA	2	6	308387	308392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152585
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4601	NC_021014	TTGT	2	8	308609	308616	0 %	75 %	25 %	0 %	479152586
4602	NC_021014	TAT	2	6	308617	308622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152586
4603	NC_021014	GAT	2	6	308633	308638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152586
4604	NC_021014	TAT	2	6	308659	308664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152586
4605	NC_021014	AC	3	6	308667	308672	50 %	0 %	0 %	50 %	479152586
4606	NC_021014	TGA	2	6	308701	308706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152586
4607	NC_021014	ATTG	2	8	308791	308798	25 %	50 %	25 %	0 %	479152586
4608	NC_021014	TAT	2	6	308830	308835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479152586
4609	NC_021014	G	6	6	308920	308925	0 %	0 %	100 %	0 %	479152586
4610	NC_021014	TGA	2	6	309056	309061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152587
4611	NC_021014	GGA	2	6	309088	309093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479152587
4612	NC_021014	AAAT	2	8	309135	309142	75 %	25 %	0 %	0 %	479152587
4613	NC_021014	T	6	6	309524	309529	0 %	100 %	0 %	0 %	479152588
4614	NC_021014	CTG	2	6	309605	309610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152588
4615	NC_021014	GGCG	2	8	309667	309674	0 %	0 %	75 %	25 %	479152588
4616	NC_021014	TTTG	2	8	309721	309728	0 %	75 %	25 %	0 %	479152588
4617	NC_021014	ATAA	2	8	309730	309737	75 %	25 %	0 %	0 %	479152588
4618	NC_021014	A	6	6	309754	309759	100 %	0 %	0 %	0 %	479152589
4619	NC_021014	T	6	6	309895	309900	0 %	100 %	0 %	0 %	479152589
4620	NC_021014	A	6	6	309908	309913	100 %	0 %	0 %	0 %	479152589
4621	NC_021014	GAT	2	6	309947	309952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152589
4622	NC_021014	A	7	7	309997	310003	100 %	0 %	0 %	0 %	479152589
4623	NC_021014	GATACG	2	12	310014	310025	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	479152589
4624	NC_021014	CTT	2	6	310194	310199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479152589
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4626	NC_021014	AAT	2	6	310401	310406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479152589
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4629	NC_021014	ATG	2	6	310449	310454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152589
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4637	NC_021014	CAG	2	6	310848	310853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152590
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4646	NC_021014	GAT	2	6	311204	311209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152590
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4648	NC_021014	ATG	2	6	311265	311270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152590
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4652	NC_021014	AT	3	6	311494	311499	50 %	50 %	0 %	0 %	479152590
4653	NC_021014	GA	3	6	311549	311554	50 %	0 %	50 %	0 %	479152590
4654	NC_021014	AAT	2	6	311573	311578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479152590
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4992	NC_021014	TGTC	2	8	339982	339989	0 %	50 %	25 %	25 %	479152601
4993	NC_021014	GAA	2	6	340017	340022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152601
4994	NC_021014	CGG	2	6	340067	340072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479152601
4995	NC_021014	TGA	2	6	340139	340144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479152601
4996	NC_021014	CTG	3	9	340150	340158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479152601
4997	NC_021014	TTGTTT	2	12	340266	340277	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	479152601
4998	NC_021014	CAG	3	9	340278	340286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479152601
4999	NC_021014	GAA	2	6	340352	340357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479152602
5000	NC_021014	TGG	2	6	340369	340374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479152602

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