MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruminococcus bromii L2-63 draft genome

Total Repeats: 32304

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021013	A	6	6	339	344	100 %	0 %	0 %	0 %	479150084
2	NC_021013	TAA	2	6	367	372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150084
3	NC_021013	TAT	2	6	383	388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150084
4	NC_021013	AAT	2	6	420	425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150084
5	NC_021013	TGA	2	6	533	538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150084
6	NC_021013	AATATC	2	12	566	577	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	479150084
7	NC_021013	GAT	2	6	579	584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150084
8	NC_021013	AT	3	6	725	730	50 %	50 %	0 %	0 %	479150084
9	NC_021013	ATG	2	6	760	765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150084
10	NC_021013	A	6	6	835	840	100 %	0 %	0 %	0 %	479150084
11	NC_021013	GAT	2	6	855	860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150084
12	NC_021013	ACA	2	6	996	1001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150084
13	NC_021013	GCG	2	6	1424	1429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479150085
14	NC_021013	GAAT	2	8	1432	1439	50 %	25 %	25 %	0 %	479150085
15	NC_021013	AATG	2	8	1445	1452	50 %	25 %	25 %	0 %	479150085
16	NC_021013	GAA	2	6	1571	1576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150085
17	NC_021013	CCTTT	2	10	1641	1650	0 %	60 %	0 %	40 %	479150085
18	NC_021013	TTG	2	6	1752	1757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150085
19	NC_021013	TGT	2	6	1933	1938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150085
20	NC_021013	TGA	2	6	1948	1953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150085
21	NC_021013	TGA	2	6	2128	2133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150085
22	NC_021013	ATTTGA	2	12	2254	2265	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	479150085
23	NC_021013	TTG	2	6	2273	2278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150085
24	NC_021013	ACA	2	6	2384	2389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150086
25	NC_021013	ATTC	2	8	2403	2410	25 %	50 %	0 %	25 %	479150086
26	NC_021013	CGG	2	6	2454	2459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479150086
27	NC_021013	CAGA	2	8	2487	2494	50 %	0 %	25 %	25 %	479150086
28	NC_021013	TTC	2	6	2543	2548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150086
29	NC_021013	CGG	2	6	2634	2639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479150086
30	NC_021013	TCA	2	6	2646	2651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150086
31	NC_021013	AGA	3	9	2679	2687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150086
32	NC_021013	AC	3	6	2697	2702	50 %	0 %	0 %	50 %	479150086
33	NC_021013	TTGT	2	8	2704	2711	0 %	75 %	25 %	0 %	479150086
34	NC_021013	TGT	2	6	2913	2918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150086
35	NC_021013	TGA	2	6	2985	2990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150086
36	NC_021013	AATC	2	8	3128	3135	50 %	25 %	0 %	25 %	479150087
37	NC_021013	T	6	6	3187	3192	0 %	100 %	0 %	0 %	479150087
38	NC_021013	GGTG	2	8	3299	3306	0 %	25 %	75 %	0 %	479150087
39	NC_021013	ATA	3	9	3315	3323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150087
40	NC_021013	CAA	2	6	3440	3445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150087
41	NC_021013	AAC	2	6	3601	3606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150087
42	NC_021013	ATT	2	6	3610	3615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150087
43	NC_021013	TTTG	2	8	3769	3776	0 %	75 %	25 %	0 %	479150087
44	NC_021013	CCA	2	6	3812	3817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479150087
45	NC_021013	TAA	2	6	3818	3823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150087
46	NC_021013	AAT	2	6	3831	3836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150087
47	NC_021013	AT	4	8	3873	3880	50 %	50 %	0 %	0 %	479150087
48	NC_021013	AAG	2	6	3909	3914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150087
49	NC_021013	TGA	2	6	3970	3975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150087
50	NC_021013	TTTG	2	8	3981	3988	0 %	75 %	25 %	0 %	479150087
51	NC_021013	A	6	6	4026	4031	100 %	0 %	0 %	0 %	479150087
52	NC_021013	CAT	2	6	4074	4079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150087
53	NC_021013	ATT	2	6	4108	4113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150087
54	NC_021013	T	6	6	4135	4140	0 %	100 %	0 %	0 %	479150087
55	NC_021013	TTG	2	6	4196	4201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150087
56	NC_021013	CAA	2	6	4225	4230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150087
57	NC_021013	A	6	6	4246	4251	100 %	0 %	0 %	0 %	479150087
58	NC_021013	GGTG	2	8	4258	4265	0 %	25 %	75 %	0 %	479150087
59	NC_021013	AAT	2	6	4298	4303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150087
60	NC_021013	AT	3	6	4343	4348	50 %	50 %	0 %	0 %	479150087
61	NC_021013	AT	3	6	4399	4404	50 %	50 %	0 %	0 %	479150087
62	NC_021013	CAT	2	6	4437	4442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150087
63	NC_021013	AC	3	6	4538	4543	50 %	0 %	0 %	50 %	479150088
64	NC_021013	TCC	2	6	4591	4596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479150088
65	NC_021013	GGT	2	6	4634	4639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479150088
66	NC_021013	TTC	2	6	4665	4670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150088
67	NC_021013	TCT	2	6	4693	4698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150088
68	NC_021013	GAA	2	6	4709	4714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150088
69	NC_021013	AG	3	6	4721	4726	50 %	0 %	50 %	0 %	479150088
70	NC_021013	CGCTCT	2	12	4748	4759	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	479150088
71	NC_021013	TAA	2	6	4775	4780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150088
72	NC_021013	TGAA	2	8	4895	4902	50 %	25 %	25 %	0 %	479150089
73	NC_021013	A	6	6	4901	4906	100 %	0 %	0 %	0 %	479150089
74	NC_021013	T	6	6	4927	4932	0 %	100 %	0 %	0 %	479150089
75	NC_021013	T	6	6	5008	5013	0 %	100 %	0 %	0 %	479150089
76	NC_021013	TTAT	2	8	5159	5166	25 %	75 %	0 %	0 %	479150089
77	NC_021013	TAA	2	6	5188	5193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150089
78	NC_021013	AGAT	2	8	5239	5246	50 %	25 %	25 %	0 %	479150089
79	NC_021013	ATAC	2	8	5298	5305	50 %	25 %	0 %	25 %	479150089
80	NC_021013	GAA	2	6	5315	5320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150089
81	NC_021013	TCA	2	6	5424	5429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150089
82	NC_021013	ATT	2	6	5438	5443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150089
83	NC_021013	T	6	6	5442	5447	0 %	100 %	0 %	0 %	479150089
84	NC_021013	ATG	2	6	5516	5521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150089
85	NC_021013	AG	3	6	5533	5538	50 %	0 %	50 %	0 %	479150089
86	NC_021013	CAA	2	6	5647	5652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150089
87	NC_021013	CAC	2	6	5687	5692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479150089
88	NC_021013	TGA	2	6	5763	5768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150089
89	NC_021013	AAG	2	6	5821	5826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150089
90	NC_021013	ATG	2	6	5888	5893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150089
91	NC_021013	CTTTT	2	10	5915	5924	0 %	80 %	0 %	20 %	479150089
92	NC_021013	ATC	2	6	5936	5941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150089
93	NC_021013	AATG	2	8	6082	6089	50 %	25 %	25 %	0 %	479150089
94	NC_021013	TAT	2	6	6108	6113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150089
95	NC_021013	ACGGC	2	10	6129	6138	20 %	0 %	40 %	40 %	479150089
96	NC_021013	TTC	2	6	6160	6165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150089
97	NC_021013	CTT	3	9	6183	6191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150089
98	NC_021013	TAG	2	6	6212	6217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150089
99	NC_021013	ACT	2	6	6364	6369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150090
100	NC_021013	TTC	2	6	6411	6416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150090
101	NC_021013	AT	3	6	6441	6446	50 %	50 %	0 %	0 %	479150090
102	NC_021013	T	6	6	6474	6479	0 %	100 %	0 %	0 %	479150090
103	NC_021013	T	7	7	6531	6537	0 %	100 %	0 %	0 %	479150090
104	NC_021013	GTT	2	6	6550	6555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150090
105	NC_021013	TCT	2	6	6566	6571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150090
106	NC_021013	AAT	2	6	6668	6673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150090
107	NC_021013	ATC	2	6	6705	6710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150090
108	NC_021013	ATA	2	6	6789	6794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150090
109	NC_021013	CCA	2	6	6863	6868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479150090
110	NC_021013	CTTG	2	8	6872	6879	0 %	50 %	25 %	25 %	479150090
111	NC_021013	AAT	2	6	6887	6892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150090
112	NC_021013	TGT	2	6	6893	6898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150090
113	NC_021013	GTT	3	9	6928	6936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150090
114	NC_021013	AAG	2	6	6964	6969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150090
115	NC_021013	CATA	2	8	6975	6982	50 %	25 %	0 %	25 %	479150090
116	NC_021013	A	6	6	6987	6992	100 %	0 %	0 %	0 %	479150090
117	NC_021013	TTA	2	6	7015	7020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150090
118	NC_021013	CAA	2	6	7053	7058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150090
119	NC_021013	ATAAA	2	10	7070	7079	80 %	20 %	0 %	0 %	479150090
120	NC_021013	ATA	2	6	7090	7095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150090
121	NC_021013	GAA	2	6	7100	7105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150090
122	NC_021013	TGCAT	2	10	7160	7169	20 %	40 %	20 %	20 %	479150090
123	NC_021013	AT	3	6	7168	7173	50 %	50 %	0 %	0 %	479150090
124	NC_021013	CAG	2	6	7214	7219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479150090
125	NC_021013	ATA	2	6	7232	7237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150090
126	NC_021013	A	6	6	7281	7286	100 %	0 %	0 %	0 %	479150090
127	NC_021013	GAAA	2	8	7308	7315	75 %	0 %	25 %	0 %	479150090
128	NC_021013	ATT	2	6	7321	7326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150090
129	NC_021013	ATT	2	6	7341	7346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150090
130	NC_021013	T	6	6	7348	7353	0 %	100 %	0 %	0 %	479150090
131	NC_021013	ATA	2	6	7358	7363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150090
132	NC_021013	ACA	2	6	7372	7377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150090
133	NC_021013	TGAAA	2	10	7398	7407	60 %	20 %	20 %	0 %	479150090
134	NC_021013	GTATC	2	10	7438	7447	20 %	40 %	20 %	20 %	479150090
135	NC_021013	A	7	7	7468	7474	100 %	0 %	0 %	0 %	479150090
136	NC_021013	AAT	2	6	7512	7517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150090
137	NC_021013	A	6	6	7549	7554	100 %	0 %	0 %	0 %	479150090
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269	NC_021013	TTC	2	6	14714	14719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150094
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