MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruminococcus bromii L2-63 draft genome

Total Repeats: 32304

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_021013	CGA	2	6	273636	273641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479150311
4002	NC_021013	TTG	2	6	273668	273673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150311
4003	NC_021013	AAG	2	6	273676	273681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150311
4004	NC_021013	CGG	2	6	273735	273740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479150311
4005	NC_021013	GACA	2	8	273787	273794	50 %	0 %	25 %	25 %	479150311
4006	NC_021013	GAA	2	6	273816	273821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150311
4007	NC_021013	AGA	2	6	274010	274015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150312
4008	NC_021013	AG	3	6	274087	274092	50 %	0 %	50 %	0 %	479150312
4009	NC_021013	TTCGG	2	10	274108	274117	0 %	40 %	40 %	20 %	479150312
4010	NC_021013	GCGG	2	8	274162	274169	0 %	0 %	75 %	25 %	479150312
4011	NC_021013	ATGA	2	8	274919	274926	50 %	25 %	25 %	0 %	479150313
4012	NC_021013	A	6	6	274929	274934	100 %	0 %	0 %	0 %	479150313
4013	NC_021013	TTG	2	6	274975	274980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150313
4014	NC_021013	ACA	2	6	274989	274994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150313
4015	NC_021013	GAC	2	6	275045	275050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479150313
4016	NC_021013	ACA	2	6	275076	275081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150313
4017	NC_021013	GATT	2	8	275170	275177	25 %	50 %	25 %	0 %	479150313
4018	NC_021013	TCT	2	6	275207	275212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150313
4019	NC_021013	A	6	6	275331	275336	100 %	0 %	0 %	0 %	479150313
4020	NC_021013	CA	3	6	275398	275403	50 %	0 %	0 %	50 %	479150313
4021	NC_021013	T	6	6	275411	275416	0 %	100 %	0 %	0 %	479150313
4022	NC_021013	AAT	2	6	275495	275500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150313
4023	NC_021013	TAA	2	6	279334	279339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150314
4024	NC_021013	CAA	2	6	279443	279448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150314
4025	NC_021013	TCT	2	6	279449	279454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150314
4026	NC_021013	TGA	2	6	279506	279511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150314
4027	NC_021013	CTT	2	6	279612	279617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150314
4028	NC_021013	ACA	2	6	279682	279687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150314
4029	NC_021013	A	6	6	281838	281843	100 %	0 %	0 %	0 %	479150315
4030	NC_021013	CAG	2	6	281888	281893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479150315
4031	NC_021013	GAA	2	6	281912	281917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150315
4032	NC_021013	TGA	2	6	281995	282000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150315
4033	NC_021013	TAC	2	6	282002	282007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150315
4034	NC_021013	GAAA	2	8	282079	282086	75 %	0 %	25 %	0 %	479150316
4035	NC_021013	ATT	2	6	282100	282105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150316
4036	NC_021013	CTTG	2	8	282145	282152	0 %	50 %	25 %	25 %	479150316
4037	NC_021013	TGA	2	6	282165	282170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150316
4038	NC_021013	CGTAGC	2	12	282280	282291	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	479150316
4039	NC_021013	TTG	2	6	282300	282305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150316
4040	NC_021013	TCA	2	6	282315	282320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150316
4041	NC_021013	ACT	2	6	282360	282365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150316
4042	NC_021013	ATC	2	6	282395	282400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150316
4043	NC_021013	AAT	2	6	282522	282527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150316
4044	NC_021013	CA	4	8	282588	282595	50 %	0 %	0 %	50 %	479150317
4045	NC_021013	TGT	2	6	282621	282626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150317
4046	NC_021013	CAGTG	2	10	282631	282640	20 %	20 %	40 %	20 %	479150317
4047	NC_021013	TCA	2	6	282757	282762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150317
4048	NC_021013	AG	3	6	282779	282784	50 %	0 %	50 %	0 %	479150317
4049	NC_021013	ACA	2	6	282845	282850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150317
4050	NC_021013	TTA	2	6	282854	282859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150317
4051	NC_021013	TTTGG	2	10	282905	282914	0 %	60 %	40 %	0 %	479150317
4052	NC_021013	ATT	2	6	282935	282940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150317
4053	NC_021013	AAATG	2	10	282951	282960	60 %	20 %	20 %	0 %	479150317
4054	NC_021013	GGT	2	6	282977	282982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479150317
4055	NC_021013	CCG	2	6	283049	283054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479150317
4056	NC_021013	CA	3	6	283109	283114	50 %	0 %	0 %	50 %	479150317
4057	NC_021013	AAG	2	6	283135	283140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150317
4058	NC_021013	ATC	2	6	283168	283173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150317
4059	NC_021013	AG	3	6	283238	283243	50 %	0 %	50 %	0 %	479150317
4060	NC_021013	CTAT	2	8	283292	283299	25 %	50 %	0 %	25 %	479150317
4061	NC_021013	TCA	2	6	283304	283309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150317
4062	NC_021013	ACA	2	6	283331	283336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150317
4063	NC_021013	A	6	6	283350	283355	100 %	0 %	0 %	0 %	479150317
4064	NC_021013	TTA	2	6	284617	284622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150318
4065	NC_021013	TTA	2	6	284636	284641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150318
4066	NC_021013	GGA	2	6	284647	284652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479150318
4067	NC_021013	TTA	2	6	284735	284740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150318
4068	NC_021013	AGA	2	6	284775	284780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150318
4069	NC_021013	GTT	2	6	284854	284859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150318
4070	NC_021013	TGT	2	6	284865	284870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150318
4071	NC_021013	CGG	2	6	284892	284897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479150318
4072	NC_021013	AAC	2	6	284914	284919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150318
4073	NC_021013	ACA	2	6	284959	284964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150318
4074	NC_021013	TAT	2	6	285010	285015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150318
4075	NC_021013	A	6	6	285040	285045	100 %	0 %	0 %	0 %	479150318
4076	NC_021013	GCC	2	6	285154	285159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479150318
4077	NC_021013	TGTC	2	8	285195	285202	0 %	50 %	25 %	25 %	479150318
4078	NC_021013	GCC	2	6	285276	285281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479150318
4079	NC_021013	GCG	2	6	285362	285367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479150318
4080	NC_021013	AATG	2	8	285639	285646	50 %	25 %	25 %	0 %	479150319
4081	NC_021013	TGA	2	6	285674	285679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150319
4082	NC_021013	TGA	2	6	285683	285688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150319
4083	NC_021013	AAT	2	6	285690	285695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150319
4084	NC_021013	ATT	2	6	285703	285708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150319
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4086	NC_021013	AAAT	2	8	285720	285727	75 %	25 %	0 %	0 %	479150319
4087	NC_021013	CGG	2	6	285888	285893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479150320
4088	NC_021013	GTT	2	6	285935	285940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150320
4089	NC_021013	CGG	2	6	285954	285959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479150320
4090	NC_021013	GGAC	2	8	286058	286065	25 %	0 %	50 %	25 %	479150320
4091	NC_021013	TAC	2	6	286149	286154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150320
4092	NC_021013	GAT	2	6	286225	286230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150320
4093	NC_021013	GA	3	6	286284	286289	50 %	0 %	50 %	0 %	479150320
4094	NC_021013	CTT	2	6	286531	286536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150320
4095	NC_021013	TTA	2	6	286559	286564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150320
4096	NC_021013	ACT	2	6	286690	286695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150320
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4101	NC_021013	ACA	2	6	287715	287720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150321
4102	NC_021013	ATT	2	6	287753	287758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150321
4103	NC_021013	AAAT	2	8	287847	287854	75 %	25 %	0 %	0 %	479150321
4104	NC_021013	GTT	2	6	287909	287914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150321
4105	NC_021013	AATC	2	8	287957	287964	50 %	25 %	0 %	25 %	479150321
4106	NC_021013	AAG	2	6	288352	288357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150321
4107	NC_021013	TAT	2	6	288577	288582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150321
4108	NC_021013	ATTT	2	8	288652	288659	25 %	75 %	0 %	0 %	479150321
4109	NC_021013	ATTC	2	8	288735	288742	25 %	50 %	0 %	25 %	479150321
4110	NC_021013	CAG	2	6	288786	288791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479150321
4111	NC_021013	TCA	2	6	288827	288832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150321
4112	NC_021013	TAT	2	6	288871	288876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150321
4113	NC_021013	AT	3	6	288907	288912	50 %	50 %	0 %	0 %	479150321
4114	NC_021013	TGT	2	6	289009	289014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150321
4115	NC_021013	TTTCA	2	10	289335	289344	20 %	60 %	0 %	20 %	479150322
4116	NC_021013	AAAAT	2	10	289460	289469	80 %	20 %	0 %	0 %	479150323
4117	NC_021013	GTT	2	6	289512	289517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150323
4118	NC_021013	GTT	2	6	289528	289533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150323
4119	NC_021013	TTG	2	6	289538	289543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150323
4120	NC_021013	TGA	2	6	289590	289595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150323
4121	NC_021013	AT	3	6	289617	289622	50 %	50 %	0 %	0 %	479150323
4122	NC_021013	GAT	2	6	289624	289629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150323
4123	NC_021013	GTA	2	6	289631	289636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150323
4124	NC_021013	TTA	2	6	289643	289648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150323
4125	NC_021013	TAA	2	6	289767	289772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150323
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4153	NC_021013	ATG	2	6	291251	291256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150324
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4247	NC_021013	GAT	2	6	296236	296241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150329
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4252	NC_021013	TCT	2	6	296423	296428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150329
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4323	NC_021013	CCTG	2	8	307971	307978	0 %	25 %	25 %	50 %	479150334
4324	NC_021013	CTGAC	2	10	308127	308136	20 %	20 %	20 %	40 %	479150334
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4353	NC_021013	TGA	2	6	309888	309893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150335
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4360	NC_021013	AAT	2	6	310222	310227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150335
4361	NC_021013	CAA	2	6	310248	310253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150335
4362	NC_021013	ATA	2	6	310262	310267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150335
4363	NC_021013	CAA	2	6	310275	310280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150335
4364	NC_021013	GTCC	2	8	310362	310369	0 %	25 %	25 %	50 %	479150335
4365	NC_021013	ATAAGC	2	12	310451	310462	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	479150335
4366	NC_021013	GAA	2	6	310503	310508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150335
4367	NC_021013	CTT	2	6	310509	310514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150335
4368	NC_021013	GAA	2	6	310619	310624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150335
4369	NC_021013	CAA	2	6	310626	310631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150335
4370	NC_021013	TGT	2	6	310642	310647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150335
4371	NC_021013	GTA	2	6	310726	310731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150335
4372	NC_021013	TTGT	2	8	310739	310746	0 %	75 %	25 %	0 %	479150335
4373	NC_021013	CTT	2	6	310834	310839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150335
4374	NC_021013	CAAGAA	2	12	310887	310898	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	479150335
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4463	NC_021013	ATA	2	6	316555	316560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150343
4464	NC_021013	TGCAA	2	10	316697	316706	40 %	20 %	20 %	20 %	479150343
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4467	NC_021013	TGC	2	6	316847	316852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479150343
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4471	NC_021013	ATGG	2	8	316953	316960	25 %	25 %	50 %	0 %	479150343
4472	NC_021013	ATA	2	6	317143	317148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150343
4473	NC_021013	ACT	2	6	317151	317156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150343
4474	NC_021013	CCTG	2	8	317313	317320	0 %	25 %	25 %	50 %	479150343
4475	NC_021013	TA	3	6	317385	317390	50 %	50 %	0 %	0 %	479150344
4476	NC_021013	ACA	2	6	317418	317423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150344
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4479	NC_021013	CAT	2	6	317575	317580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150344
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4482	NC_021013	T	7	7	317842	317848	0 %	100 %	0 %	0 %	479150344
4483	NC_021013	ACCA	2	8	317894	317901	50 %	0 %	0 %	50 %	479150344
4484	NC_021013	T	6	6	317932	317937	0 %	100 %	0 %	0 %	479150344
4485	NC_021013	TTC	2	6	317966	317971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150344
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4488	NC_021013	CTTC	2	8	318172	318179	0 %	50 %	0 %	50 %	479150344
4489	NC_021013	TAA	2	6	318223	318228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150344
4490	NC_021013	CAAT	2	8	318247	318254	50 %	25 %	0 %	25 %	479150344
4491	NC_021013	AGCC	2	8	318270	318277	25 %	0 %	25 %	50 %	479150344
4492	NC_021013	TGC	2	6	318289	318294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479150344
4493	NC_021013	A	7	7	318305	318311	100 %	0 %	0 %	0 %	479150344
4494	NC_021013	A	6	6	318318	318323	100 %	0 %	0 %	0 %	479150344
4495	NC_021013	ATA	2	6	318328	318333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150344
4496	NC_021013	GCCA	2	8	318363	318370	25 %	0 %	25 %	50 %	479150344
4497	NC_021013	GGATC	2	10	318389	318398	20 %	20 %	40 %	20 %	479150344
4498	NC_021013	TCTT	2	8	318411	318418	0 %	75 %	0 %	25 %	479150344
4499	NC_021013	ATT	2	6	318426	318431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150344
4500	NC_021013	A	6	6	319188	319193	100 %	0 %	0 %	0 %	479150345

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