MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruminococcus bromii L2-63 draft genome

Total Repeats: 32304

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021013	TTC	2	6	241098	241103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150272
3502	NC_021013	AAAAT	2	10	241311	241320	80 %	20 %	0 %	0 %	479150273
3503	NC_021013	ATC	2	6	241415	241420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150273
3504	NC_021013	A	6	6	241446	241451	100 %	0 %	0 %	0 %	479150273
3505	NC_021013	GAA	2	6	241553	241558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150273
3506	NC_021013	CGG	2	6	241597	241602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479150273
3507	NC_021013	TGC	2	6	241611	241616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479150273
3508	NC_021013	TGA	2	6	241645	241650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150273
3509	NC_021013	AAGC	2	8	241656	241663	50 %	0 %	25 %	25 %	479150273
3510	NC_021013	CA	3	6	241686	241691	50 %	0 %	0 %	50 %	479150273
3511	NC_021013	GAG	2	6	241739	241744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479150273
3512	NC_021013	GAC	2	6	241873	241878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479150274
3513	NC_021013	GAA	2	6	241889	241894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150274
3514	NC_021013	AGA	2	6	241902	241907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150274
3515	NC_021013	AAAAC	2	10	241958	241967	80 %	0 %	0 %	20 %	479150274
3516	NC_021013	TA	3	6	242393	242398	50 %	50 %	0 %	0 %	479150275
3517	NC_021013	A	6	6	242418	242423	100 %	0 %	0 %	0 %	479150275
3518	NC_021013	TGC	2	6	242495	242500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479150275
3519	NC_021013	GTT	2	6	242521	242526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150275
3520	NC_021013	CCG	2	6	242561	242566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479150275
3521	NC_021013	CTG	3	9	242635	242643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479150275
3522	NC_021013	CGG	2	6	242763	242768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479150275
3523	NC_021013	T	6	6	242805	242810	0 %	100 %	0 %	0 %	479150275
3524	NC_021013	GAT	2	6	242826	242831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150275
3525	NC_021013	TGC	2	6	242837	242842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479150275
3526	NC_021013	GGC	2	6	242883	242888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479150275
3527	NC_021013	CCG	2	6	242939	242944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479150275
3528	NC_021013	ATT	2	6	243013	243018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150275
3529	NC_021013	ACAA	2	8	243058	243065	75 %	0 %	0 %	25 %	479150275
3530	NC_021013	A	6	6	243076	243081	100 %	0 %	0 %	0 %	479150275
3531	NC_021013	AAC	2	6	243111	243116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150275
3532	NC_021013	TCT	2	6	243152	243157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150275
3533	NC_021013	CCG	2	6	243227	243232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479150275
3534	NC_021013	TTC	2	6	243267	243272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150275
3535	NC_021013	TCG	2	6	243299	243304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479150275
3536	NC_021013	TTCTGA	2	12	243356	243367	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	479150275
3537	NC_021013	CGC	2	6	243444	243449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479150275
3538	NC_021013	CTG	2	6	243472	243477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479150275
3539	NC_021013	T	6	6	243478	243483	0 %	100 %	0 %	0 %	479150275
3540	NC_021013	CGG	2	6	243486	243491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479150275
3541	NC_021013	TTCT	2	8	243602	243609	0 %	75 %	0 %	25 %	479150275
3542	NC_021013	CGG	2	6	243648	243653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479150275
3543	NC_021013	CGG	2	6	243671	243676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479150275
3544	NC_021013	CAA	2	6	243681	243686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150275
3545	NC_021013	A	6	6	243716	243721	100 %	0 %	0 %	0 %	479150275
3546	NC_021013	TAT	2	6	243747	243752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150276
3547	NC_021013	GAA	2	6	243850	243855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150276
3548	NC_021013	TG	3	6	243951	243956	0 %	50 %	50 %	0 %	479150276
3549	NC_021013	CGG	2	6	243969	243974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479150276
3550	NC_021013	CTT	2	6	244001	244006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150276
3551	NC_021013	GCT	2	6	244129	244134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479150276
3552	NC_021013	CCG	2	6	244145	244150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479150276
3553	NC_021013	GGAT	2	8	244216	244223	25 %	25 %	50 %	0 %	479150276
3554	NC_021013	GAA	2	6	244498	244503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150277
3555	NC_021013	CTG	2	6	244555	244560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479150277
3556	NC_021013	CCG	2	6	244599	244604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479150277
3557	NC_021013	ATT	2	6	244633	244638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150277
3558	NC_021013	AGA	2	6	244652	244657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150277
3559	NC_021013	AC	3	6	244821	244826	50 %	0 %	0 %	50 %	479150278
3560	NC_021013	CGC	2	6	244827	244832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479150278
3561	NC_021013	ATG	2	6	244898	244903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150278
3562	NC_021013	TCC	2	6	245104	245109	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479150278
3563	NC_021013	ATT	2	6	245131	245136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150278
3564	NC_021013	TGA	2	6	245321	245326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150278
3565	NC_021013	GCTC	2	8	245530	245537	0 %	25 %	25 %	50 %	479150278
3566	NC_021013	CTG	2	6	245575	245580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479150278
3567	NC_021013	GAT	2	6	245599	245604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150278
3568	NC_021013	TTG	2	6	245654	245659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150278
3569	NC_021013	TGT	2	6	245684	245689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150278
3570	NC_021013	GGC	2	6	245693	245698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479150278
3571	NC_021013	A	7	7	245708	245714	100 %	0 %	0 %	0 %	479150278
3572	NC_021013	AC	3	6	245719	245724	50 %	0 %	0 %	50 %	479150278
3573	NC_021013	GCT	2	6	245733	245738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479150278
3574	NC_021013	AGC	2	6	245796	245801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479150278
3575	NC_021013	GGC	2	6	245851	245856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479150278
3576	NC_021013	AGC	2	6	245914	245919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479150278
3577	NC_021013	CGC	2	6	245973	245978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479150278
3578	NC_021013	GGC	2	6	245991	245996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479150278
3579	NC_021013	AGC	2	6	246014	246019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479150278
3580	NC_021013	CGC	2	6	246062	246067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479150278
3581	NC_021013	AGC	2	6	246134	246139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479150278
3582	NC_021013	GTG	2	6	246184	246189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479150278
3583	NC_021013	CTG	2	6	246196	246201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479150278
3584	NC_021013	GACG	2	8	246220	246227	25 %	0 %	50 %	25 %	479150278
3585	NC_021013	GAA	2	6	246291	246296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150278
3586	NC_021013	A	6	6	246295	246300	100 %	0 %	0 %	0 %	479150278
3587	NC_021013	CGA	2	6	246330	246335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479150278
3588	NC_021013	CAGGG	2	10	246451	246460	20 %	0 %	60 %	20 %	479150278
3589	NC_021013	AACGGA	2	12	246484	246495	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	479150278
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3591	NC_021013	A	6	6	246543	246548	100 %	0 %	0 %	0 %	479150278
3592	NC_021013	CGG	2	6	246618	246623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479150278
3593	NC_021013	CTTTA	2	10	246669	246678	20 %	60 %	0 %	20 %	479150278
3594	NC_021013	TGAA	2	8	246698	246705	50 %	25 %	25 %	0 %	479150278
3595	NC_021013	TCG	2	6	246720	246725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479150279
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3599	NC_021013	CTG	2	6	246854	246859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479150279
3600	NC_021013	CA	3	6	246886	246891	50 %	0 %	0 %	50 %	479150279
3601	NC_021013	ATT	2	6	246929	246934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150279
3602	NC_021013	GC	3	6	246944	246949	0 %	0 %	50 %	50 %	479150279
3603	NC_021013	GAC	2	6	246992	246997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479150279
3604	NC_021013	TGC	3	9	247062	247070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479150279
3605	NC_021013	GCG	2	6	247080	247085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479150279
3606	NC_021013	GCC	2	6	247133	247138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479150279
3607	NC_021013	GAA	2	6	247160	247165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150279
3608	NC_021013	CT	3	6	247205	247210	0 %	50 %	0 %	50 %	479150279
3609	NC_021013	GCA	2	6	247249	247254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479150279
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3611	NC_021013	TGC	2	6	247386	247391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479150279
3612	NC_021013	TGCT	2	8	247754	247761	0 %	50 %	25 %	25 %	479150280
3613	NC_021013	ATT	2	6	247803	247808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150280
3614	NC_021013	ATTTG	2	10	247811	247820	20 %	60 %	20 %	0 %	479150280
3615	NC_021013	GT	4	8	247844	247851	0 %	50 %	50 %	0 %	479150280
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3618	NC_021013	ATCA	2	8	247973	247980	50 %	25 %	0 %	25 %	479150280
3619	NC_021013	TACT	2	8	248004	248011	25 %	50 %	0 %	25 %	479150280
3620	NC_021013	CGC	2	6	248085	248090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479150280
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3622	NC_021013	CAA	2	6	248131	248136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150280
3623	NC_021013	ATC	2	6	248138	248143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150280
3624	NC_021013	GCCTT	2	10	248247	248256	0 %	40 %	20 %	40 %	479150280
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3987	NC_021013	A	6	6	272853	272858	100 %	0 %	0 %	0 %	479150309
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3991	NC_021013	CCGACA	2	12	272985	272996	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	479150310
3992	NC_021013	AC	3	6	273021	273026	50 %	0 %	0 %	50 %	479150310
3993	NC_021013	CA	3	6	273065	273070	50 %	0 %	0 %	50 %	479150310
3994	NC_021013	TTA	2	6	273132	273137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150310
3995	NC_021013	CAA	2	6	273199	273204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150310
3996	NC_021013	GTAAT	2	10	273282	273291	40 %	40 %	20 %	0 %	479150310
3997	NC_021013	CAA	2	6	273350	273355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150311
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3999	NC_021013	TGA	2	6	273513	273518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150311
4000	NC_021013	TTA	2	6	273567	273572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150311

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