MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruminococcus bromii L2-63 draft genome

Total Repeats: 32304

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31501	NC_021013	CGC	2	6	2188649	2188654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479151841
31502	NC_021013	GCG	2	6	2188685	2188690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479151841
31503	NC_021013	CAA	2	6	2188733	2188738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479151841
31504	NC_021013	TGC	2	6	2188816	2188821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479151841
31505	NC_021013	GCCCC	2	10	2188916	2188925	0 %	0 %	20 %	80 %	479151841
31506	NC_021013	GGC	3	9	2188976	2188984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479151841
31507	NC_021013	A	6	6	2188991	2188996	100 %	0 %	0 %	0 %	479151841
31508	NC_021013	GACT	2	8	2189025	2189032	25 %	25 %	25 %	25 %	479151842
31509	NC_021013	GAA	2	6	2189036	2189041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479151842
31510	NC_021013	GGC	2	6	2189069	2189074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479151842
31511	NC_021013	TTGA	2	8	2189084	2189091	25 %	50 %	25 %	0 %	479151842
31512	NC_021013	CGC	2	6	2189101	2189106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479151842
31513	NC_021013	CGC	2	6	2189206	2189211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479151842
31514	NC_021013	TGA	2	6	2189212	2189217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479151842
31515	NC_021013	TTC	2	6	2189788	2189793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479151843
31516	NC_021013	CTT	2	6	2189824	2189829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479151843
31517	NC_021013	CGG	2	6	2189970	2189975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479151843
31518	NC_021013	CTGT	2	8	2190112	2190119	0 %	50 %	25 %	25 %	479151844
31519	NC_021013	ATA	2	6	2190152	2190157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479151844
31520	NC_021013	CTTT	2	8	2190171	2190178	0 %	75 %	0 %	25 %	479151844
31521	NC_021013	CTT	2	6	2190207	2190212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479151844
31522	NC_021013	GCG	2	6	2190248	2190253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479151844
31523	NC_021013	CGC	2	6	2190277	2190282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479151844
31524	NC_021013	CGG	2	6	2190297	2190302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479151844
31525	NC_021013	GGA	2	6	2190309	2190314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479151844
31526	NC_021013	CCTTG	2	10	2190355	2190364	0 %	40 %	20 %	40 %	479151844
31527	NC_021013	TTC	2	6	2190452	2190457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479151844
31528	NC_021013	GCC	2	6	2190467	2190472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479151844
31529	NC_021013	AGC	2	6	2190647	2190652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479151844
31530	NC_021013	CGC	2	6	2190657	2190662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479151844
31531	NC_021013	GCT	2	6	2190663	2190668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479151844
31532	NC_021013	CT	3	6	2190667	2190672	0 %	50 %	0 %	50 %	479151844
31533	NC_021013	CGC	2	6	2190823	2190828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479151844
31534	NC_021013	TGC	2	6	2190957	2190962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479151844
31535	NC_021013	GAC	2	6	2190973	2190978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479151844
31536	NC_021013	TTG	2	6	2191043	2191048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479151844
31537	NC_021013	TGG	2	6	2191061	2191066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479151844
31538	NC_021013	A	6	6	2191086	2191091	100 %	0 %	0 %	0 %	479151844
31539	NC_021013	CGT	2	6	2191126	2191131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479151844
31540	NC_021013	TGC	2	6	2191145	2191150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479151844
31541	NC_021013	GCT	2	6	2191173	2191178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479151844
31542	NC_021013	CGTC	2	8	2191344	2191351	0 %	25 %	25 %	50 %	479151844
31543	NC_021013	GTTGAC	2	12	2191506	2191517	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	479151845
31544	NC_021013	CGC	2	6	2191608	2191613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479151845
31545	NC_021013	GGGT	2	8	2191622	2191629	0 %	25 %	75 %	0 %	479151845
31546	NC_021013	T	6	6	2191640	2191645	0 %	100 %	0 %	0 %	479151845
31547	NC_021013	ATTTG	2	10	2191682	2191691	20 %	60 %	20 %	0 %	479151845
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31549	NC_021013	AAG	2	6	2192064	2192069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479151846
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31551	NC_021013	TTC	2	6	2192095	2192100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479151846
31552	NC_021013	CGG	2	6	2192103	2192108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479151846
31553	NC_021013	AT	3	6	2192135	2192140	50 %	50 %	0 %	0 %	479151846
31554	NC_021013	TGC	2	6	2192182	2192187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479151846
31555	NC_021013	GCG	2	6	2192216	2192221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479151846
31556	NC_021013	TCG	2	6	2192233	2192238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479151846
31557	NC_021013	AAAC	2	8	2192886	2192893	75 %	0 %	0 %	25 %	479151847
31558	NC_021013	TTAC	2	8	2192979	2192986	25 %	50 %	0 %	25 %	479151848
31559	NC_021013	TA	3	6	2193030	2193035	50 %	50 %	0 %	0 %	479151848
31560	NC_021013	TATCAA	2	12	2193072	2193083	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	479151848
31561	NC_021013	A	7	7	2193085	2193091	100 %	0 %	0 %	0 %	479151848
31562	NC_021013	TTA	2	6	2193162	2193167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479151848
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31564	NC_021013	GTTG	2	8	2193206	2193213	0 %	50 %	50 %	0 %	479151848
31565	NC_021013	T	6	6	2193228	2193233	0 %	100 %	0 %	0 %	479151848
31566	NC_021013	GCA	2	6	2193286	2193291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479151848
31567	NC_021013	ATCGT	2	10	2193318	2193327	20 %	40 %	20 %	20 %	479151848
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31569	NC_021013	GCA	2	6	2193374	2193379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479151848
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31583	NC_021013	TAATT	2	10	2193911	2193920	40 %	60 %	0 %	0 %	479151848
31584	NC_021013	A	7	7	2194211	2194217	100 %	0 %	0 %	0 %	479151849
31585	NC_021013	GCCC	2	8	2194218	2194225	0 %	0 %	25 %	75 %	479151849
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31588	NC_021013	ATC	2	6	2194266	2194271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479151849
31589	NC_021013	A	6	6	2194337	2194342	100 %	0 %	0 %	0 %	479151849
31590	NC_021013	GAA	2	6	2194348	2194353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479151849
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31599	NC_021013	ACG	2	6	2196215	2196220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479151851
31600	NC_021013	ATC	2	6	2196398	2196403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479151851
31601	NC_021013	ACCCG	2	10	2196408	2196417	20 %	0 %	20 %	60 %	479151851
31602	NC_021013	CGT	2	6	2196429	2196434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479151851
31603	NC_021013	ATGT	2	8	2196451	2196458	25 %	50 %	25 %	0 %	479151851
31604	NC_021013	TG	3	6	2196473	2196478	0 %	50 %	50 %	0 %	479151851
31605	NC_021013	GGA	2	6	2196702	2196707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479151851
31606	NC_021013	A	6	6	2196707	2196712	100 %	0 %	0 %	0 %	479151851
31607	NC_021013	TTC	2	6	2196718	2196723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479151851
31608	NC_021013	TGAT	2	8	2196743	2196750	25 %	50 %	25 %	0 %	479151851
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31614	NC_021013	A	7	7	2197244	2197250	100 %	0 %	0 %	0 %	479151851
31615	NC_021013	GGA	2	6	2197262	2197267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479151851
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31617	NC_021013	GAA	2	6	2197360	2197365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479151851
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31731	NC_021013	A	6	6	2203850	2203855	100 %	0 %	0 %	0 %	479151858
31732	NC_021013	TGA	2	6	2203864	2203869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479151858
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31734	NC_021013	AGA	2	6	2204032	2204037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479151858
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31854	NC_021013	TG	3	6	2214125	2214130	0 %	50 %	50 %	0 %	479151862
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31972	NC_021013	ATA	2	6	2223617	2223622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479151871
31973	NC_021013	GAA	2	6	2223643	2223648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479151871
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31999	NC_021013	T	6	6	2224939	2224944	0 %	100 %	0 %	0 %	479151872
32000	NC_021013	AAT	2	6	2225556	2225561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479151873

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