MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruminococcus bromii L2-63 draft genome

Total Repeats: 32304

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021013	TGT	2	6	34586	34591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150107
502	NC_021013	TGA	2	6	35104	35109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150108
503	NC_021013	TTG	2	6	35123	35128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150108
504	NC_021013	A	6	6	35164	35169	100 %	0 %	0 %	0 %	479150108
505	NC_021013	AAG	2	6	35180	35185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150108
506	NC_021013	GCTT	2	8	35304	35311	0 %	50 %	25 %	25 %	479150109
507	NC_021013	TAA	2	6	35359	35364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150109
508	NC_021013	CTGC	2	8	35462	35469	0 %	25 %	25 %	50 %	479150109
509	NC_021013	CTT	2	6	35488	35493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150109
510	NC_021013	AAT	2	6	35514	35519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150109
511	NC_021013	GA	3	6	35552	35557	50 %	0 %	50 %	0 %	479150109
512	NC_021013	ATC	2	6	35595	35600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150109
513	NC_021013	ACA	2	6	35667	35672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150109
514	NC_021013	ATA	2	6	35691	35696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150109
515	NC_021013	T	6	6	35729	35734	0 %	100 %	0 %	0 %	479150109
516	NC_021013	TAA	2	6	35773	35778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150109
517	NC_021013	GCA	2	6	35841	35846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479150109
518	NC_021013	GCC	2	6	35859	35864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479150109
519	NC_021013	TTG	2	6	35868	35873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150109
520	NC_021013	GA	3	6	35876	35881	50 %	0 %	50 %	0 %	479150109
521	NC_021013	CTT	2	6	35996	36001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150109
522	NC_021013	TAC	2	6	36035	36040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150109
523	NC_021013	GGC	2	6	36062	36067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479150109
524	NC_021013	ATAA	2	8	36092	36099	75 %	25 %	0 %	0 %	479150109
525	NC_021013	CAG	2	6	36137	36142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479150109
526	NC_021013	GTC	2	6	36153	36158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479150109
527	NC_021013	TGC	2	6	36161	36166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479150109
528	NC_021013	ATT	2	6	36185	36190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150109
529	NC_021013	ATA	2	6	36225	36230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150109
530	NC_021013	CT	3	6	36267	36272	0 %	50 %	0 %	50 %	479150109
531	NC_021013	GACA	2	8	36311	36318	50 %	0 %	25 %	25 %	479150109
532	NC_021013	GCT	2	6	36347	36352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479150109
533	NC_021013	TGC	2	6	36425	36430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479150109
534	NC_021013	ACCA	2	8	36455	36462	50 %	0 %	0 %	50 %	479150109
535	NC_021013	CT	3	6	36507	36512	0 %	50 %	0 %	50 %	479150109
536	NC_021013	TCC	2	6	36518	36523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479150109
537	NC_021013	CCA	2	6	36538	36543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479150109
538	NC_021013	TTGTT	2	10	36642	36651	0 %	80 %	20 %	0 %	479150109
539	NC_021013	CAA	2	6	36785	36790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150110
540	NC_021013	A	6	6	36910	36915	100 %	0 %	0 %	0 %	479150110
541	NC_021013	TCT	2	6	37064	37069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150110
542	NC_021013	AAATG	2	10	37121	37130	60 %	20 %	20 %	0 %	479150110
543	NC_021013	A	7	7	37178	37184	100 %	0 %	0 %	0 %	479150110
544	NC_021013	GAAA	2	8	37194	37201	75 %	0 %	25 %	0 %	479150110
545	NC_021013	CAA	3	9	37240	37248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150110
546	NC_021013	TGA	2	6	37281	37286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150110
547	NC_021013	AAT	2	6	37304	37309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150110
548	NC_021013	T	6	6	37624	37629	0 %	100 %	0 %	0 %	479150111
549	NC_021013	TCA	3	9	37708	37716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150111
550	NC_021013	GAA	2	6	37792	37797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150111
551	NC_021013	TCATC	2	10	37868	37877	20 %	40 %	0 %	40 %	479150111
552	NC_021013	ACAA	2	8	37899	37906	75 %	0 %	0 %	25 %	479150111
553	NC_021013	GCC	2	6	37930	37935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479150111
554	NC_021013	T	6	6	37941	37946	0 %	100 %	0 %	0 %	479150111
555	NC_021013	T	6	6	37983	37988	0 %	100 %	0 %	0 %	479150111
556	NC_021013	AGA	2	6	38013	38018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150111
557	NC_021013	AAG	2	6	38034	38039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479150111
558	NC_021013	TAT	2	6	38057	38062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150111
559	NC_021013	GGTC	2	8	38126	38133	0 %	25 %	50 %	25 %	479150111
560	NC_021013	TTCA	2	8	38166	38173	25 %	50 %	0 %	25 %	479150111
561	NC_021013	CTT	2	6	38177	38182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150111
562	NC_021013	AGT	2	6	38202	38207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479150111
563	NC_021013	CTTC	2	8	38254	38261	0 %	50 %	0 %	50 %	479150111
564	NC_021013	GGT	2	6	38272	38277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479150111
565	NC_021013	ATT	2	6	38283	38288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150111
566	NC_021013	TGT	2	6	38357	38362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150111
567	NC_021013	TACA	2	8	38374	38381	50 %	25 %	0 %	25 %	479150111
568	NC_021013	ACA	2	6	38393	38398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150111
569	NC_021013	TTC	2	6	38490	38495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150111
570	NC_021013	GGAAA	2	10	38539	38548	60 %	0 %	40 %	0 %	479150111
571	NC_021013	ATAC	2	8	38619	38626	50 %	25 %	0 %	25 %	479150111
572	NC_021013	T	6	6	38642	38647	0 %	100 %	0 %	0 %	479150112
573	NC_021013	AT	3	6	38702	38707	50 %	50 %	0 %	0 %	479150112
574	NC_021013	CGT	2	6	38806	38811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479150112
575	NC_021013	AAC	2	6	38819	38824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150112
576	NC_021013	ATA	3	9	38894	38902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150112
577	NC_021013	TA	3	6	38901	38906	50 %	50 %	0 %	0 %	479150112
578	NC_021013	ATT	2	6	38915	38920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150112
579	NC_021013	TTTG	2	8	38954	38961	0 %	75 %	25 %	0 %	479150112
580	NC_021013	CAA	2	6	39049	39054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150112
581	NC_021013	TTTTC	2	10	39085	39094	0 %	80 %	0 %	20 %	479150112
582	NC_021013	CA	3	6	39160	39165	50 %	0 %	0 %	50 %	479150112
583	NC_021013	TTA	2	6	39279	39284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150112
584	NC_021013	CGG	2	6	39324	39329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479150112
585	NC_021013	A	6	6	39367	39372	100 %	0 %	0 %	0 %	479150112
586	NC_021013	ATA	2	6	39383	39388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150112
587	NC_021013	AAC	2	6	39394	39399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150112
588	NC_021013	GCT	2	6	39411	39416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479150112
589	NC_021013	TCA	2	6	39417	39422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150112
590	NC_021013	TCT	2	6	39447	39452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479150112
591	NC_021013	GCT	2	6	39465	39470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479150112
592	NC_021013	CCATT	2	10	39485	39494	20 %	40 %	0 %	40 %	479150112
593	NC_021013	AAT	2	6	39757	39762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150113
594	NC_021013	A	6	6	39799	39804	100 %	0 %	0 %	0 %	479150113
595	NC_021013	AGC	2	6	39833	39838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479150113
596	NC_021013	AAT	2	6	39846	39851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150113
597	NC_021013	TTA	2	6	39926	39931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150113
598	NC_021013	A	6	6	39983	39988	100 %	0 %	0 %	0 %	479150113
599	NC_021013	TTAATA	2	12	40128	40139	50 %	50 %	0 %	0 %	479150114
600	NC_021013	GCT	2	6	40167	40172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479150114
601	NC_021013	ACA	2	6	40231	40236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150114
602	NC_021013	ATA	2	6	40303	40308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150114
603	NC_021013	GCCT	2	8	40311	40318	0 %	25 %	25 %	50 %	479150114
604	NC_021013	AT	3	6	40414	40419	50 %	50 %	0 %	0 %	479150114
605	NC_021013	CCG	2	6	40555	40560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479150114
606	NC_021013	ATA	2	6	40584	40589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150114
607	NC_021013	GCA	2	6	40592	40597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479150114
608	NC_021013	GCC	2	6	40645	40650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479150114
609	NC_021013	TGG	2	6	40655	40660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479150114
610	NC_021013	GCC	2	6	40689	40694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479150114
611	NC_021013	CAG	2	6	40790	40795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479150114
612	NC_021013	CCG	2	6	40898	40903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479150114
613	NC_021013	CGCC	2	8	40924	40931	0 %	0 %	25 %	75 %	479150114
614	NC_021013	CAT	2	6	40941	40946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150114
615	NC_021013	CTTCCG	2	12	41056	41067	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	479150114
616	NC_021013	ACA	2	6	41101	41106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479150114
617	NC_021013	AAT	2	6	41112	41117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150114
618	NC_021013	ACC	2	6	41133	41138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479150114
619	NC_021013	AAT	2	6	41175	41180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150114
620	NC_021013	TGG	2	6	41198	41203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479150114
621	NC_021013	CGG	2	6	41228	41233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479150114
622	NC_021013	GCC	2	6	41254	41259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479150114
623	NC_021013	GCC	2	6	41263	41268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479150114
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625	NC_021013	GCC	2	6	41341	41346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479150114
626	NC_021013	T	6	6	41453	41458	0 %	100 %	0 %	0 %	479150114
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628	NC_021013	GTT	2	6	41558	41563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479150114
629	NC_021013	TGC	2	6	41577	41582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479150114
630	NC_021013	TCTGC	2	10	41585	41594	0 %	40 %	20 %	40 %	479150114
631	NC_021013	TGG	2	6	41698	41703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479150114
632	NC_021013	GCA	2	6	41749	41754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479150114
633	NC_021013	TCA	2	6	41773	41778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150114
634	NC_021013	GGC	2	6	41847	41852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479150114
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747	NC_021013	T	6	6	49851	49856	0 %	100 %	0 %	0 %	479150121
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755	NC_021013	CTG	2	6	50360	50365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479150122
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757	NC_021013	GGCA	2	8	50381	50388	25 %	0 %	50 %	25 %	479150122
758	NC_021013	ATCA	2	8	50429	50436	50 %	25 %	0 %	25 %	479150122
759	NC_021013	CTG	2	6	50477	50482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479150122
760	NC_021013	ATA	2	6	50586	50591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150122
761	NC_021013	GTTGC	2	10	50653	50662	0 %	40 %	40 %	20 %	479150122
762	NC_021013	CGC	2	6	50752	50757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479150122
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791	NC_021013	GTC	2	6	52047	52052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479150124
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801	NC_021013	GGT	2	6	53015	53020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479150124
802	NC_021013	TGAT	2	8	53187	53194	25 %	50 %	25 %	0 %	479150125
803	NC_021013	CAT	2	6	53222	53227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150125
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870	NC_021013	TAT	2	6	57356	57361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479150129
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874	NC_021013	TTTC	2	8	57937	57944	0 %	75 %	0 %	25 %	479150131
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880	NC_021013	ATA	2	6	58272	58277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479150131
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882	NC_021013	CAT	2	6	58457	58462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479150131
883	NC_021013	TGCT	2	8	58732	58739	0 %	50 %	25 %	25 %	479150131
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